Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13856
• Subject: XM_017000619.2
• Aligned Length: 2688
• Identities: 1720
• Gaps: 967

Alignment

Query    1  ATGGCTGCGGCGGCCCAGCTCTCTCTGACACAGTTATCAAGTGGGAATCCTGTATATGAAAAATACTATAGACA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGTTGATACAGGCAATACTGGAAGGGTGTTGGCTTCTGATGCTGCTGCTTTCCTGAAAAAATCAGGGCTTCCAG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ACTTGATACTTGGAAAGATTTGGGATTTAGCCGACACAGATGGCAAAGGTATCCTGAACAAACAAGAATTCTTT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GTTGCTTTGCGTCTTGTGGCATGTGCCCAGAATGGATTGGAAGTTTCACTAAGTAGTTTGAACCTGGCTGTTCC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  TCCACCAAGATTTCATGATACCAGTAGTCCTTTGCTAATCAGTGGAACCTCTGCAGCTGAGCTCCCATGGGCTG  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  TAAAACCTGAAGATAAGGCCAAATATGATGCAATATTTGATAGTTTAAGCCCAGTGAATGGATTTCTGTCTGGT  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  GATAAAGTGAAACCAGTGTTGCTCAACTCTAAGTTACCTGTGGATATCCTTGGAAGAGTTTGGGAGTTGAGTGA  518
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  519  TATTGACCATGATGGAATGCTTGACAGAGATGAGTTTGCAGTTGCTATGTTTTTGGTATACTGTGCACTGGAGA  592
                                                          ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------------------------ATGTTTTTGGTATACTGTGCACTGGAGA  28

Query  593  AAGAACCTGTGCCAATGTCCTTGCCTCCAGCCTTGGTGCCACCATCTAAGAGAAAAACGTGGGTTGTATCCCCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   29  AAGAACCTGTGCCAATGTCCTTGCCTCCAGCCTTGGTGCCACCATCTAAGAGAAAAACGTGGGTTGTATCCCCT  102

Query  667  GCAGAAAAAGCTAAATATGATGAAATCTTCCTGAAAACTGATAAAGATATGGACGGATTTGTGTCTGGATTGGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  103  GCAGAAAAAGCTAAATATGATGAAATCTTCCTGAAAACTGATAAAGATATGGACGGATTTGTGTCTGGATTGGA  176

Query  741  GGTCCGTGAAATATTCTTGAAAACAGGTTTACCTTCTACCTTACTAGCCCATATATGGTCATTATGCGACACAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  177  GGTCCGTGAAATATTCTTGAAAACAGGTTTACCTTCTACCTTACTAGCCCATATATGGTCATTATGCGACACAA  250

Query  815  AGGACTGTGGGAAGCTTTCAAAGGATCAGTTTGCCTTGGCTTTTCACTTAATCAGTCAGAAGTTAATCAAGGGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  251  AGGACTGTGGGAAGCTTTCAAAGGATCAGTTTGCCTTGGCTTTTCACTTAATCAGTCAGAAGTTAATCAAGGGC  324

Query  889  ATTGATCCTCCTCACGTTCTTACTCCTGAAATGATTCCACCATCAGACAGGGCCAGTTTACAAAAGAACATCAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  325  ATTGATCCTCCTCACGTTCTTACTCCTGAAATGATTCCACCATCAGACAGGGCCAGTTTACAAAAGAACATCAT  398

Query  963  AGGATCAAGTCCTGTTGCAGATTTCTCTGCTATTAAGGAACTAGATACTCTTAACAATGAAATAGTTGACCTAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  399  AGGATCAAGTCCTGTTGCAGATTTCTCTGCTATTAAGGAACTAGATACTCTTAACAATGAAATAGTTGACCTAC  472

Query 1037  AGAGGGAAAAGAATAATGTGGAACAGGACCTTAAGGAGAAGGAAGATACTATTAAACAGAGGACAAGTGAGGTT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  473  AGAGGGAAAAGAATAATGTGGAACAGGACCTTAAGGAGAAGGAAGATACTATTAAACAGAGGACAAGTGAGGTT  546

Query 1111  CAGGATCTTCAAGATGAAGTTCAAAGGGAGAATACTAATCTGCAAAAACTACAGGCCCAGAAACAGCAGGTACA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  547  CAGGATCTTCAAGATGAAGTTCAAAGGGAGAATACTAATCTGCAAAAACTACAGGCCCAGAAACAGCAGGTACA  620

Query 1185  GGAACTCCTTGATGAACTGGATGAGCAGAAAGCCCAGCTGGAGGAGCAACTCAAGGAAGTCAGAAAGAAATGTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  621  GGAACTCCTTGATGAACTGGATGAGCAGAAAGCCCAGCTGGAGGAGCAACTCAAGGAAGTCAGAAAGAAATGTG  694

Query 1259  CTGAGGAGGCCCAACTG---------------------------------------------------------  1275
            |||||||||||||||||                                                         
Sbjct  695  CTGAGGAGGCCCAACTGATCTCTTCTCTGAAAGCTGAATTAACTAGTCAGGAATCGCAGATCTCCACTTACGAA  768

Query 1276  --------------------------------------------------------------------------  1275
                                                                                      
Sbjct  769  GAAGAATTGGCAAAAGCTAGAGAAGAGCTGAGCCGTCTACAGCAAGAAACAGCAGAATTGGAGGAGAGTGTAGA  842

Query 1276  --------------------------------------------------------------------------  1275
                                                                                      
Sbjct  843  GTCAGGGAAGGCTCAGTTGGAACCTCTTCAGCAGCACCTACAAGATTCACAACAGGAAATTAGTTCAATGCAAA  916

Query 1276  --------------------------------------------------------------------------  1275
                                                                                      
Sbjct  917  TGAAACTGATGGAAATGAAAGATTTGGAAAATCATAATAGTCAGTTAAATTGGTGCAGTAGCCCACACAGCATT  990

Query 1276  --------------------------------------------------------------------------  1275
                                                                                      
Sbjct  991  CTTGTAAACGGAGCTACAGATTATTGCAGCCTCAGCACCAGCAGCAGTGAAACAGCCAACCTTAATGAACATGT  1064

Query 1276  -------------------------------------------------GCAAGAAGTAGTCCTGAACTACTGC  1300
                                                             |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1065  TGAAGGCCAGAGCAACCTAGAGTCTGAGCCCATACACCAGGAATCTCCAGCAAGAAGTAGTCCTGAACTACTGC  1138

Query 1301  CTTCTGGTGTGACTGATGAAAATGAGGTGACTACAGCTGTTACTGAAAAAGTTTGTTCTGAACTCGACAATAAT  1374
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1139  CTTCTGGTGTGACTGATGAAAATGAGGTGACTACAGCTGTTACTGAAAAAGTTTGTTCTGAACTCGACAATAAT  1212

Query 1375  AGACATTCAAAAGAGGAAGATCCATTTAATGTAGACTCAAGTTCGCTGACAGGTCCAGTTGCAGATACAAACTT  1448
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1213  AGACATTCAAAAGAGGAAGATCCATTTAATGTAGACTCAAGTTCGCTGACAGGTCCAGTTGCAGATACAAACTT  1286

Query 1449  GGATTTTTTCCAGTCTGATCCTTTTGTTGGCAGTGATCCTTTCAAGGATGATCCTTTTGGAAAAATCGATCCAT  1522
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1287  GGATTTTTTCCAGTCTGATCCTTTTGTTGGCAGTGATCCTTTCAAGGATGATCCTTTTGGAAAAATCGATCCAT  1360

Query 1523  TTGGTGGTGATCCTTTCAAAGGTTCAGATCCATTTGCATCAGACTGTTTCTTCAGGCAATCTACTGATCCTTTT  1596
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1361  TTGGTGGTGATCCTTTCAAAGGTTCAGATCCATTTGCATCAGACTGTTTCTTCAGGCAATCTACTGATCCTTTT  1434

Query 1597  GCCACTTCAAGCACTGACCCTTTCAGTGCAGCCAACAATAGCAGTATTACATCGGTAGAAACGTTGAAGCACAA  1670
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1435  GCCACTTCAAGCACTGACCCTTTCAGTGCAGCCAACAATAGCAGTATTACATCGGTAGAAACGTTGAAGCACAA  1508

Query 1671  TGATCCTTTTGCTCCTGGTGGAACAGTTGTTGCAGCAAGCGATTCAGCCACAGACCCCTTTGCTTCTGTTTTTG  1744
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1509  TGATCCTTTTGCTCCTGGTGGAACAGTTGTTGCAGCAAGCGATTCAGCCACAGACCCCTTTGCTTCTGTTTTTG  1582

Query 1745  GGAATGAATCATTTGGAGGTGGATTTGCTGACTTCAGCACATTGTCAAAGGTCAACAATGAAGATCCTTTTCGT  1818
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1583  GGAATGAATCATTTGGAGGTGGATTTGCTGACTTCAGCACATTGTCAAAGGTCAACAATGAAGATCCTTTTCGT  1656

Query 1819  TCAGCCACATCGAGCTCTGTCAGCAACGTAGTGATTACAAAAAATGTATTTGAGGAAACATCGGTCAAAAGTGA  1892
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1657  TCAGCCACATCGAGCTCTGTCAGCAACGTAGTGATTACAAAAAATGTATTTGAGGAAACATCGGTCAAAAGTGA  1730

Query 1893  AGATGAACCCCCAGCACTGCCACCAAAGATCGGAACTCCAACAAGACCCTGCCCTCTACCACCTGGGAAAAGAT  1966
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1731  AGATGAACCCCCAGCACTGCCACCAAAGATCGGAACTCCAACAAGACCCTGCCCTCTACCACCTGGGAAAAGAT  1804

Query 1967  CCATCAACAAATTGGATTCTCCTGATCCCTTTAAACTGAATGATCCATTTCAGCCTTTCCCAGGCAACGATAGC  2040
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1805  CCATCAACAAATTGGATTCTCCTGATCCCTTTAAACTGAATGATCCATTTCAGCCTTTCCCAGGCAACGATAGC  1878

Query 2041  CCCAAAGAAAAAGATCCTGAAATGTTTTGTGATCCATTCACTTCTGCTACTACCACTACCAATAAAGAGGCTGA  2114
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1879  CCCAAAGAAAAAGATCCTGAAATATTTTGTGATCCATTCACTTCTGCTACTACCACTACCAATAAAGAGGCTGA  1952

Query 2115  TCCAAGCAATTTTGCCAACTTCAGTGCTTATCCCTCTGAAGAAGATATGATCGAATGGGCCAAGAGGGAAAGTG  2188
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1953  TCCAAGCAATTTTGCCAACTTCAGTGCTTATCCCTCTGAAGAAGATATGATCGAATGGGCCAAGAGGGAAAGTG  2026

Query 2189  AGAGAGAGGAAGAGCAGAGGCTTGCCCGACTAAATCAGCAGGAACAAGAAGACTTAGAACTGGCTATTGCACTC  2262
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2027  AGAGAGAGGAAGAGCAGAGGCTTGCCCGACTAAATCAGCAGGAACAAGAAGACTTAGAACTGGCTATTGCACTC  2100

Query 2263  AGCAAATCTGAGATAT-AGAAGCA  2285
            |||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2101  AGCAAATCTGAGATATCAGAAGCA  2124