Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_13864
- Subject:
- XM_006512545.3
- Aligned Length:
- 2680
- Identities:
- 1599
- Gaps:
- 933
Alignment
Query 1 ATGAAGATTATTTTCCCGATTCTAAGTAATCCAGTCTTCAGGCGCACCGTTAAACTCCTGCTCTGTTTACTGTG 74
|||||||||||||.|||..||.|||||||||.|||||||||.|||.||.|||||.||||||||||.||..||||
Sbjct 1 ATGAAGATTATTTCCCCAGTTTTAAGTAATCTAGTCTTCAGTCGCTCCATTAAAGTCCTGCTCTGCTTGTTGTG 74
Query 75 GATTGGATATTCTCAAGGAACCACACATGTATTAAGATTTGGTGGTATTTTTGAATATGTGGAATCTGGCCCAA 148
|||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 75 GATCGGATATTCGCAAGGAACCACACATGTGTTAAGATTCGGTGGTATATTTGAATATGTGGAATCTGGCCCTA 148
Query 149 TGGGAGCTGAGGAACTTGCATTCAGATTTGCTGTGAACACAATTAACAGAAACAGAACATTGCTACCCAATACT 222
||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||..|||||||||||||.
Sbjct 149 TGGGAGCTGAAGAACTTGCATTCAGATTTGCTGTGAATACAATCAACAGGAACAGGACTCTGCTACCCAATACC 222
Query 223 ACCCTTACCTATGATACCCAGAAGATAAACCTTTATGATAGTTTTGAAGCATCCAAGAAAGCCTGTGATCAGCT 296
||..|.||.||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 223 ACGTTAACATATGATACACAGAAGATCAATCTCTATGACAGTTTTGAAGCATCTAAGAAAGCTTGTGATCAGCT 296
Query 297 GTCTCTTGGGGTGGCTGCCATCTTCGGGCCTTCACACAGCTCATCAGCAAACGCAGTGCAGTCCATCTGCAATG 370
|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct 297 GTCTCTTGGGGTGGCTGCCATCTTCGGTCCTTCACACAGTTCATCAGCAAATGCTGTTCAGTCCATCTGCAATG 370
Query 371 CTCTGGGAGTTCCCCACATACAGACCCGCTGGAAGCACCAGGTGTCAGACAACAAAGATTCCTTCTATGTCAGT 444
|||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTCTGGGGGTTCCTCACATACAGACCCGCTGGAAGCACCAGGTGTCAGACAATAAGGATTCCTTCTATGTCAGT 444
Query 445 CTCTACCCAGACTTCTCTTCACTCAGCCGTGCCATTTTAGACCTGGTGCAGTTTTTCAAGTGGAAAACCGTCAC 518
||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||..|||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 445 CTCTACCCAGACTTCTCTTCCCTCAGCCGTGCCATCTTGGATTTGGTGCAGTTTTTTAAGTGGAAAACTGTCAC 518
Query 519 GGTTGTGTATGATGACAGCACTGGTCTCATTCGTTTGCAAGAGCTCATCAAAGCTCCATCAAGGTATAATCTTC 592
.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 519 AGTTGTGTATGACGACAGCACTGGTCTCATTCGCTTGCAAGAGCTCATCAAAGCTCCATCAAGGTACAATCTTC 592
Query 593 GACTCAAAATTCGTCAGTTACCTGCTGATACAAAGGATGCAAAACCCTTACTAAAAGAAATGAAAAGAGGCAAG 666
||||.||||||||||||.|.||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.|||||.||.||||||
Sbjct 593 GACTTAAAATTCGTCAGCTGCCAGCTGATACAAAAGATGCAAAGCCTTTGCTGAAAGAGATGAAGAGGGGCAAG 666
Query 667 GAGTTTCATGTAATCTTTGATTGTAGCCATGAAATGGCAGCAGGCATTTTAAAACAGGCATTAGCTATGGGAAT 740
|||||.||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAGTTCCACGTGATCTTCGACTGCAGCCATGAAATGGCAGCAGGCATTTTAAAGCAGGCATTAGCTATGGGAAT 740
Query 741 GATGACAGAATACTATCATTATATCTTTACCACTCTGGACCTCTTTGCTCTTGATGTTGAGCCCTACCGATACA 814
|||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct 741 GATGACAGAATACTACCACTATATATTTACGACTCTGGACCTCTTCGCTCTTGATGTGGAGCCCTACAGATACA 814
Query 815 GTGGTGTTAACATGACAGGGTTCAGAATATTAAATACAGAAAATACCCAAGTCTCCTCCATCATTGAAAAGTGG 888
||||.||.||.||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 815 GTGGCGTAAATATGACAGGGTTCAGAATACTAAATACAGAGAATACCCAAGTCTCCTCCATCATCGAGAAGTGG 888
Query 889 TCGATGGAACGATTGCAGGCACCTCCGAAACCCGATTCAGGTTTGCTGGATGGATTTATGACGACTGATGCTGC 962
|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TCGATGGAACGGTTACAGGCACCTCCAAAACCTGACTCAGGTTTGCTGGATGGATTTATGACGACTGATGCTGC 962
Query 963 TCTAATGTATGATGCTGTGCATGTGGTGTCTGTGGCCGTTCAACAGTTTCCCCAGATGACAGTCAGTTCCTTGC 1036
|||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 963 TCTGATGTATGATGCAGTGCACGTTGTGTCTGTAGCTGTCCAACAGTTTCCCCAGATGACAGTCAGCTCCTTGC 1036
Query 1037 AGTGTAATCGACATAAACCCTGGCGCTTCGGGACCCGCTTTATGAGTCTAATTAAAGAGGCACATTGGGAAGGC 1110
|.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1037 AATGCAATCGACACAAACCCTGGCGCTTTGGGACTCGCTTCATGAGCCTAATTAAAGAGGCTCATTGGGAAGGT 1110
Query 1111 CTCACAGGCAGAATAACTTTCAACAAAACCAATGGCTTGAGAACAGATTTTGATTTGGATGTGATCAGTCTGAA 1184
||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1111 CTTACAGGCAGAATTACATTTAACAAAACCAATGGATTGCGAACAGATTTTGATTTGGATGTGATCAGTCTCAA 1184
Query 1185 GGAAGAAGGTCTAGAAAAGATTGGAACGTGGGATCCAGCCAGTGGCCTGAATATGACAGAAAGTCA-AAAGGGA 1257
||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1185 GGAAGAAGGTCTGGAGAAGATTGGGACTTGGGATCCATCCAGTGGCCTGAATATGACAGAAAGTCAGAAAGGG- 1257
Query 1258 AAGCCAGCGAACATCACAGATTCCTTATCCAATCGTTCTTTGATTGTTACCACCATTTTGGAAGAGCCTTATGT 1331
||||||||.||.||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1258 AAGCCAGCAAATATTACAGATTCATTGTCTAATCGTTCTTTGATTGTTACCACCATTTTGGAAGAACCATATGT 1331
Query 1332 CCTTTTTAAGAAGTCTGACAAACCTCTCTATGGTAATGATCGATTTGAAGGCTATTGCATTGATCTCCTCAGAG 1405
|||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||..|||
Sbjct 1332 CCTGTTTAAGAAGTCTGACAAACCTCTCTATGGGAATGATCGATTTGAAGGCTACTGTATTGATCTTCTACGAG 1405
Query 1406 AGTTATCTACAATCCTTGGCTTTACATATGAAATTAGACTTGTGGAAGATGGGAAATATGGAGCCCAGGATGAT 1479
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406 AGTTATCTACAATCCTTGGCTTTACATATGAAATTAGGCTTGTGGAGGATGGGAAATATGGAGCCCAGGATGAT 1479
Query 1480 GCCAATGGACAATGGAATGGAATGGTTCGTGAACTAATTGATCATAAAGCTGACCTTGCAGTTGCTCCACTGGC 1553
|..|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480 GTGAATGGACAATGGAATGGAATGGTTCGTGAGCTAATTGATCATAAAGCTGACCTTGCAGTTGCTCCACTGGC 1553
Query 1554 TATTACCTATGTTCGAGAGAAGGTCATCGACTTTTCCAAGCCCTTTATGACACTTGGAATAAGTATTTTGTACC 1627
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554 TATTACCTATGTTCGTGAGAAGGTCATCGACTTTTCAAAGCCGTTTATGACTCTTGGAATAAGTATTTTGTACC 1627
Query 1628 GCAAGCCCAATGGTACAAACCCAGGCGTCTTCTCCTTCCTGAATCCTCTCTCCCCTGATATCTGGATGTATATT 1701
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628 GCAAGCCCAATGGTACAAACCCAGGCGTCTTCTCCTTCCTGAATCCTCTCTCCCCTGATATCTGGATGTATATT 1701
Query 1702 CTGCTGGCTTACTTGGGTGTCAGTTGTGTGCTCTTTGT-ATAGCCAGG-------------------------- 1748
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1702 CTGCTGGCTTACTTGGGTGTCAGTTGTGTGCTCTTTGTCATAGCCAGGTTTAGTCCCTATGAGTGGTATAATCC 1775
Query 1749 -------------------------------------------------------------------------- 1748
Sbjct 1776 ACACCCTTGCAACCCTGACTCAGACGTGGTGGAAAACAATTTTACCTTGCTAAATAGTTTCTGGTTTGGAGTTG 1849
Query 1749 -------------------------------------------------------------------------- 1748
Sbjct 1850 GAGCTCTCATGCAGCAAGGTTCTGAGCTCATGCCCAAAGCACTCTCCACCAGGATAGTGGGAGGCATTTGGTGG 1923
Query 1749 -------------------------------------------------------------------------- 1748
Sbjct 1924 TTTTTCACACTTATCATCATTTCTTCGTATACCGCTAACCTAGCCGCCTTTCTGACCGTGGAACGCATGGAGTC 1997
Query 1749 -------------------------------------------------------------------------- 1748
Sbjct 1998 GCCTATTGACTCTGCTGACGATTTAGCTAAGCAAACCAAGATAGAATATGGAGCAGTAGAGGACGGCGCAACCA 2071
Query 1749 -------------------------------------------------------------------------- 1748
Sbjct 2072 TGACGTTTTTCAAGAAATCAAAAATCTCAACGTATGATAAAATGTGGGCATTTATGAGCAGCAGGAGACAGTCT 2145
Query 1749 -------------------------------------------------------------------------- 1748
Sbjct 2146 GTGCTTGTCAAAAGCAATGAGGAAGGGATTCAACGTGTCCTCACCTCCGATTATGCTTTCTTAATGGAGTCAAC 2219
Query 1749 -------------------------------------------------------------------------- 1748
Sbjct 2220 GACCATCGAGTTTGTTACCCAGCGGAACTGTAACCTCACGCAGATTGGTGGCCTTATAGACTCCAAAGGCTATG 2293
Query 1749 -------------------------------------------------------------------------- 1748
Sbjct 2294 GTGTTGGCACTCCCATGGGTTCTCCATATCGAGACAAAATCACCATAGCCATTCTTCAGCTGCAGGAGGAAGGC 2367
Query 1749 -------------------------------------------------------------------------- 1748
Sbjct 2368 AAGCTGCACATGATGAAGGAGAAGTGGTGGCGAGGCAATGGCTGCCCAGAGGAGGAGAGCAAAGAGGCCAGTGC 2441
Query 1749 -------------------------------------------------------------------------- 1748
Sbjct 2442 TCTAGGGGTGCAGAATATTGGTGGTATCTTCATTGTCCTGGCAGCCGGCTTGGTGCTCTCAGTTTTTGTGGCAG 2515
Query 1749 -------------------------------------------------------------------------- 1748
Sbjct 2516 TGGGAGAGTTTTTATACAAATCCAAAAAAAACGCTCAATTGGAAAAGAAAGTCAAGACTATCTTACCTCAAGAC 2589
Query 1749 -------------------------------------------------------------------------- 1748
Sbjct 2590 AATGTATTCCTTCCCCTTTTGGAATCAGATTTTTCCATTTCTACCGTGTTGTCATCATCACCATCTTCATCATC 2663
Query 1749 ---------------- 1748
Sbjct 2664 ATTATCATCATGTTGT 2679
