Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14060
• Subject: XM_006528523.3
• Aligned Length: 2115
• Identities: 1932
• Gaps: 60

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------------------ATGGAAACACTGGA  14
                                                                        ||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGTGAGAGCCCAGCCTCTGCGGTTCTTAATGCCTCAGCAGGATTATTTTCACTAAAGATGGAAACACTGGA  74

Query   15  GTCTGAATTGACCTGTCCAATCTGCCTAGAGTTGTTTGAAGACCCCCTTCTGCTCCCTTGTGCTCACAGCCTCT  88
            |||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct   75  GTCAGAATTGACCTGTCCAATCTGCCTCGAGTTGTTTGAAGACCCCCTTCTGCTTCCTTGTGCTCACAGCCTAT  148

Query   89  GCTTCAGCTGTGCCCATCGCATTTTGGTATCAAGCTGCAGCTCTGGTGAATCCATTGAACCCATTACTGCTTTC  162
            |.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTTTTAGCTGTGCCCACCGCATCTTGGTCTCAAGCTGCAGCTCTGGTGAATCCATTGAACCCATTACTGCTTTC  222

Query  163  CAGTGTCCTACCTGCAGGTATGTTATCTCGCTGAACCACCGGGGCCTGGATGGCCTCAAGAGGAATGTGACTCT  236
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  223  CAGTGTCCTACATGCAGGTATGTTATCTCGCTGAATCACCGGGGCCTGGATGGCCTCAAGAGGAATGTGACCCT  296

Query  237  GCAGAACATTATTGATCGCTTCCAGAAGGCTTCAGTCAGTGGGCCCAATTCCCCTAGTGAGAGCCGCCGGGAAA  310
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  297  GCAGAACATTATTGATCGCTTCCAGAAGGCTTCAGTCAGTGGGCCCAATTCTCCAAGTGAGAGCCGCCGGGAGA  370

Query  311  GGACTTACAGGCCCACCACTGCCATGTCTAGCGAGCGAATTGCTTGCCAATTCTGTGAGCAGGACCCGCCAAGG  384
            |||||||||||||.|.|.|.||||||||.||.|||.|||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct  371  GGACTTACAGGCCTAGCTCCGCCATGTCGAGTGAGAGAATTGCATGTCAATTCTGTGAGCAGGACCCTCCGAGA  444

Query  385  GATGCAGTAAAAACATGCATCACCTGTGAGGTCTCCTACTGTGACCGTTGCCTGCGGGCCACGCACCCCAACAA  458
            |||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  445  GATGCTGTAAAGACGTGCATCACCTGTGAGGTCTCCTACTGTGACCGTTGCCTTCGGGCCACACACCCCAACAA  518

Query  459  GAAACCTTTCACCAGCCACCGCCTGGTGGAACCAGTGCCAGACACACATCTTCGAGGGATCACCTGCCTGGACC  532
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  519  GAAACCTTTCACCAGCCATCGCCTGGTGGAACCAGTTTCAGACACACATCTTCGAGGGATTACCTGCCTGGACC  592

Query  533  ATGAGAATGAGAAAGTGAACATGTACTGTGTATCTGATGACCAATTGATCTGTGCCTTATGCAAACTGGTGGGT  606
            |.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACGAGAATGAGAAGGTGAACATGTACTGTGTATCTGATGATCAATTGATCTGTGCCTTATGCAAACTGGTGGGT  666

Query  607  CGTCACCGAGACCATCAGGTCGCATCCCTGAATGATCGATTTGAGAAACTCAAGCAAACTCTGGAGATGAACCT  680
            |||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct  667  CGTCACCGAGACCATCAGGTCGCTTCTCTGAATGATCGATTTGAGAAACTAAAGCAAACTCTCGAGATGAACCT  740

Query  681  CACCAACCTGGTTAAGCGCAACAGCGAACTAGAAAATCAAATGGCCAAACTAATACAGATCTGCCAGCAGGTTG  754
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  741  CACCAACCTGGTTAAGCGCAACAGTGAACTAGAAAATCAAATGGCCAAACTAATACAGATCTGCCAGCAAGTTG  814

Query  755  AGGTGAATACTGCTATGCATGAGGCAAAACTTATGGAAGAATGTGACGAGTTGGTAGAGATCATCCAGCAGAGG  828
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGGTGAATACTGCTATGCATGAGGCAAAACTTATGGAAGAATGTGACGAGTTGGTAGAGATCATCCAGCAGAGG  888

Query  829  AAGCAAATGATCGCTGTCAAAATCAAAGAGACAAAGGTTATGAAACTGAGAAAGTTGGCACAGCAGGTTGCTAA  902
            ||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAACAAATGATTGCTGTCAAAATCAAAGAGACAAAGGTTATGAAACTGAGAAAGTTGGCACAGCAGGTTGCTAA  962

Query  903  TTGCCGCCAGTGTCTTGAACGGTCAACAGTCCTCATCAACCAAGCTGAGCATATCCTGAAAGAAAATGACCAGG  976
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|
Sbjct  963  TTGCCGCCAGTGTCTTGAGCGGTCAACAGTCCTCATCAACCAAGCTGAGCATATCCTAAAGGAAAATGACCAAG  1036

Query  977  CACGGTTTCTACAGTCTGCAAAAAATATTGCTGAGAGGGTCGCTATGGCAACTGCATCTTCTCAAGTTCTGATT  1050
            ||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1037  CACGGTTTCTGCAGTCTGCAAAAAACATTGCCGAGAGGGTCGCTATGGCAACTGCATCTTCGCAAGTTCTGATT  1110

Query 1051  CCAGACATCAATTTTAATGATGCCTTTGAAAACTTTGCTTTAGATTTTTCCAGAGAAAAGAAACTGCTAGAGGG  1124
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||..|.|||||
Sbjct 1111  CCAGACATCAATTTTAATGATGCCTTTGAAAACTTTGCTTTAGATTTTTCTAGAGAAAAGAAACTATTGGAGGG  1184

Query 1125  GTTAGATTATTTAACAGCCCCAAACCCACCATCTATCCGAGAAGAACTCTGTACTGCCTCCCATGACACCATTA  1198
            |.||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCTAGACTATTTAACAGCTCCAAACCCACCATCTATCCGAGAAGAGCTCTGTACTGCTTCCCATGACACCATTA  1258

Query 1199  CAGTCCACTGGATCTCGGATGATGAGTTCAGCATCAGCTCCTATGAGCTTCAGTACACCATATTCACTGGCCAG  1272
            ||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CAGTCCACTGGATCTCAGACGACGAATTCAGCATCAGCTCCTATGAGCTTCAGTACACCATATTCACTGGCCAG  1332

Query 1273  GCTAACTTCATCAGCCTGTATAATTCAGTAGACAGCTGGATGATTGTTCCCAACATTAAACAGAACCATTACAC  1346
            ||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1333  GCTAACTTCATCAGCCTGTACAATTCAGTGGATAGCTGGATGATTGTGCCCAACATTAAGCAGAACCATTACAC  1406

Query 1347  AGTGCATGGACTCCAGAGCGGGACTCGCTACATCTTCATCGTTAAAGCCATAAACCAAGCCGGCAGCCGGAACA  1420
            |||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 1407  AGTTCATGGACTCCAGAGTGGGACACGCTACATCTTTATCGTGAAAGCCATAAATCAAGCAGGCAGCCGGAACA  1480

Query 1421  GTGAACCTACCCGACTAAAAACAAACAGCCAACCCTTTAAATTGGATCCCAAAATGACTCACAAGAAGTTGAAG  1494
            |.|||||.|||.||||||||||.|||||||||||.||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GCGAACCCACCAGACTAAAAACGAACAGCCAACCATTTAAACTAGATCCCAAAATGACTCACAAGAAGTTGAAG  1554

Query 1495  ATCTCCAATGATGGATTGCAGATGGAGAAGGATGAAAGCTCTCTAAAGAAGAGCCACACCCCAGAGAGGTTTAG  1568
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct 1555  ATCTCCAATGATGGATTGCAGATGGAGAAGGATGAGAGCTCTCTGAAGAAGAGCCACACTCCGGAGAGATTTAG  1628

Query 1569  TGGCACAGGGTGCTATGGGGCAGCAGGAAATATATTCATTGACAGTGGCTGCCACTATTGGGAGGTGGTCATGG  1642
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGGCACAGGGTGTTATGGGGCAGCAGGAAATATATTCATCGACAGTGGCTGCCACTACTGGGAGGTGGTCATGG  1702

Query 1643  GTTCCTCAACATGGTATGCAATTGGCATTGCCTACAAATCAGCTCCAAAGAATGAATGGATTGGCAAGAATGCC  1716
            ||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GTTCTTCAACATGGTATGCTATTGGTATTGCCTACAAATCAGCTCCAAAGAATGAGTGGATTGGCAAGAATGCC  1776

Query 1717  TCCTCATGGGTCTTCTCTCGCTGCAATAGTAACTTCGTGGTGAGACACAACAACAAGGAAATGCTGGTGGATGT  1790
            ||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TCTTCCTGGGTCTTCTCTCGATGCAACAGTAACTTCGTGGTTCGGCACAACAACAAGGAAATGCTGGTGGATGT  1850

Query 1791  GCCCCCACACCTGAAGCGTCTGGGTGTCCTCCTGGATTATGACAACAATATGCTGTCTTTCTATGACCCAGCTA  1864
            |||||||||..||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GCCCCCACAGTTGAAGCGTCTAGGTGTCCTTCTGGATTATGACAACAACATGCTGTCTTTCTATGACCCAGCTA  1924

Query 1865  ACTCTCTCCATCTTCATACTTTTGATGTGACCTTCATTCTTCCAGTTTGTCCAACATTTACAATCTGGAACAAA  1938
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1925  ACTCTCTCCATCTTCATACTTTTGATGTTACCTTCATTCTTCCAGTTTGTCCAACATTCACAATCTGGAACAAA  1998

Query 1939  TCCCTAATGATCCTGTCTGGCTTGCCTGCCCCAGATTTTATTGATTACCCTGAGCGGCAGGAATGCAACTGCAG  2012
            |||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TCCCTAATGATTCTTTCTGGCTTGCCTGCCCCTGATTTTATTGATTATCCTGAGCGGCAGGAATGCAACTGCAG  2072

Query 2013  GCCTCAAGAATCCCCTTATGTTTCTGGGATGAAAATCTGTCAT  2055
            |||||||||||||||||||||.||.|||||||||...||.|||
Sbjct 2073  GCCTCAAGAATCCCCTTATGTGTCAGGGATGAAAGCTTGCCAT  2115