Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14034
• Subject: NM_001348030.1
• Aligned Length: 1428
• Identities: 1340
• Gaps: 88

Alignment

Query    1  ATGGCAGAGCTGCAGATGTTACTAGAGGAGGAGATCCCGTCTGGCAAGAGGGCGCTGATCGAGAGTTACCAGAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCAGAGCTGCAGATGTTACTAGAGGAGGAGATCCCGTCTGGCAAGAGGGCGCTGATCGAGAGTTACCAGAA  74

Query   75  CCTGACTCGGGTGGCAGACTACTGTGAAAACAACTACATACAGGCTACAGACAAGAGAAAAGCTTTAGAGGAGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTGACTCGGGTGGCAGACTACTGTGAAAACAACTACATACAGGCTACAGACAAGAGAAAAGCTTTAGAGGAGA  148

Query  149  CCAAAGCCTATACAACCCAATCTCTAGCTAGTGTTGCTTATCAAATAAATGCATTGGCCAACAATGTACTCCAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCAAAGCCTATACAACCCAATCTCTAGCTAGTGTTGCTTATCAAATAAATGCATTGGCCAACAATGTACTCCAG  222

Query  223  TTGCTGGATATCCAAGCCTCTCAGCTTCGGAGAATGGAGTCTTCCATCAATCATATCTCACAGACTGTGGATAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTGCTGGATATCCAAGCCTCTCAGCTTCGGAGAATGGAGTCTTCCATCAATCATATCTCACAGACTGTGGATAT  296

Query  297  TCATAAGGAGAAAGTGGCACGAAGAGAGATTGGTATTTTGACAACAAATAAGAATACATCAAGAACTCACAAAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCATAAGGAGAAAGTGGCACGAAGAGAGATTGGTATTTTGACAACAAATAAGAATACATCAAGAACTCACAAAA  370

Query  371  TAATAGCACCTGCGAATATGGAGCGCCCTGTAAGGTATATTCGGAAACCTATCGATTACACAGTTCTGGATGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TAATAGCACCTGCGAATATGGAGCGCCCTGTAAGGTATATTCGGAAACCTATCGATTACACAGTTCTGGATGAT  444

Query  445  GTGGGCCATGGTGTCAAGCATGGAAATAACCAGCCTGCAAGAACTGGCACACTGTCGAGAACAAATCCTCCTAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTGGGCCATGGTGTCAAGCATGGAAATAACCAGCCTGCAAGAACTGGCACACTGTCGAGAACAAATCCTCCTAC  518

Query  519  TCAGAAACCGCCAAGTCCTCCCATGTCAGGCCGGGGAACACTGGGACGGAATACTCCTTATAAAACCCTGGAAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCAGAAACCGCCAAGTCCTCCCATGTCAGGCCGGGGAACACTGGGACGGAATACTCCTTATAAAACCCTGGAAC  592

Query  593  CTGTTAAACCCCCAACAGTTCCTAATGACTATATGACCAGTCCTGCTAGGCTTGGAAGTCAGCATAGTCCAGGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTGTTAAACCCCCAACAGTTCCTAATGACTATATGACCAGTCCTGCTAGGCTTGGAAGTCAGCATAGTCCAGGC  666

Query  667  AGGACAGCATCTTTAAATCAGAGACCAAGGACACACAGTGGAAGTAGTGGAGGAAGTGGAAGTCGAGAAAACAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGGACAGCATCTTTAAATCAGAGACCAAGGACACACAGTGGAAGTAGTGGAGGAAGTGGAAGTCGAGAAAACAG  740

Query  741  TGGTAGCAGTAGTATTGGCATTCCCATTGCTGTGCCTACACCTTCGCCACCCACTATTGGACCAGCAGCCCCGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGGTAGCAGTAGTATTGGCATTCCCATTGCTGTGCCTACACCTTCGCCACCCACTATTGGACCAGCAGCCCCGG  814

Query  815  GCTCAGCTCCTGGTTCCCAGTATGGCACAATGACCAGGCAGATATCTCGACACAACTCTACTACTTCTTCGACA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCTCAGCTCCTGGTTCCCAGTATGGCACAATGACCAGGCAGATATCTCGACACAACTCTACTACTTCTTCGACA  888

Query  889  TCTTCTGGTGGATACAGACGAACTCCCTCTGTGACTGCTCAATTTTCTGCTCAGCCTCATGTTAATGGAGGTCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCTTCTGGTGGATACAGACGAACTCCCTCTGTGACTGCTCAATTTTCTGCTCAGCCTCATGTTAATGGAGGTCC  962

Query  963  ACTTTATTCTCAAAATTCAATTTCTATTGCTCCACCCCCTCCCCCTATGCCTCAGTTGACTCCACAGATACCTC  1036
            |||||||||||||||||||                                                       
Sbjct  963  ACTTTATTCTCAAAATTCA-------------------------------------------------------  981

Query 1037  TCACAGGCTTCGTGGCCAGGGTGCAGGAAAACATTGCTGATAGTCCAACTCCACCGCCACCACCTCCACCAGAT  1110
                                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  982  --------------------------------ATTGCTGATAGTCCAACTCCACCGCCACCACCTCCACCAGAT  1023

Query 1111  GACATTCCCATGTTTGATGACTCTCCACCTCCCCCACCACCACCACCAGTGGATTATGAAGATGAGGAGGCTGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1024  GACATTCCCATGTTTGATGACTCTCCACCTCCCCCACCACCACCACCAGTGGATTATGAAGATGAGGAGGCTGC  1097

Query 1185  AGTAGTTCAGTATAATGATCCATATGCAGATGGGGATCCTGCTTGGGCCCCCAAGAATTATATTGAGAAAGTTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1098  AGTAGTTCAGTATAATGATCCATATGCAGATGGGGATCCTGCTTGGGCCCCCAAGAATTATATTGAGAAAGTTG  1171

Query 1259  TTGCAATATATGATTATACAAAAGACAAGGATGATGAGCTGTCATTTATGGAGGGTGCAATCATTTATGTTATA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1172  TTGCAATATATGATTATACAAAAGACAAGGATGATGAGCTGTCATTTATGGAGGGTGCAATCATTTATGTTATA  1245

Query 1333  AAGAAGAATGATGATGGCTGGTATGAAGGAGTCTGCAATCGAGTGACTGGTCTGTTCCCTGGGAACTATGTTGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1246  AAGAAGAATGATGATGGCTGGTATGAAGGAGTCTGCAATCGAGTGACTGGTCTGTTCCCTGGGAACTATGTTGA  1319

Query 1407  ATCAATCATGCA-TATACTGAT  1427
            |||||||||||| |||||||||
Sbjct 1320  ATCAATCATGCACTATACTGAT  1341