Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14052
• Subject: XM_017024024.2
• Aligned Length: 1589
• Identities: 1053
• Gaps: 536

Alignment

Query    1  ATGGCTGCGATAAGGCCGTCAACTCCAAGGCTGAGGTGGCGCGGGCCCAGGCAGCTTTGGCTGTCAATATATGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GCCGCCCGAGGGCTGCAGGATGTGCTGCGGACCAACTTGGGTCCTAAAGGCACCATGAAAATGCTTGCTTCTGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGCAGGTGACATCAAACTCACCAAAGATGGCAATGTACTGCTCGATGAGATGCAAATTCAACATCCAACAGCTT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CCTTGATAGCAAAAGTAGCAACAGCTCAGGATGACGTCACAGGAGATGGTACTACTTCAAATGTTCTAATTATT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GGAGAGTTATTAAAACAAGCTGACCTGTACATTTCTGAGGGCCTGCACCCTAGAATAATAGCTGAAGGATTTGA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  AGCTGCAAAGATAAAAGCACTTGAAGTTTTGGAGGAAGTTAAAGTGACAAAGGAGATGAAAAGAAAAATCCTCT  444
                                                                   |||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------------------------------ATGAAAAGAAAAATCCTCT  19

Query  445  TAGATGTAGCTAGAACATCATTACAAACTAAAGTTCATGCTGAACTGGCTGATGTCTTAACAGAGGTTGTGGTG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   20  TAGATGTAGCTAGAACATCATTACAAACTAAAGTTCATGCTGAACTGGCTGATGTCTTAACAGAGGTTGTGGTG  93

Query  519  GATTCTGTTTTGGCTGTTAGAAGACCAGGTTACCCTATTGATCTCTTCATGGTAGAAATAATGGAGATGAAGCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   94  GATTCTGTTTTGGCTGTTAGAAGACCAGGTTACCCTATTGATCTCTTCATGGTAGAAATAATGGAGATGAAGCA  167

Query  593  TAAATTAGGAACAGATACAAAGTTGATCCAAGGATTAGTTTTGGATCATGGTGCCCGTCATCCAGATATGAAGA  666
            |||||||||||||||||||||                                                     
Sbjct  168  TAAATTAGGAACAGATACAAA-----------------------------------------------------  188

Query  667  AGCGAGTAGAAGATGCATTTATCCTTATTTGCAACGTTTCACTGGAATATGAAAAAACAGAGGTGAACTCTGGT  740
                                                                      ||||||||||||||||
Sbjct  189  ----------------------------------------------------------AGAGGTGAACTCTGGT  204

Query  741  TTCTTTTATAAGACTGCAGAAGAGAAAGAGAAATTGGTAAAAGCTGAAAGAAAATTTATTGAAGATAGAGTACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  205  TTCTTTTATAAGACTGCAGAAGAGAAAGAGAAATTGGTAAAAGCTGAAAGAAAATTTATTGAAGATAGAGTACA  278

Query  815  AAAAATAATAGACCTGAAGGACAAAGTCTGTGCTCAGTCAAATAAAGGATTTGTCGTCATTAATCAAAAGGGAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  279  AAAAATAATAGACCTGAAGGACAAAGTCTGTGCTCAGTCAAATAAAGGATTTGTCGTCATTAATCAAAAGGGAA  352

Query  889  TTGATCCATTTTCCTTAGATTCTCTTGCAAAACATGGAATAGTAGCTCTTCGCAGAGCAAAAAGAAGAAATATG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  353  TTGATCCATTTTCCTTAGATTCTCTTGCAAAACATGGAATAGTAGCTCTTCGCAGAGCAAAAAGAAGAAATATG  426

Query  963  GAAAGACTCTCTCTTGCTTGTGGTGGAATGGCCGTGAATTCTTTTGAAGATCTCACTGTAGATTGCTTGGGACA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  427  GAAAGACTCTCTCTTGCTTGTGGTGGAATGGCCGTGAATTCTTTTGAAGATCTCACTGTAGATTGCTTGGGACA  500

Query 1037  TGCTGGTCTTGTGTATGAGTATACATTAGGTGAAGAAAAGTTCACTTTTATTGAGGAGTGTGTTAACCCTTGCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  501  TGCTGGTCTTGTGTATGAGTATACATTAGGTGAAGAAAAGTTCACTTTTATTGAGGAGTGTGTTAACCCTTGCT  574

Query 1111  CTGTTACCTTGTTGGTTAAAGGACCAAATAAGCATACTCTCACACAAGTCAAGGATGCCATAAGAGATGGACTT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  575  CTGTTACCTTGTTGGTTAAAGGACCAAATAAGCATACTCTCACACAAGTCAAGGATGCCATAAGAGATGGACTT  648

Query 1185  CGTGCTATCAAAAATGCCATTGAAGATGGTTGTATGGTTCCTGGAGCTGGTGCAATTGAAGTGGCAATGGCTGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  649  CGTGCTATCAAAAATGCCATTGAAGATGGTTGTATGGTTCCTGGAGCTGGTGCAATTGAAGTGGCAATGGCTGA  722

Query 1259  AGCTCTTGTTACATATAAGAACAGTATAAAAGGAAGAGCTCGTCTTGGAGTCCAAGCTTTTGCTGATGCCTTAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  723  AGCTCTTGTTACATATAAGAACAGTATAAAAGGAAGAGCTCGTCTTGGAGTCCAAGCTTTTGCTGATGCCTTAC  796

Query 1333  TCATTATTCCCAAGGTTCTTGCTCAGAATGCTGGTTATGACCCACAGGAAACATTAGTAAAAGTTCAGGCTGAG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  797  TCATTATTCCCAAGGTTCTTGCTCAGAATGCTGGTTATGACCCACAGGAAACATTAGTAAAAGTTCAGGCTGAG  870

Query 1407  CATGTCGAGTCAAAACAACTTGTGGGCGTAGATTTGAATACAGGTGAGCCAATGGTAGCAGCAGATGCAGGAGT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  871  CATGTCGAGTCAAAACAACTTGTGGGCGTAGATTTGAATACAGGTGAGCCAATGGTAGCAGCAGATGCAGGAGT  944

Query 1481  TTGGGATAATTATTGTGTAAAAAAACAACTTCTTCACTCTTGCACAGTGATTGCCACCAACATTCTCCTGGTTG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  945  TTGGGATAATTATTGTGTAAAAAAACAACTTCTTCACTCTTGCACAGTGATTGCCACCAACATTCTCCTGGTTG  1018

Query 1555  ATGAAATTATGCGAGCTGGGATGTCTTCTCTCAAA  1589
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1019  ATGAAATTATGCGAGCTGGGATGTCTTCTCTCAAA  1053