Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14123
- Subject:
- NM_145341.3
- Aligned Length:
- 1407
- Identities:
- 1369
- Gaps:
- 34
Alignment
Query 1 ATGGATGTAGAAAATGAGCAGATACTGAATGTAAACCCTGCAGATCCTGATAACTTAAGTGACTCTCTCTTTTC 74
||||.||.|| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -------------ATGACCAAAT--------------------ATCCTGATAACTTAAGTGACTCTCTCTTTTC 41
Query 75 CGGTGATGAAGAAAATGCTGGGACTGAGGAAGTAAAGAATGAAATAAATGGAAATTGGATTTCAGCATACTCCA 148
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 42 CGGTGATGAAGAAAATGCTGGGACTGAGGAAATAAAGAATGAAATAAATGGAAATTGGATTTCAGCATCCTCCA 115
Query 149 TTAACGAAGCTAGAATTAATGCCAAGGCAAAAAGGCGACTAAGGAAAAACTCATCCCGGGACTCTGGCAGAGGC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 116 TTAACGAAGCTAGAATTAATGCCAAGGCAAAAAGGCGACTAAGGAAAAACTCATCCCGGGACTCTGGCAGAGGC 189
Query 223 GATTCGGTCAGCGACAGTGGGAGTGACGCCCTTAGAAGTGGATTAACTGTGCCAACCAGTCCAAAGGGAAGGTT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 190 GATTCGGTCAGCGACAGTGGGAGTGACGCCCTTAGAAGTGGATTAACTGTGCCAACCAGTCCAAAGGGAAGGTT 263
Query 297 GCTGGATAGGCGATCCAGATCTGGGAAAGGAAGGGGACTACCAAAGAAAGGTGGTGCAGGAGGCAAAGGTGTCT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 264 GCTGGATAGGCGATCCAGATCTGGGAAAGGAAGGGGACTACCAAAGAAAGGTGGTGCAGGAGGCAAAGGTGTCT 337
Query 371 GGGGTACACCTGGACAGGTGTATGATGTGGAGGAGGTGGATGTGAAAGATCCTAACTATGATGATGACCAGGAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 338 GGGGTACACCTGGACAGGTGTATGATGTGGAGGAGGTGGATGTGAAAGATCCTAACTATGATGATGACCAGGAG 411
Query 445 AACTGTGTTTATGAAACTGTAGTTTTGCCTTTGGATGAAAGGGCATTTGAGAAGACTTTAACACCAATCATACA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 412 AACTGTGTTTATGAAACTGTAGTTTTGCCTTTGGATGAAAGGGCATTTGAGAAGACTTTAACACCAATCATACA 485
Query 519 GGAATATTTTGAGCATGGAGATACTAATGAAGTTGCGGAAATGTTAAGAGATTTAAATCTTGGTGAAATGAAAA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 486 GGAATATTTTGAGCATGGAGATACTAATGAAGTTGCGGAAATGTTAAGAGATTTAAATCTTGGTGAAATGAAAA 559
Query 593 GTGGAGTACCAGTGTTGGCAGTATCCTTAGCATTGGAGGGGAAGGCTAGTCATAGAGAGATGACATCTAAGCTT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 560 GTGGAGTACCAGTGTTGGCAGTATCCTTAGCATTGGAGGGGAAGGCTAGTCATAGAGAGATGACATCTAAGCTT 633
Query 667 CTTTCTGACCTTTGTGGGACAGTAATGAGCACAACTGATGTGGAAAAATCATTTGATAAATTGTTGAAAGATCT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 634 CTTTCTGACCTTTGTGGGACAGTAATGAGCACAACTGATGTGGAAAAATCATTTGATAAATTGTTGAAAGATCT 707
Query 741 ACCTGAATTAGCACTGGATACTCCTAGAGCACCACAGTTGGTGGGCCAGTTTATTGCTAGAGCTGTTGGAGATG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 708 ACCTGAATTAGCACTGGATACTCCTAGAGCACCACAGTTGGTGGGCCAGTTTATTGCTAGAGCTGTTGGAGATG 781
Query 815 GAATTTTATGTAATACCTATATTGATAGTTACAAAGGAACTGTAGATTGTGTGCAGGCTAGAGCTGCTCTGGAT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 782 GAATTTTATGTAATACCTATATTGATAGTTACAAAGGAACTGTAGATTGTGTGCAGGCTAGAGCTGCTCTGGAT 855
Query 889 AAGGCTACCGTGCTTCTGAGTATGTCTAAAGGTGGAAAGCGTAAAGATAGTGTGTGGGGCTCTGGAGGTGGGCA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 856 AAGGCTACCGTGCTTCTGAGTATGTCTAAAGGTGGAAAGCGTAAAGATAGTGTGTGGGGCTCTGGAGGTGGGCA 929
Query 963 GCAATCTGTCAATCACCTTGTTAAAGAGATTGATATGCTGCTGAAAGAATATTTACTCTCTGGAGACATATCTG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 930 GCAATCTGTCAATCACCTTGTTAAAGAGATTGATATGCTGCTGAAAGAATATTTACTCTCTGGAGACATATCTG 1003
Query 1037 AAGCTGAACATTGCCTTAAGGAACTGGAAGTACCTCATTTTCACCATGAGCTTGTATATGAAGCTATTATAATG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1004 AAGCTGAACATTGCCTTAAGGAACTGGAAGTACCTCATTTTCACCATGAGCTTGTATATGAAGCTATTATAATG 1077
Query 1111 GTTTTAGAGTCAACTGGAGAAAGTACATTTAAGATGATTTTGGATTTATTAAAGTCCCTTTGGAAGTCTTCTAC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1078 GTTTTAGAGTCAACTGGAGAAAGTACATTTAAGATGATTTTGGATTTATTAAAGTCCCTTTGGAAGTCTTCTAC 1151
Query 1185 CATTACTGTAGACCAAATGAAAAGAGGTTATGAGAGAATTTACAATGAAATTCCGGACATTAATCTGGATGTCC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1152 CATTACTGTAGACCAAATGAAAAGAGGTTATGAGAGAATTTACAATGAAATTCCGGACATTAATCTGGATGTCC 1225
Query 1259 CACATTCATACTCTGTGCTGGAGCGGTTTGTAGAAGAATGTTTTCAGGCTGGAATAATTTCCAAACAACTCAGA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1226 CACATTCATACTCTGTGCTGGAGCGGTTTGTAGAAGAATGTTTTCAGGCTGGAATAATTTCCAAACAACTCAGA 1299
Query 1333 GATCTTTGTCCTTCAAGGGGCAGAAAGCGTTTTGTAAGCGAAGGAGATGGAGGTCGTCTTAAACCAG-GAGCTA 1405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1300 GATCTTTGTCCTTCAAGGGGCAGAAAGCGTTTTGTAAGCGAAGGAGATGGAGGTCGTCTTAAACCAGAGAGCTA 1373
Query 1406 C 1406
|
Sbjct 1374 C 1374