Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_13627
- Subject:
- XM_006540670.3
- Aligned Length:
- 2671
- Identities:
- 2115
- Gaps:
- 206
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCCACGTGGGAGCCTGCTGACAAGATGGGCATTCTGCCTGGCTGGTGTCAGGTGGAAGGTCCTCAGCTTCCT 74
Query 1 ---------------------------------------------ATGGAGCAGTACA----------AAC--- 16
.|| ||| |.|| |||
Sbjct 75 TCTTCAGTTTCTTGTACTCACGCTGCTCAGCGGACACCCCCACCCTTG--GCA-TCCACGACCCCATCAACTCC 145
Query 17 ------------TGCAGAGCGACCGGCTGCGTGAGCAGCAGGAGGAGATGGTGGAACTGCGGCTGCGGTTAGAG 78
|||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||..|||||
Sbjct 146 TGGACTGTGTCTTGCAGAGTGACCGCCTGCGGGAGCAGCAGGAAGAGATGGTAGAACTGCGGCTACGCCTAGAG 219
Query 79 CTGGTGCGGCCAGGCTGGGGGGGCCCGCGGCTCCTGAATGGCCTGCCTCCCGGGTCCTTTGTGCCTCGACCTCA 152
||||..|.|||.||||||||.|..|||.||||||||.|.|||.||||.||.||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct 220 CTGGCACAGCCTGGCTGGGGTGCACCGGGGCTCCTGCAGGGCTTGCCACCGGGATCCTTTGTGCCCCGGCCTCA 293
Query 153 TACAGCCCCCCTGGGGGGTGCCCACGCCCATGTGCTGGGCATGGTGCCGCCTGCCTGCCTCCCTGGAGATGAAG 226
.||||||||||||||||||||||||.|.||..|||||||||||.||||..|..|.||.||.||||||||.||||
Sbjct 294 CACAGCCCCCCTGGGGGGTGCCCACACTCACATGCTGGGCATGATGCCCTCGACATGTCTTCCTGGAGAAGAAG 367
Query 227 TTGGCTCTGAGCAGAGGGGAGAGCAGGTGACAAATGGCAGGGAGGCTGGAGCTGAGTTGCTGACTGAGGTGAAC 300
||.||||||||| ||||||||...|.|||||.|||.|....|||.|||.||.||.|..|||.|.||
Sbjct 368 TTAGCTCTGAGC---------AGCAGGTGGTGAGTGGCAAGGAAGTCAAAGCAGAGGTGTTGGCCCAGGCGGAC 432
Query 301 AGGCTGGGAAGTGGCTCTTCAGCTGCTTCAGAGGAGGAAGAGGAGGAG------------------------GA 350
|...||.|.||||.||||||..||.|.|||||||||||||.||||||| ||
Sbjct 433 AAATTGAGGAGTGCCTCTTCCACTACATCAGAGGAGGAAGGGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAAGAAGAAGA 506
Query 351 GGAGCCGCCCAGGCGGACCTTACACCTGCGCAGAAATAGGATCAGCAACTGCAGTCAGAGGGCGGGGGCACGCC 424
||||||.|||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||.|||....|.|
Sbjct 507 GGAGCCACCCAGGCGGACCTTATACTTGCGCAGAAATGGGATCAGCAACTGGAGTCAGAGGGCAGGGTTGAGTC 580
Query 425 CAGGGAGTCTGCCAGAGAGGAAGGGCCCAGAGCTTTGCCTTGAGGAGTTGGATGCAGCCATTCCAGGGTCCA-- 496
|||||||.|..||.||.|||||||||||||||.|.||||..||.|||...|.|||.|||||.|||| ||
Sbjct 581 CAGGGAGCCCACCTGACAGGAAGGGCCCAGAGGTCTGCCCAGAAGAGCCAGCTGCTGCCATCCCAG----CACC 650
Query 497 --GAGCAGTTGGTGGGAGCAAGGCCCGAGTTCAGGCCCGCCAGGTCCCCCCTGCCACAGCCTCAGAGTGGCGGC 568
.||||||.|||.|..||||||.||.|||||||.|||||||||.|||..||||||..|||||.||||||||.|
Sbjct 651 ACAAGCAGTCGGTAGCGGCAAGGTCCCAGTTCAGACCCGCCAGGCCCCAGCTGCCATGGCCTCTGAGTGGCGAC 724
Query 569 TGGCCCAGGCCCAGCAGAAGATCCGGGAGCTGGCTATCAACATCCGCATGAAGGAGGAGCTTATTGGCGAGCTG 642
|||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 725 TGGCCCAGGCCCAACAGAAAATCCGGGAACTGGCCATCAACATCCGCATGAAGGAGGAGCTCATTGGTGAGCTG 798
Query 643 GTCCGCACAGGAAAGGCAGCTCAGGCCCTGAACCGCCAGCACAGCCAGCGTATCCGGGAGCTGGAGCAGGAGGC 716
|||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 799 GTCCGGACAGGGAAGGCGGCCCAGGCCCTGAACCGTCAACACAGCCAGCGCATCCGGGAGCTGGAGCAGGAGGC 872
Query 717 AGAGCAGGTGCGGGCCGAGCTGAGTGAAGGCCAGAGGCAGCTGCGGGAGCTCGAGGGCAAGGAGCTCCAGGATG 790
.||||..||||||||.||||||.|||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||.|||||.|||.||||
Sbjct 873 TGAGCGTGTGCGGGCGGAGCTGTGTGAAGGGCAGAGGCAGCTTCGAGAGCTGGAGGGCAGGGAGCCCCAAGATG 946
Query 791 CTGGCGAGCGGTCTCGGCTCCAGGAGTTCCGCAGGAGGGTCGCTGCGGCCCAGAGCCAGGTGCAGGTGCTGAAG 864
|..|||||.||||..||||||||||.|||||.|.|||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 947 CCAGCGAGAGGTCCAGGCTCCAGGAATTCCGTAAGAGAGTGGCTGCAGCCCAAAGCCAGGTGCAGGTGCTGAAG 1020
Query 865 GAGAAGAAGCAGGCTACGGAGCGGCTGGTGTCACTGTCGGCCCAGAGTGAGAAGCGACTGCAGGAGCTCGAGCG 938
||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||..||.||.||||||||.|||.|
Sbjct 1021 GAGAAGAAGCAGGCAACAGAGCGACTGGTGTCACTGTCGGCTCAAAGTGAGACTCGGCTACAGGAGCTGGAGAG 1094
Query 939 GAACGTGCAGCTCATGCGGCAGCAGCAGGGACAGCTGCAGAGGCGGCTTCGCGAGGAGACGGAGCAGAAGCGGC 1012
|||.||||||||||||||||..||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1095 GAATGTGCAGCTCATGCGGCGACAGCAGGGGCAGCTGCAGAGGCGGCTCCGTGAGGAGACAGAGCAGAAGCGGC 1168
Query 1013 GCCTGGAGGCAGAAATGAGCAAGCGGCAGCACCGCGTCAAGGAGCTGGAGCTGAAGCATGAGCAACAGCAGAAG 1086
||||.|||.|.||.||||.||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1169 GCCTAGAGACGGAGATGAACAAGCGGCAGCATCGCGTCAAGGAGCTGGAACTGAAGCACGAGCAACAGCAAAAG 1242
Query 1087 ATCCTGAAGATTAAGACGGAAGAGATCGCGGCCTTCCAGAGGAAGAGGCGCAGTGGCAGCAACGGCTCTGTGGT 1160
||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1243 ATCCTGAAAATCAAGACAGAAGAGATTGCAGCCTTCCAGAGGAAGAGGCGCAGTGGCAGCAATGGCTCTGTGGT 1316
Query 1161 CAGCCTGGAACAGCAGCAGAAGATTGAGGAGCAGAAGAAGTGGCTGGACCAGGAGATGGAGAAGGTGCTACAGC 1234
.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1317 GAGCCTGGAGCAGCAGCAGAAGATCGAGGAGCAGAAGAAGTGGCTGGACCAGGAGATGGAAAAGGTGCTGCAGC 1390
Query 1235 AGCGGCGGGCGCTGGAGGAGCTGGGGGAGGAGCTCCACAAGCGGGAGGCCATCCTGGCCAAGAAGGAGGCCCTG 1308
||||||||||||||||||||.||||.||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1391 AGCGGCGGGCGCTGGAGGAGTTGGGAGAGGAGCTTCGCAAGCGGGAGGTCATCCTGGCCAAGAAGGAGGCCCTG 1464
Query 1309 ATGCAGGAGAAGACGGGGCTGGAGATCAAGCGCCTGAGATCCAGCCAGGCCCTCAACGAGGACATCGTGCGAGT 1382
||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||
Sbjct 1465 ATGCAGGAGAAGACGGGGCTTGAGAGCAAGCGCCTGAGGTCCAGCCAGGCCCTAAATGAAGACATTGTGCGTGT 1538
Query 1383 GTCCAGCCGGCTGGAGCACCTGGAGAAGGAGCTGTCCGAGAAGAGCGGGCAGCTGCGGCAGGGCAGCGCCCAGA 1456
|||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1539 GTCCAGCCGCCTAGAACACCTGGAGAAGGAGCTATCTGAGAAGAGTGGGCAGCTGCGGCAAGGCAGCGCCCAGA 1612
Query 1457 GCCAGCAGCAGATCCGCAGGGAGATCGACAGCCTGCGCCAGGAGAAGGACTCACTGCTCAAGCAGCGCCTGGAG 1530
.|||||||||||||.|..|||||||.||||.|||||||||.|||||||||||||||.|.|||||.|||||||||
Sbjct 1613 ACCAGCAGCAGATCAGAGGGGAGATAGACACCCTGCGCCAAGAGAAGGACTCACTGTTGAAGCAACGCCTGGAG 1686
Query 1531 ATCGACGGCAAGCTGAGGCAGGGGAGTCTGCTGTCCCCCGAGGAGGAGCGGACGCTGTTCCAGTTGGATGAGGC 1604
||.||..||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||.||||.|||||||||.|||||||.||
Sbjct 1687 ATTGATAGCAAGCTGAGGCAGGGAAGCCTGCTGTCACCTGAGGAAGAGAGGACACTGTTCCAGCTGGATGAAGC 1760
Query 1605 CATCGAGGCCCTGGATGCTGCCATTGAGTATAAGAATGAGGCCATCACATGCCGCCAGCGGGTGCTTCGGGCCT 1678
|||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1761 CATCGAGGCCCTGGACGCTGCCATCGAGTACAAGAATGAGGCTATCACATGCCGCCAGCGGGTGCTACGGGCTT 1834
Query 1679 CAGCCTCGTTGCTGTCCCAGTGCGAGATGAACCTCATGGCCAAGCTCAGCTACCTCTCATCCTCAGAGACCAGA 1752
|.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1835 CGGCCTCCTTGCTGTCCCAGTGTGAGATGAATCTCATGGCAAAGCTCAGCTACCTTTCCTCCTCAGAGACCAGA 1908
Query 1753 GCCCTCCTCTGCAAGTATTTTGACAAGGTGGTGACGCTCCGAGAGGAGCAGCACCAGCAGCAGATTGCCTTCTC 1826
|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1909 GCCCTGCTGTGCAAGTATTTTGACAAGGTGGTGACACTCCGAGAGGAGCAACACCAGCAACAGATTGCCTTCTC 1982
Query 1827 GGAACTGGAGATGCAGCTGGAGGAGCAGCAGAGGCTGGTGTACTGGCTGGAGGTGGCCCTGGAGCGGCAGCGCC 1900
|||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1983 GGAGCTGGAGATGCAGCTGGAGGAGCAGCAGCGGCTGGTGTACTGGCTGGAGGTGGCCCTGGAGCGGCAGCGCC 2056
Query 1901 TGGAGATGGACCGCCAGCTGACCCTGCAGCAGAAGGAGCACGAGCAGAACATGCAGCTGCTCCTGCAGCAGAGT 1974
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.|||||||||||.||||||.|.
Sbjct 2057 TGGAGATGGACCGGCAGCTGACCCTGCAGCAGAAGGAGCACGAGCAGAATGTACAGCTGCTCCTCCAGCAGGGC 2130
Query 1975 CGAGACCACCTCGGTGAAGGGTTAGCAGACAGCAGGAGGCAGTATGAGGCCCGGATTCAAGCTCTGGAGAAGGA 2048
|||||||||||.||.||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2131 CGAGACCACCTTGGCGAGGGGTTAGCAGACAGCAAGAGGCAGTATGAGGCCCGGATTCACGCTCTGGAGAAGGA 2204
Query 2049 ACTGGGCCGTTACATGTGGATAAACCAGGAACTGAAACAGAAGCTCGGCGGTGTGAA-CGCTGTAGGCCACAGC 2121
|||.||.||..|||||||||||||||||||.|||||.|||||||||.|.|..| ||| |.|||.||||||.|||
Sbjct 2205 ACTAGGTCGACACATGTGGATAAACCAGGAGCTGAAGCAGAAGCTCAGTGCAG-GAAGCACTGCAGGCCAGAGC 2277
Query 2122 AGGGGTGGGGAGAAGAGGAGCCTGTGCTCGGAGGGCAGACA--GGCTCCTGGAAATGAAGATGAGCTCCACCTG 2193
.|||||.|.||||.|||.|||||.|||..|||...|||||| |.|| ||||||||||||||.||||||.|..
Sbjct 2278 CGGGGTTGTGAGAGGAGAAGCCTCTGCCTGGAAAACAGACAATGCCT--TGGAAATGAAGATGGGCTCCATCCC 2349
Query 2194 GCA---CCCGAGCTTCTCTGGCTGTCCCCCCTCACT-GAGGGGGCCCCCCGCACCCGGGAGGAGACGCGGGACT 2263
||| ||.||.|.||||||||.||||.|||| .|| |||||||...||||.....||||.|||.|.|||||||
Sbjct 2350 GCAGCTCCTGAACCTCTCTGGCAGTCCTCCCT-TCTGGAGGGGGTGTCCCGTGTGTGGGATGAGTCCCGGGACT 2422
Query 2264 TGGTCCACGCTCCGTTACCCTTGACCTGGAAACGCTCGAGCCTGTGTGGTGAG-GAGCAGGGGTCCCCCGAGGA 2336
|||||||.||.||..|||||.||||.|||||||||||.|||.|||| .|| ||||||||.|||.|.|||||
Sbjct 2423 TGGTCCATGCCCCACTACCCCTGACATGGAAACGCTCAAGCTTGTG----CAGCGAGCAGGGCTCCTCTGAGGA 2492
Query 2337 -ACTGAGGCAGCGGGAGGCGGCTGAGCCCCTGGTGGGGCGGGTGCTTCCTGTGGGTGAGGCAGGCCTGCCCTGG 2409
.|| |||...||||||.|..||||.||||..||.|||||||||||.|||.|||||||.|..|||||..|||||
Sbjct 2493 GTCT-AGGGTCCGGGAGACAACTGAACCCCCAGTAGGGCGGGTGCTACCTATGGGTGAAGTGGGCCTCTCCTGG 2565
Query 2410 AACTTTGGGCCTTTGTCCAAGCCCCGGCGGGAACTGCGACGAGCCAGCCCGGGGATGATTGATGTCCGGAAAAA 2483
||||||||.||.|||.|||||||||||.||||||..|||.||.|||||||.||||||||.||.|||.|||||||
Sbjct 2566 AACTTTGGACCCTTGCCCAAGCCCCGGTGGGAACCCCGAAGAACCAGCCCAGGGATGATCGACGTCAGGAAAAA 2639
Query 2484 CCCCCTG 2490
||||.||
Sbjct 2640 CCCCTTG 2646