Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14034
• Subject: NM_007380.4
• Aligned Length: 1428
• Identities: 1314
• Gaps: 4

Alignment

Query    1  ATGGCAGAGCTGCAGATGTTACTAGAGGAGGAGATCCCGTCTGGCAAGAGGGCGCTGATCGAGAGTTACCAGAA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCAGAGCTGCAGATGTTACTAGAGGAGGAGATCCCGTCTGGCAAGAGGGCGCTGATAGAGAGTTACCAGAA  74

Query   75  CCTGACTCGGGTGGCAGACTACTGTGAAAACAACTACATACAGGCTACAGACAAGAGAAAAGCTTTAGAGGAGA  148
            ||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||.||||
Sbjct   75  CCTGACCCGGGTGGCGGACTACTGTGAAAACAACTATATACAGGCTACAGACAAGAGAAAAGCTCTAGAAGAGA  148

Query  149  CCAAAGCCTATACAACCCAATCTCTAGCTAGTGTTGCTTATCAAATAAATGCATTGGCCAACAATGTACTCCAG  222
            |||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  CCAAAGCATATACAACTCAATCTCTAGCTAGTGTTGCTTATCAAATAAATGCATTGGCCAACAATGTGCTCCAG  222

Query  223  TTGCTGGATATCCAAGCCTCTCAGCTTCGGAGAATGGAGTCTTCCATCAATCATATCTCACAGACTGTGGATAT  296
            .||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGCTGGATATCCAAGCATCTCAGCTGCGGAGGATGGAGTCATCCATCAATCACATCTCACAGACTGTGGATAT  296

Query  297  TCATAAGGAGAAAGTGGCACGAAGAGAGATTGGTATTTTGACAACAAATAAGAATACATCAAGAACTCACAAAA  370
            ||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCATAAAGAAAAAGTGGCTCGAAGAGAGATTGGTATTTTGACAACAAATAAGAATACATCAAGAACTCACAAAA  370

Query  371  TAATAGCACCTGCGAATATGGAGCGCCCTGTAAGGTATATTCGGAAACCTATCGATTACACAGTTCTGGATGAT  444
            ||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  371  TAATCGCACCCGCAAATATGGAGCGTCCTGTCAGGTATATTCGGAAACCTATCGACTATACAGTTCTGGATGAT  444

Query  445  GTGGGCCATGGTGTCAAGCATGGAAATAACCAGCCTGCAAGAACTGGCACACTGTCGAGAACAAATCCTCCTAC  518
            |||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||.||
Sbjct  445  GTGGGCCATGGAGTTAAGCACGGAAATAACCAGCCTGCAAGAACTGGCACATTGTCGAGAACAAACCCTCCCAC  518

Query  519  TCAGAAACCGCCAAGTCCTCCCATGTCAGGCCGGGGAACACTGGGACGGAATACTCCTTATAAAACCCTGGAAC  592
            .||||||||.|||||.||||||.||||.|||||.||.||..|||||||||||||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct  519  GCAGAAACCACCAAGCCCTCCCGTGTCGGGCCGAGGGACTTTGGGACGGAATACCCCTTACAAAACCCTAGAGC  592

Query  593  CTGTTAAACCCCCAACAGTTCCTAATGACTATATGACCAGTCCTGCTAGGCTTGGAAGTCAGCATAGTCCAGGC  666
            |||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  593  CTGTTAAGCCTCCAACAGTTCCCAATGACTACATGACTAGTCCTGCGAGGCTTGGAAGCCAGCATAGTCCAGGC  666

Query  667  AGGACAGCATCTTTAAATCAGAGACCAAGGACACACAGTGGAAGTAGTGGAGGAAGTGGAAGTCGAGAAAACAG  740
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct  667  AGGACAGCTTCTTTAAATCAGAGACCAAGGACGCATAGTGGAAGTAGTGGAGGAAGCGGAAGCCGAGAGAACAG  740

Query  741  TGGTAGCAGTAGTATTGGCATTCCCATTGCTGTGCCTACACCTTCGCCACCCACTATTGGACCAGCAGCCCCGG  814
            |||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||...||.|   |||||||.|
Sbjct  741  TGGGAGCAGCAGCATTGGCATTCCTATTGCTGTGCCTACGCCCTCACCGCCCACTGCGGGCC---CAGCCCCTG  811

Query  815  GCTCAGCTCCTGGTTCCCAGTATGGCACAATGACCAGGCAGATATCTCGACACAACTCTACTACTTCTTCGACA  888
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  812  GCGCAGCTCCTGGTTCCCAGTATGGCACAATGACCAGGCAGATTTCTCGACACAACTCTACCACTTCTTCGACA  885

Query  889  TCTTCTGGTGGATACAGACGAACTCCCTCTGTGACTGCTCAATTTTCTGCTCAGCCTCATGTTAATGGAGGTCC  962
            ||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  886  TCTTCTGGTGGATATAGACGAACTCCTTCTGTGGCCGCCCAATTCTCTGCTCAGCCTCATGTTAATGGAGGTCC  959

Query  963  ACTTTATTCTCAAAATTCAATTTCTATTGCTCCACCCCCTCCCCCTATGCCTCAGTTGACTCCACAGATACCTC  1036
            |||||||||||||||||||||||||.||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  960  ACTTTATTCTCAAAATTCAATTTCTGTTGCCCCTCCTCCTCCCCCCATGCCTCAGTTGACTCCACAGATCCCTC  1033

Query 1037  TCACAGGCTTCGTGGCCAGGGTGCAGGAAAACATTGCTGATAGTCCAACTCCACCGCCACCACCTCCACCAGAT  1110
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1034  TCACAGGCTTCGTGGCCAGGGTGCAGGAAAACATTGCTGATAGCCCAACTCCACCACCACCCCCTCCACCAGAT  1107

Query 1111  GACATTCCCATGTTTGATGACTCTCCACCTCCCCCACCACCACCACCAGTGGATTATGAAGATGAGGAGGCTGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1108  GACATTCCCATGTTTGATGACTCTCCGCCTCCTCCGCCACCTCCTCCTGTGGACTATGAAGATGAGGAAGCTGC  1181

Query 1185  AGTAGTTCAGTATAATGATCCATATGCAGATGGGGATCCTGCTTGGGCCCCCAAGAATTATATTGAGAAAGTTG  1258
            ||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1182  AGTAGTTCAGTATAGTGACCCATATGCAGATGGGGACCCTGCATGGGCTCCCAAGAACTATATTGAGAAAGTTG  1255

Query 1259  TTGCAATATATGATTATACAAAAGACAAGGATGATGAGCTGTCATTTATGGAGGGTGCAATCATTTATGTTATA  1332
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||..||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1256  TTGCAATATATGATTATACAAAAGACAAGGATGATGAGCTGTCCTTTAAAGAGGGTGCAATCATCTATGTTATA  1329

Query 1333  AAGAAGAATGATGATGGCTGGTATGAAGGAGTCTGCAATCGAGTGACTGGTCTGTTCCCTGGGAACTATGTTGA  1406
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1330  AAGAAGAATGATGATGGCTGGTTTGAAGGAGTTTGCAATCGAGTGACTGGACTCTTCCCTGGGAACTATGTTGA  1403

Query 1407  ATCAATCATGCA-TATACTGAT  1427
            |||||||||||| |||||||||
Sbjct 1404  ATCAATCATGCACTATACTGAT  1425