Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14033
• Subject: XM_017321534.1
• Aligned Length: 2844
• Identities: 2157
• Gaps: 405

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCTTGCCGAAGACGCTATTTTGTTGAGGGCGAGGCCCCCAGCAGCGAGACTGGCACATCGCTGGACAGCCC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CTCAGCCTACCATCAGGGTCCCCTGGTACCTGGTTCCAGCCTGAGTCCAGACCACTACGAGCACACATCAGTGG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GCGCCTATGGGCTGTACGCAGGGCCAGGACCACAACAGCGCACACGGAGGCCCCGGCTGCAGCACTCGACCTCA  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GTCCTGCGCAAGCAGGCTGAGGAGGAGGCCATCAAGCGCTCTCGGTCACTCTCTGAGAGCTATGAGCTCTCTTC  296

Query    1  -------------------------ATGCTAGAACGAAAGTATGGGGGGCGCCTGGTAACCCGCCATGCGGCCC  49
                                     |||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||
Sbjct  297  AGATCTGCAAGACAAGCAGGTGGAAATGCTAGAACGCAAGTATGGGGGACGCCTCGTGACCCGCCATGCAGCCC  370

Query   50  GCACCATCCAGACGGCGTTTCGCCAGTACCAGATGAACAAGAACTTCGAGCGCTTGCGCAGCTCCATGTCAGAG  123
            |||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||.|||
Sbjct  371  GCACCATCCAGACGGCGTTCCGCCAATACCAGATGAACAAGAACTTTGAGCGCCTGCGCAGCTCCATGTCGGAG  444

Query  124  AACCGCATGTCACGCCGGATTGTGCTGTCCAACATGAGGATGCAGTTCTCCTTTGAGGGGCCTGAGAAAGTGCA  197
            ||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct  445  AACCGCATGTCACGTCGCATTGTGCTGTCCAACATGAGGATGCAGTTCTCCTTTGAGGGCCCCGAGAAGGTGCA  518

Query  198  CAGCTCCTACTTCGAGGGGAAGCAGGTCTCAGTGACTAACGACGGCTCCCAGCTGGGAGCCCTGGTGTCCCCTG  271
            ||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||.|..|.|
Sbjct  519  CAGCTCCTACTTTGAGGGAAAGCAGGTCTCTGTGACTAATGATGGCTCCCAGCTGGGGGCCCTGGTGCCATCAG  592

Query  272  AGTGTGGTGACCTCAGCGAGCCCACCACCCTCAAGTCTCCGGCCCCCTCCAGTGACTTTGCGGACGCCATCACC  345
            |.|||||.|||||.||.|| ||||  .|||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.
Sbjct  593  AATGTGGAGACCTTAGTGA-CCCA--GCCCTCAAGTCTCCAGCCCCCTCCAGTGACTTTGCAGATGCCATCACG  663

Query  346  GAGCTGGAGGACGCCTTCTCTAGGCAAGTGAAATCACTGGCCGAGTCCATCGACGATGCCCTCAACTGCCGCAG  419
            ||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  664  GAACTGGAGGATGCCTTCTCCAGGCAGGTGAAATCCCTGGCTGAATCCATCGATGATGCCCTCAATTGCCGCAG  737

Query  420  CCTGCACACTGAGGAGGCACCGGCCCTGGATGCGGCGCGGGCCCGGGACACCGAACCCCAGACAGCCCTGCACG  493
            |||.||||.||||||||.|||.|||...||..||||.|||||.||||||||.||.|||.|..|||..||.||.|
Sbjct  738  CCTACACAGTGAGGAGGTACCAGCCTCAGACACGGCCCGGGCTCGGGACACTGAGCCCAAACCAGGTCTACATG  811

Query  494  GCATGGACCACCGCAAACTGGACGAGATGACGGCCTCGTACAGTGATGTCACCCTGTACATCGATGAGGAGGAG  567
            ||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||
Sbjct  812  GCATGGACCACCGCAAACTGGATGAGATGACAGCCTCGTATAGTGATGTGACCCTCTACATTGATGAGGAAGAG  885

Query  568  CTGTCGCCCCCTCTGCCCCTCTCGCAGGCAGGGGACCGGCCGTCCAGCACCGAGTCGGACCTGCGGCTACGGGC  641
            |||||.||.||.||.||.|||||.|||||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||..||.|
Sbjct  886  CTGTCACCACCGCTTCCACTCTCACAGGCTGGCGATCGGCCCTCCAGCACAGAGTCGGACCTGCGGCTGAGGTC  959

Query  642  TGGGGGCGCAGCCCCAGACTACTGGGCCCTGGCCCACAAAGAGGACAAGGCTGACACGGACACGAGCTGCCGGA  715
            ||||||.|||||||..||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  960  TGGGGGTGCAGCCCAGGACTACTGGGCCTTGGCCCACAAAGAGGACAAGGCTGACACGGACACAAGCTGCCGAA  1033

Query  716  GCACGCCGTCGCTGGAGCGGCAGGNGCAGCGGCTGCGGGTGGAGCATCTGCCGCTGCTCACCATCGAGCCACCC  789
            ||||.||.||.||||||||||..|.||..|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1034  GCACACCATCACTGGAGCGGCCAGAGCCACGGCTGCGGGTGGAGCACCTGCCCCTGCTTACCATTGAGCCACCC  1107

Query  790  AGCGACAGCTCTGTGGACCTTAGTGACCGCTCGGAGCGGGGGTCACTCAAGAGGCAGAGTGCTTACGAGCGCAG  863
            ||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||.||..|.||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 1108  AGTGATAGCTCCGTGGAACTCAGTGACCGCTCAGATCGCAGCTCACTCAAGAGGCAGAGTGCCTATGAGCGCAG  1181

Query  864  CCTTGGCGGGCAGCAGGGCAGTCCCAAGCATGGTCCCCACAGCGGCGCCCCCAAGAGCCTCCCCCGGGAGGAGC  937
            |||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|.|||.|||||||..||||||||.|||||||.|
Sbjct 1182  CCTCGGTGGGCAGCAGGGCAGCCCCAAGCATGGCCCCCACGGTGGCCCCCCCAAAGGCCTCCCCAGGGAGGAAC  1255

Query  938  CTGAGTTGCGGCCCCGGCCCCCCAGGCCCCTGGACAGCCACTTGGCCATCAATGGCTCAGCCAACCGGCAGAGC  1011
            ||||.||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.|||.|.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1256  CTGAATTGCGGCCTCGGCCCCCCAGACCTCTTGAGAGTCACCTAGCCATCAATGGTTCAGCCAACCGGCAGAGC  1329

Query 1012  AAGTCTGAGTCGGACTACTCAGACGGTGACAATGACAGCATCAACAGCACGTCCAACTCCAACGATACCATCAA  1085
            ||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||
Sbjct 1330  AAATCTGAGTCTGACTACTCAGATGGGGACAATGACAGCATCAACAGCACCTCCAACTCCAATGACACCATAAA  1403

Query 1086  CTGCAGCTCCGAGTCATCGTCCCGTGACAGCCTGCGGGAGCAGACGCTCAGCAAGCAGACCTACCACAAGGAGG  1159
            |||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||.
Sbjct 1404  CTGCAGCTCTGAGTCCTCATCACGGGACAGCCTGCGGGAACAGACACTCAGCAAGCAGACATACCACAAGGAGA  1477

Query 1160  CCCGCAACAGCTGGGACTCGCCTGCCTTTAGCAACGATGTCATCCGCAAGAGGCACTACCGCATCGGCCTGAAC  1233
            |||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.
Sbjct 1478  CCCGCAACAGCTGGGACTCTCCAGCTTTCAGCAACGATGTCATCCGTAAGAGGCATTACCGAATTGGCCTAAAT  1551

Query 1234  CTCTTCAACAAGAAGCCTGAGAAGGGAGTCCAGTACCTCATCGAGCGTGGCTTTGTGCCCGACACGCCCGTCGG  1307
            ||||||||||||||||||||||||||..|||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 1552  CTCTTCAACAAGAAGCCTGAGAAGGGCATCCAGTATCTCATTGAGCGCGGCTTCGTGCCCGACACGCCAGTGGG  1625

Query 1308  GGTGGCCCACTTCCTGCTGCAGCGCAAGGGCCTCAGCCGGCAGATGATCGGCGAGTTCCTGGGCAACCGGCAGA  1381
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 1626  AGTGGCCCACTTCCTGCTGCAGCGCAAGGGCCTCAGCCGCCAGATGATCGGTGAGTTCCTGGGAAACCGGCAGA  1699

Query 1382  AGCAGTTCAACCGTGACGTGCTCGACTGCGTCGTGGACGAGATGGACTTCTCTACCATGGAGCTGGATGAGGCC  1455
            ||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1700  AGCAGTTCAACCGTGATGTGCTCGACTGTGTTGTGGACGAGATGGACTTCTCTGCCATGGAGCTAGATGAAGCC  1773

Query 1456  CTCAGGAAATTCCAGGCGCACATCCGTGTCCAAGGGGAGGCTCAGAAAGTGGAGCGGCTCATAGAGGCGTTCAG  1529
            |||.||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1774  CTCCGGAAGTTCCAGGCACACATCCGAGTCCAAGGGGAGGCTCAGAAAGTGGAGCGGCTCATCGAGGCATTCAG  1847

Query 1530  CCAGCGCTACTGCATCTGCAACCCTGGGGTGGTGCGGCAATTCCGGAACCCAGACACCATTTTCATCCTGGCCT  1603
            ||||||.|||||..||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1848  CCAGCGGTACTGTGTCTGCAACCCAGGGGTGGTGCGACAGTTCCGGAACCCAGACACCATCTTCATCCTGGCCT  1921

Query 1604  TCGCCATCATCCTGCTGAACACCGACATGTACAGCCCCAATGTCAAGCCCGAGCGGAAAATGAAGCTAGAGGAC  1677
            ||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1922  TCGCCATCATCCTGCTCAACACAGACATGTACAGCCCCAATGTCAAGCCAGAGCGCAAAATGAAGCTGGAGGAC  1995

Query 1678  TTCATCAAGAACCTCCGAGGTGTGGACGATGGTGAGGACATTCCCCGTGAGATGCTGATGGGGATCTATGAACG  1751
            ||..||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||.|||.||.|||||||||||.||
Sbjct 1996  TTTGTCAAGAACCTCCGAGGTGTGGATGACGGTGAAGACATTCCCCGGGAGACGCTAATTGGGATCTATGAGCG  2069

Query 1752  GATCCGTAAGCGAGAGCTAAAGACCAATGAGGACCATGTGTCCCAGGTGCAGAAGGTGGAGAAGCTCATTGTGG  1825
            .||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 2070  AATCCGTAAGCGAGAACTGAAGACCAACGAGGACCACGTGTCCCAGGTGCAGAAGGTTGAGAAGCTCATCGTGG  2143

Query 1826  GGAAAAAGCCGATCGGATCCCTGCATCCCGGGCTCGGCTGTGTGCTCTCTCTGCCCCACCGTCGGTTGGTCTGC  1899
            |.||.||||||||.|||||||||||||..||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||..|.||||||
Sbjct 2144  GCAAGAAGCCGATTGGATCCCTGCATCATGGTCTTGGCTGTGTGCTGTCTCTTCCCCATCGACGACTAGTCTGC  2217

Query 1900  TACTGCCGGCTCTTTGAGGTTCCAGACCCAAACAAGCCCCAGAAACTCGGACTACACCAGCGAGAAATCTTCCT  1973
            |||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2218  TACTGCCGGCTTTTTGAAGTTCCTGACCCCAACAAACCCCAGAAGCTGGGACTACACCAGCGAGAGATCTTCCT  2291

Query 1974  GTTCAACGACCTCCTGGTGGTCACCAAGATCTTCCAGAAGAAGAAGAACTCGGTGACGTACAGCTTCCGACAGT  2047
            |||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 2292  GTTTAATGACCTCCTGGTGGTCACCAAGATCTTCCAGAAGAAGAAGAACTCGGTGACATACAGCTTCCGGCAGT  2365

Query 2048  CCTTCTCCTTGTACGGCATGCAGGTCCTGCTCTTCGAGAACCAGTACTACCCCAATGGCATCCGGCTCACCTCG  2121
            ||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.
Sbjct 2366  CCTTCTCCCTCTACGGCATGCAGGTCCTGCTCTTCGAGAACCAGTACTATCCCAATGGCATCCGGCTGACGTCT  2439

Query 2122  TCTGTCCCCGGAGCAGATATCAAAGTGTTAATAAACTTCAACGCCCCCAACCCTCAAGACCGGAAGAAATTCAC  2195
            .|||||||.||||||||.|||||||||.||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 2440  GCTGTCCCTGGAGCAGACATCAAAGTGCTAATAAACTTCAACGCTCCCAATCCTCAGGACCGGAAGAAGTTCAC  2513

Query 2196  CGATGACCTGCGGGAGTCCATTGCGGAAGTCCAAGAGATGGAGAAGCACAGGATAGAGTCGGAGCTCGAGAAGC  2269
            .||.||||||||||||||..|.||.|||||.||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||
Sbjct 2514  TGACGACCTGCGGGAGTCTGTCGCTGAAGTGCAAGAGATGGAGAAACACCGAATAGAGTCGGAGCTCGAGAAGC  2587

Query 2270  AGAAAGGCGTCGTGCGGCCCAGCATGTCCCAGTGCTCTAGCCTCAAAAAGGAGTCGGGCAACGGAACACTGAGC  2343
            |||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 2588  AGAAAGGTGTCGTGCGGCCCAGCATGTCACAGTGCTCCAGCCTCAAAAAGGAGTCAGGCAACGGGACACTGAGC  2661

Query 2344  CGGGCCTGCCTGGACGACAGCTATGCCAGCGGTGAGGGCCTCAAGCGCAGCGCCCTCAGCAGCTCCCTGCGGGA  2417
            .||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|.||
Sbjct 2662  AGGGCTTGCCTGGATGACAGCTATGCCAGTGGCGAGGGCCTCAAGCGCAGCGCCCTCAGCAGCTCACTGAGAGA  2735

Query 2418  CCTCTCGGAAGCCGGG----------GTC-CATCAT--------------------------------------  2442
            ||||||.|||||.|||          ||| ||.||.                                      
Sbjct 2736  CCTCTCAGAAGCGGGGAAGCGAGGGCGTCGCAGCAGTGCGGGATCGCTAGAGAGCAATGTGGAATTTCAGCCCT  2809

Query 2443  --------------------------------  2442
                                            
Sbjct 2810  TCCAGCCACCACAGCCTCCAGTGCTGTGCTCC  2841