Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14200
- Subject:
- NM_018717.5
- Aligned Length:
- 3415
- Identities:
- 3396
- Gaps:
- 16
Alignment
Query 1 ATGGGGGATTTCGCAGCCCCCGCTGCTGCCGCGAATGGCAGTAGTATTTGCATCAACAGTAGCCTGAACAGCAG 74
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Sbjct 1 ATGGGGGATTTCGCAGCCCCCGCTGCTGCCGCGAATGGCAGTAGTATTTGCATCAACAGTAGCCTGAACAGCAG 74
Query 75 CCTCGGCGGGGCCGGGATCGGTGTGAATAATACTCCCAATAGTACTCCCGCTGCTCCGAGTAGCAATCACCCGG 148
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Sbjct 75 CCTCGGCGGGGCCGGGATCGGTGTGAATAATACTCCCAATAGTACTCCCGCTGCTCCGAGTAGCAATCACCCGG 148
Query 149 CAGCCGGTGGATGCGGCGGCTCCGGGGGCCCCGGCGGCGGTTCGGCGGCCGTTCCCAAGCACAGCACCGTGGTG 222
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Sbjct 149 CAGCCGGTGGATGCGGCGGCTCCGGGGGCCCCGGCGGCGGTTCGGCGGCCGTTCCCAAGCACAGCACCGTGGTG 222
Query 223 GAGCGGCTCCGCCAGCGCATCGAGGGCTGCCGTCGGCACCACGTCAACTGCGAGAACAGGTACCAGCAGGCTCA 296
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Sbjct 223 GAGCGGCTCCGCCAGCGCATCGAGGGCTGCCGTCGGCACCACGTCAACTGCGAGAACAGGTACCAGCAGGCTCA 296
Query 297 GGTGGAGCAGCTGGAGCTGGAGCGCCGGGACACCGTGAGCCTCTACCAGCGGACCCTGGAGCAGAGGGCCAAGA 370
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Sbjct 297 GGTGGAGCAGCTGGAGCTGGAGCGCCGGGACACCGTGAGCCTCTACCAGCGGACCCTGGAGCAGAGGGCCAAGA 370
Query 371 AATCGGGCGCCGGCACCGGCAAACAGCAGCACCCGAGCAAACCCCAGCAAGATGCGGAGGCTGCCTCGGCGGAG 444
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Sbjct 371 AATCGGGCGCCGGCACCGGCAAACAGCAGCACCCGAGCAAACCCCAGCAAGATGCGGAGGCTGCCTCGGCGGAG 444
Query 445 CAGAGGAACCACACGCTGATCATGCTACAAGAGACTGTGAAAAGGAAGTTGGAAGGAGCTCGATCACCACTTAA 518
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Sbjct 445 CAGAGGAACCACACGCTGATCATGCTACAAGAGACTGTGAAAAGGAAGTTGGAAGGAGCTCGATCACCACTTAA 518
Query 519 TGGAGACCAGCAGAATGGTGCTTGTGATGGGAATTTTTCTCCGACTAGCAAACGAATTCGAAAGGACATTTCTG 592
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Sbjct 519 TGGAGACCAGCAGAATGGTGCTTGTGATGGGAATTTTTCTCCGACTAGCAAACGAATTCGAAAGGACATTTCTG 592
Query 593 CGGGGATGGAAGCCATCAACAATTTGCCCAGTAACATGCCACTGCCTTCAGCTTCTCCTCTTCACCAACTTGAC 666
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Sbjct 593 CGGGGATGGAAGCCATCAACAATTTGCCCAGTAACATGCCACTGCCTTCAGCTTCTCCTCTTCACCAACTTGAC 666
Query 667 CTGAAACCTTCTTTGCCCTTGCAGAACAGTGGAACTCACACTCCTGGGCTTCTAGAAGATCTAAGTAAGAATGG 740
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Sbjct 667 CTGAAACCTTCTTTGCCCTTGCAGAACAGTGGAACTCACACTCCTGGGCTTCTAGAAGATCTAAGTAAGAATGG 740
Query 741 TAGGCTCCCTGAGATTAAACTTCCTGTCAACGGTTGCAGTGACCTGGAGGATAGCTTCACCATCTTGCAGAGCA 814
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Sbjct 741 TAGGCTCCCTGAGATTAAACTTCCTGTCAACGGTTGCAGTGACCTGGAGGATAGCTTCACCATCTTGCAGAGCA 814
Query 815 AAGACCTCAAACAAGAACCTCTCGATGACCCTACTTGCATAGACACATCAGAAACATCTCTTTCAAATCAGAAC 888
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Sbjct 815 AAGACCTCAAACAAGAACCTCTCGATGACCCTACTTGCATAGACACATCAGAAACATCTCTTTCAAATCAGAAC 888
Query 889 AAGCTGTTCTCAGACATTAATCTGAATGATCAGGAGTGGCAAGAATTAATAGATGAATTGGCCAACACGGTTCC 962
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Sbjct 889 AAGCTGTTCTCAGACATTAATCTGAATGATCAGGAGTGGCAAGAATTAATAGATGAATTGGCCAACACGGTTCC 962
Query 963 TGAGGATGACATACAGGACCTGTTCAACGAAGACTTTGAAGAGAAGAAGGAGCCAGAATTCTCGCAGCCAGCAA 1036
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Sbjct 963 TGAGGATGACATACAGGACCTGTTCAACGAAGACTTTGAAGAGAAGAAGGAGCCAGAATTCTCGCAGCCAGCAA 1036
Query 1037 CTGAGACCCCTCTCTCCCAGGAGAGTGCGAGCGTGAAGAGCGACCCCTCTCACTCTCCCTTCGCACATGTCTCC 1110
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Sbjct 1037 CTGAGACCCCTCTCTCCCAGGAGAGTGCGAGCGTGAAGAGCGACCCCTCTCACTCTCCCTTCGCACATGTCTCC 1110
Query 1111 ATGGGATCTCCCCAGGCGAGGCCTTCTTCTTCTGGTCCTCCCTTTTCTACTGTCTCCACGGCCACTAGTTTACC 1184
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Sbjct 1111 ATGGGATCTCCCCAGGCGAGGCCTTCTTCTTCTGGTCCTCCCTTTTCTACTGTCTCCACGGCCACTAGTTTACC 1184
Query 1185 TTCTGTTGCCAGCACTCCCGCAGCTCCAAACCCTGCAAGCTCACCAGCAAACTGTGCTGTCCAGTCCCCTCAAA 1258
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Sbjct 1185 TTCTGTTGCCAGCACTCCCGCAGCTCCAAACCCTGCAAGCTCACCAGCAAACTGTGCTGTCCAGTCCCCTCAAA 1258
Query 1259 CTCCAAACCAAGCCCACACTCCAGGCCAAGCTCCACCTCGGCCTGGAAATGGTTATCTCCTGAATCCGGCAGCA 1332
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Sbjct 1259 CTCCAAACCAAGCCCACACTCCAGGCCAAGCTCCACCTCGGCCTGGAAATGGTTATCTCCTGAATCCGGCAGCA 1332
Query 1333 GTGACAGTGGCCGGTTCAGCGTCAGGGCCTGTGGCTGTGCCCAGCTCTGACATGTCTCCAGCAGAACAGCTCAA 1406
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Sbjct 1333 GTGACAGTGGCCGGTTCAGCGTCAGGGCCTGTGGCTGTGCCCAGCTCTGACATGTCTCCAGCAGAACAGCTCAA 1406
Query 1407 ACAGATGGCTGCACAGCAGCAACAAAGGGCCAAACTCATGCAGCAGAAGCAGCAACAGCAA------------C 1468
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Sbjct 1407 ACAGATGGCTGCACAGCAGCAACAAAGGGCCAAACTCATGCAGCAGAAACAGCAACAGCAACAGCAGCAGCAGC 1480
Query 1469 AGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCACTCAAATCAGACTTCAAATTGG 1542
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Sbjct 1481 AGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCACTCAAATCAGACTTCAAATTGG 1554
Query 1543 TCTCCCTTAGGACCTCCCTCTAGTCCATATGGAGCAGCTTTTACTGCAGAAAAACCAAATAGCCCAATGATGTA 1616
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Sbjct 1555 TCTCCCTTAGGACCTCCCTCTAGTCCATATGGAGCAGCTTTTACTGCAGAAAAACCAAATAGCCCAATGATGTA 1628
Query 1617 CCCCCAAGCCTTTAACAACCAAAACCCTATAGTGCCTCCAATGGCAAACAACCTGCAGAAGACAACAATGAATA 1690
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Sbjct 1629 CCCCCAAGCCTTTAACAACCAAAACCCTATAGTGCCTCCAATGGCAAACAACCTGCAGAAGACAACAATGAATA 1702
Query 1691 ACTACCTCCCTCAGAATCACATGAATATGATCAATCAGCAGCCAAATAACTTGGGTACAAACTCCTTAAACAAA 1764
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Sbjct 1703 ACTACCTCCCTCAGAATCACATGAATATGATCAATCAGCAGCCAAATAACTTGGGTACAAACTCCTTAAACAAA 1776
Query 1765 CAGCACAATATTCTGACTTATGGCAACACTAAACCCCTGACCCACTTCAATGCAGACCTGAGTCAGAGGATGAC 1838
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Sbjct 1777 CAGCACAATATTCTGACTTATGGCAACACTAAACCCCTGACCCACTTCAATGCAGACCTGAGTCAGAGGATGAC 1850
Query 1839 ACCACCAGTGGCCAACCCCAACAAAAACCCCTTGATGCCGTATATCCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAACAGC 1912
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Sbjct 1851 ACCACCAGTGGCCAACCCCAACAAAAACCCCTTGATGCCGTATATCCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAACAGC 1924
Query 1913 AACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCACCACCTCCACAGCTCCAGGCCCCCAGGGCACACCTGAGCGAAGAC 1986
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Sbjct 1925 AACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCACCTCCACAGCTCCAGGCCCCCAGGGCACACCTGAGCGAAGAC 1998
Query 1987 CAGAAACGCCTGCTTCTCATGAAGCAGAAAGGAGTGATGAATCAGCCCATGGCTTACGCTGCACTTCCATCCCA 2060
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Sbjct 1999 CAGAAACGCCTGCTTCTCATGAAGCAGAAAGGAGTGATGAATCAGCCCATGGCTTACGCTGCACTTCCATCCCA 2072
Query 2061 CGGTCAGGAGCAGCATCCAGTTGGACTTCCCCGAACCACAGGCCCCATGCAGTCCTCCGTGCCCCCAGGCTCAG 2134
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Sbjct 2073 CGGTCAGGAGCAGCATCCAGTTGGACTTCCCCGAACCACAGGCCCCATGCAGTCCTCCGTGCCCCCAGGCTCAG 2146
Query 2135 GTGGCATGGTCTCAGGAGCCAGTCCCGCAGGCCCCGGCTTCCTGGGCAGCCAGCCCCAAGCAGCCATCATGAAG 2208
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Sbjct 2147 GTGGCATGGTCTCAGGAGCCAGTCCCGCAGGCCCCGGCTTCCTGGGCAGCCAGCCCCAAGCAGCCATCATGAAG 2220
Query 2209 CAGATGCTCATTGATCAGCGGGCCCAGTTGATAGAGCAGCAGAAGCAACAGTTCCTGCGGGAGCAAAG---GCA 2279
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Sbjct 2221 CAGATGCTCATTGATCAGCGGGCCCAGTTGATAGAGCAGCAGAAGCAACAGTTCCTGCGGGAGCAAAGGCAGCA 2294
Query 2280 GCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGATTTTGGCGGAACAGCAGTTGCAGCAATCACATCTACCCCGGCAGCACCTCC 2353
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Sbjct 2295 GCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGATTTTGGCGGAACAGCAGTTGCAGCAATCACATCTACCCCGGCAGCACCTCC 2368
Query 2354 AGCCACAGCGGAATCCATACCCAGTGCAGCAGGTCAATCAGTTTCAAGGTTCTCCCCAGGATATAGCAGCCGTA 2427
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Sbjct 2369 AGCCACAGCGGAATCCATACCCAGTGCAGCAGGTCAATCAGTTTCAAGGTTCTCCCCAGGATATAGCAGCCGTA 2442
Query 2428 AGAAGCCAAGCAGCCCTCCAGAGCATGCGAACGTCACGGCTGATGGCACAGAACGCAGGCATGATGGGAATAGG 2501
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Sbjct 2443 AGAAGCCAAGCAGCCCTCCAGAGCATGCGAACGTCACGGCTGATGGCACAGAACGCAGGCATGATGGGAATAGG 2516
Query 2502 ACCCTCCCAGAACCCTGGGACGATGGCCACCGCAGCTGCGCAGTCGGAGATGGGACTGGCCCCTTATAGCACCA 2575
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Sbjct 2517 ACCCTCCCAGAACCCTGGGACGATGGCCACCGCAGCTGCGCAGTCGGAGATGGGACTGGCCCCTTATAGCACCA 2590
Query 2576 CGCCTACCAGCCAACCAGGAATGTACAATATGAGCACAGGCATGACCCAAATGTTGCAGCATCCAAACCAAAGT 2649
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Sbjct 2591 CGCCTACCAGCCAACCAGGAATGTACAATATGAGCACAGGCATGACCCAAATGTTGCAGCATCCAAACCAAAGT 2664
Query 2650 GGCATGAGCATCACACATAACCAAGCCCAGGGACCGAGGCAACCTGCCTCTGGGCAGGGGGTTGGAATGGTGAG 2723
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Sbjct 2665 GGCATGAGCATCACACATAACCAAGCCCAGGGACCGAGGCAACCTGCCTCTGGGCAGGGGGTTGGAATGGTGAG 2738
Query 2724 TGGCTTTGGTCAGAGCATGCTGGTGAACTCAGCCATTACCCAGCAACATCCACAGATGAAAGGGCCAGTAGGCC 2797
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Sbjct 2739 TGGCTTTGGTCAGAGCATGCTGGTGAACTCAGCCATTACCCAGCAACATCCACAGATGAAAGGGCCAGTAGGCC 2812
Query 2798 AGGCCTTGCCTAGGCCCCAAGCCCCTCCAAGGCTGCAGAGCCTTATGGGAACAGTCCAGCAAGGAGCACAAAGC 2871
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Sbjct 2813 AGGCCTTGCCTAGGCCCCAAGCCCCTCCAAGGCTGCAGAGCCTTATGGGAACAGTCCAGCAAGGAGCACAAAGC 2886
Query 2872 TGGCAACAGAGGAGCTTGCAGGGCATGCCTGGGAGGACTAGTGGAGAATTGGGACCATTCAACAATGGCGCCAG 2945
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Sbjct 2887 TGGCAACAGAGGAGCTTGCAGGGCATGCCTGGGAGGACTAGTGGAGAATTGGGACCATTCAACAATGGCGCCAG 2960
Query 2946 CTACCCTCTTCAAGCTGGGCAGCCGAGACTGACCAAGCAGCACTTCCCACAGGGACTGAGCCAGTCAGTCGTGG 3019
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Sbjct 2961 CTACCCTCTTCAAGCTGGGCAGCCGAGACTGACCAAGCAGCACTTCCCACAGGGACTGAGCCAGTCAGTCGTGG 3034
Query 3020 ATGCTAACACGGGCACAGTGAGGACCCTCAACCCAGCTGCCATGGGTCGGCAGATGATGCCATCGCTCCCGGGG 3093
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Sbjct 3035 ATGCTAACACGGGCACAGTGAGGACCCTCAACCCAGCTGCCATGGGTCGGCAGATGATGCCATCGCTCCCGGGG 3108
Query 3094 CAGCAAGGCACCAGCCAGGCGATGGCCAATGGTCATGTCTGGCCTGAGCCAGGGAGTCCCAGGCATGCCAGCGT 3167
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Sbjct 3109 CAGCAAGGCACCAGCCAGGCGA-GGCCAATGGTCATGTCTGGCCTGAGCCAGGGAGTCCCAGGCATGCCAGCGT 3181
Query 3168 TCAGCCAGCCCCCAGCACAGCAGCAGATACCCAGTGGCAGCTTTGCTCCAAGCAGCCAGAGCCAAGCCTATGAG 3241
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Sbjct 3182 TCAGCCAGCCCCCAGCACAGCAGCAGATACCCAGTGGCAGCTTTGCTCCAAGCAGCCAGAGCCAAGCCTATGAG 3255
Query 3242 CGGAATGCCCCTCAGGACGTGTCATACAATTACAGTGGCGACGGAGCTGGGGGTTCCTTCCCTGGCCTCCCGGA 3315
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Sbjct 3256 CGGAATGCCCCTCAGGACGTGTCATACAATTACAGTGGCGACGGAGCTGGGGGTTCCTTCCCTGGCCTCCCGGA 3329
Query 3316 CGGTGCAGACCTTGTGGACTCCATCATCAAAGGCGGGCCAGGGGACGAGTGGATGCAGGAGCTTGATGAATTGT 3389
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Sbjct 3330 CGGTGCAGACCTTGTGGACTCCATCATCAAAGGCGGGCCAGGGGACGAGTGGATGCAGGAGCTTGATGAATTGT 3403
Query 3390 TTGGTAACCCC 3400
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Sbjct 3404 TTGGTAACCCC 3414