Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14034
• Subject: NM_001331043.1
• Aligned Length: 1443
• Identities: 1315
• Gaps: 19

Alignment

Query    1  ATGGCAGAGCTGCAGATGTTACTAGAGGAGGAGATCCCGTCTGGCAAGAGGGCGCTGATCGAGAGTTACCAGAA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCAGAGCTGCAGATGTTACTAGAGGAGGAGATCCCGTCTGGCAAGAGGGCGCTGATAGAGAGTTACCAGAA  74

Query   75  CCTGACTCGGGTGGCAGACTACTGTGAAAACAACTACATACAGGCTACAGACAAGAGAAAAGCTTTAGAGGAGA  148
            ||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||.||||
Sbjct   75  CCTGACCCGGGTGGCGGACTACTGTGAAAACAACTATATACAGGCTACAGACAAGAGAAAAGCTCTAGAAGAGA  148

Query  149  CCAAAGCCTATACAACCCAATCTCTAGCTAGTGTTGCTTATCAAATAAATGCATTGGCCAACAATGTACTCCAG  222
            |||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  CCAAAGCATATACAACTCAATCTCTAGCTAGTGTTGCTTATCAAATAAATGCATTGGCCAACAATGTGCTCCAG  222

Query  223  TTGCTGGATATCCAAGCCTCTCAGCTTCGGAGAATGGAGTCTTCCATCAATCATATCTCACAGACTGTGGATAT  296
            .||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGCTGGATATCCAAGCATCTCAGCTGCGGAGGATGGAGTCATCCATCAATCACATCTCACAGACTGTGGATAT  296

Query  297  TCATAAGGAGAAAGTGGCACGAAGAGAGATTGGTATTTTGACAACAAATAAGAATACATCAAGAACTCACAAAA  370
            ||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCATAAAGAAAAAGTGGCTCGAAGAGAGATTGGTATTTTGACAACAAATAAGAATACATCAAGAACTCACAAAA  370

Query  371  TAATAGCACCTGCGAATATGGAGCGCCCTGTAAGGTATATTCGGAAACCTATCGATTACACAGTTCTGGATGAT  444
            ||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  371  TAATCGCACCCGCAAATATGGAGCGTCCTGTCAGGTATATTCGGAAACCTATCGACTATACAGTTCTGGATGAT  444

Query  445  GTGGGCCATGGTGT---------------CAAGCATGGAAATAACCAGCCTGCAAGAACTGGCACACTGTCGAG  503
            |||||||||||.||               ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  445  GTGGGCCATGGAGTTAAGTGGCTAAAAGCCAAGCACGGAAATAACCAGCCTGCAAGAACTGGCACATTGTCGAG  518

Query  504  AACAAATCCTCCTACTCAGAAACCGCCAAGTCCTCCCATGTCAGGCCGGGGAACACTGGGACGGAATACTCCTT  577
            ||||||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||.||||.|||||.||.||..|||||||||||||.||||
Sbjct  519  AACAAACCCTCCCACGCAGAAACCACCAAGCCCTCCCGTGTCGGGCCGAGGGACTTTGGGACGGAATACCCCTT  592

Query  578  ATAAAACCCTGGAACCTGTTAAACCCCCAACAGTTCCTAATGACTATATGACCAGTCCTGCTAGGCTTGGAAGT  651
            |.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct  593  ACAAAACCCTAGAGCCTGTTAAGCCTCCAACAGTTCCCAATGACTACATGACTAGTCCTGCGAGGCTTGGAAGC  666

Query  652  CAGCATAGTCCAGGCAGGACAGCATCTTTAAATCAGAGACCAAGGACACACAGTGGAAGTAGTGGAGGAAGTGG  725
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct  667  CAGCATAGTCCAGGCAGGACAGCTTCTTTAAATCAGAGACCAAGGACGCATAGTGGAAGTAGTGGAGGAAGCGG  740

Query  726  AAGTCGAGAAAACAGTGGTAGCAGTAGTATTGGCATTCCCATTGCTGTGCCTACACCTTCGCCACCCACTATTG  799
            |||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||...|
Sbjct  741  AAGCCGAGAGAACAGTGGGAGCAGCAGCATTGGCATTCCTATTGCTGTGCCTACGCCCTCACCGCCCACTGCGG  814

Query  800  GACCAGCAGCCCCGGGCTCAGCTCCTGGTTCCCAGTATGGCACAATGACCAGGCAGATATCTCGACACAACTCT  873
            |.|   |||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  815  GCC---CAGCCCCTGGCGCAGCTCCTGGTTCCCAGTATGGCACAATGACCAGGCAGATTTCTCGACACAACTCT  885

Query  874  ACTACTTCTTCGACATCTTCTGGTGGATACAGACGAACTCCCTCTGTGACTGCTCAATTTTCTGCTCAGCCTCA  947
            ||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|.||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  886  ACCACTTCTTCGACATCTTCTGGTGGATATAGACGAACTCCTTCTGTGGCCGCCCAATTCTCTGCTCAGCCTCA  959

Query  948  TGTTAATGGAGGTCCACTTTATTCTCAAAATTCAATTTCTATTGCTCCACCCCCTCCCCCTATGCCTCAGTTGA  1021
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||.||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct  960  TGTTAATGGAGGTCCACTTTATTCTCAAAATTCAATTTCTGTTGCCCCTCCTCCTCCCCCCATGCCTCAGTTGA  1033

Query 1022  CTCCACAGATACCTCTCACAGGCTTCGTGGCCAGGGTGCAGGAAAACATTGCTGATAGTCCAACTCCACCGCCA  1095
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1034  CTCCACAGATCCCTCTCACAGGCTTCGTGGCCAGGGTGCAGGAAAACATTGCTGATAGCCCAACTCCACCACCA  1107

Query 1096  CCACCTCCACCAGATGACATTCCCATGTTTGATGACTCTCCACCTCCCCCACCACCACCACCAGTGGATTATGA  1169
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.|||||.|||||
Sbjct 1108  CCCCCTCCACCAGATGACATTCCCATGTTTGATGACTCTCCGCCTCCTCCGCCACCTCCTCCTGTGGACTATGA  1181

Query 1170  AGATGAGGAGGCTGCAGTAGTTCAGTATAATGATCCATATGCAGATGGGGATCCTGCTTGGGCCCCCAAGAATT  1243
            |||||||||.|||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|
Sbjct 1182  AGATGAGGAAGCTGCAGTAGTTCAGTATAGTGACCCATATGCAGATGGGGACCCTGCATGGGCTCCCAAGAACT  1255

Query 1244  ATATTGAGAAAGTTGTTGCAATATATGATTATACAAAAGACAAGGATGATGAGCTGTCATTTATGGAGGGTGCA  1317
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||..|||||||||
Sbjct 1256  ATATTGAGAAAGTTGTTGCAATATATGATTATACAAAAGACAAGGATGATGAGCTGTCCTTTAAAGAGGGTGCA  1329

Query 1318  ATCATTTATGTTATAAAGAAGAATGATGATGGCTGGTATGAAGGAGTCTGCAATCGAGTGACTGGTCTGTTCCC  1391
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1330  ATCATCTATGTTATAAAGAAGAATGATGATGGCTGGTTTGAAGGAGTTTGCAATCGAGTGACTGGACTCTTCCC  1403

Query 1392  TGGGAACTATGTTGAATCAATCATGCA-TATACTGAT  1427
            ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1404  TGGGAACTATGTTGAATCAATCATGCACTATACTGAT  1440