Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14060
- Subject:
- NM_011845.2
- Aligned Length:
- 2055
- Identities:
- 1932
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGGAAACACTGGAGTCTGAATTGACCTGTCCAATCTGCCTAGAGTTGTTTGAAGACCCCCTTCTGCTCCCTTG 74
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1 ATGGAAACACTGGAGTCAGAATTGACCTGTCCAATCTGCCTCGAGTTGTTTGAAGACCCCCTTCTGCTTCCTTG 74
Query 75 TGCTCACAGCCTCTGCTTCAGCTGTGCCCATCGCATTTTGGTATCAAGCTGCAGCTCTGGTGAATCCATTGAAC 148
||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGCTCACAGCCTATGTTTTAGCTGTGCCCACCGCATCTTGGTCTCAAGCTGCAGCTCTGGTGAATCCATTGAAC 148
Query 149 CCATTACTGCTTTCCAGTGTCCTACCTGCAGGTATGTTATCTCGCTGAACCACCGGGGCCTGGATGGCCTCAAG 222
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCATTACTGCTTTCCAGTGTCCTACATGCAGGTATGTTATCTCGCTGAATCACCGGGGCCTGGATGGCCTCAAG 222
Query 223 AGGAATGTGACTCTGCAGAACATTATTGATCGCTTCCAGAAGGCTTCAGTCAGTGGGCCCAATTCCCCTAGTGA 296
|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 223 AGGAATGTGACCCTGCAGAACATTATTGATCGCTTCCAGAAGGCTTCAGTCAGTGGGCCCAATTCTCCAAGTGA 296
Query 297 GAGCCGCCGGGAAAGGACTTACAGGCCCACCACTGCCATGTCTAGCGAGCGAATTGCTTGCCAATTCTGTGAGC 370
||||||||||||.||||||||||||||.|.|.|.||||||||.||.|||.|||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 297 GAGCCGCCGGGAGAGGACTTACAGGCCTAGCTCCGCCATGTCGAGTGAGAGAATTGCATGTCAATTCTGTGAGC 370
Query 371 AGGACCCGCCAAGGGATGCAGTAAAAACATGCATCACCTGTGAGGTCTCCTACTGTGACCGTTGCCTGCGGGCC 444
|||||||.||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 371 AGGACCCTCCGAGAGATGCTGTAAAGACGTGCATCACCTGTGAGGTCTCCTACTGTGACCGTTGCCTTCGGGCC 444
Query 445 ACGCACCCCAACAAGAAACCTTTCACCAGCCACCGCCTGGTGGAACCAGTGCCAGACACACATCTTCGAGGGAT 518
||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ACACACCCCAACAAGAAACCTTTCACCAGCCATCGCCTGGTGGAACCAGTTTCAGACACACATCTTCGAGGGAT 518
Query 519 CACCTGCCTGGACCATGAGAATGAGAAAGTGAACATGTACTGTGTATCTGATGACCAATTGATCTGTGCCTTAT 592
.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 519 TACCTGCCTGGACCACGAGAATGAGAAGGTGAACATGTACTGTGTATCTGATGATCAATTGATCTGTGCCTTAT 592
Query 593 GCAAACTGGTGGGTCGTCACCGAGACCATCAGGTCGCATCCCTGAATGATCGATTTGAGAAACTCAAGCAAACT 666
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 593 GCAAACTGGTGGGTCGTCACCGAGACCATCAGGTCGCTTCTCTGAATGATCGATTTGAGAAACTAAAGCAAACT 666
Query 667 CTGGAGATGAACCTCACCAACCTGGTTAAGCGCAACAGCGAACTAGAAAATCAAATGGCCAAACTAATACAGAT 740
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CTCGAGATGAACCTCACCAACCTGGTTAAGCGCAACAGTGAACTAGAAAATCAAATGGCCAAACTAATACAGAT 740
Query 741 CTGCCAGCAGGTTGAGGTGAATACTGCTATGCATGAGGCAAAACTTATGGAAGAATGTGACGAGTTGGTAGAGA 814
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTGCCAGCAAGTTGAGGTGAATACTGCTATGCATGAGGCAAAACTTATGGAAGAATGTGACGAGTTGGTAGAGA 814
Query 815 TCATCCAGCAGAGGAAGCAAATGATCGCTGTCAAAATCAAAGAGACAAAGGTTATGAAACTGAGAAAGTTGGCA 888
||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TCATCCAGCAGAGGAAACAAATGATTGCTGTCAAAATCAAAGAGACAAAGGTTATGAAACTGAGAAAGTTGGCA 888
Query 889 CAGCAGGTTGCTAATTGCCGCCAGTGTCTTGAACGGTCAACAGTCCTCATCAACCAAGCTGAGCATATCCTGAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 889 CAGCAGGTTGCTAATTGCCGCCAGTGTCTTGAGCGGTCAACAGTCCTCATCAACCAAGCTGAGCATATCCTAAA 962
Query 963 AGAAAATGACCAGGCACGGTTTCTACAGTCTGCAAAAAATATTGCTGAGAGGGTCGCTATGGCAACTGCATCTT 1036
.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGAAAATGACCAAGCACGGTTTCTGCAGTCTGCAAAAAACATTGCCGAGAGGGTCGCTATGGCAACTGCATCTT 1036
Query 1037 CTCAAGTTCTGATTCCAGACATCAATTTTAATGATGCCTTTGAAAACTTTGCTTTAGATTTTTCCAGAGAAAAG 1110
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1037 CGCAAGTTCTGATTCCAGACATCAATTTTAATGATGCCTTTGAAAACTTTGCTTTAGATTTTTCTAGAGAAAAG 1110
Query 1111 AAACTGCTAGAGGGGTTAGATTATTTAACAGCCCCAAACCCACCATCTATCCGAGAAGAACTCTGTACTGCCTC 1184
|||||..|.||||||.||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1111 AAACTATTGGAGGGGCTAGACTATTTAACAGCTCCAAACCCACCATCTATCCGAGAAGAGCTCTGTACTGCTTC 1184
Query 1185 CCATGACACCATTACAGTCCACTGGATCTCGGATGATGAGTTCAGCATCAGCTCCTATGAGCTTCAGTACACCA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCATGACACCATTACAGTCCACTGGATCTCAGACGACGAATTCAGCATCAGCTCCTATGAGCTTCAGTACACCA 1258
Query 1259 TATTCACTGGCCAGGCTAACTTCATCAGCCTGTATAATTCAGTAGACAGCTGGATGATTGTTCCCAACATTAAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1259 TATTCACTGGCCAGGCTAACTTCATCAGCCTGTACAATTCAGTGGATAGCTGGATGATTGTGCCCAACATTAAG 1332
Query 1333 CAGAACCATTACACAGTGCATGGACTCCAGAGCGGGACTCGCTACATCTTCATCGTTAAAGCCATAAACCAAGC 1406
|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1333 CAGAACCATTACACAGTTCATGGACTCCAGAGTGGGACACGCTACATCTTTATCGTGAAAGCCATAAATCAAGC 1406
Query 1407 CGGCAGCCGGAACAGTGAACCTACCCGACTAAAAACAAACAGCCAACCCTTTAAATTGGATCCCAAAATGACTC 1480
.||||||||||||||.|||||.|||.||||||||||.|||||||||||.||||||.|.||||||||||||||||
Sbjct 1407 AGGCAGCCGGAACAGCGAACCCACCAGACTAAAAACGAACAGCCAACCATTTAAACTAGATCCCAAAATGACTC 1480
Query 1481 ACAAGAAGTTGAAGATCTCCAATGATGGATTGCAGATGGAGAAGGATGAAAGCTCTCTAAAGAAGAGCCACACC 1554
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1481 ACAAGAAGTTGAAGATCTCCAATGATGGATTGCAGATGGAGAAGGATGAGAGCTCTCTGAAGAAGAGCCACACT 1554
Query 1555 CCAGAGAGGTTTAGTGGCACAGGGTGCTATGGGGCAGCAGGAAATATATTCATTGACAGTGGCTGCCACTATTG 1628
||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1555 CCGGAGAGATTTAGTGGCACAGGGTGTTATGGGGCAGCAGGAAATATATTCATCGACAGTGGCTGCCACTACTG 1628
Query 1629 GGAGGTGGTCATGGGTTCCTCAACATGGTATGCAATTGGCATTGCCTACAAATCAGCTCCAAAGAATGAATGGA 1702
||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1629 GGAGGTGGTCATGGGTTCTTCAACATGGTATGCTATTGGTATTGCCTACAAATCAGCTCCAAAGAATGAGTGGA 1702
Query 1703 TTGGCAAGAATGCCTCCTCATGGGTCTTCTCTCGCTGCAATAGTAACTTCGTGGTGAGACACAACAACAAGGAA 1776
||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..|.|||||||||||||||
Sbjct 1703 TTGGCAAGAATGCCTCTTCCTGGGTCTTCTCTCGATGCAACAGTAACTTCGTGGTTCGGCACAACAACAAGGAA 1776
Query 1777 ATGCTGGTGGATGTGCCCCCACACCTGAAGCGTCTGGGTGTCCTCCTGGATTATGACAACAATATGCTGTCTTT 1850
|||||||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1777 ATGCTGGTGGATGTGCCCCCACAGTTGAAGCGTCTAGGTGTCCTTCTGGATTATGACAACAACATGCTGTCTTT 1850
Query 1851 CTATGACCCAGCTAACTCTCTCCATCTTCATACTTTTGATGTGACCTTCATTCTTCCAGTTTGTCCAACATTTA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1851 CTATGACCCAGCTAACTCTCTCCATCTTCATACTTTTGATGTTACCTTCATTCTTCCAGTTTGTCCAACATTCA 1924
Query 1925 CAATCTGGAACAAATCCCTAATGATCCTGTCTGGCTTGCCTGCCCCAGATTTTATTGATTACCCTGAGCGGCAG 1998
|||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1925 CAATCTGGAACAAATCCCTAATGATTCTTTCTGGCTTGCCTGCCCCTGATTTTATTGATTATCCTGAGCGGCAG 1998
Query 1999 GAATGCAACTGCAGGCCTCAAGAATCCCCTTATGTTTCTGGGATGAAAATCTGTCAT 2055
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||...||.|||
Sbjct 1999 GAATGCAACTGCAGGCCTCAAGAATCCCCTTATGTGTCAGGGATGAAAGCTTGCCAT 2055