Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_13957
- Subject:
- XM_017004766.2
- Aligned Length:
- 1457
- Identities:
- 1280
- Gaps:
- 169
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAGCATTGCTTTCCTGGACCCAGGAAACATCGAGTCAGATCTTCAGGCTGGCGCCGTGGCGGGATTCAAACT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TCTCTGGGTGCTGCTCTGGGCCACCGTGTTGGGCTTGCTCTGCCAGCGACTGGCTGCACGTCTGGGCGTGGTGA 148
Query 1 -----------ATGGTGCGATGTCAGCTCACTGCAACCTCTACCTCCC--AGGTGCCCCGCACCGTCCTCTGGC 61
.||| ||||.|| ||||.|.||||||..||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CAGGCAAGGACTTGG-GCGAGGT-------CTGCCATCTCTACTACCCTAAGGTGCCCCGCACCGTCCTCTGGC 214
Query 62 TGACCATCGAGCTAGCCATTGTGGGCTCCGACATGCAGGAAGTCATCGGCACGGCCATTGCATTCAATCTGCTC 135
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 215 TGACCATCGAGCTAGCCATTGTGGGCTCCGACATGCAGGAAGTCATCGGCACGGCCATTGCATTCAATCTGCTC 288
Query 136 TCAGCTGGACGAATCCCACTCTGGGGTGGCGTCCTCATCACCATCGTGGACACCTTCTTCTTCCTCTTCCTCGA 209
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 289 TCAGCTGGACGAATCCCACTCTGGGGTGGCGTCCTCATCACCATCGTGGACACCTTCTTCTTCCTCTTCCTCGA 362
Query 210 TAACTACGGGCTGCGGAAGCTGGAAGCTTTTTTTGGACTCCTTATAACCATTATGGCCTTGACCTTTGGCTATG 283
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 363 TAACTACGGGCTGCGGAAGCTGGAAGCTTTTTTTGGACTCCTTATAACCATTATGGCCTTGACCTTTGGCTATG 436
Query 284 AGTATGTGGTGGCGCGTCCTGAGCAGGGAGCGCTTCTTCGGGGCCTGTTCCTGCCCTCGTGCCCGGGCTGCGGC 357
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 437 AGTATGTGGTGGCGCGTCCTGAGCAGGGAGCGCTTCTTCGGGGCCTGTTCCTGCCCTCGTGCCCGGGCTGCGGC 510
Query 358 CACCCCGAGCTGCTGCAGGCGGTGGGCATTGTTGGCGCCATCATCATGCCCCACAACATCTACCTGCACTCGGC 431
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 511 CACCCCGAGCTGCTGCAGGCGGTGGGCATTGTTGGCGCCATCATCATGCCCCACAACATCTACCTGCACTCGGC 584
Query 432 CCTGGTCAAGTCTCGAGAGATAGACCGGGCCCGCCGAGCGGACATCAGAGAAGCCAACATGTACTTCCTGATTG 505
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 585 CCTGGTCAAGTCTCGAGAGATAGACCGGGCCCGCCGAGCAGACATCAGAGAAGCCAACATGTACTTCCTGATTG 658
Query 506 AGGCCACCATCGCCCTGTCCGTCTCCTTTATCATCAACCTCTTTGTCATGGCTGTCTTTGGGCAGGCCTTCTAC 579
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 659 AGGCCACCATCGCCCTGTCCGTCTCCTTTATCATCAACCTCTTTGTCATGGCTGTCTTTGGGCAGGCCTTCTAC 732
Query 580 CAGAAAACCAACCAGGCTGCGTTCAACATCTGTGCCAACAGCAGCCTCCACGACTACGCCAAGATCTTCCCCAT 653
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 733 CAGAAAACCAACCAGGCTGCGTTCAACATCTGTGCCAACAGCAGCCTCCACGACTACGCCAAGATCTTCCCCAT 806
Query 654 GAACAACGCCACCGTGGCCGTGGACATTTACCAGGGGGGCGTGATCCTGGGCTGCCTGTTCGGCCCCGCGGCCC 727
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 807 GAACAACGCCACCGTGGCCGTGGACATTTACCAGGGGGGCGTGATCCTGGGCTGCCTGTTCGGCCCCGCGGCCC 880
Query 728 TCTACATCTGGGCCATAGGTCTCCTGGCGGCTGGGCAGAGCTCCACCATGACGGGCACCTACGCGGGACAGTTC 801
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 881 TCTACATCTGGGCCATAGGTCTCCTGGCGGCTGGGCAGAGCTCCACCATGACGGGCACCTACGCGGGACAGTTC 954
Query 802 GTGATGGAGGGCTTCCTGAGGCTGCGGTGGTCACGCTTCGCCCGTGTCCTCCTCACCCGCTCCTGCGCCATCCT 875
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 955 GTGATGGAGGGCTTCCTGAGGCTGCGGTGGTCACGCTTCGCCCGTGTCCTCCTCACCCGCTCCTGCGCCATCCT 1028
Query 876 GCCCACCGTGCTCGTGGCTGTCTTCCGGGACCTGAGGGACTTGTCGGGCCTCAATGATCTGCTCAACGTGCTGC 949
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029 GCCCACCGTGCTCGTGGCTGTCTTCCGGGACCTGAGGGACTTGTCGGGCCTCAATGATCTGCTCAACGTGCTGC 1102
Query 950 AGAGCCTGCTGCTCCCGTTCGCCGTGCTGCCCATCCTCACGTTCACCAGCATGCCCACCCTCATGCAGGAGTTT 1023
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1103 AGAGCCTGCTGCTCCCGTTCGCCGTGCTGCCCATCCTCACGTTCACCAGCATGCCCACCCTCATGCAGGAGTTT 1176
Query 1024 GCCAATGGCCTGCTGAACAAGGTCGTCACCTCTTCCATCATGGTGCTAGTCTGCGCCATCAACCTCTACTTCGT 1097
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1177 GCCAATGGCCTGCTGAACAAGGTCGTCACCTCTTCCATCATGGTGCTAGTCTGCGCCATCAACCTCTACTTCGT 1250
Query 1098 GGTCAGCTATCTGCCCAGCCTGCCCCACCCTGCCTACTTCGGCCTTGCAGCCTTGCTGGCCGCAGCCTACCCGG 1171
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1251 GGTCAGCTATCTGCCCAGCCTGCCCCACCCTGCCTACTTCGGCCTTGCAGCCTTGCTGGCCGCAGCCTACCTGG 1324
Query 1172 GCCTCAGCACCTACCTGGTCTGGACCTGTTGCCTTGCCCACGGAGCCACCTTTCTGGCCCACAGCTCCCACCAC 1245
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1325 GCCTCAGCACCTACCTGGTCTGGACCTGTTGCCTTGCCCACGGAGCCACCTTTCTGGCCCACAGCTCCCACCAC 1398
Query 1246 CACTTCCTGTATGGGCTCCTTGAAGAGGACCAGAAAGGGGAGACCTCTGGC 1296
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1399 CACTTCCTGTATGGGCTCCTTGAAGAGGACCAGAAAGGGGAGACCTCTGGC 1449