Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_13795
- Subject:
- NR_148401.1
- Aligned Length:
- 3384
- Identities:
- 2842
- Gaps:
- 540
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 GGCACCTGAAGCCCTTCGGGGCAGAGGAGGGCGGGGACTCGGGGCGGCTCTCAGCATCCGCCTGGAGCTCGTGG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CGCTGTGTTTCCGTGCTGTGGAGTTGCCTGGTCCGCTTCCTCCCCGCGAATAAGAATAAAAGATTCTGGAGGAG 148
Query 1 -----------------------------------------------ATGCACAATTTTGAGGAAGAGTTAACT 27
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TTGGAGAAGAGTGTATTCAGCCCCCAAACCACGAGATCAACAAAGAAATGCACAATTTTGAGGAAGAGTTAACT 222
Query 28 TGTCCCATATGTTATAGTATTTTTGAAGATCCTCGTGTACTGCCATGCTCTCATACATTTTGTAGAAATTGTTT 101
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TGTCCCATATGTTATAGTATTTTTGAAGATCCTCGTGTACTGCCATGCTCTCATACATTTTGTAGAAATTGTTT 296
Query 102 GGAAAACATTCTTCAGGCATCTGGTAACTTTTATATATGGAGACCTTTACGAATTCCACTCAAGTGCCCTAATT 175
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGAAAACATTCTTCAGGCATCTGGTAACTTTTATATATGGAGACCTTTACGAATTCCACTCAAGTGCCCTAATT 370
Query 176 GCAGAAGTATTACTGAAATTGCTCCAACTGGCATTGAATCTTTACCTGTTAATTTTGCACTAAGGGCTATTATT 249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GCAGAAGTATTACTGAAATTGCTCCAACTGGCATTGAATCTTTACCTGTTAATTTTGCACTAAGGGCTATTATT 444
Query 250 GAAAAGTACCAGCAAGAAGACCATCCAGATATTGTCACCTGCCCTGAACATTACAGGCAACCATTAAATGTTTA 323
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAAAAGTACCAGCAAGAAGACCATCCAGATATTGTCACCTGCCCTGAACATTACAGGCAACCATTAAATGTTTA 518
Query 324 CTGTCTATTAGATAAAAAATTAGTTTGTGGTCATTGCCTTACCATAGGTCAACATCATGGTCATCCTATAGATG 397
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CTGTCTATTAGATAAAAAATTAGTTTGTGGTCATTGCCTTACCATAGGTCAACATCATGGTCATCCTATAGATG 592
Query 398 ACCTTCAAAGTGCCTATTTGAAAGAAAAGGACACTCCTCAAAAACTGCTTGAACAGTTGACTGACACACACTGG 471
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACCTTCAAAGTGCCTATTTGAAAGAAAAGGACACTCCTCAAAAACTGCTTGAACAGTTGACTGACACACACTGG 666
Query 472 ACAGATCTTACCCATCTTATTGAAAAGCCGAAAGAACAAAAATCTCATTCTGAGAAAATGATCCAAGGCGATAA 545
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ACAGATCTTACCCATCTTATTGAAAAGCTGAAAGAACAAAAATCTCATTCTGAGAAAATGATCCAAGGCGATAA 740
Query 546 GGAAGCTGTTCTCCAGTATTTTAAGGAGCTTAATGATACATTAGAACAGAAAAAAAAAAGTTTCCTAACGGCTC 619
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGAAGCTGTTCTCCAGTATTTTAAGGAGCTTAATGATACATTAGAACAGAAAAAAAAAAGTTTCCTAACGGCTC 814
Query 620 TCTGTGATGTTGGCAATCTAATTAATCAAGAATATACTCCACAAATTGAAAGAATGAAGGAAATACGAGAGCAG 693
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TCTGTGATGTTGGCAATCTAATTAATCAAGAATATACTCCACAAATTGAAAGAATGAAGGAAATACGAGAGCAG 888
Query 694 CAGCTTGAATTAATGGCACTGACAATATCTTTACAAGAAGAGTCTCCACTTAAATTTCTTGAAAAAGTTGATGA 767
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CAGCTTGAATTAATGGCACTGACAATATCTTTACAAGAAGAGTCTCCACTTAAATTTCTTGAAAAAGTTGATGA 962
Query 768 TGTACGCCAGCATGTACAGATCTTGAAACAAAGACCACTTCCTGAGGTTCAACCCGTTGAAATTTATCCTCGAG 841
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGTACGCCAGCATGTACAGATCTTGAAACAAAGACCACTTCCTGAGGTTCAACCCGTTGAAATTTATCCTCGAG 1036
Query 842 TAAGCAAAATATTGAAAGAAGAATGGAGCAGAACAGAAATTGGACAAATTAAGAACGTTCTCATTCCCAAAATG 915
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TAAGCAAAATATTGAAAGAAGAATGGAGCAGAACAGAAATTGGACAAATTAAGAACGTTCTCATTCCCAAAATG 1110
Query 916 AAAATTTCTCCAAAAAGGATGTCATGTTCCTGGCCTGGAACACCAGTGTATTCAGTAGCGTGGGGCCCTGATTC 989
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AAAATTTCTCCAAAAAGGATGTCATGTTCCTGGCCTGGAACACCAGTGTATTCAGTAGCGTGGGGCCCTGATTC 1184
Query 990 AGAAAAGGTTCTTTATACAGCAGGCAAGCAGCTAATCATTAAACCTCTTCAACCAAATGCTAAAGTTTTGCAGT 1063
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AGAAAAGGTTCTTTATACAGCAGGCAAGCAGCTAATCATTAAACCTCTTCAACCAAATGCTAAAGTTTTGCAGT 1258
Query 1064 GGAAAGCTCATGATGGCATTATTTTAAAAGTAGATTGGAACTCGGTCAATGATCTTATTTTATCTGCTGGTGAA 1137
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GGAAAGCTCATGATGGCATTATTTTAAAAGTAGATTGGAACTCGGTCAATGATCTTATTTTATCTGCTGGTGAA 1332
Query 1138 GACTGTAAATATAAGGTATGGGATAGTTACGGCCGCCCACTGTACAATTCACAACCTCATGAGCATCCCATTAC 1211
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GACTGTAAATATAAGGTATGGGATAGTTACGGCCGCCCACTGTACAATTCACAACCTCATGAGCATCCCATTAC 1406
Query 1212 TTCAGTTGCCTGGGCTCCAGATGGAGAATTATTTGCTGTTGGATCGTTTCATACTTTACGCTTGTGTGATAAAA 1285
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TTCAGTTGCCTGGGCTCCAGATGGAGAATTATTTGCTGTTGGATCGTTTCATACTTTACGCTTGTGTGATAAAA 1480
Query 1286 CTGGGTGGTCATATGCATTAGAAAAACCCAACACTGGCAGCATATTTAATATTGCATGGTCTATCGATGGCACT 1359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CTGGGTGGTCATATGCATTAGAAAAACCCAACACTGGCAGCATATTTAATATTGCATGGTCTATCGATGGCACT 1554
Query 1360 CAGATTGCTGGAGCCTGTGGAAATGGACATGTCGTTTTTGCACATGTGGTGGAACAACATTGGGAGTGGAAAAA 1433
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CAGATTGCTGGAGCCTGTGGAAATGGACATGTCGTTTTTGCACATGTGGTGGAACAACATTGGGAGTGGAAAAA 1628
Query 1434 TTTTCAAGTAACATTAACGAAAAGAAGAGCCATGCAGGTTCGTAATGTTCTTAATGATGCAGTGGATTTACTGG 1507
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TTTTCAAGTAACATTAACGAAAAGAAGAGCCATGCAGGTTCGTAATGTTCTTAATGATGCAGTGGATTTACTGG 1702
Query 1508 AATTCCGTGATAGAGTCATTAAAGCATCTTTGAACTATGCACACTTAGTTGTTTCAACGTCTCTTCAATGTTAC 1581
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AATTCCGTGATAGAGTCATTAAAGCATCTTTGAACTATGCACACTTAGTTGTTTCAACGTCTCTTCAATGTTAC 1776
Query 1582 GTGTTCTCCACGAAGAACTGGAACACACCAATTATATTTGATCTCAAAGAAGGAACTGTTAGTTTGATTCTGCA 1655
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GTGTTCTCCACGAAGAACTGGAACACACCAATTATATTTGATCTCAAAGAAGGAACTGTTAGTTTGATTCTGCA 1850
Query 1656 GGCAGAAAGACATTTTCTTCTTGTAGATGGTAGTAGTATCTATTTATATTCATATGAAGGGCGCTTTATTTCAT 1729
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GGCAGAAAGACATTTTCTTCTTGTAGATGGTAGTAGTATCTATTTATATTCATATGAAGGGCGCTTTATTTCAT 1924
Query 1730 CTCCAAAATTTCCTGGAATGAGAACAGATATTCTGAATGCACAGACTGTGTCTTTGAGTAATGATACCATAGCA 1803
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CTCCAAAATTTCCTGGAATGAGAACAGATATTCTGAATGCACAGACTGTGTCTTTGAGTAATGATACCATAGCA 1998
Query 1804 ATAAGAGACAAAGCTGATGAAAAAATAATCTTCCTCTTTGAGGCATCAACCGGAAAGCCGTTAGGTGATGGAAA 1877
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 ATAAGAGACAAAGCTGATGAAAAAATAATCTTCCTCTTTGAGGCATCAACCGGAAAGCCGTTAGGTGATGGAAA 2072
Query 1878 GTTTCTTTCTCATAAGAATGAAATCTTGGAAATTGCTCTGGATCAAAAAGGACTTACCAATGATAGAAAAATTG 1951
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GTTTCTTTCTCATAAGAATGAAATCTTGGAAATTGCTCTGGATCAAAAAGGACTTACCAATGATAGAAAAATTG 2146
Query 1952 CTTTCATTGATAAAAATAGAGATCTCTGTATCACTTCTGTGAAACGATTTGGGAAGGAAGAACAAATTATCAAG 2025
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CTTTCATTGATAAAAATAGAGATCTCTGTATCACTTCTGTGAAACGATTTGGGAAGGAAGAACAAATTATCAAG 2220
Query 2026 CTTGGAACAATGGTGCATACTTTGGCATGGAACGATACATGCAATATCCTTTGTGGACTTCAAGATACTCGATT 2099
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CTTGGAACAATGGTGCATACTTTGGCATGGAACGATACATGCAATATCCTTTGTGGACTTCAAGATACTCGATT 2294
Query 2100 TATAGTGTGGTATTACCCCAATACAGTTTATGTGGACAGAGACATTTTGCCTAAAACATTATATGAAAGGGATG 2173
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 TATAGTGTGGTATTACCCCAATACAGTTTATGTGGACAGAGACATTTTGCCTAAAACATTATATGAAAGGGATG 2368
Query 2174 CAAGTGAATTTAGTAAAAATCCCCATATTGTGAGTTTTGTTGGAAATCAAGTAACTATTAGAAGAGCTGATGGC 2247
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 CAAGTGAATTTAGTAAAAATCCCCATATTGTGAGTTTTGTTGGAAATCAAGTAACTATTAGAAGAGCTGATGGC 2442
Query 2248 TCCCTGGTTCACATCAGCATAACACCATATCCTGCTATTCTCCATGAATATGTAAGCAGTTCAAAATGGGAAGA 2321
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 TCCCTGGTTCACATCAGCATAACACCATATCCTGCTATTCTCCATGAATATGTAAGCAGTTCAAAATGGGAAGA 2516
Query 2322 TGCTGTGAGACTTTGTCGCTTTGTTAAGGAGCAAACCATGTGGGCTTGTCTAGCTGCTATGGCAGTTGCTAATC 2395
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 TGCTGTGAGACTTTGTCGCTTTGTTAAGGAGCAAACCATGTGGGCTTGTCTAGCTGCTATGGCAGTTGCTAATC 2590
Query 2396 GAGATATGACTACTGCAGAAGTAGCCTATGCAGCAATTGGTGAAATTGATAAGGTTCAGTACATCAATTCTATA 2469
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 GAGATATGACTACTGCAGAAATAGCCTATGCAGCAATTGGTGAAATTGATAAGGTTCAGTACATCAATTCTATA 2664
Query 2470 AAAAATCTTCCATCTAAAGAATCAAAAATGGCCCACATACTACTGTTTAGTGGGAACATACAGGAGGCTGAAAT 2543
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 AAAAATCTTCCATCTAAAGAATCAAAAATGGCCCACATACTACTGTTTAGTGGGAACATACAGGAGGCTGAAAT 2738
Query 2544 AGTACTTCTTCAGGCTGGCCTTGTTTATCAAGCAATCCAGATCAATATTAATCTCTACAACTGGGAAAGGGCAC 2617
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 AGTACTTCTTCAGGCTGGCCTTGTTTATCAAGCAATCCAGATCAATATTAATCTCTACAACTGGGAAAGGGCAC 2812
Query 2618 TGGAATTGGCTGTAAAATACAAAACACATGTTGATACAGTTCTTGCTTACCGTCAAAAGTTTTTGGAGACATTT 2691
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 TGGAATTGGCTGTAAAATACAAAACACATGTTGATACAGTTCTTGCTTACCGTCAAAAGTTTTTGGAGACATTT 2886
Query 2692 GGTAAACAGGAAACTAATAAACGATACTTGCATTATGCAGAAGGTCTCCAAATAGATTGGGAGAAAATCAAAGC 2765
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 GGTAAACAGGAAACTAATAAACGATACTTGCATTATGCAGAAGGTCTCCAAATAGATTGGGAGAAAATCAAAGC 2960
Query 2766 CAAAATTGAGATGGAAATTACAAAAGAAAGAGAGCAATCATCAAGCAGCCAATCCAGCAAGAGTATAGGTTTAA 2839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 CAAAATTGAGATGGAAATTACAAAAGAAAGAGAGCAATCATCAAGCAGCCAATCCAGCAAGAGTATAGGTTTAA 3034
Query 2840 AGCCC--------------------------------------------------------------------- 2844
|||||
Sbjct 3035 AGCCCTAAATGCCATGCGTATCTTTAAGAAATTTTATCTTTTGAAACACGTTCTGATTAACCAAGGGGCGTGTC 3108
Query 2845 -------------------------------------------------------------------------- 2844
Sbjct 3109 ACAGAACAGGAAACTGATACAATGACACTTGTTTCTTAAGAGAAGCTGATTGAATCCTGTAGCACATTACTGCA 3182
Query 2845 -------------------------------------------------------------------------- 2844
Sbjct 3183 CAATTAATGGCTTTAAACGAGTTACAAGTCGTAAGTTCTTATGTTTTGGATCATGTTGTGGAATGTATTCCAAA 3256
Query 2845 -------------------------------------------------------------------------- 2844
Sbjct 3257 TGAAAAATGGAGGAGAAAGTGCACAACATCATATGCTTCATGGTATGGCATATACATGTCAATTATTTTTACAT 3330
Query 2845 ------------------------------------------------------ 2844
Sbjct 3331 ATAACTGTGATGAATGATACAATTAAAAGCTATACTACAAAAAAAAAAAAAAAA 3384