Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14034
• Subject: NM_001348031.1
• Aligned Length: 1444
• Identities: 1227
• Gaps: 201

Alignment

Query    1  ATGGCAGAGCTGCAGATGTTACTAGAGGAGGAGATCCCGTCTGGCAAGAGGGCGCTGATCGAGAGTTACCAGAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCAGAGCTGCAGATGTTACTAGAGGAGGAGATCCCGTCTGGCAAGAGGGCGCTGATCGAGAGTTACCAGAA  74

Query   75  CCTGACTCGGGTGGCAGACTACTGTGAAAACAACTACATACAGGCTACAGACAAGAGAAAAGCTTTAGAGGAGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTGACTCGGGTGGCAGACTACTGTGAAAACAACTACATACAGGCTACAGACAAGAGAAAAGCTTTAGAGGAGA  148

Query  149  CCAAAGCCTATACAACCCAATCTCTAGCTAGTGTTGCTTATCAAATAAATGCATTGGCCAACAATGTACTCCAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCAAAGCCTATACAACCCAATCTCTAGCTAGTGTTGCTTATCAAATAAATGCATTGGCCAACAATGTACTCCAG  222

Query  223  TTGCTGGATATCCAAGCCTCTCAGCTTCGGAGAATGGAGTCTTCCATCAATCATATCTCACAGACTGTGGATAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTGCTGGATATCCAAGCCTCTCAGCTTCGGAGAATGGAGTCTTCCATCAATCATATCTCACAGACTGTGGATAT  296

Query  297  TCATAAGGAGAAAGTGGCACGAAGAGAGATTGGTATTTTGACAACAAATAAGAATACATCAAGAACTCACAAAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCATAAGGAGAAAGTGGCACGAAGAGAGATTGGTATTTTGACAACAAATAAGAATACATCAAGAACTCACAAAA  370

Query  371  TAATAGCACCTGCGAATATGGAGCGCCCTGTAAGGTATATTCGGAAACCTATCGATTACACAGTTCTGGATGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TAATAGCACCTGCGAATATGGAGCGCCCTGTAAGGTATATTCGGAAACCTATCGATTACACAGTTCTGGATGAT  444

Query  445  GTGGGCCATGGTGT---------------CAAGCATGGAAATAACCAGCCTGCAAGAACTGGCACACTGTCGAG  503
            ||||||||||||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTGGGCCATGGTGTCAAGTGGCTAAAAGCCAAGCATGGAAATAACCAGCCTGCAAGAACTGGCACACTGTCGAG  518

Query  504  AACAAATCCTCCTACTCAGAAACCGCCAAGTCCTCCCATGTCAGGCCGGGGAACACTGGGACGGAATACTCCTT  577
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AACAAATCCTCCTACTCAGAAACCGCCAAGTCCTCCCATGTCAGGCCGGGGAACACTGGGACGGAATACTCCTT  592

Query  578  ATAAAACCCTGGAACCTGTTAAACCCCCAACAGTTCCTAATGACTATATGACCAGTCCTGCTAGGCTTGGAAGT  651
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATAAAACCCTGGAACCTGTTAAACCCCCAACAGTTCCTAATGACTATATGACCAGTCCTGCTAGGCTTGGAAGT  666

Query  652  CAGCATAGTCCAGGCAGGACAGCATCTTTAAATCAGAGACCAAGGACACACAGTGGAAGTAGTGGAGGAAGTGG  725
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGCATAGTCCAGGCAGGACAGCATCTTTAAATCAGAGACCAAGGACACACAGTGGAAGTAGTGGAGGAAGTGG  740

Query  726  AAGTCGAGAAAACAGTGGTAGCAGTAGTATTGGCATTCCCATTGCTGTGCCTACACCTTCGCCACCCACTATTG  799
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AAGTCGAGAAAACAGTGGTAGCAGTAGTATTGGCATTCCCATTGCTGTGCCTACACCTTCGCCACCCACTATTG  814

Query  800  GACCAGCAGCCCCGGGCTCAGCTCCTGGTTCCCAGTATGGCACAATGACCAGGCAGATATCTCGACACAACTCT  873
            ||||||.|                                                                  
Sbjct  815  GACCAGAA------------------------------------------------------------------  822

Query  874  ACTACTTCTTCGACATCTTCTGGTGGATACAGACGAACTCCCTCTGTGACTGCTCAATTTTCTGCTCAGCCTCA  947
                       .|||| |||||                ||||||        |||   .|||            
Sbjct  823  -----------AACAT-TTCTG----------------TCCCTC--------CTC---CTTC------------  845

Query  948  TGTTAATGGAGGTCCACTTTATTCTCAAAATTCAATTTCTATTGCTCCACCCCCTCCCCCTATGCCTCAGTTGA  1021
                  |||||.|||||                           |..||||.||||               ||.
Sbjct  846  ------TGGAGCTCCAC---------------------------CAGCACCACCTC---------------TGG  871

Query 1022  CTCCACAGATACCTCTCACAGGCTTCGTGGCCAGGGTGCAGGAAAACA-TTGCTGATAGTCCAACTCCACCGCC  1094
            |.||      ||.||||.||      |||..||..|||       |.| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  872  CACC------ACTTCTCCCA------GTGAGCACTGTG-------ATAGTTGCTGATAGTCCAACTCCACCGCC  926

Query 1095  ACCACCTCCACCAGATGACATTCCCATGTTTGATGACTCTCCACCTCCCCCACCACCACCACCAGTGGATTATG  1168
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  927  ACCACCTCCACCAGATGACATTCCCATGTTTGATGACTCTCCACCTCCCCCACCACCACCACCAGTGGATTATG  1000

Query 1169  AAGATGAGGAGGCTGCAGTAGTTCAGTATAATGATCCATATGCAGATGGGGATCCTGCTTGGGCCCCCAAGAAT  1242
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1001  AAGATGAGGAGGCTGCAGTAGTTCAGTATAATGATCCATATGCAGATGGGGATCCTGCTTGGGCCCCCAAGAAT  1074

Query 1243  TATATTGAGAAAGTTGTTGCAATATATGATTATACAAAAGACAAGGATGATGAGCTGTCATTTATGGAGGGTGC  1316
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1075  TATATTGAGAAAGTTGTTGCAATATATGATTATACAAAAGACAAGGATGATGAGCTGTCATTTATGGAGGGTGC  1148

Query 1317  AATCATTTATGTTATAAAGAAGAATGATGATGGCTGGTATGAAGGAGTCTGCAATCGAGTGACTGGTCTGTTCC  1390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1149  AATCATTTATGTTATAAAGAAGAATGATGATGGCTGGTATGAAGGAGTCTGCAATCGAGTGACTGGTCTGTTCC  1222

Query 1391  CTGGGAACTATGTTGAATCAATCATGCA-TATACTGAT  1427
            |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1223  CTGGGAACTATGTTGAATCAATCATGCACTATACTGAT  1260