Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14034
• Subject: NM_001348029.1
• Aligned Length: 1521
• Identities: 1426
• Gaps: 94

Alignment

Query    1  ATGGCAGAGCTGCAGATGTTACTAGAGGAGGAGATCCCGTCTGGCAAGAGGGCGCTGATCGAGAGTTACCAGAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCAGAGCTGCAGATGTTACTAGAGGAGGAGATCCCGTCTGGCAAGAGGGCGCTGATCGAGAGTTACCAGAA  74

Query   75  CCTGACTCGGGTGGCAGACTACTGTGAAAACAACTACATACAGGCTACAGACAAGAGAAAAGCTTTAGAGGAGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTGACTCGGGTGGCAGACTACTGTGAAAACAACTACATACAGGCTACAGACAAGAGAAAAGCTTTAGAGGAGA  148

Query  149  CCAAAGCCTATACAACCCAATCTCTAGCTAGTGTTGCTTATCAAATAAATGCATTGGCCAACAATGTACTCCAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCAAAGCCTATACAACCCAATCTCTAGCTAGTGTTGCTTATCAAATAAATGCATTGGCCAACAATGTACTCCAG  222

Query  223  TTGCTGGATATCCAAGCCTCTCAGCTTCGGAGAATGGAGTCTTCCATCAATCATATCTCACAGACTGTGGATAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTGCTGGATATCCAAGCCTCTCAGCTTCGGAGAATGGAGTCTTCCATCAATCATATCTCACAGACTGTGGATAT  296

Query  297  TCATAAGGAGAAAGTGGCACGAAGAGAGATTGGTATTTTGACAACAAATAAGAATACATCAAGAACTCACAAAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCATAAGGAGAAAGTGGCACGAAGAGAGATTGGTATTTTGACAACAAATAAGAATACATCAAGAACTCACAAAA  370

Query  371  TAATAGCACCTGCGAATATGGAGCGCCCTGTAAGGTATATTCGGAAACCTATCGATTACACAGTTCTGGATGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TAATAGCACCTGCGAATATGGAGCGCCCTGTAAGGTATATTCGGAAACCTATCGATTACACAGTTCTGGATGAT  444

Query  445  GTGGGCCATGGTGT---------------CAAGCATGGAAATAACCAGCCTGCAAGAACTGGCACACTGTCGAG  503
            ||||||||||||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTGGGCCATGGTGTCAAGTGGCTAAAAGCCAAGCATGGAAATAACCAGCCTGCAAGAACTGGCACACTGTCGAG  518

Query  504  AACAAATCCTCCTACTCAGAAACCGCCAAGTCCTCCCATGTCAGGCCGGGGAACACTGGGACGGAATACTCCTT  577
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AACAAATCCTCCTACTCAGAAACCGCCAAGTCCTCCCATGTCAGGCCGGGGAACACTGGGACGGAATACTCCTT  592

Query  578  ATAAAACCCTGGAACCTGTTAAACCCCCAACAGTTCCTAATGACTATATGACCAGTCCTGCTAGGCTTGGAAGT  651
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATAAAACCCTGGAACCTGTTAAACCCCCAACAGTTCCTAATGACTATATGACCAGTCCTGCTAGGCTTGGAAGT  666

Query  652  CAGCATAGTCCAGGCAGGACAGCATCTTTAAATCAGAGACCAAGGACACACAGTGGAAGTAGTGGAGGAAGTGG  725
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGCATAGTCCAGGCAGGACAGCATCTTTAAATCAGAGACCAAGGACACACAGTGGAAGTAGTGGAGGAAGTGG  740

Query  726  AAGTCGAGAAAACAGTGGTAGCAGTAGTATTGGCATTCCCATTGCTGTGCCTACACCTTCGCCACCCACTATTG  799
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AAGTCGAGAAAACAGTGGTAGCAGTAGTATTGGCATTCCCATTGCTGTGCCTACACCTTCGCCACCCACTATTG  814

Query  800  GACCAG--------------------------------------------------------------------  805
            ||||||                                                                    
Sbjct  815  GACCAGAAAACATTTCTGTCCCTCCTCCTTCTGGAGCTCCACCAGCACCACCTCTGGCACCACTTCTCCCAGTG  888

Query  806  ----------CAGCCCCGGGCTCAGCTCCTGGTTCCCAGTATGGCACAATGACCAGGCAGATATCTCGACACAA  869
                      .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGCACTGTGATAGCCCCGGGCTCAGCTCCTGGTTCCCAGTATGGCACAATGACCAGGCAGATATCTCGACACAA  962

Query  870  CTCTACTACTTCTTCGACATCTTCTGGTGGATACAGACGAACTCCCTCTGTGACTGCTCAATTTTCTGCTCAGC  943
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTCTACTACTTCTTCGACATCTTCTGGTGGATACAGACGAACTCCCTCTGTGACTGCTCAATTTTCTGCTCAGC  1036

Query  944  CTCATGTTAATGGAGGTCCACTTTATTCTCAAAATTCAATTTCTATTGCTCCACCCCCTCCCCCTATGCCTCAG  1017
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTCATGTTAATGGAGGTCCACTTTATTCTCAAAATTCAATTTCTATTGCTCCACCCCCTCCCCCTATGCCTCAG  1110

Query 1018  TTGACTCCACAGATACCTCTCACAGGCTTCGTGGCCAGGGTGCAGGAAAACATTGCTGATAGTCCAACTCCACC  1091
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTGACTCCACAGATACCTCTCACAGGCTTCGTGGCCAGGGTGCAGGAAAACATTGCTGATAGTCCAACTCCACC  1184

Query 1092  GCCACCACCTCCACCAGATGACATTCCCATGTTTGATGACTCTCCACCTCCCCCACCACCACCACCAGTGGATT  1165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCCACCACCTCCACCAGATGACATTCCCATGTTTGATGACTCTCCACCTCCCCCACCACCACCACCAGTGGATT  1258

Query 1166  ATGAAGATGAGGAGGCTGCAGTAGTTCAGTATAATGATCCATATGCAGATGGGGATCCTGCTTGGGCCCCCAAG  1239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATGAAGATGAGGAGGCTGCAGTAGTTCAGTATAATGATCCATATGCAGATGGGGATCCTGCTTGGGCCCCCAAG  1332

Query 1240  AATTATATTGAGAAAGTTGTTGCAATATATGATTATACAAAAGACAAGGATGATGAGCTGTCATTTATGGAGGG  1313
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AATTATATTGAGAAAGTTGTTGCAATATATGATTATACAAAAGACAAGGATGATGAGCTGTCATTTATGGAGGG  1406

Query 1314  TGCAATCATTTATGTTATAAAGAAGAATGATGATGGCTGGTATGAAGGAGTCTGCAATCGAGTGACTGGTCTGT  1387
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGCAATCATTTATGTTATAAAGAAGAATGATGATGGCTGGTATGAAGGAGTCTGCAATCGAGTGACTGGTCTGT  1480

Query 1388  TCCCTGGGAACTATGTTGAATCAATCATGCA-TATACTGAT  1427
            ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1481  TCCCTGGGAACTATGTTGAATCAATCATGCACTATACTGAT  1521