Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14073
• Subject: XM_011519427.2
• Aligned Length: 1180
• Identities: 1120
• Gaps: 60

Alignment

Query    1  AT-GGGAAGTCGGATTTTCTTACTCCCAAGGCTATCGCCAACAGGATCAAGTCCAAGGGGCTGCAGAAGCTACG  73
            || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGAAGTCGGATTTTCTTACTCCCAAGGCTATCGCCAACAGGATCAAGTCCAAGGGGCTGCAGAAGCTACG  74

Query   74  CTGGTATTGCCAGATGTGCCAGAAGCAGTGCCGGGACGAGAATGGCTTTAAGTGTCATTGTATGTCCGAATCTC  147
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTGGTATTGCCAGATGTGCCAGAAGCAGTGCCGGGACGAGAATGGCTTTAAGTGTCATTGTATGTCCGAATCTC  148

Query  148  ATCAGAGACAACTATTGCTGGCTTCAGAAAATCCTCAGCAGTTTATGGATTATTTTTCAGAGGAATTCCGAAAT  221
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATCAGAGACAACTATTGCTGGCTTCAGAAAATCCTCAGCAGTTTATGGATTATTTTTCAGAGGAATTCCGAAAT  222

Query  222  GACTTTCTAGAACTTCTCAGGAGACGCTTTGGCACTAAAAGGGTCCACAACAACATTGTCTACAACGAATACAT  295
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACTTTCTAGAACTTCTCAGGAGACGCTTTGGCACTAAAAGGGTCCACAACAACATTGTCTACAACGAATACAT  296

Query  296  CAGCCACCGAGAGCACATCCACATGAATGCCACTCAGTGGGAAACTCTGACTGATTTTACTAAGTGGCTGGGCA  369
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAGCCACCGAGAGCACATCCACATGAATGCCACTCAGTGGGAAACTCTGACTGATTTTACTAAGTGGCTGGGCA  370

Query  370  GAGAAGGCTTGTGCAAAGTGGACGAGACACCAAAAGGCTGGTATATTCAGTACATAGACAGGGACCCAGAAACT  443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAGAAGGCTTGTGCAAAGTGGACGAGACACCAAAAGGCTGGTATATTCAGTACATAGACAGGGACCCAGAAACT  444

Query  444  ATCCGCCGGCAACTGGAACTGGAGAAAAAGAAAAAGCAGGACCTTGATGATGAAGAAAAAACTGCCAAATTTAT  517
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATCCGCCGGCAACTGGAACTGGAGAAAAAGAAAAAGCAGGACCTTGATGATGAAGAAAAAACTGCCAAATTTAT  518

Query  518  TGAAGAGCAAGTGAGAAGAGGCCTGGAAGGGAAGGAACAGGAGGTCCCTACTTTTACGGAATTAAGCAGAGAAA  591
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGAAGAGCAAGTGAGAAGAGGCCTGGAAGGGAAGGAACAGGAGGTCCCTACTTTTACGGAATTAAGCAGAGAAA  592

Query  592  ATGATGAAGAGAAAGTCACGTTTAATTTGAGTAAAGGAGCATGTAGCTCATCCGGAGCAACATCTTCCAAGTCA  665
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGATGAAGAGAAAGTCACGTTTAATTTGAGTAAAGGAGCATGTAGCTCATCCGGAGCAACATCTTCCAAGTCA  666

Query  666  AGTACTCTGGGACCGAGTGCACTGAAGACGATAGGAAGTTCAGCATCAGTGAAACGAAAAGAATCTTCCCAGAG  739
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGTACTCTGGGACCGAGTGCACTGAAGACGATAGGAAGTTCAGCATCAGTGAAACGAAAAGAATCTTCCCAGAG  740

Query  740  CTCAACTCAGTCTAAAGAAAAGAAGAAAAAGAAATCTGCACTGGATGAAATCATGGAGATTGAAGAGGAAAAGA  813
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTCAACTCAGTCTAAAGAAAAGAAGAAAAAGAAATCTGCACTGGATGAAATCATGGAGATTGAAGAGGAAAAGA  814

Query  814  AAAGAACTGCCCGAACAGACTACTGGCTACAGCCTGAAATTATTGTGAAAATTATAACCAAGAAACTGGGAGAG  887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAAGAACTGCCCGAACAGACTACTGGCTACAGCCTGAAATTATTGTGAAAATTATAACCAAGAAACTGGGAGAG  888

Query  888  AAATATCATAAGAAAAAGGCTATTGTTAAGGAAGTAATTGACAAATATACAGCTGTTGTGAAGATGATTGATTC  961
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAATATCATAAGAAAAAGGCTATTGTTAAGGAAGTAATTGACAAATATACAGCTGTTGTGAAGATGATTGATTC  962

Query  962  TGGAGACAAGCTGAAACTTGACCAGACTCATTTAGAGACAGTAATTCCAGCACCAGGAAAAAGAATTCTAGTTT  1035
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGGAGACAAGCTGAAACTTGACCAGACTCATTTAGAGACAGTAATTCCAGCACCAGGAAAAAGAATTCTAGTTT  1036

Query 1036  TAAATGGAGGCTACAGAGGAAATGAAGGTACCCTAGAATCCATCAATGAGAAGACTTTTTCAGCTACTATCGTC  1109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TAAATGGAGGCTACAGAGGAAATGAAGGTACCCTAGAATCCATCAATGAGAAGACTTTTTCAGCTACTATCGTC  1110

Query 1110  ATTGAAACTG-GCCCTTTAAAAGGACGCAGAGTTGAAGGAATTCAATATGAAGACATTTCTAAACTTGCC  1178
            |||||||||| |                                                          
Sbjct 1111  ATTGAAACTGTG----------------------------------------------------------  1122