Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13856
• Subject: XM_017000617.2
• Aligned Length: 2484
• Identities: 2283
• Gaps: 199

Alignment

Query    1  ATGGCTGCGGCGGCCCAGCTCTCTCTGACACAGTTATCAAGTGGGAATCCTGTATATGAAAAATACTATAGACA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTGCGGCGGCCCAGCTCTCTCTGACACAGTTATCAAGTGGGAATCCTGTATATGAAAAATACTATAGACA  74

Query   75  GGTTGATACAGGCAATACTGGAAGGGTGTTGGCTTCTGATGCTGCTGCTTTCCTGAAAAAATCAGGGCTTCCAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGTTGATACAGGCAATACTGGAAGGGTGTTGGCTTCTGATGCTGCTGCTTTCCTGAAAAAATCAGGGCTTCCAG  148

Query  149  ACTTGATACTTGGAAAGATTTGGGATTTAGCCGACACAGATGGCAAAGGTATCCTGAACAAACAAGAATTCTTT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACTTGATACTTGGAAAGATTTGGGATTTAGCCGACACAGATGGCAAAGGTATCCTGAACAAACAAGAATTCTTT  222

Query  223  GTTGCTTTGCGTCTTGTGGCATGTGCCCAGAATGGATTGGAAGTTTCACTAAGTAGTTTGAACCTGGCTGTTCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTTGCTTTGCGTCTTGTGGCATGTGCCCAGAATGGATTGGAAGTTTCACTAAGTAGTTTGAACCTGGCTGTTCC  296

Query  297  TCCACCAAGATTTCATGATACCAGTAGTCCTTTGCTAATCAGTGGAACCTCTGCAGCTGAGCTCCCATGGGCTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCCACCAAGATTTCATGATACCAGTAGTCCTTTGCTAATCAGTGGAACCTCTGCAGCTGAGCTCCCATGGGCTG  370

Query  371  TAAAACCTGAAGATAAGGCCAAATATGATGCAATATTTGATAGTTTAAGCCCAGTGAATGGATTTCTGTCTGGT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TAAAACCTGAAGATAAGGCCAAATATGATGCAATATTTGATAGTTTAAGCCCAGTGAATGGATTTCTGTCTGGT  444

Query  445  GATAAAGTGAAACCAGTGTTGCTCAACTCTAAGTTACCTGTGGATATCCTTGGAAGAGTTTGGGAGTTGAGTGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATAAAGTGAAACCAGTGTTGCTCAACTCTAAGTTACCTGTGGATATCCTTGGAAGAGTTTGGGAGTTGAGTGA  518

Query  519  TATTGACCATGATGGAATGCTTGACAGAGATGAGTTTGCAGTTGCTATGTTTTTGGTATACTGTGCACTGGAGA  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TATTGACCATGATGGAATGCTTGACAGAGATGAGTTTGCAGTTGCCATGTTTTTGGTATACTGTGCACTGGAGA  592

Query  593  AAGAACCTGTGCCAATGTCCTTGCCTCCAGCCTTGGTGCCACCATCTAAGAGAAAAACGTGGGTTGTATCCCCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAGAACCTGTGCCAATGTCCTTGCCTCCAGCCTTGGTGCCACCATCTAAGAGAAAAACGTGGGTTGTATCCCCT  666

Query  667  GCAGAAAAAGCTAAATATGATGAAATCTTCCTGAAAACTGATAAAGATATGGACGGATTTGTGTCTGGATTGGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCAGAAAAAGCTAAATATGATGAAATCTTCCTGAAAACTGATAAAGATATGGACGGATTTGTGTCTGGATTGGA  740

Query  741  GGTCCGTGAAATATTCTTGAAAACAGGTTTACCTTCTACCTTACTAGCCCATATATGGTCATTATGCGACACAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGTCCGTGAAATATTCTTGAAAACAGGTTTACCTTCTACCTTACTAGCCCATATATGGTCATTATGCGACACAA  814

Query  815  AGGACTGTGGGAAGCTTTCAAAGGATCAGTTTGCCTTGGCTTTTCACTTAATCAGTCAGAAGTTAATCAAGGGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGGACTGTGGGAAGCTTTCAAAGGATCAGTTTGCCTTGGCTTTTCACTTAATCAGTCAGAAGTTAATCAAGGGC  888

Query  889  ATTGATCCTCCTCACGTTCTTACTCCTGAAATGATTCCACCATCAGACAGGGCCAGTTTACAAAAGAACATCAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATTGATCCTCCTCACGTTCTTACTCCTGAAATGATTCCACCATCAGACAGGGCCAGTTTACAAAAGAACATCAT  962

Query  963  AGGATCAAGTCCTGTTGCAGATTTCTCTGCTATTAAGGAACTAGATACTCTTAACAATGAAATAGTTGACCTAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGGATCAAGTCCTGTTGCAGATTTCTCTGCTATTAAGGAACTAGATACTCTTAACAATGAAATAGTTGACCTAC  1036

Query 1037  AGAGGGAAAAGAATAATGTGGAACAGGACCTTAAGGAGAAGGAAGATACTATTAAACAGAGGACAAGTGAGGTT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGAGGGAAAAGAATAATGTGGAACAGGACCTTAAGGAGAAGGAAGATACTATTAAACAGAGGACAAGTGAGGTT  1110

Query 1111  CAGGATCTTCAAGATGAAGTTCAAAGGGAGAATACTAATCTGCAAAAACTACAGGCCCAGAAACAGCAGGTACA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGGATCTTCAAGATGAAGTTCAAAGGGAGAATACTAATCTGCAAAAACTACAGGCCCAGAAACAGCAGGTACA  1184

Query 1185  GGAACTCCTTGATGAACTGGATGAGCAGAAAGCCCAGCTGGAGGAGCAACTCAAGGAAGTCAGAAAGAAATGTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGAACTCCTTGATGAACTGGATGAGCAGAAAGCCCAGCTGGAGGAGCAACTCAAGGAAGTCAGAAAGAAATGTG  1258

Query 1259  CTGAGGAGGCCCAACTG---------------------------------------------------------  1275
            |||||||||||||||||                                                         
Sbjct 1259  CTGAGGAGGCCCAACTGATCTCTTCTCTGAAAGCTGAATTAACTAGTCAGGAATCGCAGATCTCCACTTACGAA  1332

Query 1276  --------------------------------------------------------------------------  1275
                                                                                      
Sbjct 1333  GAAGAATTGGCAAAAGCTAGAGAAGAGCTGAGCCGTCTACAGCAAGAAACAGCAGAATTGGAGGAGAGTGTAGA  1406

Query 1276  -------------------------------------------------------------------GCAAGAA  1282
                                                                               |||||||
Sbjct 1407  GTCAGGGAAGGCTCAGTTGGAACCTCTTCAGCAGCACCTACAAGATTCACAACAGGAAATTAGTTCAGCAAGAA  1480

Query 1283  GTAGTCCTGAACTACTGCCTTCTGGTGTGACTGATGAAAATGAGGTGACTACAGCTGTTACTGAAAAAGTTTGT  1356
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GTAGTCCTGAACTACTGCCTTCTGGTGTGACTGATGAAAATGAGGTGACTACAGCTGTTACTGAAAAAGTTTGT  1554

Query 1357  TCTGAACTCGACAATAATAGACATTCAAAAGAGGAAGATCCATTTAATGTAGACTCAAGTTCGCTGACAGGTCC  1430
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TCTGAACTCGACAATAATAGACATTCAAAAGAGGAAGATCCATTTAATGTAGACTCAAGTTCGCTGACAGGTCC  1628

Query 1431  AGTTGCAGATACAAACTTGGATTTTTTCCAGTCTGATCCTTTTGTTGGCAGTGATCCTTTCAAGGATGATCCTT  1504
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGTTGCAGATACAAACTTGGATTTTTTCCAGTCTGATCCTTTTGTTGGCAGTGATCCTTTCAAGGATGATCCTT  1702

Query 1505  TTGGAAAAATCGATCCATTTGGTGGTGATCCTTTCAAAGGTTCAGATCCATTTGCATCAGACTGTTTCTTCAGG  1578
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TTGGAAAAATCGATCCATTTGGTGGTGATCCTTTCAAAGGTTCAGATCCATTTGCATCAGACTGTTTCTTCAGG  1776

Query 1579  CAATCTACTGATCCTTTTGCCACTTCAAGCACTGACCCTTTCAGTGCAGCCAACAATAGCAGTATTACATCGGT  1652
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CAATCTACTGATCCTTTTGCCACTTCAAGCACTGACCCTTTCAGTGCAGCCAACAATAGCAGTATTACATCGGT  1850

Query 1653  AGAAACGTTGAAGCACAATGATCCTTTTGCTCCTGGTGGAACAGTTGTTGCAGCAAGCGATTCAGCCACAGACC  1726
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AGAAACGTTGAAGCACAATGATCCTTTTGCTCCTGGTGGAACAGTTGTTGCAGCAAGCGATTCAGCCACAGACC  1924

Query 1727  CCTTTGCTTCTGTTTTTGGGAATGAATCATTTGGAGGTGGATTTGCTGACTTCAGCACATTGTCAAAGGTCAAC  1800
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CCTTTGCTTCTGTTTTTGGGAATGAATCATTTGGAGGTGGATTTGCTGACTTCAGCACATTGTCAAAGGTCAAC  1998

Query 1801  AATGAAGATCCTTTTCGTTCAGCCACATCGAGCTCTGTCAGCAACGTAGTGATTACAAAAAATGTATTTGAGGA  1874
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AATGAAGATCCTTTTCGTTCAGCCACATCGAGCTCTGTCAGCAACGTAGTGATTACAAAAAATGTATTTGAGGA  2072

Query 1875  AACATCGGTCAAAAGTGAAGATGAACCCCCAGCACTGCCACCAAAGATCGGAACTCCAACAAGACCCTGCCCTC  1948
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  AACATCGGTCAAAAGTGAAGATGAACCCCCAGCACTGCCACCAAAGATCGGAACTCCAACAAGACCCTGCCCTC  2146

Query 1949  TACCACCTGGGAAAAGATCCATCAACAAATTGGATTCTCCTGATCCCTTTAAACTGAATGATCCATTTCAGCCT  2022
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TACCACCTGGGAAAAGATCCATCAACAAATTGGATTCTCCTGATCCCTTTAAACTGAATGATCCATTTCAGCCT  2220

Query 2023  TTCCCAGGCAACGATAGCCCCAAAGAAAAAGATCCTGAAATGTTTTGTGATCCATTCACTTCTGCTACTACCAC  2096
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  TTCCCAGGCAACGATAGCCCCAAAGAAAAAGATCCTGAAATATTTTGTGATCCATTCACTTCTGCTACTACCAC  2294

Query 2097  TACCAATAAAGAGGCTGATCCAAGCAATTTTGCCAACTTCAGTGCTTATCCCTCTGAAGAAGATATGATCGAAT  2170
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TACCAATAAAGAGGCTGATCCAAGCAATTTTGCCAACTTCAGTGCTTATCCCTCTGAAGAAGATATGATCGAAT  2368

Query 2171  GGGCCAAGAGGGAAAGTGAGAGAGAGGAAGAGCAGAGGCTTGCCCGACTAAATCAGCAGGAACAAGAAGACTTA  2244
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  GGGCCAAGAGGGAAAGTGAGAGAGAGGAAGAGCAGAGGCTTGCCCGACTAAATCAGCAGGAACAAGAAGACTTA  2442

Query 2245  GAACTGGCTATTGCACTCAGCAAATCTGAGATAT-AGAAGCA  2285
            |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2443  GAACTGGCTATTGCACTCAGCAAATCTGAGATATCAGAAGCA  2484