Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14060
- Subject:
- XM_006528522.3
- Aligned Length:
- 2205
- Identities:
- 1932
- Gaps:
- 150
Alignment
Query 1 ------------------------------------------------------------ATGGAAACACTGGA 14
||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGTGAGAGCCCAGCCTCTGCGGTTCTTAATGCCTCAGCAGGATTATTTTCACTAAAGATGGAAACACTGGA 74
Query 15 GTCTGAATTGACCTGTCCAATCTGCCTAGAGTTGTTTGAAGACCCCCTTCTGCTCCCTTGTGCTCACAGCCTCT 88
|||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 75 GTCAGAATTGACCTGTCCAATCTGCCTCGAGTTGTTTGAAGACCCCCTTCTGCTTCCTTGTGCTCACAGCCTAT 148
Query 89 GCTTCAGCTGTGCCCATCGCATTTTGGTATCAAGCTGCAGCTCTGGTGAATCCATTGAACCCATTACTGCTTTC 162
|.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GTTTTAGCTGTGCCCACCGCATCTTGGTCTCAAGCTGCAGCTCTGGTGAATCCATTGAACCCATTACTGCTTTC 222
Query 163 CAGTGTCCTACCTGCAGGTATGTTATCTCGCTGAACCACCGGGGCCTGGATGGCCTCAAGAGGAATGTGACTCT 236
|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 223 CAGTGTCCTACATGCAGGTATGTTATCTCGCTGAATCACCGGGGCCTGGATGGCCTCAAGAGGAATGTGACCCT 296
Query 237 GCAGAACATTATTGATCGCTTCCAGAAGGCTTCAGTCAGTGGGCCCAATTCCCCTAGTGAGAGCCGCCGGGAAA 310
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 297 GCAGAACATTATTGATCGCTTCCAGAAGGCTTCAGTCAGTGGGCCCAATTCTCCAAGTGAGAGCCGCCGGGAGA 370
Query 311 GGACTTACAGGCCCACCACTGCCATGTCTAGCGAGCGAATTGCTTGCCAATTCTGTGAGCAGGACCCGCCAAGG 384
|||||||||||||.|.|.|.||||||||.||.|||.|||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct 371 GGACTTACAGGCCTAGCTCCGCCATGTCGAGTGAGAGAATTGCATGTCAATTCTGTGAGCAGGACCCTCCGAGA 444
Query 385 GATGCAGTAAAAACATGCATCACCTGTGAGGTCTCCTACTGTGACCGTTGCCTGCGGGCCACGCACCCCAACAA 458
|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 445 GATGCTGTAAAGACGTGCATCACCTGTGAGGTCTCCTACTGTGACCGTTGCCTTCGGGCCACACACCCCAACAA 518
Query 459 GAAACCTTTCACCAGCCACCGCCTGGTGGAACCAGTGCCAGACACACATCTTCGAGGGATCACCTGCCTGGACC 532
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 519 GAAACCTTTCACCAGCCATCGCCTGGTGGAACCAGTTTCAGACACACATCTTCGAGGGATTACCTGCCTGGACC 592
Query 533 ATGAGAATGAGAAAGTGAACATGTACTGTGTATCTGATGACCAATTGATCTGTGCCTTATGCAAACTGGTGGGT 606
|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACGAGAATGAGAAGGTGAACATGTACTGTGTATCTGATGATCAATTGATCTGTGCCTTATGCAAACTGGTGGGT 666
Query 607 CGTCACCGAGACCATCAGGTCGCATCCCTGAATGATCGATTTGAGAAACTCAAGCAAACTCTGGAGATGAACCT 680
|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 667 CGTCACCGAGACCATCAGGTCGCTTCTCTGAATGATCGATTTGAGAAACTAAAGCAAACTCTCGAGATGAACCT 740
Query 681 CACCAACCTGGTTAAGCGCAACAGCGAACTAGAAAATCAAATGGCCAAACTAATACAGATCTGCCAGCAGGTTG 754
||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 741 CACCAACCTGGTTAAGCGCAACAGTGAACTAGAAAATCAAATGGCCAAACTAATACAGATCTGCCAGCAAGTTG 814
Query 755 AGGTGAATACTGCTATGCATGAGGCAAAACTTATGGAAGAATGTGACGAGTTGGTAGAGATCATCCAGCAGAGG 828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGGTGAATACTGCTATGCATGAGGCAAAACTTATGGAAGAATGTGACGAGTTGGTAGAGATCATCCAGCAGAGG 888
Query 829 AAGCAAATGATCGCTGTCAAAATCAAAGAGACAAAGGTTATGAAACTGAGAAAGTTGGCACAGCAGGTTGCTAA 902
||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAACAAATGATTGCTGTCAAAATCAAAGAGACAAAGGTTATGAAACTGAGAAAGTTGGCACAGCAGGTTGCTAA 962
Query 903 TTGCCGCCAGTGTCTTGAACGGTCAACAGTCCTCATCAACCAAGCTGAGCATATCCTGAAAGAAAATGACCAGG 976
||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|
Sbjct 963 TTGCCGCCAGTGTCTTGAGCGGTCAACAGTCCTCATCAACCAAGCTGAGCATATCCTAAAGGAAAATGACCAAG 1036
Query 977 CACGGTTTCTACAGTCTGCAAAAAATATTGCTGAGAGGGTCGCTATGGCAACTGCATCTTCTCAAGTTCTGATT 1050
||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1037 CACGGTTTCTGCAGTCTGCAAAAAACATTGCCGAGAGGGTCGCTATGGCAACTGCATCTTCGCAAGTTCTGATT 1110
Query 1051 CCAGACATCAATTTTAATGATGCCTTTGAAAACTTTGCTTTAGATTTTTCCAGAGAAAAGAAACTGCTAGAGGG 1124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||..|.|||||
Sbjct 1111 CCAGACATCAATTTTAATGATGCCTTTGAAAACTTTGCTTTAGATTTTTCTAGAGAAAAGAAACTATTGGAGGG 1184
Query 1125 GTTAGATTATTTAACAGCCCCAAACCCACCATCTATCCGAGAAGAACTCTGTACTGCCTCCCATGACACCATTA 1198
|.||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1185 GCTAGACTATTTAACAGCTCCAAACCCACCATCTATCCGAGAAGAGCTCTGTACTGCTTCCCATGACACCATTA 1258
Query 1199 CAGTCCACTGGATCTCGGATGATGAGTTCAGCATCAGCTCCTATGAGCTTCAGTACACCATATTCACTGGCCAG 1272
||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CAGTCCACTGGATCTCAGACGACGAATTCAGCATCAGCTCCTATGAGCTTCAGTACACCATATTCACTGGCCAG 1332
Query 1273 GCTAACTTCATCA------------------------------------------------------------- 1285
|||||||||||||
Sbjct 1333 GCTAACTTCATCAGTAAGTCATGGTGTAGTTGGGGCCTGTGGCCAGAGATAAGGAAATGTAAGGAAGCAGTAAG 1406
Query 1286 -----------------------------GCCTGTATAATTCAGTAGACAGCTGGATGATTGTTCCCAACATTA 1330
|||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1407 CTGCTCAAGATTGGCCGGTGCGCCACGAGGCCTGTACAATTCAGTGGATAGCTGGATGATTGTGCCCAACATTA 1480
Query 1331 AACAGAACCATTACACAGTGCATGGACTCCAGAGCGGGACTCGCTACATCTTCATCGTTAAAGCCATAAACCAA 1404
|.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1481 AGCAGAACCATTACACAGTTCATGGACTCCAGAGTGGGACACGCTACATCTTTATCGTGAAAGCCATAAATCAA 1554
Query 1405 GCCGGCAGCCGGAACAGTGAACCTACCCGACTAAAAACAAACAGCCAACCCTTTAAATTGGATCCCAAAATGAC 1478
||.||||||||||||||.|||||.|||.||||||||||.|||||||||||.||||||.|.||||||||||||||
Sbjct 1555 GCAGGCAGCCGGAACAGCGAACCCACCAGACTAAAAACGAACAGCCAACCATTTAAACTAGATCCCAAAATGAC 1628
Query 1479 TCACAAGAAGTTGAAGATCTCCAATGATGGATTGCAGATGGAGAAGGATGAAAGCTCTCTAAAGAAGAGCCACA 1552
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1629 TCACAAGAAGTTGAAGATCTCCAATGATGGATTGCAGATGGAGAAGGATGAGAGCTCTCTGAAGAAGAGCCACA 1702
Query 1553 CCCCAGAGAGGTTTAGTGGCACAGGGTGCTATGGGGCAGCAGGAAATATATTCATTGACAGTGGCTGCCACTAT 1626
|.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1703 CTCCGGAGAGATTTAGTGGCACAGGGTGTTATGGGGCAGCAGGAAATATATTCATCGACAGTGGCTGCCACTAC 1776
Query 1627 TGGGAGGTGGTCATGGGTTCCTCAACATGGTATGCAATTGGCATTGCCTACAAATCAGCTCCAAAGAATGAATG 1700
||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1777 TGGGAGGTGGTCATGGGTTCTTCAACATGGTATGCTATTGGTATTGCCTACAAATCAGCTCCAAAGAATGAGTG 1850
Query 1701 GATTGGCAAGAATGCCTCCTCATGGGTCTTCTCTCGCTGCAATAGTAACTTCGTGGTGAGACACAACAACAAGG 1774
||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..|.|||||||||||||
Sbjct 1851 GATTGGCAAGAATGCCTCTTCCTGGGTCTTCTCTCGATGCAACAGTAACTTCGTGGTTCGGCACAACAACAAGG 1924
Query 1775 AAATGCTGGTGGATGTGCCCCCACACCTGAAGCGTCTGGGTGTCCTCCTGGATTATGACAACAATATGCTGTCT 1848
|||||||||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1925 AAATGCTGGTGGATGTGCCCCCACAGTTGAAGCGTCTAGGTGTCCTTCTGGATTATGACAACAACATGCTGTCT 1998
Query 1849 TTCTATGACCCAGCTAACTCTCTCCATCTTCATACTTTTGATGTGACCTTCATTCTTCCAGTTTGTCCAACATT 1922
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 TTCTATGACCCAGCTAACTCTCTCCATCTTCATACTTTTGATGTTACCTTCATTCTTCCAGTTTGTCCAACATT 2072
Query 1923 TACAATCTGGAACAAATCCCTAATGATCCTGTCTGGCTTGCCTGCCCCAGATTTTATTGATTACCCTGAGCGGC 1996
.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2073 CACAATCTGGAACAAATCCCTAATGATTCTTTCTGGCTTGCCTGCCCCTGATTTTATTGATTATCCTGAGCGGC 2146
Query 1997 AGGAATGCAACTGCAGGCCTCAAGAATCCCCTTATGTTTCTGGGATGAAAATCTGTCAT 2055
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||...||.|||
Sbjct 2147 AGGAATGCAACTGCAGGCCTCAAGAATCCCCTTATGTGTCAGGGATGAAAGCTTGCCAT 2205