Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_13827
- Subject:
- NM_001793.6
- Aligned Length:
- 2500
- Identities:
- 2322
- Gaps:
- 161
Alignment
Query 1 ATGGGGCTCCCTCGTGGACCTCTCGCGTCTCTCCTCCTTCTCCAGGTTTGCTGGCTGCAGTGCGCGGCCTCCGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGGCTCCCTCGTGGACCTCTCGCGTCTCTCCTCCTTCTCCAGGTTTGCTGGCTGCAGTGCGCGGCCTCCGA 74
Query 75 GCCGTGCCGGGCGGTCTTCAGGGAGGCTGAAGTGACCTTGGAGGCGGGAGGCGCGGAGCAGGAGCCCGGCCAGG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GCCGTGCCGGGCGGTCTTCAGGGAGGCTGAAGTGACCTTGGAGGCGGGAGGCGCGGAGCAGGAGCCCGGCCAGG 148
Query 149 CGCTGGGGAAAGTATTCATGGGCTGCCCTGGGCAAGAGCCAGCTCTGTTTAGCACTGATAATGATGACTTCACT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CGCTGGGGAAAGTATTCATGGGCTGCCCTGGGCAAGAGCCAGCTCTGTTTAGCACTGATAATGATGACTTCACT 222
Query 223 GTGCGGAATGGCGAGACAGTCCAGGAAAGAAGGTCACTGAAGGAAAGGAATCCATTGAAGATCTTCCCATCCAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GTGCGGAATGGCGAGACAGTCCAGGAAAGAAGGTCACTGAAGGAAAGGAATCCATTGAAGATCTTCCCATCCAA 296
Query 297 ACGTATCTTACGAAGACACAAGAGAGATTGGGTGGTTGCTCCAATATCTGTCCCTGAAAATGGCAAGGGTCCCT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ACGTATCTTACGAAGACACAAGAGAGATTGGGTGGTTGCTCCAATATCTGTCCCTGAAAATGGCAAGGGTCCCT 370
Query 371 TCCCCCAGAGACTGAATCAGCTCAAGTCTAATAAAGATAGAGACACCAAGATTTTCTACAGCATCACGGGGCCG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCCCCCAGAGACTGAATCAGCTCAAGTCTAATAAAGATAGAGACACCAAGATTTTCTACAGCATCACGGGGCCG 444
Query 445 GGGGCAGACAGCCCCCCTGAGGGTGTCTTCGCTGTAGAGAAGGAGACAGGCTGGTTGTTGTTGAATAAGCCACT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGGGCAGACAGCCCCCCTGAGGGTGTCTTCGCTGTAGAGAAGGAGACAGGCTGGTTGTTGTTGAATAAGCCACT 518
Query 519 GGACCGGGAGGAGATTGCCAAGTATGAGCTCTTTGGCCACGCTGTGTCAGAGAATGGTGCCTCAGTGGAGGACC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGACCGGGAGGAGATTGCCAAGTATGAGCTCTTTGGCCACGCTGTGTCAGAGAATGGTGCCTCAGTGGAGGACC 592
Query 593 CCATGAACATCTCCATCATCGTGACCGACCAGAATGACCACAAGCCCAAGTTTACCCAGGACACCTTCCGAGGG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCATGAACATCTCCATCATCGTGACCGACCAGAATGACCACAAGCCCAAGTTTACCCAGGACACCTTCCGAGGG 666
Query 667 AGTGTCTTAGAGGGAGTCCTACCAGGTACTTCTGTGATGCAGGTGACAGCCACAGATGAGGATGATGCCATCTA 740
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGTGTCTTAGAGGGAGTCCTACCAGGTACTTCTGTGATGCAGGTGACAGCCACGGATGAGGATGATGCCATCTA 740
Query 741 CACCTACAATGGGGTGGTTGCTTACTCCATCCATAGCCAAGAACCAAAGGACCCACACGACCTCATGTTCACAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 741 CACCTACAATGGGGTGGTTGCTTACTCCATCCATAGCCAAGAACCAAAGGACCCACACGACCTCATGTTCACCA 814
Query 815 TTCACCGGAGCACAGGCACCATCAGCGTCATCTCCAGTGGCCTGGACCGGGAAAAAGTCCCTGAGTACACACTG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTCACCGGAGCACAGGCACCATCAGCGTCATCTCCAGTGGCCTGGACCGGGAAAAAGTCCCTGAGTACACACTG 888
Query 889 ACCATCCAGGCCACAGACATGGATGGGGACGGCTCCACCACCACGGCAGTGGCAGTAGTGGAGATCCTTGATGC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ACCATCCAGGCCACAGACATGGATGGGGACGGCTCCACCACCACGGCAGTGGCAGTAGTGGAGATCCTTGATGC 962
Query 963 CAATGACAATGCTCCCATGTTTGACCCCCAGAAGTACGAGGCCCATGTGCCTGAGAATGCAGTGGGCCATGAGG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CAATGACAATGCTCCCATGTTTGACCCCCAGAAGTACGAGGCCCATGTGCCTGAGAATGCAGTGGGCCATGAGG 1036
Query 1037 TGCAGAGGCTGACGGTCACTGATCTGGACGCCCCCAACTCACCAGCGTGGCGTGCCACCTACCTTATCATGGGC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGCAGAGGCTGACGGTCACTGATCTGGACGCCCCCAACTCACCAGCGTGGCGTGCCACCTACCTTATCATGGGC 1110
Query 1111 GGTGACGACGGGGACCATTTTACCATCACCACCCACCCTGAGAGCAACCAGGGCATCCTGACAACCAGGAAGGG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GGTGACGACGGGGACCATTTTACCATCACCACCCACCCTGAGAGCAACCAGGGCATCCTGACAACCAGGAAGGG 1184
Query 1185 TTTGGATTTTGAGGCCAAAAACCAGCACACCCTGTACGTTGAAGTGACCAACGAGGCCCCTTTTGTGCTGAAGC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TTTGGATTTTGAGGCCAAAAACCAGCACACCCTGTACGTTGAAGTGACCAACGAGGCCCCTTTTGTGCTGAAGC 1258
Query 1259 TCCCAACCTCCACAGCCACCATAGTGGTCCACGTGGAGGATGTGAATGAGGCACCTGTGTTTGTCCCACCCTCC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TCCCAACCTCCACAGCCACCATAGTGGTCCACGTGGAGGATGTGAATGAGGCACCTGTGTTTGTCCCACCCTCC 1332
Query 1333 AAAGTCGTTGAGGTCCAGGAGGGCATCCCCACTGGGGAGCCTGTGTGTGTCTACACTGCAGAAGACCCTGACAA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AAAGTCGTTGAGGTCCAGGAGGGCATCCCCACTGGGGAGCCTGTGTGTGTCTACACTGCAGAAGACCCTGACAA 1406
Query 1407 GGAGAATCAAAAGATCAGCTACCGCATCCTGAGAGACCCAGCAGGGTGGCTAGCCATGGACCCAGACAGTGGGC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GGAGAATCAAAAGATCAGCTACCGCATCCTGAGAGACCCAGCAGGGTGGCTAGCCATGGACCCAGACAGTGGGC 1480
Query 1481 AGGTCACAGCTGTGGGCACCCTCGACCGTGAGGATGAGCAGTTTGTGAGGAACAACATCTATGAAGTCATGGTC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGGTCACAGCTGTGGGCACCCTCGACCGTGAGGATGAGCAGTTTGTGAGGAACAACATCTATGAAGTCATGGTC 1554
Query 1555 TTGGCCATGGACAATGGAAGCCCTCCCACCACTGGCACGGGAACCCTTCTGCTAACACTGATTGATGTCAACGA 1628
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1555 TTGGCCATGGACAATGGAAGCCCTCCCACCACTGGCACGGGAACCCTTCTGCTAACACTGATTGATGTCAATGA 1628
Query 1629 CCATGGCCCAGTCCCTGAGCCCCGTCAGATCACCATCTGCAACCAAAGCCCTGTGCGCCAGGTGCTGAACATCA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CCATGGCCCAGTCCCTGAGCCCCGTCAGATCACCATCTGCAACCAAAGCCCTGTGCGCCAGGTGCTGAACATCA 1702
Query 1703 CGGACAAGGACCTGTCTCCCCACACCTCCCCTTTCCAGGCCCAGCTCACAGATGACTCAGACATCTACTGGACG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CGGACAAGGACCTGTCTCCCCACACCTCCCCTTTCCAGGCCCAGCTCACAGATGACTCAGACATCTACTGGACG 1776
Query 1777 GCAGAGGTCAACGAGGAAGGTGACACAGTGGTCTTGTCCCTGAAGAAGTTCCTGAAGCAGGATACATATGACGT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GCAGAGGTCAACGAGGAAGGTGACACAGTGGTCTTGTCCCTGAAGAAGTTCCTGAAGCAGGATACATATGACGT 1850
Query 1851 GCACCTTTCTCTGTCTGACCATGGCAACAAAGAGCAGCTGACGGTGATCAGGGCCACTGTGTGCGACTGCCATG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GCACCTTTCTCTGTCTGACCATGGCAACAAAGAGCAGCTGACGGTGATCAGGGCCACTGTGTGCGACTGCCATG 1924
Query 1925 GCCATGTCGAAACCTGCCCTGGACCCTGGAAAGGAGGTTTCATCCTCCCTGTGCTGGGGGCTGTCCTGGCTCTG 1998
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 GCCATGTCGAAACCTGCCCTGGACCCTGGAAGGGAGGTTTCATCCTCCCTGTGCTGGGGGCTGTCCTGGCTCTG 1998
Query 1999 CTGTTCCTCCTGCTGGTGCTGCTTTTGTTGGTGAGAAAGAAGCGGAAGATCAAGGAGCCCCTCCTACTCCCAGA 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CTGTTCCTCCTGCTGGTGCTGCTTTTGTTGGTGAGAAAGAAGCGGAAGATCAAGGAGCCCCTCCTACTCCCAGA 2072
Query 2073 AGATGACACCCGTGACAACGTCTTCTACTATGGCGAAGAGGGGGGTGGCGAAGAGGACCAGGACTATGACATCA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 AGATGACACCCGTGACAACGTCTTCTACTATGGCGAAGAGGGGGGTGGCGAAGAGGACCAGGACTATGACATCA 2146
Query 2147 CCCAGCTCCACCGAGGTCTGGAGGCCAGGCCGGAGGTGGTTCTCCGCAATGACGTGGCACCAACCATCATCCCG 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CCCAGCTCCACCGAGGTCTGGAGGCCAGGCCGGAGGTGGTTCTCCGCAATGACGTGGCACCAACCATCATCCCG 2220
Query 2221 ACACCCATGTACCGTCCTAGGCCAGCCAACCCAGATGAAATCGGCAACTTTATAATTGAGGGGAGGGGA----G 2290
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 2221 ACACCCATGTACCGTCCTCGGCCAGCCAACCCAGATGAAATCGGCAACTTTATAATTGA--------GAACCTG 2286
Query 2291 AGAGG-GGCTCACAGAG------------------AGGAAA------TG------------GAGGCTTGCAGCT 2327
| ||| ||||.|||.|| |.||.| || |||| |||||
Sbjct 2287 A-AGGCGGCTAACACAGACCCCACAGCCCCGCCCTACGACACCCTCTTGGTGTTCGACTATGAGG---GCAGC- 2355
Query 2328 GGC-AAGAGGCAG-GNCCCGCCGCTCC----------------------------------------------- 2352
||| ..||.||.| |.|||...|||||
Sbjct 2356 GGCTCCGACGCCGCGTCCCTGAGCTCCCTCACCTCCTCCGCCTCCGACCAAGACCAAGATTACGATTATCTGAA 2429
Query 2353 ---------------------------------------------------------- 2352
Sbjct 2430 CGAGTGGGGCAGCCGCTTCAAGAAGCTGGCAGACATGTACGGTGGCGGGGAGGACGAC 2487