Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14033
• Subject: XM_011534305.2
• Aligned Length: 3396
• Identities: 2441
• Gaps: 954

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCTCAAGTTCAAGGCCTTTTGCCTGGATTACTGGCAGTTCCTGTGCCTACAGCCCCTGCATGGAGCCTACAA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  AAGCGTCGAGGGCGAGGCCCCCAGCAGTGAGACTGGCACATCCCTGGACAGCCCCTCAGCCTACCCCCAGGGCC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CCTTGGTGCCCGGTTCCAGCCTGAGCCCGGATCACTACGAGCACACGTCAGTGGGAGCCTATGGGCTGTACTCG  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GGGCCGCCGGGGCAACAGCAGCGCACGCGGAGGCCCAAGCTGCAGCACTCGACCTCCATCCTGCGCAAGCAGGC  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  TGAGGAGGAGGCCATCAAGCGCTCACGCTCACTCTCCGAGAGCTATGAGCTCTCCTCGGACCTGCAGGACAAGC  370

Query    1  --------ATGCTAGAACGAAAGTATGGGGGGCGCCTGGTAACCCGCCATGCGGCCCGCACCATCCAGACGGCG  66
                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGTGGAGATGCTAGAACGAAAGTATGGGGGGCGCCTGGTAACCCGCCATGCGGCCCGCACCATCCAGACGGCG  444

Query   67  TTTCGCCAGTACCAGATGAACAAGAACTTCGAGCGCTTGCGCAGCTCCATGTCAGAGAACCGCATGTCACGCCG  140
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTTCGCCAGTACCAGATGAACAAGAACTTCGAGCGCTTGCGCAGCTCCATGTCAGAGAACCGCATGTCACGCCG  518

Query  141  GATTGTGCTGTCCAACATGAGGATGCAGTTCTCCTTTGAGGGGCCTGAGAAAGTGCACAGCTCCTACTTCGAGG  214
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GATTGTGCTGTCCAACATGAGGATGCAGTTCTCCTTTGAGGGGCCTGAGAAAGTGCACAGCTCCTACTTCGAGG  592

Query  215  GGAAGCAGGTCTCAGTGACTAACGACGGCTCCCAGCTGGGAGCCCTGGTGTCCCCTGAGTGTGGTGACCTCAGC  288
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGAAGCAGGTCTCAGTGACTAACGACGGCTCCCAGCTGGGAGCCCTGGTGTCCCCTGAGTGTGGTGACCTCAGC  666

Query  289  GAGCCCACCACCCTCAAGTCTCCGGCCCCCTCCAGTGACTTTGCGGACGCCATCACCGAGCTGGAGGACGCCTT  362
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGCCCACCACCCTCAAGTCTCCGGCCCCCTCCAGTGACTTTGCGGACGCCATCACCGAGCTGGAGGACGCCTT  740

Query  363  CTCTAGGCAAGTGAAATCACTGGCCGAGTCCATCGACGATGCCCTCAACTGCCGCAGCCTGCACACTGAGGAGG  436
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTCTAGGCAAGTGAAATCACTGGCCGAGTCCATCGACGATGCCCTCAACTGCCGCAGCCTGCACACTGAGGAGG  814

Query  437  CACCGGCCCTGGATGCGGCGCGGGCCCGGGACACCGAACCCCAGACAGCCCTGCACGGCATGGACCACCGCAAA  510
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CACCGGCCCTGGATGCGGCGCGGGCCCGGGACACCGAACCCCAGACAGCCCTGCACGGCATGGACCACCGCAAA  888

Query  511  CTGGACGAGATGACGGCCTCGTACAGTGATGTCACCCTGTACATCGATGAGGAGGAGCTGTCGCCCCCTCTGCC  584
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGGACGAGATGACGGCCTCGTACAGTGATGTCACCCTGTACATCGATGAGGAGGAGCTGTCGCCCCCTCTGCC  962

Query  585  CCTCTCGCAGGCAGGGGACCGGCCGTCCAGCACCGAGTCGGACCTGCGGCTACGGGCTGGGGGCGCAGCCCCAG  658
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCTCTCGCAGGCAGGGGACCGGCCGTCCAGCACCGAGTCGGACCTGCGGCTACGGGCTGGGGGCGCAGCCCCAG  1036

Query  659  ACTACTGGGCCCTGGCCCACAAAGAGGACAAGGCTGACACGGACACGAGCTGCCGGAGCACGCCGTCGCTGGAG  732
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACTACTGGGCCCTGGCCCACAAAGAGGACAAGGCTGACACGGACACGAGCTGCCGGAGCACGCCGTCGCTGGAG  1110

Query  733  CGGCAGGNGCAGCGGCTGCGGGTGGAGCATCTGCCGCTGCTCACCATCGAGCCACCCAGCGACAGCTCTGTGGA  806
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CGGCAGGAGCAGCGGCTGCGGGTGGAGCATCTGCCGCTGCTCACCATCGAGCCACCCAGCGACAGCTCTGTGGA  1184

Query  807  CCTTAGTGACCGCTCGGAGCGGGGGTCACTCAAGAGGCAGAGTGCTTACGAGCGCAGCCTTGGCGGGCAGCAGG  880
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCTTAGTGACCGCTCGGAGCGGGGGTCACTCAAGAGGCAGAGTGCTTACGAGCGCAGCCTTGGCGGGCAGCAGG  1258

Query  881  GCAGTCCCAAGCATGGTCCCCACAGCGGCGCCCCCAAGAGCCTCCCCCGGGAGGAGCCTGAGTTGCGGCCCCGG  954
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GCAGTCCCAAGCATGGTCCCCACAGCGGCGCCCCCAAGAGCCTCCCCCGGGAGGAGCCTGAGTTGCGGCCCCGG  1332

Query  955  CCCCCCAGGCCCCTGGACAGCCACTTGGCCATCAATGGCTCAGCCAACCGGCAGAGCAAGTCTGAGTCGGACTA  1028
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCCCCCAGGCCCCTGGACAGCCACTTGGCCATCAATGGCTCAGCCAACCGGCAGAGCAAGTCTGAGTCGGACTA  1406

Query 1029  CTCAGACGGTGACAATGACAGCATCAACAGCACGTCCAACTCCAACGATACCATCAACTGCAGCTCCGAGTCAT  1102
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTCAGACGGTGACAATGACAGCATCAACAGCACGTCCAACTCCAACGATACCATCAACTGCAGCTCCGAGTCAT  1480

Query 1103  CGTCCCGTGACAGCCTGCGGGAGCAGACGCTCAGCAAGCAGACCTACCACAAGGAGGCCCGCAACAGCTGGGAC  1176
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CGTCCCGTGACAGCCTGCGGGAGCAGACGCTCAGCAAGCAGACCTACCACAAGGAGGCCCGCAACAGCTGGGAC  1554

Query 1177  TCGCCTGCCTTTAGCAACGATGTCATCCGCAAGAGGCACTACCGCATCGGCCTGAACCTCTTCAACAAGAAGCC  1250
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TCGCCTGCCTTTAGCAACGATGTCATCCGCAAGAGGCACTACCGCATCGGCCTGAACCTCTTCAACAAGAAGCC  1628

Query 1251  TGAGAAGGGAGTCCAGTACCTCATCGAGCGTGGCTTTGTGCCCGACACGCCCGTCGGGGTGGCCCACTTCCTGC  1324
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGAGAAGGGAGTCCAGTACCTCATCGAGCGTGGCTTTGTGCCCGACACGCCCGTCGGGGTGGCCCACTTCCTGC  1702

Query 1325  TGCAGCGCAAGGGCCTCAGCCGGCAGATGATCGGCGAGTTCCTGGGCAACCGGCAGAAGCAGTTCAACCGTGAC  1398
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TGCAGCGCAAGGGCCTCAGCCGGCAGATGATCGGCGAGTTCCTGGGCAACCGGCAGAAGCAGTTCAACCGTGAC  1776

Query 1399  GTGCTCGACTGCGTCGTGGACGAGATGGACTTCTCTACCATGGAGCTGGATGAGGCCCTCAGGAAATTCCAGGC  1472
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GTGCTCGACTGCGTCGTGGACGAGATGGACTTCTCTACCATGGAGCTGGATGAGGCCCTCAGGAAATTCCAGGC  1850

Query 1473  GCACATCCGTGTCCAAGGGGAGGCTCAGAAAGTGGAGCGGCTCATAGAGGCGTTCAGCCAGCGCTACTGCATCT  1546
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GCACATCCGTGTCCAAGGGGAGGCTCAGAAAGTGGAGCGGCTCATAGAGGCGTTCAGCCAGCGCTACTGCATCT  1924

Query 1547  GCAACCCTGGGGTGGTGCGGCAATTCCGGAACCCAGACACCATTTTCATCCTGGCCTTCGCCATCATCCTGCTG  1620
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GCAACCCTGGGGTGGTGCGGCAATTCCGGAACCCAGACACCATTTTCATCCTGGCCTTCGCCATCATCCTGCTG  1998

Query 1621  AACACCGACATGTACAGCCCCAATGTCAAGCCCGAGCGGAAAATGAAGCTAGAGGACTTCATCAAGAACCTCCG  1694
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AACACCGACATGTACAGCCCCAATGTCAAGCCCGAGCGGAAAATGAAGCTAGAGGACTTCATCAAGAACCTCCG  2072

Query 1695  AGGTGTGGACGATGGTGAGGACATTCCCCGTGAGATGCTGATGGGGATCTATGAACGGATCCGTAAGCGAGAGC  1768
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  AGGTGTGGACGATGGTGAGGACATTCCCCGTGAGATGCTGATGGGGATCTATGAACGGATCCGTAAGCGAGAGC  2146

Query 1769  TAAAGACCAATGAGGACCATGTGTCCCAGGTGCAGAAGGTGGAGAAGCTCATTGTGGGGAAAAAGCCGATCGGA  1842
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TAAAGACCAATGAGGACCATGTGTCCCAGGTGCAGAAGGTGGAGAAGCTCATTGTGGGGAAAAAGCCGATCGGA  2220

Query 1843  TCCCTGCATCCCGGGCTCGGCTGTGTGCTCTCTCTGCCCCACCGTCGGTTGGTCTGCTACTGCCGGCTCTTTGA  1916
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  TCCCTGCATCCCGGGCTCGGCTGTGTGCTCTCTCTGCCCCACCGTCGGTTGGTCTGCTACTGCCGGCTCTTTGA  2294

Query 1917  GGTTCCAGACCCAAACAAGCCCCAGAAACTCGGACTACACCAGCGAGAAATCTTCCTGTTCAACGACCTCCTGG  1990
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GGTTCCAGACCCAAACAAGCCCCAGAAACTCGGACTACACCAGCGAGAAATCTTCCTGTTCAACGACCTCCTGG  2368

Query 1991  TGGTCACCAAGATCTTCCAGAAGAAGAAGAACTCGGTGACGTACAGCTTCCGACAGTCCTTCTCCTTGTACGGC  2064
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TGGTCACCAAGATCTTCCAGAAGAAGAAGAACTCGGTGACGTACAGCTTCCGACAGTCCTTCTCCTTGTACGGC  2442

Query 2065  ATGCAGGTCCTGCTCTTCGAGAACCAGTACTACCCCAATGGCATCCGGCTCACCTCGTCTGTCCCCGGAGCAGA  2138
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  ATGCAGGTCCTGCTCTTCGAGAACCAGTACTACCCCAATGGCATCCGGCTCACCTCGTCTGTCCCCGGAGCAGA  2516

Query 2139  TATCAAAGTGTTAATAAACTTCAACGCCCCCAACCCTCAAGACCGGAAGAAATTCACCGATGACCTGCGGGAGT  2212
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  TATCAAAGTGTTAATAAACTTCAACGCCCCCAACCCTCAAGACCGGAAGAAATTCACCGATGACCTGCGGGAGT  2590

Query 2213  CCATTGCGGAAGTCCAAGAGATGGAGAAGCACAGGATAGAGTCGGAGCTCGAGAAGCAGAAAGGCGTCGTGCGG  2286
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  CCATTGCGGAAGTCCAAGAGATGGAGAAGCACAGGATAGAGTCGGAGCTCGAGAAGCAGAAAGGCGTCGTGCGG  2664

Query 2287  CCCAGCATGTCCCAGTGCTCTAGCCTCAAAAAGGAGTCGGGCAACGGAACACTGAGCCGGGCCTGCCTGGACGA  2360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  CCCAGCATGTCCCAGTGCTCTAGCCTCAAAAAGGAGTCGGGCAACGGAACACTGAGCCGGGCCTGCCTGGACGA  2738

Query 2361  CAGCTATGCCAGCGGTGAGGGCCTCAAGCGCAGCGCCCTCAGCAGCTCCCTGCGGGACCTCTCGGAAGCCG---  2431
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct 2739  CAGCTATGCCAGCGGTGAGGGCCTCAAGCGCAGCGCCCTCAGCAGCTCCCTGCGGGACCTCTCGGAAGCCGGGA  2812

Query 2432  -----------------------------------------------GGGTCCATCAT----------------  2442
                                                           |||||||||||                
Sbjct 2813  AGCGAGGGCGTCGCAGCAGTGCGGGATCGCTAGAGAGCAATGTGGAAGGGTCCATCATTAGCAGTCCTCACATG  2886

Query 2443  --------------------------------------------------------------------------  2442
                                                                                      
Sbjct 2887  CGCCGGAGAGCTACATCAACACGAGAGTGTCCATCTCGCCCACACCAGACTATGCCCAACTCATCTTCCCTCCT  2960

Query 2443  --------------------------------------------------------------------------  2442
                                                                                      
Sbjct 2961  GGGCTCCTTATTCGGGAGCAAGAGAGGGAAGCCCCCTCCCCAGGCCCACCTGCCCTCAGCCCCAGCCCTGCCAC  3034

Query 2443  --------------------------------------------------------------------------  2442
                                                                                      
Sbjct 3035  CCCCCCACCCACCGGTGGTCCTGCCTCACTTGCAGCACTCTGTGGCTGGCCACCACCTGGGGCCCCCAGAGGGG  3108

Query 2443  --------------------------------------------------------------------------  2442
                                                                                      
Sbjct 3109  CTGCCGCAGGCCGCCATGCACGGGCATCACACCCAGTACTGCCACATGCAGAACCCTCCCCCGTACCACCATCA  3182

Query 2443  --------------------------------------------------------------------------  2442
                                                                                      
Sbjct 3183  CCACCACCACCACCCACCCCAGCACATCCAGCACGCACACCAGTACCACCACGGCCCCCATGGGGGCCACCCAG  3256

Query 2443  --------------------------------------------------------------------------  2442
                                                                                      
Sbjct 3257  CCTACGGGGCCCATGCCCACGGCCACCCGCCGCTGCCCTCGGCCCACGTGGGGCACACAGTGCACCACCATGGG  3330

Query 2443  ------------------------------------------------------------------  2442
                                                                              
Sbjct 3331  CAGCCCCCTGCCCCGCCGCCCCCCACCAGCAGCAAGGCCAAACCCAGCGGCATCAGCACAATTGTG  3396