Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_14033
Subject:
NM_001134382.3
Aligned Length:
1114
Identities:
810
Gaps:
300

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  MACRRRYFVEGEAPSSETGTSLDSPSAYPQGPLVPGSSLSPDHYEHTSVGAYGLYSGPPGQQQRTRRPKLQHST  74

Query    1  ----------------------------------MLERKYGGRLVTRHAARTIQTAFRQYQMNKNFERLRSSMS  40
                                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  SILRKQAEEEAIKRSRSLSESYELSSDLQDKQVEMLERKYGGRLVTRHAARTIQTAFRQYQMNKNFERLRSSMS  148

Query   41  ENRMSRRIVLSNMRMQFSFEGPEKVHSSYFEGKQVSVTNDGSQLGALVSPECGDLSEPTTLKSPAPSSDFADAI  114
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ENRMSRRIVLSNMRMQFSFEGPEKVHSSYFEGKQVSVTNDGSQLGALVSPECGDLSEPTTLKSPAPSSDFADAI  222

Query  115  TELEDAFSRQVKSLAESIDDALNCRSLHTEEAPALDAARARDTEPQTALHGMDHRKLDEMTASYSDVTLYIDEE  188
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TELEDAFSRQVKSLAESIDDALNCRSLHTEEAPALDAARARDTEPQTALHGMDHRKLDEMTASYSDVTLYIDEE  296

Query  189  ELSPPLPLSQAGDRPSSTESDLRLRAGGAAPDYWALAHKEDKADTDTSCRSTPSLERQXQRLRVEHLPLLTIEP  262
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  297  ELSPPLPLSQAGDRPSSTESDLRLRAGGAAPDYWALAHKEDKADTDTSCRSTPSLERQEQRLRVEHLPLLTIEP  370

Query  263  PSDSSVDLSDRSERGSLKRQSAYERSLGGQQGSPKHGPHSGAPKSLPREEPELRPRPPRPLDSHLAINGSANRQ  336
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  PSDSSVDLSDRSERGSLKRQSAYERSLGGQQGSPKHGPHSGAPKSLPREEPELRPRPPRPLDSHLAINGSANRQ  444

Query  337  SKSESDYSDGDNDSINSTSNSNDTINCSSESSSRDSLREQTLSKQTYHKEARNSWDSPAFSNDVIRKRHYRIGL  410
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  SKSESDYSDGDNDSINSTSNSNDTINCSSESSSRDSLREQTLSKQTYHKEARNSWDSPAFSNDVIRKRHYRIGL  518

Query  411  NLFNKKPEKGVQYLIERGFVPDTPVGVAHFLLQRKGLSRQMIGEFLGNRQKQFNRDVLDCVVDEMDFSTMELDE  484
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  NLFNKKPEKGVQYLIERGFVPDTPVGVAHFLLQRKGLSRQMIGEFLGNRQKQFNRDVLDCVVDEMDFSTMELDE  592

Query  485  ALRKFQAHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCICNPGVVRQFRNPDTIFILAFAIILLNTDMYSPNVKPERKMKLE  558
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ALRKFQAHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCICNPGVVRQFRNPDTIFILAFAIILLNTDMYSPNVKPERKMKLE  666

Query  559  DFIKNLRGVDDGEDIPREMLMGIYERIRKRELKTNEDHVSQVQKVEKLIVGKKPIGSLHPGLGCVLSLPHRRLV  632
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  DFIKNLRGVDDGEDIPREMLMGIYERIRKRELKTNEDHVSQVQKVEKLIVGKKPIGSLHPGLGCVLSLPHRRLV  740

Query  633  CYCRLFEVPDPNKPQKLGLHQREIFLFNDLLVVTKIFQKKKNSVTYSFRQSFSLYGMQVLLFENQYYPNGIRLT  706
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CYCRLFEVPDPNKPQKLGLHQREIFLFNDLLVVTKIFQKKKNSVTYSFRQSFSLYGMQVLLFENQYYPNGIRLT  814

Query  707  SSVPGADIKVLINFNAPNPQDRKKFTDDLRESIAEVQEMEKHRIESELEKQKGVVRPSMSQCSSLKKESGNGTL  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  SSVPGADIKVLINFNAPNPQDRKKFTDDLRESIAEVQEMEKHRIESELEKQKGVVRPSMSQCSSLKKESGNGTL  888

Query  781  SRACLDDSYASGEGLKRSALSSSLRDLSEAGVHH----------------------------------------  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||...                                        
Sbjct  889  SRACLDDSYASGEGLKRSALSSSLRDLSEAGKRGRRSSAGSLESNVEGSIISSPHMRRRATSTRECPSRPHQTM  962

Query  815  --------------------------------------------------------------------------  814
                                                                                      
Sbjct  963  PNSSSLLGSLFGSKRGKPPPQAHLPSAPALPPPHPPVVLPHLQHSVAGHHLGPPEGLPQAAMHGHHTQYCHMQN  1036

Query  815  --------------------------------------------------------------------------  814
                                                                                      
Sbjct 1037  PPPYHHHHHHHPPQHIQHAHQYHHGPHGGHPAYGAHAHGHPPLPSAHVGHTVHHHGQPPAPPPPTSSKAKPSGI  1110

Query  815  ----  814
                
Sbjct 1111  STIV  1114