Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_13846
- Subject:
- NM_001383.5
- Aligned Length:
- 1314
- Identities:
- 1088
- Gaps:
- 225
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCGGCGCTGGTCGTATCCGGGGCAGCGGAGCAGGGCGGCCGAGACGGCCCTGGCAGAGGTCGGGCCCCTCG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GGGCCGCGTGGCCAATCAGATCCCCCCTGAGATCCTGAAGAACCCTCAGCTGCAGGCAGCAATCCGGGTCCTGC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CTTCCAACTACAACTTTGAGATCCCCAAGACCATCTGGAGGATCCAACAAGCCCAGGCCAAGAAGGTGGCCTTG 222
Query 1 ---ATGCCGGAAGGCCTCCTCCTCTTTGCCTGTACCATTGTGGATATCTTGGAAAGGTTCACGGAGGCCGAAGT 71
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CAAATGCCGGAAGGCCTCCTCCTCTTTGCCTGTACCATTGTGGATATCTTGGAAAGGTTCACGGAGGCCGAAGT 296
Query 72 GATGGTGATGGGTGACGTGACCTACGGGGCTTGCTGTGTGGATGACTTCACAGCGAGGGCCCTGGGAGCTGACT 145
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GATGGTGATGGGTGACGTGACCTACGGGGCTTGCTGTGTGGATGACTTCACAGCGAGGGCCCTGGGAGCTGACT 370
Query 146 TCTTGGTGCACTACGGCCACAGTTGCCTGATTCCCATGGACACCTCGGCCCAAGACTTCCGGGTGCTGTACGTC 219
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCTTGGTGCACTACGGCCACAGTTGCCTGATTCCCATGGACACCTCGGCCCAAGACTTCCGGGTGCTGTACGTC 444
Query 220 TTTGTGGACATCCGGATAGACACTACACACCTCCTGGACTCTCTCCGCCTCACCTTTCCCCCAGCCACTGCCCT 293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTTGTGGACATCCGGATAGACACTACACACCTCCTGGACTCTCTCCGCCTCACCTTTCCCCCAGCCACTGCCCT 518
Query 294 TGCCCTGGTCAGCACCATTCAGTTTGTGTCGACCTTGCAGGCAGCCGCCCAGGAGCTGAAAGCCGAGTATCGTG 367
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGCCCTGGTCAGCACCATTCAGTTTGTGTCGACCTTGCAGGCAGCCGCCCAGGAGCTGAAAGCCGAGTATCGTG 592
Query 368 TGAGTGTCCCACAGTGCAAGCCCCTGTCCCCTGGAGAGATCCTGGGCTGCACATCCCCCCGACTGTCCAAAGAG 441
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGAGTGTCCCACAGTGCAAGCCCCTGTCCCCTGGAGAGATCCTGGGCTGCACATCCCCCCGACTGTCCAAAGAG 666
Query 442 GTGGAGGCCGTTGTGTATCTTGGAGATGGCCGCTTCCATCTGGAGTCTGTCATGATTGCCAACCCCAATGTCCC 515
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GTGGAGGCCGTTGTGTATCTTGGAGATGGCCGCTTCCATCTGGAGTCTGTCATGATTGCCAACCCCAATGTCCC 740
Query 516 CGCTTACCGGTATGACCCATATAGCAAAGTCCTATCCAGAGAACACTATGACCACCAGCGCATGCAGGCTGCTC 589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CGCTTACCGGTATGACCCATATAGCAAAGTCCTATCCAGAGAACACTATGACCACCAGCGCATGCAGGCTGCTC 814
Query 590 GCCAAGAAGCCATAGCCACTGCCCGCTCAGCTAAGTCCTGGGGCCTTATTCTGGGCACTTTGGGCCGCCAGGGC 663
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GCCAAGAAGCCATAGCCACTGCCCGCTCAGCTAAGTCCTGGGGCCTTATTCTGGGCACTTTGGGCCGCCAGGGC 888
Query 664 AGTCCTAAGATCCTGGAGCACCTGGAATCTCGACTCCGAGCCTTGGGCCTTTCCTTTGTGAGGCTGCTGCTCTC 737
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AGTCCTAAGATCCTGGAGCACCTGGAATCTCGACTCCGAGCCTTGGGCCTTTCCTTTGTGAGGCTGCTGCTCTC 962
Query 738 TGAGATCTTCCCCAGCAAGCTTAGCCTACTTCCCGAGGTGGATGTGTGGGTGCAGGTGGCATGTCCACGTCTCT 811
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGAGATCTTCCCCAGCAAGCTTAGCCTACTTCCTGAGGTGGATGTGTGGGTGCAGGTGGCATGTCCACGTCTCT 1036
Query 812 CCATTGACTGGGGCACAGCCTTCCCCAAGCCGCTGCTGACACCCTATGAGGCGGCCGTGGCTCTGAGGGACATT 885
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCATTGACTGGGGCACAGCCTTCCCCAAGCCGCTGCTGACACCCTATGAGGCGGCCGTGGCTCTGAGGGACATT 1110
Query 886 TCCTGGCAGCAGCCCTACCCGATGGACTTCTACGCTGGCAGCTCCTTGGGGCCCTGGACGGTGAACCACGGCCA 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TCCTGGCAGCAGCCCTACCCGATGGACTTCTACGCTGGCAGCTCCTTGGGGCCCTGGACGGTGAACCACGGCCA 1184
Query 960 GGACCGCCGTCCCCACGCCCCGGGCCGGCCCGCGCGGGGGAAGGTGCAGGAGGGGTCCGCGCGTCCCCCTTCGG 1033
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGACCGCCGTCCCCACGCCCCGGGCCGGCCCGCGCGGGGGAAGGTGCAGGAGGGGTCCGCGCGTCCCCCTTCGG 1258
Query 1034 CCGTGGCTTGCGAGGACTGCAGCTGCAGGGACGAGAAGGTGGCGCCGCTGGCTCCT 1089
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CCGTGGCTTGCGAGGACTGCAGCTGCAGGGACGAGAAGGTGGCGCCGCTGGCTCCT 1314