Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_13825
- Subject:
- NM_001286049.1
- Aligned Length:
- 1292
- Identities:
- 1059
- Gaps:
- 82
Alignment
Query 1 ATGGCCAGTGCTTGGGGCACAGTCTTTTTCATGCTGGTGGTATCCTGTGTTTGCAGCGCTGTCTCCCACAG-GA 73
|||||||.|.|.|||||..|.||| |||||||||.|..||.||||.|||.|||||.||||||.|.|||| ||
Sbjct 1 ATGGCCACTTCCTGGGGGGCTGTC---TTCATGCTGATCATAGCCTGCGTTGGCAGCACTGTCTTCTACAGAGA 71
Query 74 ACCAGCAGACTTGGTTTGAGGGTATCTTCCTGTCTTCCATGTGCCCCATCAATGTCAGCGCCAGCACCTTGTAT 147
| ||||||||.||||||||.|||.|||||.|||||||||||||||||||.||||||||.|||.|||||||.|||
Sbjct 72 A-CAGCAGACCTGGTTTGAAGGTGTCTTCTTGTCTTCCATGTGCCCCATTAATGTCAGTGCCGGCACCTTTTAT 144
Query 148 GGAATTATGTTTGATGCAGGGAGCACTGGAACTCGAATTCATGTTTACACCTTTGTGCAGAAAATGCCAGGACA 221
|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||...|||||||
Sbjct 145 GGAATTATGTTTGATGCGGGCAGCACTGGAACTCGGATTCATGTTTACACTTTTGTGCAGAAAACAGCAGGACA 218
Query 222 GCTTCCAATTCTAGAAGGGGAAGTTTTTGATTCTGTGAAGCCAGGACTTTCTGCTTTTGTAGATCAACCTAAGC 295
|||.||..||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.|
Sbjct 219 GCTCCCCTTTCTGGAAGGTGAAATTTTTGATTCTGTGAAGCCGGGACTTTCTGCTTTTGTGGATCAGCCCAAAC 292
Query 296 AGGGTGCTGAGACCGTTCAAGGGCTCTTAGAGGTGGCCAAAGACTCAATCCCCCGAAGTCACTGGAAAAAGACC 369
|||||||||||||.||.||.|.||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||.||||||.|||.||||
Sbjct 293 AGGGTGCTGAGACTGTCCAGGAGCTCTTGGAGGTGGCCAAAGACTCGATCCCCAGAAGCCACTGGGAAAGGACC 366
Query 370 CCAGTGGTCCTAAAGGCAACAGCAGGACTACGCTTACTGCCAGAACACAAAGCCAAGGCTCTGCTCTTTGAGGT 443
||.|||||.||.||.|||||.||.|||||.||.||.|||||.||.||.||||||.|||||||||||||.|||||
Sbjct 367 CCGGTGGTTCTGAAAGCAACGGCCGGACTCCGTTTGCTGCCTGAGCAGAAAGCCCAGGCTCTGCTCTTGGAGGT 440
Query 444 AAAGGAGATCTTCAGGAAGTCACCTTTCCTGGTACCAAAGGGCAGTGTTAGCATCATGGATGGATCCGACGAAG 517
|.||||||||||||.|||.||||||||||||||.|||.|.|||||.|||||||||||||||||.|||.|.||||
Sbjct 441 AGAGGAGATCTTCAAGAATTCACCTTTCCTGGTCCCAGATGGCAGCGTTAGCATCATGGATGGGTCCTATGAAG 514
Query 518 GCATATTAGCTTGGGTTACTGTGAATTTTCTGACAGGTCAGCTGCATGGCCACAGACAGGAGACTGTGGGGACC 591
|||||.||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|...|.||||||||||||||||||
Sbjct 515 GCATACTAGCCTGGGTTACCGTGAACTTTCTAACAGGTCAGCTGCATGGTCGTGGCCAGGAGACTGTGGGGACC 588
Query 592 TTGGACCTAGGGGGAGCCTCCACCCAAATCACGTTCCTGCCCCAGTTTGAGAAAACTCTGGAACAAACTCCTAG 665
.|.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 589 CTTGACCTGGGGGGTGCCTCCACCCAAATCACGTTTCTACCCCAGTTTGAGAAAACCCTGGAACAAACACCTAG 662
Query 666 GGGCTACCTCACTTCCTTTGAGATGTTTAACAGCACTTATAAGCTCTATACACATAGTTACCTGGGATTTGGAT 739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 663 GGGCTACCTCACTTCCTTTGAGATGTTTAACAGCACTTTTAAGCTCTATACACATAGTTACTTGGGATTTGGAC 736
Query 740 TGAAAGCTGCAAGACTAGCAACCCTGGGAGCCCTGGAGACAGAAGGGACTGATGGGCACACTTTCCGGAGTGCC 813
||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..||.|||||||||||||.||.||.||.||.||||||
Sbjct 737 TGAAAGCTGCAAGACTGGCAACTCTGGGAGCCCTGGAAGCAAAAGGGACTGATGGACATACGTTTCGAAGTGCC 810
Query 814 TGTTTACCGAGATGGTTGGAAGCAGAGTGGATCTTTGGGGGTGTGAAATACCAGTATGGTGGCAACCAAGAAGG 887
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 811 TGTTTACCAAGATGGTTGGAAGCAGAGTGGATCTTTGGGGGTGTGAAATACCAGTATGGTGGTAACCAAGAAGG 884
Query 888 GGAGGTGGGCTTTGAGCCCTGCTATGCCGAAGTGCTGAGGGTGGTACGAGGAAAACTTCACCAGCCAGAGGAGG 961
||||.||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||..||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct 885 GGAGATGGGCTTTGAACCCTGCTATGCGGAAGTGCTGAGGGTAGTACAGGGGAAACTTCACCAGCCAGAAGAAG 958
Query 962 TCCAGA-GAGGTTCCTTCTATGCTTTCTCTTACTATTATGACCGAGCTGTTGACACAGACATGATTGATTATGA 1034
||| || ||.|..|||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.|.|||||||.||.||||.||||||||
Sbjct 959 TCC-GAGGAAGCGCCTTCTACGCTTTCTCTTACTACTACGATCGAGCCGCTGACACACACTTGATCGATTATGA 1031
Query 1035 AAAGGGGGGTATTTTAAAAGTTGAAGATTTTGAAAGAAAAGCCAGGGAAGTGTGTGATAACTTGGAAAACTTCA 1108
||||||.||..||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||..|.||||.
Sbjct 1032 AAAGGGCGGGGTTTTAAAAGTTGAAGATTTTGAAAGAAAAGCCAGAGAAGTGTGTGACAACTTGGGGAGCTTCT 1105
Query 1109 CCTCAGGCAGTCCTTTCCTGTGCATGGATCTCAGCTACATCACAGCCCTGTTAAAGGATGGCTTTGGCTTTGCA 1182
||||.||||||||||||||.||||||||.||||..|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.
Sbjct 1106 CCTCGGGCAGTCCTTTCCTCTGCATGGACCTCACTTACATCACAGCCCTGTTGAAAGATGGTTTTGGCTTTGCC 1179
Query 1183 GACAGCACAGTCTTACAGC---------------ACATCATCAG---CTGGGTAAAT----------------- 1221
|||.||||..||||||||| |||.||| || |||| |
Sbjct 1180 GACGGCACCCTCTTACAGCTCACAAAGAAAGTGAACAACAT-AGAGACTGG-----TTGGGCCTTGGGGGCCAC 1247
Query 1222 ---------------------------------- 1221
Sbjct 1248 CTTTCACCTGCTCCAGTCTCTGGGCATCACCAGC 1281