Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14020
• Subject: NM_011894.3
• Aligned Length: 1377
• Identities: 1138
• Gaps: 105

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGACACGGCGCTGAAACGGAGCCGCTCTGACGAGCCGGCGGAGCTCCCGCCGCCTGCCCGGGAGGTGGAGGA  74

Query    1  ----------------------ATGGAGCAGGGGCT---GGAGGAGGAAGAAGAGGTGGATCCCCGGATCCAGG  49
                                  |||||.|||||.||   |||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct   75  GAAAGAGGAGGAGGAAGAGAGGATGGAACAGGGCCTGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGTGGACCCCCGGATCCAGG  148

Query   50  GAGAACTGGAGAAGTTAAATCAGTCCACGGATGATATCAACAGACGGGAGACTGAACTTGAGGATGCTCGTCAG  123
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct  149  GAGAACTGGAGAAGTTAAATCAATCCACGGATGATATCAACCGACGGGAGACTGAGCTTGAGGATGCACGCCAG  222

Query  124  AAGTTCCGCTCTGTTCTGGTTGAAGCAACGGTGAAACTGGATGAACTGGTGAAGAAAATTGGCAAAGCTGTGGA  197
            ||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||||..||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  223  AAGTTCCGATCTGTCCTGGTCGAGGCAACGGTGAAACTAGACGAACTGGCAAAGAAAATCGGCAAAGCCGTGGA  296

Query  198  AGACTCCAAGCCCTACTGGGAGGCACGGAGGGTGGCGAGGCAGGCTCAGCTGGAAGCTCAGAAAGCCACGCAGG  271
            .|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||
Sbjct  297  GGACTCGAAGCCCTACTGGGAGGCCCGGAGGGTGGCAAGGCAGGCTCAGCTGGAGGCGCAGAAGGCCACACAGG  370

Query  272  ACTTCCAGAGGGCCACAGAGGTGCTCCGTGCCGCCAAGGAGACCATCTCCCTGGCCGAGCAGCGGCTGCTGGAG  345
            ||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||.|||||
Sbjct  371  ACTTCCAGAGGGCCACCGAGGTACTCCGTGCAGCCAAGGAAACAATCTCTCTGGCTGAGCAGCGGCTGTTGGAG  444

Query  346  GATGACAAGCGGCAGTTCGACTCCGCCTGGCAGGAGATGCTGAATCACGCCACTCAGAGGGTCATGGAGGCGGA  419
            |||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct  445  GATGACAAGCGGCAGTTTGACTCTGCTTGGCAGGAAATGCTGAACCATGCTACTCAGAGGGTCATGGAGGCCGA  518

Query  420  GCAGACCAAGACCAGGAGCGAGCTGGTGCATAAGGAGACGGCAGCCAGGTACAATGCCGCCATGGGCCGCATGC  493
            ||||||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct  519  GCAGACCAAGACAAGGAGTGAGCTAGTACACAAGGAGACGGCAGCCAGGTACAACGCTGCCATGGGTCGCATGC  592

Query  494  GACAGCTGGAGAAGAAACTCAAGAGAGCCATCAACAAGTCCAAGCCTTATTTTGAACTCAAGGCAAAGTACTAT  567
            |.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.
Sbjct  593  GCCAGCTGGAGAAGAAACTCAAGCGAGCCATCAACAAGTCCAAGCCTTATTTTGAGCTAAAGGCAAAGTACTAC  666

Query  568  GTGCAGCTCGAGCAACTGAAAAAGACTGTGGATGACCTGCAGGCCAAACTGACCCTGGCAAAAGGCGAGTACAA  641
            ||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||.||||||||||.|||||||||||
Sbjct  667  GTGCAGCTTGAGCAACTGAAGAAGACGGTGGATGACCTTCAGGCCAAGCTGGCCCTGGCAAAGGGCGAGTACAA  740

Query  642  GATGGCCCTGAAGAACCTGGAGATGATCTCAGATGAGATCCACGAGCGGCGGCGCTCCAGTGCCATGGGGCCTC  715
            |...||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||.||||.||||||||||||.|
Sbjct  741  GGCAGCCCTGAAGAGCCTGGAGAGGATCTCAGATGAGATACACGAGCGGCGGCGTTCCAATGCCATGGGGCCCC  814

Query  716  GGGGATGCGGTGTTGGTGCTGAGGGCAGCAGCACATCTGTGGAGGATCTGCCAGGGAGCAAACCTGAGCCTGAT  789
            ||||.||.||.||.||.||.||||||||||.|.|.||.||||||.|.|||||.|..|||||||||||||||||.
Sbjct  815  GGGGCTGTGGCGTGGGGGCAGAGGGCAGCATCGCCTCAGTGGAGAACCTGCCTGTAAGCAAACCTGAGCCTGAC  888

Query  790  GCCATTTCTGTGGCCTCGGAGGCCTTTGAAGATGACAGCTGTAGCAACTTTGTGTCTGAAGATGACTCGGAAAC  863
            ||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||.|||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCCATTTCTGTGGCATCAGAAGCCTTTGAAGATGACAACTGCAGCAACTTGGTGTCTGAAGATGACTCGGAAAC  962

Query  864  CCAGTCCGTGTCCAGCTTTAGTTCAGGACCAACAAGCCCGTCTGAGATGCCTGACCAGTTCCCTGCGGTTGTGA  937
            ||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|..|
Sbjct  963  CCAGTCTGTGTCCAGCTTTAGTTCGGGACCGACGAGTCCGTCTGAAATGCCTGATCAGTTCCCTGCAGTGGCAA  1036

Query  938  GGCCTGGCAGCCTGGATCTGCCCAGCCCTGTGTCCCTGTCAGAGTTTGGGATGATGTTCCCAGTGTTGGGCCCT  1011
            ||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|..||||.|||
Sbjct 1037  GGCCTGGCAGTCTGGATCTGCCTAGCCCTGTGTCCCTGTCAGAATTTGGGATGATGTTCCCAATACTGGGTCCT  1110

Query 1012  CGAAGTGAATGCAGCGGGGCCTCCTCCCCTGAATGTGAAGTAGAACGAGGAGACAGGGCAGAAGGGGCAGAGAA  1085
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1111  CGAAGTGAATGCAGTGGGGCCTCCTCCCCTGAATGTGAGGTTGAACGAGGAGACAGAGCAGAAGGGGCCGAGAA  1184

Query 1086  TAAAACAAGTGACAAAGCCAACAACAACCGGGGCCTCAGCAGTAGCA---GTGGCAGTGGTGGCAGCAGTAAGA  1156
            |||||..|||||||||||||||||||||||.|..|||.||||.|.||   ||||||   |||||||.||.|.||
Sbjct 1185  TAAAATGAGTGACAAAGCCAACAACAACCGTGTTCTCGGCAGCACCAACGGTGGCA---GTGGCAGGAGCAGGA  1255

Query 1157  GCCAAAGCAGCACCTCCCCTGAGGGCCAGGCCTTGGAGAACCGGATGAAGCAGCTCTCCCTACAGTGCTCAAAG  1230
            |||||||||||||.||||.||||.|||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1256  GCCAAAGCAGCACGTCCCTTGAGAGCCAGGCCTTGGAAACCCGGATGAAGCAGCTCTCCCTACAGTGCTCAAAA  1329

Query 1231  GGAAGAGATGGAATTATTGCTGACATAAAAATGGTGCAGATTGGC  1275
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330  GGAAGAGATGGAATTATTGCTGACATAAAAATGGTGCAGATTGGC  1374