Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_13627
Subject:
NM_198525.3
Aligned Length:
1343
Identities:
828
Gaps:
513

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  MGLEAQRLPGAEEAPVRVALRVRPLLPKELLHGHQSCLQVEPGLGRVTLGRDRHFGFHVVLAEDAGQEAVYQAC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  VQPLLEAFFEGFNATVFAYGQTGSGKTYTMGEASVASLLEDEQGIVPRAMAEAFKLIDENDLLDCLVHVSYLEV  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  YKEEFRDLLEVGTASRDIQLREDERGNVVLCGVKEVDVEGLDEVLSLLEMGNAARHTGATHLNHLSSRSHTVFT  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  VTLEQRGRAPSRLPRPAPGQLLVSKFHFVDLAGSERVLKTGSTGERLKESIQINSSLLALGNVISALGDPQRRG  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  SHIPYRDSKITRILKDSLGGNAKTVMIACVSPSSSDFDETLNTLNYASRAQNIRNRATVNWRPEAERPPEETAS  370

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  371  GARGPPRHRSETRIIHRGRRAPGPATASAAAAMRLGAECARYRACTDAAYSLLRELQAEPGLPGAAARKVRDWL  444

Query    1  ---------------------------------------------------------------------MEQYK  5
                                                                                 |||||
Sbjct  445  CAVEGERSALSSASGPDSGIESASVEDQAAQGAGGRKEDEGAQQLLTLQNQVARLEEENRDFLAALEDAMEQYK  518

Query    6  LQSDRLREQQEEMVELRLRLELVRPGWGGPRLLNGLPPGSFVPRPHTAPLGGAHAHVLGMVPPACLPGDEVGSE  79
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  LQSDRLREQQEEMVELRLRLELVRPGWGGPRLLNGLPPGSFVPRPHTAPLGGAHAHVLGMVPPACLPGDEVGSE  592

Query   80  QRGEQVTNGREAGAELLTEVNRLGSGSSAASEEEEEEEEPPRRTLHLRRNRISNCSQRAGARPGSLPERKGPEL  153
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  QRGEQVTNGREAGAELLTEVNRLGSGSSAASEEEEEEEEPPRRTLHLRRNRISNCSQRAGARPGSLPERKGPEL  666

Query  154  CLEELDAAIPGSRAVGGSKARVQARQVPPATASEWRLAQAQQKIRELAINIRMKEELIGELVRTGKAAQALNRQ  227
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CLEELDAAIPGSRAVGGSKARVQARQVPPATASEWRLAQAQQKIRELAINIRMKEELIGELVRTGKAAQALNRQ  740

Query  228  HSQRIRELEQEAEQVRAELSEGQRQLRELEGKELQDAGERSRLQEFRRRVAAAQSQVQVLKEKKQATERLVSLS  301
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  HSQRIRELEQEAEQVRAELSEGQRQLRELEGKELQDAGERSRLQEFRRRVAAAQSQVQVLKEKKQATERLVSLS  814

Query  302  AQSEKRLQELERNVQLMRQQQGQLQRRLREETEQKRRLEAEMSKRQHRVKELELKHEQQQKILKIKTEEIAAFQ  375
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AQSEKRLQELERNVQLMRQQQGQLQRRLREETEQKRRLEAEMSKRQHRVKELELKHEQQQKILKIKTEEIAAFQ  888

Query  376  RKRRSGSNGSVVSLEQQQKIEEQKKWLDQEMEKVLQQRRALEELGEELHKREAILAKKEALMQEKTGLEIKRLR  449
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  889  RKRRSGSNGSVVSLEQQQKIEEQKKWLDQEMEKVLQQRRALEELGEELHKREAILAKKEALMQEKTGLESKRLR  962

Query  450  SSQALNEDIVRVSSRLEHLEKELSEKSGQLRQGSAQSQQQIRREIDSLRQEKDSLLKQRLEIDGKLRQGSLLSP  523
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  SSQALNEDIVRVSSRLEHLEKELSEKSGQLRQGSAQSQQQIRGEIDSLRQEKDSLLKQRLEIDGKLRQGSLLSP  1036

Query  524  EEERTLFQLDEAIEALDAAIEYKNEAITCRQRVLRASASLLSQCEMNLMAKLSYLSSSETRALLCKYFDKVVTL  597
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  EEERTLFQLDEAIEALDAAIEYKNEAITCRQRVLRASASLLSQCEMNLMAKLSYLSSSETRALLCKYFDKVVTL  1110

Query  598  REEQHQQQIAFSELEMQLEEQQRLVYWLEVALERQRLEMDRQLTLQQKEHEQNMQLLLQQSRDHLGEGLADSRR  671
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  REEQHQQQIAFSELEMQLEEQQRLVYWLEVALERQRLEMDRQLTLQQKEHEQNMQLLLQQSRDHLGEGLADSRR  1184

Query  672  QYEARIQALEKELGRYMWINQELKQKLGGVNAVGHSRGGEKRSLCSEGRQAPGNEDELHLAPELLWLSPLTEGA  745
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  QYEARIQALEKELGRYMWINQELKQKLGGVNAVGHSRGGEKRSLCSEGRQAPGNEDELHLAPELLWLSPLTEGA  1258

Query  746  PRTREETRDLVHAPLPLTWKRSSLCGEEQGSPEELRQREAAEPLVGRVLPVGEAGLPWNFGPLSKPRRELRRAS  819
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  PRTREETRDLVHAPLPLTWKRSSLCGEEQGSPEELRQREAAEPLVGRVLPVGEAGLPWNFGPLSKPRRELRRAS  1332

Query  820  PGMIDVRKNPL  830
            |||||||||||
Sbjct 1333  PGMIDVRKNPL  1343