Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14034
- Subject:
- XM_006497619.1
- Aligned Length:
- 1443
- Identities:
- 1072
- Gaps:
- 280
Alignment
Query 1 ATGGCAGAGCTGCAGATGTTACTAGAGGAGGAGATCCCGTCTGGCAAGAGGGCGCTGATCGAGAGTTACCAGAA 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCAGAGCTGCAGATGTTACTAGAGGAGGAGATCCCGTCTGGCAAGAGGGCGCTGATAGAGAGTTACCAGAA 74
Query 75 CCTGACTCGGGTGGCAGACTACTGTGAAAACAACTACATACAGGCTACAGACAAGAGAAAAGCTTTAGAGGAGA 148
||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||.||||
Sbjct 75 CCTGACCCGGGTGGCGGACTACTGTGAAAACAACTATATACAGGCTACAGACAAGAGAAAAGCTCTAGAAGAGA 148
Query 149 CCAAAGCCTATACAACCCAATCTCTAGCTAGTGTTGCTTATCAAATAAATGCATTGGCCAACAATGTACTCCAG 222
|||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 149 CCAAAGCATATACAACTCAATCTCTAGCTAGTGTTGCTTATCAAATAAATGCATTGGCCAACAATGTGCTCCAG 222
Query 223 TTGCTGGATATCCAAGCCTCTCAGCTTCGGAGAATGGAGTCTTCCATCAATCATATCTCACAGACTGTGGATAT 296
.||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTGCTGGATATCCAAGCATCTCAGCTGCGGAGGATGGAGTCATCCATCAATCACATCTCACAGACTGTGGATAT 296
Query 297 TCATAAGGAGAAAGTGGCACGAAGAGAGATTGGTATTTTGACAACAAATAAGAATACATCAAGAACTCACAAAA 370
||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCATAAAGAAAAAGTGGCTCGAAGAGAGATTGGTATTTTGACAACAAATAAGAATACATCAAGAACTCACAAAA 370
Query 371 TAATAGCACCTGCGAATATGGAGCGCCCTGTAAGGTATATTCGGAAACCTATCGATTACACAGTTCTGGATGAT 444
||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 371 TAATCGCACCCGCAAATATGGAGCGTCCTGTCAGGTATATTCGGAAACCTATCGACTATACAGTTCTGGATGAT 444
Query 445 GTGGGCCATGGTGT---------------CAAGCATGGAAATAACCAGCCTGCAAGAACTGGCACACTGTCGAG 503
|||||||||||.|| ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 445 GTGGGCCATGGAGTTAAGTGGCTAAAAGCCAAGCACGGAAATAACCAGCCTGCAAGAACTGGCACATTGTCGAG 518
Query 504 AACAAATCCTCCTACTCAGAAACCGCCAAGTCCTCCCATGTCAGGCCGGGGAACACTGGGACGGAATACTCCTT 577
||||||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||.||||.|||||.||.||..|||||||||||||.||||
Sbjct 519 AACAAACCCTCCCACGCAGAAACCACCAAGCCCTCCCGTGTCGGGCCGAGGGACTTTGGGACGGAATACCCCTT 592
Query 578 ATAAAACCCTGGAACCTGTTAAACCCCCAACAGTTCCTAATGACTATATGACCAGTCCTGCTAGGCTTGGAAGT 651
|.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 593 ACAAAACCCTAGAGCCTGTTAAGCCTCCAACAGTTCCCAATGACTACATGACTAGTCCTGCGAGGCTTGGAAGC 666
Query 652 CAGCATAGTCCAGGCAGGACAGCATCTTTAAATCAGAGACCAAGGACACACAGTGGAAGTAGTGGAGGAAGTGG 725
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 667 CAGCATAGTCCAGGCAGGACAGCTTCTTTAAATCAGAGACCAAGGACGCATAGTGGAAGTAGTGGAGGAAGCGG 740
Query 726 AAGTCGAGAAAACAGTGGTAGCAGTAGTATTGGCATTCCCATTGCTGTGCCTACACCTTCGCCACCCACTATTG 799
|||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||
Sbjct 741 AAGCCGAGAGAACAGTGGGAGCAGCAGCATTGGCATTCCTATTGCTGTGCCTACGCCCTCACCGCCCACT---- 810
Query 800 GACCAGCAGCCCCGGGCTCAGCTCCTGGTTCCCAGTATGGCACAATGACCAGGCAGATATCTCGACACAACTCT 873
.|||||.|||
Sbjct 811 -----------GCGGGCCCAG----------------------------------------------------- 820
Query 874 ACTACTTCTTCGACATCTTCTGGTGGATACAGACGAACTCCCTCTGTGACTGCTCAATTTTCTGCTCAGCCTCA 947
Sbjct 821 -------------------------------------------------------------------------- 820
Query 948 TGTTAATGGAGGTCCACTTTATTCTCAAAATTCAATTTCTATTGCTCCACCCCCTCCCCCTATGCCTCAGTTGA 1021
Sbjct 821 -------------------------------------------------------------------------- 820
Query 1022 CTCCACAGATACCTCTCACAGGCTTCGTGGCCAGGGTGCAGGAAAACATTGCTGATAGTCCAACTCCACCGCCA 1095
||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 821 ------------------------------------------------TTGCTGATAGCCCAACTCCACCACCA 846
Query 1096 CCACCTCCACCAGATGACATTCCCATGTTTGATGACTCTCCACCTCCCCCACCACCACCACCAGTGGATTATGA 1169
||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.|||||.|||||
Sbjct 847 CCCCCTCCACCAGATGACATTCCCATGTTTGATGACTCTCCGCCTCCTCCGCCACCTCCTCCTGTGGACTATGA 920
Query 1170 AGATGAGGAGGCTGCAGTAGTTCAGTATAATGATCCATATGCAGATGGGGATCCTGCTTGGGCCCCCAAGAATT 1243
|||||||||.|||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|
Sbjct 921 AGATGAGGAAGCTGCAGTAGTTCAGTATAGTGACCCATATGCAGATGGGGACCCTGCATGGGCTCCCAAGAACT 994
Query 1244 ATATTGAGAAAGTTGTTGCAATATATGATTATACAAAAGACAAGGATGATGAGCTGTCATTTATGGAGGGTGCA 1317
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||..|||||||||
Sbjct 995 ATATTGAGAAAGTTGTTGCAATATATGATTATACAAAAGACAAGGATGATGAGCTGTCCTTTAAAGAGGGTGCA 1068
Query 1318 ATCATTTATGTTATAAAGAAGAATGATGATGGCTGGTATGAAGGAGTCTGCAATCGAGTGACTGGTCTGTTCCC 1391
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1069 ATCATCTATGTTATAAAGAAGAATGATGATGGCTGGTTTGAAGGAGTTTGCAATCGAGTGACTGGACTCTTCCC 1142
Query 1392 TGGGAACTATGTTGAATCAATCATGCA-TATACTGAT 1427
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1143 TGGGAACTATGTTGAATCAATCATGCACTATACTGAT 1179