Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14033
• Subject: XM_011534306.3
• Aligned Length: 3387
• Identities: 2441
• Gaps: 945

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAAGGGGTATGGCAGTGCCGTGTGGAGCCTTATGTGGAAGTACTGCATCTCTGTGAGGACACTCAGCGTCGA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGGCGAGGCCCCCAGCAGTGAGACTGGCACATCCCTGGACAGCCCCTCAGCCTACCCCCAGGGCCCCTTGGTGC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CCGGTTCCAGCCTGAGCCCGGATCACTACGAGCACACGTCAGTGGGAGCCTATGGGCTGTACTCGGGGCCGCCG  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GGGCAACAGCAGCGCACGCGGAGGCCCAAGCTGCAGCACTCGACCTCCATCCTGCGCAAGCAGGCTGAGGAGGA  296

Query    1  -------------------------------------------------------------------------A  1
                                                                                     |
Sbjct  297  GGCCATCAAGCGCTCACGCTCACTCTCCGAGAGCTATGAGCTCTCCTCGGACCTGCAGGACAAGCAGGTGGAGA  370

Query    2  TGCTAGAACGAAAGTATGGGGGGCGCCTGGTAACCCGCCATGCGGCCCGCACCATCCAGACGGCGTTTCGCCAG  75
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGCTAGAACGAAAGTATGGGGGGCGCCTGGTAACCCGCCATGCGGCCCGCACCATCCAGACGGCGTTTCGCCAG  444

Query   76  TACCAGATGAACAAGAACTTCGAGCGCTTGCGCAGCTCCATGTCAGAGAACCGCATGTCACGCCGGATTGTGCT  149
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TACCAGATGAACAAGAACTTCGAGCGCTTGCGCAGCTCCATGTCAGAGAACCGCATGTCACGCCGGATTGTGCT  518

Query  150  GTCCAACATGAGGATGCAGTTCTCCTTTGAGGGGCCTGAGAAAGTGCACAGCTCCTACTTCGAGGGGAAGCAGG  223
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTCCAACATGAGGATGCAGTTCTCCTTTGAGGGGCCTGAGAAAGTGCACAGCTCCTACTTCGAGGGGAAGCAGG  592

Query  224  TCTCAGTGACTAACGACGGCTCCCAGCTGGGAGCCCTGGTGTCCCCTGAGTGTGGTGACCTCAGCGAGCCCACC  297
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCTCAGTGACTAACGACGGCTCCCAGCTGGGAGCCCTGGTGTCCCCTGAGTGTGGTGACCTCAGCGAGCCCACC  666

Query  298  ACCCTCAAGTCTCCGGCCCCCTCCAGTGACTTTGCGGACGCCATCACCGAGCTGGAGGACGCCTTCTCTAGGCA  371
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACCCTCAAGTCTCCGGCCCCCTCCAGTGACTTTGCGGACGCCATCACCGAGCTGGAGGACGCCTTCTCTAGGCA  740

Query  372  AGTGAAATCACTGGCCGAGTCCATCGACGATGCCCTCAACTGCCGCAGCCTGCACACTGAGGAGGCACCGGCCC  445
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGTGAAATCACTGGCCGAGTCCATCGACGATGCCCTCAACTGCCGCAGCCTGCACACTGAGGAGGCACCGGCCC  814

Query  446  TGGATGCGGCGCGGGCCCGGGACACCGAACCCCAGACAGCCCTGCACGGCATGGACCACCGCAAACTGGACGAG  519
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGATGCGGCGCGGGCCCGGGACACCGAACCCCAGACAGCCCTGCACGGCATGGACCACCGCAAACTGGACGAG  888

Query  520  ATGACGGCCTCGTACAGTGATGTCACCCTGTACATCGATGAGGAGGAGCTGTCGCCCCCTCTGCCCCTCTCGCA  593
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATGACGGCCTCGTACAGTGATGTCACCCTGTACATCGATGAGGAGGAGCTGTCGCCCCCTCTGCCCCTCTCGCA  962

Query  594  GGCAGGGGACCGGCCGTCCAGCACCGAGTCGGACCTGCGGCTACGGGCTGGGGGCGCAGCCCCAGACTACTGGG  667
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGCAGGGGACCGGCCGTCCAGCACCGAGTCGGACCTGCGGCTACGGGCTGGGGGCGCAGCCCCAGACTACTGGG  1036

Query  668  CCCTGGCCCACAAAGAGGACAAGGCTGACACGGACACGAGCTGCCGGAGCACGCCGTCGCTGGAGCGGCAGGNG  741
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1037  CCCTGGCCCACAAAGAGGACAAGGCTGACACGGACACGAGCTGCCGGAGCACGCCGTCGCTGGAGCGGCAGGAG  1110

Query  742  CAGCGGCTGCGGGTGGAGCATCTGCCGCTGCTCACCATCGAGCCACCCAGCGACAGCTCTGTGGACCTTAGTGA  815
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGCGGCTGCGGGTGGAGCATCTGCCGCTGCTCACCATCGAGCCACCCAGCGACAGCTCTGTGGACCTTAGTGA  1184

Query  816  CCGCTCGGAGCGGGGGTCACTCAAGAGGCAGAGTGCTTACGAGCGCAGCCTTGGCGGGCAGCAGGGCAGTCCCA  889
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCGCTCGGAGCGGGGGTCACTCAAGAGGCAGAGTGCTTACGAGCGCAGCCTTGGCGGGCAGCAGGGCAGTCCCA  1258

Query  890  AGCATGGTCCCCACAGCGGCGCCCCCAAGAGCCTCCCCCGGGAGGAGCCTGAGTTGCGGCCCCGGCCCCCCAGG  963
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGCATGGTCCCCACAGCGGCGCCCCCAAGAGCCTCCCCCGGGAGGAGCCTGAGTTGCGGCCCCGGCCCCCCAGG  1332

Query  964  CCCCTGGACAGCCACTTGGCCATCAATGGCTCAGCCAACCGGCAGAGCAAGTCTGAGTCGGACTACTCAGACGG  1037
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCCCTGGACAGCCACTTGGCCATCAATGGCTCAGCCAACCGGCAGAGCAAGTCTGAGTCGGACTACTCAGACGG  1406

Query 1038  TGACAATGACAGCATCAACAGCACGTCCAACTCCAACGATACCATCAACTGCAGCTCCGAGTCATCGTCCCGTG  1111
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGACAATGACAGCATCAACAGCACGTCCAACTCCAACGATACCATCAACTGCAGCTCCGAGTCATCGTCCCGTG  1480

Query 1112  ACAGCCTGCGGGAGCAGACGCTCAGCAAGCAGACCTACCACAAGGAGGCCCGCAACAGCTGGGACTCGCCTGCC  1185
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACAGCCTGCGGGAGCAGACGCTCAGCAAGCAGACCTACCACAAGGAGGCCCGCAACAGCTGGGACTCGCCTGCC  1554

Query 1186  TTTAGCAACGATGTCATCCGCAAGAGGCACTACCGCATCGGCCTGAACCTCTTCAACAAGAAGCCTGAGAAGGG  1259
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TTTAGCAACGATGTCATCCGCAAGAGGCACTACCGCATCGGCCTGAACCTCTTCAACAAGAAGCCTGAGAAGGG  1628

Query 1260  AGTCCAGTACCTCATCGAGCGTGGCTTTGTGCCCGACACGCCCGTCGGGGTGGCCCACTTCCTGCTGCAGCGCA  1333
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGTCCAGTACCTCATCGAGCGTGGCTTTGTGCCCGACACGCCCGTCGGGGTGGCCCACTTCCTGCTGCAGCGCA  1702

Query 1334  AGGGCCTCAGCCGGCAGATGATCGGCGAGTTCCTGGGCAACCGGCAGAAGCAGTTCAACCGTGACGTGCTCGAC  1407
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGGGCCTCAGCCGGCAGATGATCGGCGAGTTCCTGGGCAACCGGCAGAAGCAGTTCAACCGTGACGTGCTCGAC  1776

Query 1408  TGCGTCGTGGACGAGATGGACTTCTCTACCATGGAGCTGGATGAGGCCCTCAGGAAATTCCAGGCGCACATCCG  1481
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TGCGTCGTGGACGAGATGGACTTCTCTACCATGGAGCTGGATGAGGCCCTCAGGAAATTCCAGGCGCACATCCG  1850

Query 1482  TGTCCAAGGGGAGGCTCAGAAAGTGGAGCGGCTCATAGAGGCGTTCAGCCAGCGCTACTGCATCTGCAACCCTG  1555
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TGTCCAAGGGGAGGCTCAGAAAGTGGAGCGGCTCATAGAGGCGTTCAGCCAGCGCTACTGCATCTGCAACCCTG  1924

Query 1556  GGGTGGTGCGGCAATTCCGGAACCCAGACACCATTTTCATCCTGGCCTTCGCCATCATCCTGCTGAACACCGAC  1629
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GGGTGGTGCGGCAATTCCGGAACCCAGACACCATTTTCATCCTGGCCTTCGCCATCATCCTGCTGAACACCGAC  1998

Query 1630  ATGTACAGCCCCAATGTCAAGCCCGAGCGGAAAATGAAGCTAGAGGACTTCATCAAGAACCTCCGAGGTGTGGA  1703
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  ATGTACAGCCCCAATGTCAAGCCCGAGCGGAAAATGAAGCTAGAGGACTTCATCAAGAACCTCCGAGGTGTGGA  2072

Query 1704  CGATGGTGAGGACATTCCCCGTGAGATGCTGATGGGGATCTATGAACGGATCCGTAAGCGAGAGCTAAAGACCA  1777
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CGATGGTGAGGACATTCCCCGTGAGATGCTGATGGGGATCTATGAACGGATCCGTAAGCGAGAGCTAAAGACCA  2146

Query 1778  ATGAGGACCATGTGTCCCAGGTGCAGAAGGTGGAGAAGCTCATTGTGGGGAAAAAGCCGATCGGATCCCTGCAT  1851
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  ATGAGGACCATGTGTCCCAGGTGCAGAAGGTGGAGAAGCTCATTGTGGGGAAAAAGCCGATCGGATCCCTGCAT  2220

Query 1852  CCCGGGCTCGGCTGTGTGCTCTCTCTGCCCCACCGTCGGTTGGTCTGCTACTGCCGGCTCTTTGAGGTTCCAGA  1925
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CCCGGGCTCGGCTGTGTGCTCTCTCTGCCCCACCGTCGGTTGGTCTGCTACTGCCGGCTCTTTGAGGTTCCAGA  2294

Query 1926  CCCAAACAAGCCCCAGAAACTCGGACTACACCAGCGAGAAATCTTCCTGTTCAACGACCTCCTGGTGGTCACCA  1999
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CCCAAACAAGCCCCAGAAACTCGGACTACACCAGCGAGAAATCTTCCTGTTCAACGACCTCCTGGTGGTCACCA  2368

Query 2000  AGATCTTCCAGAAGAAGAAGAACTCGGTGACGTACAGCTTCCGACAGTCCTTCTCCTTGTACGGCATGCAGGTC  2073
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  AGATCTTCCAGAAGAAGAAGAACTCGGTGACGTACAGCTTCCGACAGTCCTTCTCCTTGTACGGCATGCAGGTC  2442

Query 2074  CTGCTCTTCGAGAACCAGTACTACCCCAATGGCATCCGGCTCACCTCGTCTGTCCCCGGAGCAGATATCAAAGT  2147
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CTGCTCTTCGAGAACCAGTACTACCCCAATGGCATCCGGCTCACCTCGTCTGTCCCCGGAGCAGATATCAAAGT  2516

Query 2148  GTTAATAAACTTCAACGCCCCCAACCCTCAAGACCGGAAGAAATTCACCGATGACCTGCGGGAGTCCATTGCGG  2221
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  GTTAATAAACTTCAACGCCCCCAACCCTCAAGACCGGAAGAAATTCACCGATGACCTGCGGGAGTCCATTGCGG  2590

Query 2222  AAGTCCAAGAGATGGAGAAGCACAGGATAGAGTCGGAGCTCGAGAAGCAGAAAGGCGTCGTGCGGCCCAGCATG  2295
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  AAGTCCAAGAGATGGAGAAGCACAGGATAGAGTCGGAGCTCGAGAAGCAGAAAGGCGTCGTGCGGCCCAGCATG  2664

Query 2296  TCCCAGTGCTCTAGCCTCAAAAAGGAGTCGGGCAACGGAACACTGAGCCGGGCCTGCCTGGACGACAGCTATGC  2369
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  TCCCAGTGCTCTAGCCTCAAAAAGGAGTCGGGCAACGGAACACTGAGCCGGGCCTGCCTGGACGACAGCTATGC  2738

Query 2370  CAGCGGTGAGGGCCTCAAGCGCAGCGCCCTCAGCAGCTCCCTGCGGGACCTCTCGGAAGCCG------------  2431
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
Sbjct 2739  CAGCGGTGAGGGCCTCAAGCGCAGCGCCCTCAGCAGCTCCCTGCGGGACCTCTCGGAAGCCGGGAAGCGAGGGC  2812

Query 2432  --------------------------------------GGGTCCATCAT-------------------------  2442
                                                  |||||||||||                         
Sbjct 2813  GTCGCAGCAGTGCGGGATCGCTAGAGAGCAATGTGGAAGGGTCCATCATTAGCAGTCCTCACATGCGCCGGAGA  2886

Query 2443  --------------------------------------------------------------------------  2442
                                                                                      
Sbjct 2887  GCTACATCAACACGAGAGTGTCCATCTCGCCCACACCAGACTATGCCCAACTCATCTTCCCTCCTGGGCTCCTT  2960

Query 2443  --------------------------------------------------------------------------  2442
                                                                                      
Sbjct 2961  ATTCGGGAGCAAGAGAGGGAAGCCCCCTCCCCAGGCCCACCTGCCCTCAGCCCCAGCCCTGCCACCCCCCCACC  3034

Query 2443  --------------------------------------------------------------------------  2442
                                                                                      
Sbjct 3035  CACCGGTGGTCCTGCCTCACTTGCAGCACTCTGTGGCTGGCCACCACCTGGGGCCCCCAGAGGGGCTGCCGCAG  3108

Query 2443  --------------------------------------------------------------------------  2442
                                                                                      
Sbjct 3109  GCCGCCATGCACGGGCATCACACCCAGTACTGCCACATGCAGAACCCTCCCCCGTACCACCATCACCACCACCA  3182

Query 2443  --------------------------------------------------------------------------  2442
                                                                                      
Sbjct 3183  CCACCCACCCCAGCACATCCAGCACGCACACCAGTACCACCACGGCCCCCATGGGGGCCACCCAGCCTACGGGG  3256

Query 2443  --------------------------------------------------------------------------  2442
                                                                                      
Sbjct 3257  CCCATGCCCACGGCCACCCGCCGCTGCCCTCGGCCCACGTGGGGCACACAGTGCACCACCATGGGCAGCCCCCT  3330

Query 2443  ---------------------------------------------------------  2442
                                                                     
Sbjct 3331  GCCCCGCCGCCCCCCACCAGCAGCAAGGCCAAACCCAGCGGCATCAGCACAATTGTG  3387