Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_13612
- Subject:
- XM_024452373.1
- Aligned Length:
- 1893
- Identities:
- 1884
- Gaps:
- 9
Alignment
Query 1 ATGTCCCACCAAGAAGGCAGCACAGACGGCTTACCAGACTTAGGGACTGAAAGCCTGTTCAGCAGCCCAGAGGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCCCACCAAGAAGGCAGCACAGACGGCTTACCAGACTTAGGGACTGAAAGCCTGTTCAGCAGCCCAGAGGA 74
Query 75 GCAGTCTGGAGCCGTGGCGGCGACAGAGGCCTCCTCAGACATTGACATAGCGACCTCAGAGCTGAGTGTGACAG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GCAGTCTGGAGCCGTGGCGGCGACAGAGGCCTCCTCAGACATTGACATAGCGACCTCAGAGCTGAGTGTGACAG 148
Query 149 TGACCGGAGATGGCAGTGATAGCAGGGATGGTGGATTCCCCAACGATGCCAGCACAGAAAATCGAAGCTCAGAC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGACCGGAGATGGCAGTGATAGCAGGGATGGTGGATTCCCCAACGATGCCAGCACAGAAAATCGAAGCTCAGAC 222
Query 223 CAAGAAAGCGCAAGTGAAGACATCGAACTTGAGAGCTTGGAGGACTTTGAGCATTTCCTCATGAGTGGTGAAAG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CAAGAAAGCGCAAGTGAAGACATCGAACTTGAGAGCTTGGAGGACTTTGAGCATTTCCTCATGAGTGGTGAAAG 296
Query 297 TTTATTCCATTACCCTTTAGTGGGAGAGGAGGAGACAGAAAGGGAGGAGGAAGACGAAGAGATACAAGAGGAGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TTTATTCCATTACCCTTTAGTGGGAGAGGAGGAGACAGAAAGGGAGGAGGAAGACGAAGAGATACAAGAGGAGG 370
Query 371 GAGGGGAGGAGGAGGAA---------GAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAAGAACAG 435
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GAGGGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAAGAACAG 444
Query 436 CCTCGGGCGGGTCCACAAGGCAGTGGCGGCAACCATGAGCAGTATTCGTTAGAGGAGGATCAGGCGCTGGAGGA 509
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCTCGGGCGGGTCCACAAGGCAGTGGCGGCAACCATGAGCAGTATTCGTTAGAGGAGGATCAGGCGCTGGAGGA 518
Query 510 GTGGGTTTCCTCAGAGACATCTGCCCTGCCCCGACCTCGCTGGCAGGTCGTTACTGCTCTTCACCAGCGGCAGC 583
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GTGGGTTTCCTCAGAGACATCTGCCCTGCCCCGACCTCGCTGGCAGGTCGTTACTGCTCTTCACCAGCGGCAGC 592
Query 584 TGGGTTCACGTCCCCGCTTTGTATATGAGGCCTGTGGGGCAAGAGCCTTTGTGCAGCGTTTCCGCCTGCAATAT 657
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGGGTTCACGTCCCCGCTTTGTATATGAGGCCTGTGGGGCAAGAGCCTTTGTGCAGCGTTTCCGCCTGCAATAT 666
Query 658 CGTCTTGCAGACCATGTCGGCTGTGTCAATACTGTACACTTTAACCAGCGTGGCACCCGGCTGGCCAGTAGCGG 731
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CGTCTTGCAGACCATGTCGGCTGTGTCAATACTGTACACTTTAACCAGCGTGGCACCCGGCTGGCCAGTAGCGG 740
Query 732 TGATGACCTAAAGGTGATAGTGTGGGACTGGGTGCGGCAGAGGCCAGTACTGAACTTTGAAAGTGGTCACACAA 805
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGATGACCTAAAGGTGATAGTGTGGGACTGGGTGCGGCAGAGGCCAGTACTGAACTTTGAAAGTGGTCACACAA 814
Query 806 ATAATGTCTTCCAGGCCAAGTTCCTTCCTAACTGTGGTGATTCCACTCTGGCCATGTGTGCCCGTGATGGGCAG 879
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ATAATGTCTTCCAGGCCAAGTTCCTTCCTAACTGTGGTGATTCCACTCTGGCCATGTGTGCCCGTGATGGGCAG 888
Query 880 GTACGGGTAGCAGAGTTAATTAATGCATCATATTTCAACAATACTAAGTGTGTGGCCCAGCACAGGGGACCTGC 953
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GTACGGGTAGCAGAGTTAATTAATGCATCATATTTCAACAATACTAAGTGTGTGGCCCAGCACAGGGGACCTGC 962
Query 954 CCACAAGTTGGCTCTGGAGCCTGACTCTCCTTATAAGTTCCTCACTTCAGGTGAAGATGCTGTTGTCTTCACCA 1027
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CCACAAGTTGGCTCTGGAGCCTGACTCTCCTTATAAGTTCCTCACTTCAGGTGAAGATGCTGTTGTCTTCACCA 1036
Query 1028 TTGACCTCAGACAAGACCGGCCAGCTTCAAAAGTTGTGGTAACAAGAGAAAATGATAAGAAAGTGGGACTGTAT 1101
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TTGACCTCAGACAAGACCGGCCAGCTTCAAAAGTTGTGGTAACAAGAGAAAATGATAAGAAAGTGGGACTGTAT 1110
Query 1102 ACAATTACTGTGAATCCCGCCAATACCTACCAATTTGCAGTGGGTGGACAAGATCAGTTTGTAAGGATTTATGA 1175
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ACAATTACTGTGAATCCCGCCAATACCTACCAATTTGCAGTGGGTGGACAAGATCAGTTTGTAAGGATTTATGA 1184
Query 1176 CCAGAGGAAAATTGATAAGAAAGAAAACAATGGCGTGCTCAAGAAATTCACTCCTCATCATCTGGTTAATTGTG 1249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCAGAGGAAAATTGATAAGAAAGAAAACAATGGCGTGCTCAAGAAATTCACTCCTCATCATCTGGTTAATTGTG 1258
Query 1250 ATTTCCCAACAAACATCACCTGCGTTGTGTACAGCCACGATGGCACAGAGCTGCTAGCCAGCTACAATGATGAC 1323
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ATTTCCCAACAAACATCACCTGCGTTGTGTACAGCCACGATGGCACAGAGCTGCTAGCCAGCTACAATGATGAC 1332
Query 1324 GATATTTACCTCTTCAACTCCTCTCACAGTGATGGTGCTCAATACAGTAAGAGATTTAAGGGACACAGAAATAA 1397
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GATATTTACCTCTTCAACTCCTCTCACAGTGATGGTGCTCAATACAGTAAGAGATTTAAGGGACACAGAAATAA 1406
Query 1398 TACCACAGTCAAAGGTGTTAATTTCTATGGCCCCAGGAGTGAGTTTGTAGTGAGCGGTAGTGATTGCGGGCACA 1471
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TACCACAGTCAAAGGTGTTAATTTCTATGGCCCCAGGAGTGAGTTTGTAGTGAGCGGTAGTGATTGCGGGCACA 1480
Query 1472 TCTTCTTCTGGGAGAAATCATCCTGCCAAATCATCCAGTTCCTAAAGGGGAGCAGAGAAGGTACAATAAACTGT 1545
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TCTTCTTCTGGGAGAAATCATCCTGCCAAATCATCCAGTTCCTAAAGGGGAGCAGAGAAGGTACAATAAACTGT 1554
Query 1546 CTTGAACCCCACCCTTACCTACCTGTGTTGGCGTGCAGTGGCCTAGATCATGATGTCAAGATCTGGACACCCAC 1619
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CTTGAACCCCACCCTTACCTACCTGTGTTGGCGTGCAGTGGCCTAGATCATGATGTCAAGATCTGGACACCCAC 1628
Query 1620 AGCTAAAGCTGCCACTGAGCTTACTGGGTTAAAGAAGGTGATTAAGAAGAACAAGTGGGAACGAGATGAAGACA 1693
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AGCTAAAGCTGCCACTGAGCTTACTGGGTTAAAGAAGGTGATTAAGAAGAACAAGTGGGAACGAGATGAAGACA 1702
Query 1694 GCTTGCACCATGGCAGCCTGTTTGACCAGTACATGCTTTGGTTCCTCCTGCGTCACGTGACGCAGAGAGGTCGT 1767
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GCTTGCACCATGGCAGCCTGTTTGACCAGTACATGCTTTGGTTCCTCCTGCGTCACGTGACGCAGAGAGGTCGT 1776
Query 1768 CACCAGGACTGGAGAAGTGGTGAAGCTGAATTTCCAGATGAAGAATCGGATGAGTCTTCCAGCACTTCAGAGAC 1841
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CACCAGGACTGGAGAAGTGGTGAAGCTGAATTTCCAGATGAAGAATCGGATGAGTCTTCCAGCACTTCAGAGAC 1850
Query 1842 ATCTGAGGAGGAGGTCCAAGACCGAGTGCAGTGCATGCCATCC 1884
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 ATCTGAGGAGGAGGTCCAAGACCGAGTGCAGTGCATGCCATCC 1893