Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13754
• Subject: NM_014513.2
• Aligned Length: 1023
• Identities: 857
• Gaps: 120

Alignment

Query    1  ATGTCGCTCACTGTCGTCAGCATGGCGTGTGTTGGGTTCTTCTTGCTGCAGGGGGCCTGGCCACATGAGGGAGT  74
            ||||||||||..|||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct    1  ATGTCGCTCATGGTCATCAGCATGGCGTGTGTTGCGTTCTTCTTGCTGCAGGGGGCCTGGCCACATGAGGGATT  74

Query   75  CCACAGAAAACCTTCCCTCCTGGCCCACCCAGGTCCCCTGGTGAAATCAGAAGAGACAGTCATCCTGCAATGTT  148
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCGCAGAAAACCTTCCCTCCTGGCCCACCCAGGTCCCCTGGTGAAATCAGAAGAGACAGTCATCCTGCAATGTT  148

Query  149  GGTCAGATGTCAGGTTTGAGCACTTCCTTCTGCACAGAGAGGGGAAGTATAAGGACACTTTGCACCTCATTGGA  222
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||..|||||||||.||||||||||
Sbjct  149  GGTCAGATGTCATGTTTGAGCACTTCCTTCTGCACAGAGAGGGGACGTTTAACCACACTTTGCGCCTCATTGGA  222

Query  223  GAGCACCATGATGGGGTCTCCAAGGCCAACTTCTCCATCGGTCCCATGATGCAAGACCTTGCAGGGACCTACAG  296
            ||||||..|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||..||||||||.||||||||||||||
Sbjct  223  GAGCACATTGATGGGGTCTCCAAGGGCAACTTCTCCATCGGTCGCATGACACAAGACCTGGCAGGGACCTACAG  296

Query  297  ATGCTACGGTTCTGTTACTCACTCCCCCTATCAGTTGTCAGCTCCCAGTGACCCTCTGGACATCGTCATCACAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  297  ATGCTACGGTTCTGTTACTCACTCCCCCTATCAGTTGTCAGCGCCCAGTGACCCTCTGGACATCGTGATCACAG  370

Query  371  GTCTATATGAGAAACCTTCTCTCTCAGCCCAGCCGGGCCCCACGGTTTTGGCAGGAGAGAGCGTGACCTTGTCC  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GTCTATATGAGAAACCTTCTCTCTCAGCCCAGCCGGGCCCCACGGTTCTGGCAGGAGAGAGCGTGACCTTGTCC  444

Query  445  TGCAGCTCCCGGAGCTCCTATGACATGTACCATCTATCCAGGGAGGGGGAGGCCCATGAACGTAGGTTCTCTGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  445  TGCAGCTCCCGGAGCTCCTATGACATGTACCATCTATCCAGGGAAGGGGAGGCCCATGAACGTAGGCTCCCTGC  518

Query  519  AGGGCCCAAGGTCAACGGAACATTCCAGGCCGACTTTCCTCTGGGCCCTGCCACCCACGGAGGAACCTACAGAT  592
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  519  AGGGCCCAAGGTCAACAGAACATTCCAGGCCGACTTTCCTCTGGACCCTGCCACCCACGGAGGGACCTACAGAT  592

Query  593  GCTTCGGCTCTTTCCGTGACTCTCCCTATGAGTGGTCAAACTCGAGTGACCCACTGCTTGTTTCTGTCACAGGA  666
            |||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCTTCGGCTCTTTCCGTGACTCTCCATACGAGTGGTCAAAGTCAAGTGACCCACTGCTTGTTTCTGTCACAGGA  666

Query  667  AACCCTTCAAATAGTTGGCCTTCACCCACTGAACCAAGCTCCAAAACCGGTAACCCCAGACACCTGCATGTTCT  740
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  667  AACTCTTCAAATAGTTGGCCTTCACCCACTGAACCAAGCTCCGAAACCGGTAACCCCAGACACCTACACGTTCT  740

Query  741  GATTGGGACCTCAGTGGTCAAAATCCCTTTCACCATCCTCCTCTTCTTTCTCCTTCATCGCTGGTGCTCCAACA  814
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GATTGGGACCTCAGTGGTCAAACTCCCTTTCACCATCCTCCTCTTCTTTCTCCTTCATCGCTGGTGCTCCAACA  814

Query  815  AAAAAAATGCTGCTGTAATGGACCAAGAGCCTGCAGGGAACAGAACAGTGAACAGCGAGAGAGAAATCACTCGC  888
            ||||||||||..|||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||.||| ||            
Sbjct  815  AAAAAAATGCATCTGTAATGGACCAAGGGCCTGCGGGGAACAGAACAGTGAACAGGGAG-GA------------  875

Query  889  CCTTCTGA-GAGGCCCAAGACACCCCCAACAG--------ATACCAGCATGTACATAGAACTTCCAAATGCTGA  953
              |||||| ||        |||...|||.|||        ||||  |||                         
Sbjct  876  --TTCTGATGA--------ACAGGACCATCAGGAGGTGTCATAC--GCA-------------------------  912

Query  954  GCCCAGATCCAAAGTTGTCTTCTGTCCACGAGCACCACAGTCAGGCCTTGAGGGGATCTTC  1014
                                                                         
Sbjct  913  -------------------------------------------------------------  912