Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14041
• Subject: XM_006503019.1
• Aligned Length: 1484
• Identities: 1282
• Gaps: 62

Alignment

Query    1  ATGGGGATGTGGGCGTCGCTGGACGCTTTGTGGGAGATGCCGGCCGAGAAGCGTATCTTCGGGGCCGTGCTGCT  74
            ||||||||||||||.|||.||||||||.|||||||..|.||.||.||||||||.|||||||||||.|||.||||
Sbjct    1  ATGGGGATGTGGGCATCGGTGGACGCTATGTGGGACTTCCCTGCGGAGAAGCGAATCTTCGGGGCGGTGTTGCT  74

Query   75  CTTTTCCTGGACAGTGTATCTTTGGGAGACCTTCCTAGCACAGCGGCAGAGAAGGATATATAAAACAACAACTC  148
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||
Sbjct   75  CTTTTCCTGGACGGTGTATCTTTGGGAGACCTTCCTAGCACAGCGGCAGAGAAGGATATACAAAACGACGACTC  148

Query  149  ATGTACCACCGGAGTTAGGACAGATCATGGATTCTGAAACATTTGAGAAATCTCGACTCTATCAACTGGATAAA  222
            ..||||||.|.|||||||.|||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||.|.|||||||||||||||
Sbjct  149  GCGTACCAGCAGAGTTAGAACAGATCATGGATTCGGACACGTTTGAGAAATCTCGATTGTATCAACTGGATAAA  222

Query  223  AGCACTTTCAGCTTCTGGTCAGGACTCTATTCAGAGACTGAAGGCACT--------------------------  270
            ||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||...|||||||||                          
Sbjct  223  AGTACCTTCAGCTTCTGGTCAGGACTCTACTCAGAGGTGGAAGGCACTGATTCATCTTTTCCTGACCACAGGAG  296

Query  271  -------------------------------CTTATTCTTCTCTTTGGAGGAATACCTTATCTCTGGAGACTTT  313
                                           .||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  297  GTCTGAGTCTCCAATTCTGTTCCACAGTCTGTTTATTCTTCTCTTTGGAGGAATCCCTTACCTCTGGAGACTTT  370

Query  314  CTGGACGGTTCTGTGGTTATGCTGGCTTTGGACCAGAATATGAGATCACTCAGTCCCTGGTGTTTCTGCTGTTG  387
            ||||.|.|||||||.|||.|||||||||||||||||||||.|||||||.||||||..|||||||.|||||||||
Sbjct  371  CTGGGCAGTTCTGTAGTTCTGCTGGCTTTGGACCAGAATACGAGATCATTCAGTCATTGGTGTTCCTGCTGTTG  444

Query  388  GCTACACTTTTCAGTGCATTGGCTGGTTTGCCATGGAGTCTTTATAATACTTTTGTGATAGAAGAAAAACATGG  461
            ||.|||||.|||||||||.||.||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  445  GCCACACTCTTCAGTGCACTGACTGGCTTGCCCTGGAGTCTGTACAATACTTTTGTAATAGAAGAAAAGCATGG  518

Query  462  CTTCAATCAACAGACTTTGGGGTTCTTCATGAAAGATGCAATCAAGAAATTTGTTGTGACTCAGTGCATTTTGT  535
            |||||||||.||||||||||.|||.||.|||||||||||||||||.||||||.||||||||||.||.|||||.|
Sbjct  519  CTTCAATCACCAGACTTTGGAGTTTTTTATGAAAGATGCAATCAAAAAATTTATTGTGACTCAATGTATTTTAT  592

Query  536  TGCCTGTGTCTTCACTTCTACTTTACATTATTAAAATTGGGGGTGACTATTTTTTTATTTATGCCTGGCTGTTC  609
            |||||||||||.|.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  593  TGCCTGTGTCTGCCCTTCTGCTTTACATTATTAAAATTGGAGGTGACTACTTTTTTATATATGCCTGGCTGTTC  666

Query  610  ACATTAGTTGTGTCTCTGGTTCTTGTCACAATCTATGCTGATTATATTGCCCCTTTATTTGACAAATTCACACC  683
            |||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||.|.|||||||||||||||||
Sbjct  667  ACATTAGTTGTTTCTCTGGTTCTTGTCACCATTTATGCTGACTATATTGCCCCTCTGTTTGACAAATTCACACC  740

Query  684  TCTGCCTGAGGGAAAGCTTAAAGAAGAAATTGAAGTAATGGCAAAGAGTATTGACTTTCCTTTGACGAAGGTGT  757
            |||.||.||||||||||||||..|.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct  741  TCTACCGGAGGGAAAGCTTAAGCAGGAAATTGAAGTGATGGCAAAGAGTATTGACTTCCCTTTGACTAAGGTGT  814

Query  758  ATGTTGTGGAAGGATCTAAACGCTCTTCCCACAGCAATGCTTATTTTTATGGCTTCTTCAAGAACAAGCGAATA  831
            |||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  815  ATGTTGTTGAAGGATCTAAGCGTTCCTCCCACAGCAATGCTTACTTTTATGGCTTCTTCAAGAACAAGAGAATA  888

Query  832  GTTTTGTTTGACACTCTACTAGAAGAGTACTCTGTACTAAACAAAGACATCCAGGAGGATTCTGGCATGGAACC  905
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.||||||||||||.|
Sbjct  889  GTTTTGTTTGACACTCTACTAGAAGAGTACTCTGTACCAAACAAAGACAACCAGGAGGAGTCTGGCATGGAAGC  962

Query  906  CCGCAATGAGGAAGAAGGGAACAGTGAAGAAATAAAAGCTAAAGTTAAAAATAAGAAACAAGGATGTAAAAATG  979
            |||||||||.|..||||||.|||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  963  CCGCAATGAAGGTGAAGGGGACAGTGAAGAAGTAAAAGCTAAAGTGAAAAATAAGAAACAAGGTTGTAAAAATG  1036

Query  980  AGGAGGTACTCGCTGTACTAGGCCATGAACTGGGGCACTGGAAGTTGGGACATACAGTCAAAAATATCATTATT  1053
            ||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1037  AGGAGGTACTGGCTGTGCTTGGCCATGAACTGGGACACTGGAAGTTGGGACACACAGTAAAAAATATCATTATT  1110

Query 1054  AGCCAGATGAATTCTTTCCTGTGTTTTTTTTTATTTGCTGTATTAATTGGTCGAAAGGAGCTTTTTGCTGCATT  1127
            ||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||.|||.||||||||.||.||
Sbjct 1111  AGTCAGATGAATTCTTTCCTGTGTTTTTTCTTGTTTGCTGTATTAATTGGTCGAAGGGAACTTTTTGCCGCCTT  1184

Query 1128  TGGTTTTTATGATAGCCAACCCACTCTTATTGGACTATTGATCATCTTCCAGTTTATTTTTTCACCTTACAATG  1201
            ||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1185  TGGTTTTTATGACAGCCAACCCACTCTGATCGGACTCTTGATCATCTTTCAGTTTATTTTCTCACCTTACAATG  1258

Query 1202  AGGTTCTTTCTTTTTGCCTAACAGTCCTAAGCCGCAGATTTGAGTTTCAAGCTGATGCATTTGCCAAGAAACTT  1275
            |||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1259  AGGTTCTGTCTTTCTGCCTAACAGTCCTGAGCCGCAGATTTGAATTTCAAGCTGATGCGTTTGCCAAGAAACTT  1332

Query 1276  GGGAAGGCTAAAGACTTATATTCTGCTTTAATCAAACTTAACAAAGATAACTTGGGATTCCCTGTTTCTGACTG  1349
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||.||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1333  GGGAAGGCTAAAGACTTATATTCTGCTTTGATCAAGCTGAACAAAGATAACCTGGGATTCCCGGTTTCTGACTG  1406

Query 1350  GTTGTTCTCAATGTGGCATTATTCTCATCCTCCACTGCTAGAGAGACTTCAAGCTTTGAAAACTATG---AACA  1420
            ||||||.||||..|||||.|||||.||.|||||.||.||||||||.|||||.|||.||||||  |||   ||||
Sbjct 1407  GTTGTTTTCAACATGGCACTATTCACACCCTCCGCTTCTAGAGAGGCTTCAGGCTCTGAAAA--ATGCAAAACA  1478

Query 1421  ACAC  1424
            |.||
Sbjct 1479  AGAC  1482