Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13913
• Subject: XM_017001374.2
• Aligned Length: 3183
• Identities: 2107
• Gaps: 1072

Alignment

Query    1  ATGCCGGGGCCCCGGCGCCCCGCTGGCTCCCGCCTGCGCCTGCTCCTGCTCCTGCTGCTGCCGCCGCTGCTGCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCGGGGCCCCGGCGCCCCGCTGGCTCCCGCCTGCGCCTGCTCCTGCTCCTGCTGCTGCCGCCGCTGCTGCT  74

Query   75  GCTGCTCCGGGGCAGCCACGCGGGCAACCTGACGGTAGCCGTGGTACTGCCGCTGGCCAATACCTCGTACCCCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCTGCTCCGGGGCAGCCACGCGGGCAACCTGACGGTAGCCGTGGTACTGCCGCTGGCCAATACCTCGTACCCCT  148

Query  149  GGTCGTGGGCGCGCGTGGGACCCGCCGTGGAGCTGGCCCTGGCCCAGGTGAAGGCGCGCCCCGACTTGCTGCCG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGTCGTGGGCGCGCGTGGGACCCGCCGTGGAGCTGGCCCTGGCCCAGGTGAAGGCGCGCCCCGACTTGCTGCCG  222

Query  223  GGCTGGACGGTCCGCACGGTGCTGGGCAGCAGCGAAAACGCGCTGGGCGTCTGCTCCGACACCGCAGCGCCCCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGCTGGACGGTCCGCACGGTGCTGGGCAGCAGCGAAAACGCGCTGGGCGTCTGCTCCGACACCGCAGCGCCCCT  296

Query  297  GGCCGCGGTGGACCTCAAGTGGGAGCACAACCCCGCTGTGTTCCTGGGCCCCGGCTGCGTGTACGCCGCCGCCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGCCGCGGTGGACCTCAAGTGGGAGCACAACCCCGCTGTGTTCCTGGGCCCCGGCTGCGTGTACGCCGCCGCCC  370

Query  371  CAGTGGGGCGCTTCACCGCGCACTGGCGGGTCCCGCTGCTGACCGCCGGCGCCCCGGCGCTGGGCTTCGGTGTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAGTGGGGCGCTTCACCGCGCACTGGCGGGTCCCGCTGCTGACCGCCGGCGCCCCGGCGCTGGGCTTCGGTGTC  444

Query  445  AAGGACGAGTATGCGCTGACCACCCGCGCGGGGCCCAGCTACGCCAAGCTGGGGGACTTCGTGGCGGCGCTGCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGGACGAGTATGCGCTGACCACCCGCGCGGGGCCCAGCTACGCCAAGCTGGGGGACTTCGTGGCGGCGCTGCA  518

Query  519  CCGACGGCTGGGCTGGGAGCGCCAAGCGCTCATGCTCTACGCCTACAGGCCGGGTGACGAAGAGCACTGCTTCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCGACGGCTGGGCTGGGAGCGCCAAGCGCTCATGCTCTACGCCTACCGGCCGGGTGACGAAGAGCACTGCTTCT  592

Query  593  TCCTCGTGGAGGGGCTGTTCATGCGGGTCCGCGACCGCCTCAATATTACGGTGGACCACCTGGAGTTCGCCGAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCCTCGTGGAGGGGCTGTTCATGCGGGTCCGCGACCGCCTCAATATTACGGTGGACCACCTGGAGTTCGCCGAG  666

Query  667  GACGACCTCAGCCACTACACCAGGCTGCTGCGGACCATGCCGCGCAAAGGCCGAGTTATCTACATCTGCAGCTC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GACGACCTCAGCCACTACACCAGGCTGCTGCGGACCATGCCGCGCAAAGGCCGAGTTATCTACATCTGCAGCTC  740

Query  741  CCCTGATGCCTTCAGAACCCTCATGCTCCTGGCCCTGGAAGCTGGCTTGTGTGGGGAGGACTACGTTTTCTTCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCCTGATGCCTTCAGAACCCTCATGCTCCTGGCCCTGGAAGCTGGCTTGTGTGGGGAGGACTACGTTTTCTTCC  814

Query  815  ACCTGGATATCTTTGGGCAAAGCCTGCAAGGTGGACAGGGCCCTGCTCCCCGCAGGCCCTGGGAGAGAGGGGAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACCTGGATATCTTTGGGCAAAGCCTGCAAGGTGGACAGGGCCCTGCTCCCCGCAGGCCCTGGGAGAGAGGGGAT  888

Query  889  GGGCAGGATGTCAGTGCCCGCCAGGCCTTTCAGGCTGCCAAAATCATTACATATAAAGACCCAGATAATCCCGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGGCAGGATGTCAGTGCCCGCCAGGCCTTTCAGGCTGCCAAAATCATTACATATAAAGACCCAGATAATCCCGA  962

Query  963  GTACTTGGAATTCCTGAAGCAGTTAAAACACCTGGCCTATGAGCAGTTCAACTTCACCATGGAGGATGTCCTGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  963  GTACTTGGAATTCCTGAAGCAGTTAAAACACCTGGCCTATGAGCAGTTCAACTTCACCATGGAGGATGGCCTGG  1036

Query 1037  TGAACACCATCCCAGCATCCTTCCACGACGGGCTCCTGCTCTATATCCAGGCAGTGACGGAGACTCTGGCACAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGAACACCATCCCAGCATCCTTCCACGACGGGCTCCTGCTCTATATCCAGGCAGTGACGGAGACTCTGGCACAT  1110

Query 1111  GGGGGAACTGTTACTGATGGGGAGAACATCACTCAGCGGATGTGGAACCGAAGCTTTCAAGGTGTGACAGGATA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGGGGAACTGTTACTGATGGGGAGAACATCACTCAGCGGATGTGGAACCGAAGCTTTCAAGGTGTGACAGGATA  1184

Query 1185  CCTGAAAATTGATAGCAGTGGCGATCGGGAAACAGACTTCTCCCTCTGGGATATGGATCCCGAGAATGGTGCCT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCTGAAAATTGATAGCAGTGGCGATCGGGAAACAGACTTCTCCCTCTGGGATATGGATCCCGAGAATGGTGCCT  1258

Query 1259  TCAGGGTTGTACTGAACTACAATGGGACTTCCCAAGAGCTGGTGGCTGTGTCGGGGCGCAAACTGAACTGGCCC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCAGGGTTGTACTGAACTACAATGGGACTTCCCAAGAGCTGGTGGCTGTGTCGGGGCGCAAACTGAACTGGCCC  1332

Query 1333  CTGGGGTACCCTCCTCCTGACATCCCCAAATGTGGCTTTGACAACGAAGACCCAGCATGCAACCAAGATCACCT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTGGGGTACCCTCCTCCTGACATCCCCAAATGTGGCTTTGACAACGAAGACCCAGCATGCAACCAAGATCACCT  1406

Query 1407  TTCCACCCTGGAGGTGCTGGCTTTGGTGGGCAGCCTCTCCTTGCTCGGCATTCTGATTGTCTCCTTCTTCATAT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TTCCACCCTGGAGGTGCTGGCTTTGGTGGGCAGCCTCTCCTTGCTCGGCATTCTGATTGTCTCCTTCTTCATAT  1480

Query 1481  ACAGGAAGATGCAGCTGGAGAAGGAACTGGCCTCGGAGCTGTGGCGGGTGCGCTGGGAGGACGTTGAGCCCAGT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACAGGAAGATGCAGCTGGAGAAGGAACTGGCCTCGGAGCTGTGGCGGGTGCGCTGGGAGGACGTTGAGCCCAGT  1554

Query 1555  AGCCTTGAGAGGCACCTGCGGAGTGCAGGCAGCCGGCTGACCCTGAGCGGGAGAGGCTCCAATTACGGCTCCCT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AGCCTTGAGAGGCACCTGCGGAGTGCAGGCAGCCGGCTGACCCTGAGCGGGAGAGGCTCCAATTACGGCTCCCT  1628

Query 1629  GCTAACCACAGAGGGCCAGTTCCAAGTCTTTGCCAAGACAGCATATTATAAGGGCAACCTCGTGGCTGTGAAAC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCTAACCACAGAGGGCCAGTTCCAAGTCTTTGCCAAGACAGCATATTATAAGGGCAACCTCGTGGCTGTGAAAC  1702

Query 1703  GTGTGAACCGTAAACGCATTGAGCTGACACGAAAAGTCCTGTTTGAACTGAAGCATATGCGGGATGTGCAGAAT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GTGTGAACCGTAAACGCATTGAGCTGACACGAAAAGTCCTGTTTGAACTGAAGCATATGCGGGATGTGCAGAAT  1776

Query 1777  GAACACCTGACCAGGTTTGTGGGAGCCTGCACCGACCCCCCCAATATCTGCATCCTCACAGAGTACTGTCCCCG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GAACACCTGACCAGGTTTGTGGGAGCCTGCACCGACCCCCCCAATATCTGCATCCTCACAGAGTACTGTCCCCG  1850

Query 1851  TGGGAGCCTGCAGGACATTCTGGAGAATGAGAGCATCACCCTGGACTGGATGTTCCGGTACTCACTCACCAATG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TGGGAGCCTGCAGGACATTCTGGAGAATGAGAGCATCACCCTGGACTGGATGTTCCGGTACTCACTCACCAATG  1924

Query 1925  ACATCGTCAAGGGCATGCTGTTTCTACACAATGGGGCTATCTGTTCCCATGGGAACCTCAAGTCATCCAACTGC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ACATCGTCAAGGGCATGCTGTTTCTACACAATGGGGCTATCTGTTCCCATGGGAACCTCAAGTCATCCAACTGC  1998

Query 1999  GTGGTAGATGGGCGCTTTGTGCTCAAGATCACCGACTATGGGCTGGAGAGCTTCAGGGACCTGGACCCAGAGCA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GTGGTAGATGGGCGCTTTGTGCTCAAGATCACCGACTATGGGCTGGAGAGCTTCAGGGACCTGGACCCAGAGCA  2072

Query 2073  AGGACACACCGTTTATGCCAAAAAGCTGTGGACGGC-CCCTGAGCTCCTGCGAATGGCTTCACCCCCTGTGCGG  2145
            ||||||||||||||||||||     ||.||   ||| ||||.| |||        ||                 
Sbjct 2073  AGGACACACCGTTTATGCCA-----CTTTG---GGCTCCCTCA-CTC--------GG-----------------  2112

Query 2146  GGCTCCCAGGCTGGTGACGTATACAGCTTTGGGATCATCCTTCAGGAGATTGCCCTGAGGAGTGGGGTCTTCCA  2219
                                                                                      
Sbjct 2113  --------------------------------------------------------------------------  2112

Query 2220  CGTGGAAGGTTTGGACCTGAGCCCCAAAGAGATCATCGAGCGGGTGACTCGGGGTGAGCAGCCCCCCTTCCGGC  2293
                                                                                      
Sbjct 2113  --------------------------------------------------------------------------  2112

Query 2294  CCTCCCTGGCCCTGCAGAGTCACCTGGAGGAGTTGGGGCTGCTCATGCAGCGGTGCTGGGCTGAGGACCCACAG  2367
                                                                                      
Sbjct 2113  --------------------------------------------------------------------------  2112

Query 2368  GAGAGGCCACCATTCCAGCAGATCCGCCTGACGTTGCGCAAATTTAACAGGGAGAACAGCAGCAACATCCTGGA  2441
                                                                                      
Sbjct 2113  --------------------------------------------------------------------------  2112

Query 2442  CAACCTGCTGTCCCGCATGGAGCAGTACGCGAACAATCTGGAGGAACTGGTGGAGGAGCGGACCCAGGCATACC  2515
                                                                                      
Sbjct 2113  --------------------------------------------------------------------------  2112

Query 2516  TGGAGGAGAAGCGCAAGGCTGAGGCCCTGCTCTACCAGATCCTGCCTCACTCAGTGGCTGAGCAGCTGAAGCGT  2589
                                                                                      
Sbjct 2113  --------------------------------------------------------------------------  2112

Query 2590  GGGGAGACGGTGCAGGCCGAAGCCTTTGACAGTGTTACCATCTACTTCAGTGACATTGTGGGTTTCACAGCGCT  2663
                                                                                      
Sbjct 2113  --------------------------------------------------------------------------  2112

Query 2664  GTCGGCGGAGAGCACGCCCATGCAGGTGGTGACCCTGCTCAATGACCTGTACACTTGCTTTGATGCTGTCATAG  2737
                                                                                      
Sbjct 2113  --------------------------------------------------------------------------  2112

Query 2738  ACAACTTTGATGTGTACAAGGTGGAGACAATTGGCGATGCCTACATGGTGGTGTCAGGGCTCCCTGTGCGGAAC  2811
                                                                                      
Sbjct 2113  --------------------------------------------------------------------------  2112

Query 2812  GGGCGGCTACACGCCTGCGAGGTAGCCCGCATGGCCCTGGCACTGCTGGATGCTGTGCGCTCCTTCCGAATCCG  2885
                                                                                      
Sbjct 2113  --------------------------------------------------------------------------  2112

Query 2886  CCACCGGCCCCAGGAGCAGCTGCGCTTGCGCATTGGCATCCACACAGGACCTGTGTGTGCTGGAGTGGTGGGAC  2959
                                                                                      
Sbjct 2113  --------------------------------------------------------------------------  2112

Query 2960  TGAAGATGCCCCGTTACTGTCTCTTTGGGGATACAGTCAACACAGCCTCAAGAATGGAGTCTAATGGGGAAGCC  3033
                                                                                      
Sbjct 2113  --------------------------------------------------------------------------  2112

Query 3034  CTGAAGATCCACTTGTCTTCTGAGACCAAGGCTGTCCTGGAGGAGTTTGGTGGTTTCGAGCTGGAGCTTCGAGG  3107
                                                                                      
Sbjct 2113  --------------------------------------------------------------------------  2112

Query 3108  GGATGTAGAAATGAAGGGCAAAGGCAAGGTTCGGACCTACTGGCTCCTTGGGGAGAGGGGGAGTAGCCCCGAGG  3181
                                                                                      
Sbjct 2113  --------------------------------------------------------------------------  2112

Query 3182  C  3182
             
Sbjct 2113  -  2112