Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14123
- Subject:
- NM_001168492.1
- Aligned Length:
- 1409
- Identities:
- 1259
- Gaps:
- 5
Alignment
Query 1 ATGGATGTAGAAAATGAGCAGATACTGAATGTAAACCCTGCAGATCCTGATAACTTAAGTGACTCTCTCTTTTC 74
||||||.|||||||||||||||.|||||||||.|||||..|.||.|||||.||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGATATAGAAAATGAGCAGACACTGAATGTGAACCCCACTGACCCTGACAATTTAAGCGACTCTCTCTTTTC 74
Query 75 CGGTGATGAAGAAAATGCTGGGACTGAGGAAGTAAAGAATGAAATAAATGGAAATTGGATTTCAGCA--TACTC 146
.||.|||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||| ||||
Sbjct 75 TGGAGATGAAGAAAATGCTGGCACTGAAGAAATAAAGAATGAAATAAATGGAAATTGGATTTCCGCATCTACT- 147
Query 147 CATTAACGAAGCTAGAATTAATGCCAAGGCAAAAAGGCGACTAAGGAAAAACTCATCCCGGGACTCTGGCAGAG 220
|||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||..|||||||.||||||||||||||||||.|||
Sbjct 148 -ATTAATGAAGCTAGAATCAATGCAAAAGCCAAAAGACGACTGCGGAAAAATTCATCCCGGGACTCTGGCCGAG 220
Query 221 GCGATTCGGTCAGCGACAGTGGGAGTGACGCCCTTAGAAGTGGATTAACTGTGCCAACCAGTCCAAAGGGAAGG 294
|.||.||.|||||.||||.|||.|||||.||..|||||||||||.|..|||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 221 GAGACTCAGTCAGTGACAATGGAAGTGAAGCGGTTAGAAGTGGAGTTGCTGTGCCCACCAGTCCAAAAGGAAGG 294
Query 295 TTGCTGGATAGGCGATCCAGATCTGGGAAAGGAAGGGGACTACCAAAGAAAGGTGGTGCAGGAGGCAAAGGTGT 368
|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 295 TTGCTAGATAGGCGGTCCAGATCTGGGAAAGGAAGGGGGCTGCCAAAGAAAGGTGGTGCAGGCGGCAAGGGTGT 368
Query 369 CTGGGGTACACCTGGACAGGTGTATGATGTGGAGGAGGTGGATGTGAAAGATCCTAACTATGATGATGACCAGG 442
||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 369 CTGGGGCACACCTGGACAGGTGTATGATGTGGAAGAGGTGGATGTGAAAGATCCAAACTATGATGACGACCAGG 442
Query 443 AGAACTGTGTTTATGAAACTGTAGTTTTGCCTTTGGATGAAAGGGCATTTGAGAAGACTTTAACACCAATCATA 516
|||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||.|..|||||||||||||||.||||||||||.|||
Sbjct 443 AGAACTGTGTTTATGAAACTGTAGTTTTGCCCCTGGATGAGACCGCATTTGAGAAGACTCTAACACCAATTATA 516
Query 517 CAGGAATATTTTGAGCATGGAGATACTAATGAAGTTGCGGAAATGTTAAGAGATTTAAATCTTGGTGAAATGAA 590
||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||
Sbjct 517 CAGGAATACTTTGAGCATGGAGATACAAATGAAGTTGCGGAGATGTTAAGAGACTTAAACCTTGGGGAGATGAA 590
Query 591 AAGTGGAGTACCAGTGTTGGCAGTATCCTTAGCATTGGAGGGGAAGGCTAGTCATAGAGAGATGACATCTAAGC 664
.|||||.||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||..|.|||||||||||.||||
Sbjct 591 GAGTGGCGTGCCGGTGTTGGCAGTGTCCTTAGCCTTGGAGGGGAAGGCCAGCCACCGGGAGATGACATCCAAGC 664
Query 665 TTCTTTCTGACCTTTGTGGGACAGTAATGAGCACAACTGATGTGGAAAAATCATTTGATAAATTGTTGAAAGAT 738
|.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||.|||.||||||||.||||||||.||.|||.||||.|||
Sbjct 665 TGCTTTCTGACCTTTGCGGGACGGTGATGAGCACAAATGACGTGGAAAAGTCATTTGACAAGTTGCTGAAGGAT 738
Query 739 CTACCTGAATTAGCACTGGATACTCCTAGAGCACCACAGTTGGTGGGCCAGTTTATTGCTAGAGCTGTTGGAGA 812
||.|||||..||||..||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 739 CTCCCTGAGCTAGCCTTGGACACTCCTAGGGCACCGCAGTTGGTGGGCCAGTTTATTGCTAGAGCTGTTGGAGA 812
Query 813 TGGAATTTTATGTAATACCTATATTGATAGTTACAAAGGAACTGTAGATTGTGTGCAGGCTAGAGCTGCTCTGG 886
||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||
Sbjct 813 TGGAATCTTATGTAATACCTATATCGATAGTTACAAAGGAACTGTAGATTGTGTACAGGCTCGAGCTGCTCTGG 886
Query 887 ATAAGGCTACCGTGCTTCTGAGTATGTCTAAAGGTGGAAAGCGTAAAGATAGTGTGTGGGGCTCTGGAGGTGGG 960
||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 887 ATAAGGCTACTGTGCTCCTGAGTATGTCCAAAGGCGGGAAGCGGAAAGACAGTGTGTGGGGATCTGGAGGCGGG 960
Query 961 CAGCAATCTGTCAATCACCTTGTTAAAGAGATTGATATGCTGCTGAAAGAATATTTACTCTCTGGAGACATATC 1034
||.||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 961 CAACAGCCTGTCAATCACCTTGTTAAAGAGATTGATATGCTGCTTAAAGAGTATTTACTCTCTGGAGATATATC 1034
Query 1035 TGAAGCTGAACATTGCCTTAAGGAACTGGAAGTACCTCATTTTCACCATGAGCTTGTATATGAAGCTATTATAA 1108
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||.|||
Sbjct 1035 TGAAGCTGAACACTGCCTTAAGGAACTGGAAGTACCTCATTTTCACCACGAGCTTGTATATGAAGCCATTGTAA 1108
Query 1109 TGGTTTTAGAGTCAACTGGAGAAAGTACATTTAAGATGATTTTGGATTTATTAAAGTCCCTTTGGAAGTCTTCT 1182
||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||.||.|||||||||||.|||.|.||||||||||||
Sbjct 1109 TGGTTTTAGAGTCAACTGGAGAAAGTGCATTCAAGATGATCTTAGATTTATTAAAATCCTTGTGGAAGTCTTCT 1182
Query 1183 ACCATTACTGTAGACCAAATGAAAAGAGGTTATGAGAGAATTTACAATGAAATTCCGGACATTAATCTGGATGT 1256
||.|||||..|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1183 ACTATTACCATAGACCAAATGAAAAGAGGCTATGAGAGAATTTACAATGAAATCCCAGACATTAATCTGGATGT 1256
Query 1257 CCCACATTCATACTCTGTGCTGGAGCGGTTTGTAGAAGAATGTTTTCAGGCTGGAATAATTTCCAAACAACTCA 1330
||||||.|||||||||||.||.|||.|.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1257 CCCACACTCATACTCTGTTCTTGAGAGATTTGTGGAGGAATGTTTTCAGGCTGGAATAATTTCCAAACAACTCC 1330
Query 1331 GAGATCTTTGTCCTTCAAGGGGCAGAAAGCGTTTTGTAAGCGAAGGAGATGGAGGTCGTCTTAAACCAG-GAGC 1403
|.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.| ||||
Sbjct 1331 GTGATCTTTGTCCATCAAGGGGAAGAAAGCGTTTTGTAAGTGAAGGAGATGGAGGCCGTCTTAAACCTGAGAGC 1404
Query 1404 TAC 1406
|||
Sbjct 1405 TAC 1407