Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14041
• Subject: NM_172700.2
• Aligned Length: 1427
• Identities: 1282
• Gaps: 5

Alignment

Query    1  ATGGGGATGTGGGCGTCGCTGGACGCTTTGTGGGAGATGCCGGCCGAGAAGCGTATCTTCGGGGCCGTGCTGCT  74
            ||||||||||||||.|||.||||||||.|||||||..|.||.||.||||||||.|||||||||||.|||.||||
Sbjct    1  ATGGGGATGTGGGCATCGGTGGACGCTATGTGGGACTTCCCTGCGGAGAAGCGAATCTTCGGGGCGGTGTTGCT  74

Query   75  CTTTTCCTGGACAGTGTATCTTTGGGAGACCTTCCTAGCACAGCGGCAGAGAAGGATATATAAAACAACAACTC  148
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||
Sbjct   75  CTTTTCCTGGACGGTGTATCTTTGGGAGACCTTCCTAGCACAGCGGCAGAGAAGGATATACAAAACGACGACTC  148

Query  149  ATGTACCACCGGAGTTAGGACAGATCATGGATTCTGAAACATTTGAGAAATCTCGACTCTATCAACTGGATAAA  222
            ..||||||.|.|||||||.|||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||.|.|||||||||||||||
Sbjct  149  GCGTACCAGCAGAGTTAGAACAGATCATGGATTCGGACACGTTTGAGAAATCTCGATTGTATCAACTGGATAAA  222

Query  223  AGCACTTTCAGCTTCTGGTCAGGACTCTATTCAGAGACTGAAGGCACTCTTATTCTTCTCTTTGGAGGAATACC  296
            ||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||...|||||||||.||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  223  AGTACCTTCAGCTTCTGGTCAGGACTCTACTCAGAGGTGGAAGGCACTTTTATTCTTCTCTTTGGAGGAATCCC  296

Query  297  TTATCTCTGGAGACTTTCTGGACGGTTCTGTGGTTATGCTGGCTTTGGACCAGAATATGAGATCACTCAGTCCC  370
            |||.|||||||||||||||||.|.|||||||.|||.|||||||||||||||||||||.|||||||.||||||..
Sbjct  297  TTACCTCTGGAGACTTTCTGGGCAGTTCTGTAGTTCTGCTGGCTTTGGACCAGAATACGAGATCATTCAGTCAT  370

Query  371  TGGTGTTTCTGCTGTTGGCTACACTTTTCAGTGCATTGGCTGGTTTGCCATGGAGTCTTTATAATACTTTTGTG  444
            |||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||.||.||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.
Sbjct  371  TGGTGTTCCTGCTGTTGGCCACACTCTTCAGTGCACTGACTGGCTTGCCCTGGAGTCTGTACAATACTTTTGTA  444

Query  445  ATAGAAGAAAAACATGGCTTCAATCAACAGACTTTGGGGTTCTTCATGAAAGATGCAATCAAGAAATTTGTTGT  518
            |||||||||||.||||||||||||||.||||||||||.|||.||.|||||||||||||||||.||||||.||||
Sbjct  445  ATAGAAGAAAAGCATGGCTTCAATCACCAGACTTTGGAGTTTTTTATGAAAGATGCAATCAAAAAATTTATTGT  518

Query  519  GACTCAGTGCATTTTGTTGCCTGTGTCTTCACTTCTACTTTACATTATTAAAATTGGGGGTGACTATTTTTTTA  592
            ||||||.||.|||||.||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct  519  GACTCAATGTATTTTATTGCCTGTGTCTGCCCTTCTGCTTTACATTATTAAAATTGGAGGTGACTACTTTTTTA  592

Query  593  TTTATGCCTGGCTGTTCACATTAGTTGTGTCTCTGGTTCTTGTCACAATCTATGCTGATTATATTGCCCCTTTA  666
            |.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||.|.
Sbjct  593  TATATGCCTGGCTGTTCACATTAGTTGTTTCTCTGGTTCTTGTCACCATTTATGCTGACTATATTGCCCCTCTG  666

Query  667  TTTGACAAATTCACACCTCTGCCTGAGGGAAAGCTTAAAGAAGAAATTGAAGTAATGGCAAAGAGTATTGACTT  740
            ||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||..|.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTTGACAAATTCACACCTCTACCGGAGGGAAAGCTTAAGCAGGAAATTGAAGTGATGGCAAAGAGTATTGACTT  740

Query  741  TCCTTTGACGAAGGTGTATGTTGTGGAAGGATCTAAACGCTCTTCCCACAGCAATGCTTATTTTTATGGCTTCT  814
            .||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  741  CCCTTTGACTAAGGTGTATGTTGTTGAAGGATCTAAGCGTTCCTCCCACAGCAATGCTTACTTTTATGGCTTCT  814

Query  815  TCAAGAACAAGCGAATAGTTTTGTTTGACACTCTACTAGAAGAGTACTCTGTACTAAACAAAGACATCCAGGAG  888
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  815  TCAAGAACAAGAGAATAGTTTTGTTTGACACTCTACTAGAAGAGTACTCTGTACCAAACAAAGACAACCAGGAG  888

Query  889  GATTCTGGCATGGAACCCCGCAATGAGGAAGAAGGGAACAGTGAAGAAATAAAAGCTAAAGTTAAAAATAAGAA  962
            ||.||||||||||||.||||||||||.|..||||||.|||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  889  GAGTCTGGCATGGAAGCCCGCAATGAAGGTGAAGGGGACAGTGAAGAAGTAAAAGCTAAAGTGAAAAATAAGAA  962

Query  963  ACAAGGATGTAAAAATGAGGAGGTACTCGCTGTACTAGGCCATGAACTGGGGCACTGGAAGTTGGGACATACAG  1036
            ||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  963  ACAAGGTTGTAAAAATGAGGAGGTACTGGCTGTGCTTGGCCATGAACTGGGACACTGGAAGTTGGGACACACAG  1036

Query 1037  TCAAAAATATCATTATTAGCCAGATGAATTCTTTCCTGTGTTTTTTTTTATTTGCTGTATTAATTGGTCGAAAG  1110
            |.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1037  TAAAAAATATCATTATTAGTCAGATGAATTCTTTCCTGTGTTTTTTCTTGTTTGCTGTATTAATTGGTCGAAGG  1110

Query 1111  GAGCTTTTTGCTGCATTTGGTTTTTATGATAGCCAACCCACTCTTATTGGACTATTGATCATCTTCCAGTTTAT  1184
            ||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1111  GAACTTTTTGCCGCCTTTGGTTTTTATGACAGCCAACCCACTCTGATCGGACTCTTGATCATCTTTCAGTTTAT  1184

Query 1185  TTTTTCACCTTACAATGAGGTTCTTTCTTTTTGCCTAACAGTCCTAAGCCGCAGATTTGAGTTTCAAGCTGATG  1258
            |||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1185  TTTCTCACCTTACAATGAGGTTCTGTCTTTCTGCCTAACAGTCCTGAGCCGCAGATTTGAATTTCAAGCTGATG  1258

Query 1259  CATTTGCCAAGAAACTTGGGAAGGCTAAAGACTTATATTCTGCTTTAATCAAACTTAACAAAGATAACTTGGGA  1332
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||.|||||
Sbjct 1259  CGTTTGCCAAGAAACTTGGGAAGGCTAAAGACTTATATTCTGCTTTGATCAAGCTGAACAAAGATAACCTGGGA  1332

Query 1333  TTCCCTGTTTCTGACTGGTTGTTCTCAATGTGGCATTATTCTCATCCTCCACTGCTAGAGAGACTTCAAGCTTT  1406
            |||||.|||||||||||||||||.||||..|||||.|||||.||.|||||.||.||||||||.|||||.|||.|
Sbjct 1333  TTCCCGGTTTCTGACTGGTTGTTTTCAACATGGCACTATTCACACCCTCCGCTTCTAGAGAGGCTTCAGGCTCT  1406

Query 1407  GAAAACTATG---AACAACAC  1424
            |||||  |||   |||||.||
Sbjct 1407  GAAAA--ATGCAAAACAAGAC  1425