Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14020
• Subject: XM_011534251.2
• Aligned Length: 1279
• Identities: 1238
• Gaps: 38

Alignment

Query    1  ATGGAGCAGGGGCTGGAGGAGGAAGAAGAGGTGGAT-CCCCGG---ATCCAGGGAGAACTGGAGAAGTTAAATC  70
                                              || |.||.|   ||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------------ATGCTCCTGGCTATTCAGGGAGAACTGGAGAAGTTAAATC  40

Query   71  AGTCCACGGATGATATCAACAGACGGGAGACTGAACTTGAGGATGCTCGTCAGAAGTTCCGCTCTGTTCTGGTT  144
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   41  AGTCCACGGATGATATCAACAGACGGGAGACTGAACTTGAGGATGCTCGTCAGAAGTTCCGCTCTGTTCTGGTT  114

Query  145  GAAGCAACGGTGAAACTGGATGAACTGGTGAAGAAAATTGGCAAAGCTGTGGAAGACTCCAAGCCCTACTGGGA  218
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  115  GAAGCAACGGTGAAACTGGATGAACTGGTGAAGAAAATTGGCAAAGCTGTGGAAGACTCCAAGCCCTACTGGGA  188

Query  219  GGCACGGAGGGTGGCGAGGCAGGCTCAGCTGGAAGCTCAGAAAGCCACGCAGGACTTCCAGAGGGCCACAGAGG  292
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  189  GGCACGGAGGGTGGCGAGGCAGGCTCAGCTGGAAGCTCAGAAAGCCACGCAGGACTTCCAGAGGGCCACAGAGG  262

Query  293  TGCTCCGTGCCGCCAAGGAGACCATCTCCCTGGCCGAGCAGCGGCTGCTGGAGGATGACAAGCGGCAGTTCGAC  366
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  263  TGCTCCGTGCCGCCAAGGAGACCATCTCCCTGGCCGAGCAGCGGCTGCTGGAGGATGACAAGCGGCAGTTCGAC  336

Query  367  TCCGCCTGGCAGGAGATGCTGAATCACGCCACTCAGAGGGTCATGGAGGCGGAGCAGACCAAGACCAGGAGCGA  440
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  337  TCCGCCTGGCAGGAGATGCTGAATCACGCCACTCAGAGGGTCATGGAGGCGGAGCAGACCAAGACCAGGAGCGA  410

Query  441  GCTGGTGCATAAGGAGACGGCAGCCAGGTACAATGCCGCCATGGGCCGCATGCGACAGCTGGAGAAGAAACTCA  514
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  411  GCTGGTGCATAAGGAGACGGCAGCCAGGTACAATGCCGCCATGGGCCGCATGCGACAGCTGGAGAAGAAACTCA  484

Query  515  AGAGAGCCATCAACAAGTCCAAGCCTTATTTTGAACTCAAGGCAAAGTACTATGTGCAGCTCGAGCAACTGAAA  588
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  485  AGAGAGCCATCAACAAGTCCAAGCCTTATTTTGAACTCAAGGCAAAGTACTATGTGCAGCTCGAGCAACTGAAA  558

Query  589  AAGACTGTGGATGACCTGCAGGCCAAACTGACCCTGGCAAAAGGCGAGTACAAGATGGCCCTGAAGAACCTGGA  662
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  559  AAGACTGTGGATGACCTGCAGGCCAAACTGACCCTGGCAAAAGGCGAGTACAAGATGGCCCTGAAGAACCTGGA  632

Query  663  GATGATCTCAGATGAGATCCACGAGCGGCGGCGCTCCAGTGCCATGGGGCCTCGGGGATGCGGTGTTGGTGCTG  736
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  633  GATGATCTCAGATGAGATCCACGAGCGGCGGCGCTCCAGTGCCATGGGGCCTCGGGGATGCGGTGTTGGTGCTG  706

Query  737  AGGGCAGCAGCACATCTGTGGAGGATCTGCCAGGGAGCAAACCTGAGCCTGATGCCATTTCTGTGGCCTCGGAG  810
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  707  AGGGCAGCAGCACATCTGTGGAGGATCTGCCAGGGAGCAAACCTGAGCCTGATGCCATTTCTGTGGCCTCGGAG  780

Query  811  GCCTTTGAAGATGACAGCTGTAGCAACTTTGTGTCTGAAGATGACTCGGAAACCCAGTCCGTGTCCAGCTTTAG  884
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  GCCTTTGAAGATGACAGCTGTAGCAACTTTGTGTCTGAAGATGACTCGGAAACCCAGTCCGTGTCCAGCTTTAG  854

Query  885  TTCAGGACCAACAAGCCCGTCTGAGATGCCTGACCAGTTCCCTGCGGTTGTGAGGCCTGGCAGCCTGGATCTGC  958
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  855  TTCAGGACCAACAAGCCCGTCTGAGATGCCTGACCAGTTCCCTGCGGTTGTGAGGCCTGGCAGCCTGGATCTGC  928

Query  959  CCAGCCCTGTGTCCCTGTCAGAGTTTGGGATGATGTTCCCAGTGTTGGGCCCTCGAAGTGAATGCAGCGGGGCC  1032
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  929  CCAGCCCTGTGTCCCTGTCAGAGTTTGGGATGATGTTCCCAGTGTTGGGCCCTCGAAGTGAATGCAGCGGGGCC  1002

Query 1033  TCCTCCCCTGAATGTGAAGTAGAACGAGGAGACAGGGCAGAAGGGGCAGAGAATAAAACAAGTGACAAAGCCAA  1106
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1003  TCCTCCCCTGAATGTGAAGTAGAACGAGGAGACAGGGCAGAAGGGGCAGAGAATAAAACAAGTGACAAAGCCAA  1076

Query 1107  CAACAACCGGGGCCTCAGCAGTAGCAGTGGCAGTGGTGGCAGCAGTAAGAGCCAAAGCAGCACCTCCCCTGAGG  1180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077  CAACAACCGGGGCCTCAGCAGTAGCAGTGGCAGTGGTGGCAGCAGTAAGAGCCAAAGCAGCACCTCCCCTGAGG  1150

Query 1181  GCCAGGCCTTGGAGAACCGGATGAAGCAGCTCTCCCTACAGTGCTCAAAGGGAAGAGATGGAATTATTGCTGAC  1254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1151  GCCAGGCCTTGGAGAACCGGATGAAGCAGCTCTCCCTACAGTGCTCAAAGGGAAGAGATGGAATTATTGCTGAC  1224

Query 1255  ATAAAAATGGTGCAGATTGGC  1275
            |||||||||||||||||||||
Sbjct 1225  ATAAAAATGGTGCAGATTGGC  1245