Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13628
• Subject: XM_006524860.3
• Aligned Length: 1451
• Identities: 1177
• Gaps: 73

Alignment

Query    1  ATGACTCCTGTGAGGATGCAGCACTCCCTGGCAGGTCAGACCTATGCCGTGCCCCTCATCCAGCCAGACCTGCG  74
            |||||.||.||||.||..|||..||||.||||.||.|||...|||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGACACCGGTGAAGACCCAGTGCTCCTTGGCGGGCCAGCTTTATGCAGTGCCCCTCATCCAGCCCGACCTGCG  74

Query   75  GCGAGAGGAGGCCGTCCAGCAGATGGCGGATGCCCTGCAGTACCTGCAGAAGGTCTCTGGAGACATCTTCAGCA  148
            .|||||||||||..|||||||..||||.|||||||||||||||||.|||||..|||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACGAGAGGAGGCAATCCAGCAAGTGGCAGATGCCCTGCAGTACCTACAGAACATCTCTGGAGACATCTTCAGCA  148

Query  149  GGATCTCCCAGCGGGTAGAGCAGAGCCGGAGCCAGGTGCAGGCCATTGGAGAGAAGGTCTCCTTGGCCCAGGCC  222
            |||||||||..||.|||||||.|||.|||.|||||.|||||||||||.|.||||.||||||||||||||||||.
Sbjct  149  GGATCTCCCGACGAGTAGAGCTGAGTCGGCGCCAGCTGCAGGCCATTAGTGAGAGGGTCTCCTTGGCCCAGGCT  222

Query  223  AAGATTGAGAAGATCAAGGGCAGCAAGAAGGCCATCAAGGTGTTCTCCAGTGCCAAGTACCCTGCTCCAGAGCG  296
            |||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||.
Sbjct  223  AAGATAGAGAAGATCAAGGGCAGTAAGAAGGCCATCAAGGTCTTTTCTAGTGCCAAGTACCCAGCACCAGAGCA  296

Query  297  CCTGCAGGAATATGGCTCCATCTTCACGGGCGCCCAGGACCCTGGCCTGCAGAGACGCTCCCGCCACAGGATCC  370
            ||||||||||||.|||||||||||.||.||||||..|||||||||.|||||||||.|..||||..|||||||||
Sbjct  297  CCTGCAGGAATACGGCTCCATCTTTACTGGCGCCTTGGACCCTGGTCTGCAGAGAAGACCCCGTTACAGGATCC  370

Query  371  AGAGCAAGCACCGCCCCCTGGACGAGCGGGCCCTGCAGGAGAAGCTGAAGTACTTTCCTGTGTGTGTGAGCACC  444
            ||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||.||||
Sbjct  371  AGAGCAAGCACCGCCCACTGGATGAGCGGGCTCTGCAGGAGAAGCTGAAATACTTTCCCGTGTGTGTGAACACC  444

Query  445  AAGCCGGAGCCCGAGGACGATGCAGAAGAGGGACTTGGGGGTCTTCCCAGCAACATCAGCTCTGTCAGCTCCTT  518
            |||.|||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||.|
Sbjct  445  AAGTCGGAGCCTGAGGATGAAGCTGAGGAGGGACTTGGGGGTCTTCCCAGCAACATCAGCTCCATCAGCTCCCT  518

Query  519  GCTGCTCTTCAACACCACCGAGAACCTGTACAAGAAGTATGTCTTCCTGGACCCCCTGGCTGGTGCTGTAACAA  592
            ||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  519  GCTGCTCTTCAACACCACAGAGAATCTGTATAAGAAGTATGTTTTCCTGGACCCTCTGGCTGGTGCAGTAACAA  592

Query  593  AGACCCATGTGATGCTGGGGGCAGAGACAGAGGAGAAGCTGTTTGATGCCCCCTTGTCCATCAGCAAGAGAGAG  666
            |.||.||...|||||||||..|||||   ||||||||..||||.||||||||..||||.|||||||||||||||
Sbjct  593  AAACGCACACGATGCTGGGCACAGAG---GAGGAGAAATTGTTCGATGCCCCTCTGTCTATCAGCAAGAGAGAG  663

Query  667  CAGCTGGAACAGCAGGTCCCAGAGAACTACTTCTATGTGCCAGACCTGGGCCAGGTGCCTGAGATTGATGTTCC  740
            ||||||||.|.|||||..|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||
Sbjct  664  CAGCTGGAGCGGCAGGCTCCAGAAAACTACTTCTACGTGCCAGACCTGGGCCAGGTTCCTGAGATCGACGTGCC  737

Query  741  GTCCTACCTGCCTGACCTGCCCGGCATTGCCAACGACCTCATGTACAGTGCCGACCTGGGCCCCGGCATTGCCC  814
            .||||||||.||.||..|.||||||.|.||..|||||||.|||||||||||.||..|||||||.||||||||||
Sbjct  738  ATCCTACCTACCCGATTTACCCGGCGTCGCAGACGACCTGATGTACAGTGCGGATTTGGGCCCTGGCATTGCCC  811

Query  815  CCTCTGCCCCTGGCACCATTCCGGAACTGCCCACCTTCCACACTGAGGTAGCCGAGCCTCTCAAGGCAGACCTA  888
            |.|||||.|||||..|.||.||.||..||||..||||||||||.|||||.||.||.||||||.||.||||.|||
Sbjct  812  CGTCTGCTCCTGGTGCTATCCCAGAGTTGCCTGCCTTCCACACAGAGGTGGCAGAACCTCTCCAGCCAGAGCTA  885

Query  889  CAAGATGGGGTACTAACAGCACCACCACCACCCCCACCGCCCCCA------CCACCTCCCCCAGCTCCTGAGGT  956
            .|..|||..|||||....|||.||||.||.||.||.||.||||||      |||||||||||||||||      
Sbjct  886  GAGAATGAAGTACTGTTGGCAGCACCGCCCCCGCCTCCTCCCCCACCGCCGCCACCTCCCCCAGCTCC------  953

Query  957  GC-------TGGCCAGTGCATCCCCACTCCCA--------CCCT-------CAACCGCGGCCCCTGTAGGCCAA  1008
             |       |||.||||   .||||||..|||        ||||       ||||.|      |||..|||||.
Sbjct  954  -CACAGCATTGGTCAGT---ACCCCACAGCCACCGATGTTCCCTGACATGGCAACTG------CTGCTGGCCAG  1017

Query 1009  GGCGCCAGGCAGGACGAC---AGCAGCAGCA--GC-------GCGTCTCCTTCAGTCCAGGGAGCTCCCAGGGA  1070
            |..||||||.|.||.|||   ||||||||||  ||       ||.|||      ||.||||||||.||.|.|||
Sbjct 1018  GTTGCCAGGGAAGAAGACTCTAGCAGCAGCATGGCCCACACAGCCTCT------GTTCAGGGAGCCCCTAAGGA  1085

Query 1071  AGTGGTCGACCCCTCCGGTGGCCGGGCCACTCTGCTAGAGTCCATCCGCCAAGCTGGGGGCATCGGCAAGGCCA  1144
            .|||||.|||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1086  GGTGGTTGACCCCTCCAGTGGCCGGGCCACTCTGCTCGAGTCCATCCGCCAAGCTGGGGGCATTGGCAAGGCCA  1159

Query 1145  AGCTGCGCAGCGTGAAGGAGCGAAAGCTGGAGAAGAAGAAGCAGAAGGAGCAGGAGCAAGTGAGAGCCACGAGC  1218
            ||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1160  AGCTACGCAGCGTGAAGGAGCGCAAACTGGAGAAGAAGAAACAGAAGGAGCAGGAGCAAGTGAGAGCCACGAGC  1233

Query 1219  CAAGGTGGGGACTTGATGTCGGATCTCTTCAACAAGCTGGTCATGAGGCGCAAGGGCATCTCTGGGAAAGGACC  1292
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||
Sbjct 1234  CAAGGTGGGGACTTGATGTCAGATCTCTTCAACAAACTTGTCATGAGGCGCAAAGGTATCTCTGGAAAGGGACC  1307

Query 1293  TGGGGCTG------GTGAGGGGCCCGGAGGAGCCTTTGCCCGCGTGTCAGACTCCATCCCTCCTCTGCCGCCAC  1360
            |.|..|||      |||||||.||.|||||||||||..|.||..||||||||||||||||.||.|||||.||.|
Sbjct 1308  TAGCACTGGAACCAGTGAGGGACCTGGAGGAGCCTTCTCTCGAATGTCAGACTCCATCCCACCGCTGCCACCCC  1381

Query 1361  CGCAGCAGCC-ACAGGCAGAGGAGGACGAGGACGACTGGGAATCG  1404
            |.|||||||| .|||| |||.|||||.|||||.||||||||.||.
Sbjct 1382  CACAGCAGCCGGCAGG-AGACGAGGATGAGGAGGACTGGGAGTCC  1425