Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14220
- Subject:
- XM_011539976.2
- Aligned Length:
- 1821
- Identities:
- 1370
- Gaps:
- 447
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCATCGTGATTACCCGGCAGCCACTAACCAGGAAATATCCTACACTTTATGGTCTCCTTTGGCTTTTATCGC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CCGCTTCTGCCCAGACCGGATTAAAACCCTGGGGTGGGGCAGCATTAATAAACTTGAATTGAAGAGCAGTTTAT 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 ACTTACTTTATCAAGATAAAGAGGAAGTTGTCTTATGGATGAATACTGTTGGGCCCTACCATAATCGTCAAGAA 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 ACATATAAGTACTTTTCACTTCCATTCTGTGTGGGGTCAAAAAAAAGTATCAGTCATTACCATGAAACTCTGGG 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 AGAAGCACTTCAAGGGGTTGAATTGGAATTTAGTGGTCTGGATATTAAATTTAAAGATGATGTGATGCCAGCCA 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 CTTACTGTGAAATTGATTTAGATAAAGAAAAGAGAGATGCATTTGTATATGCCATAAAAAATCATTACTGGTAC 444
Query 1 ---ATGCACATAGATGATTTACCAATATGGGGTATTGTTGGTGAGGCTGATGAAAATGGAGAAGATTACTATCT 71
|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CAGATGTACATAGATGATTTACCAATATGGGGTATTGTTGGTGAGGCTGATGAAAATGGAGAAGATTACTATCT 518
Query 72 TTGGACCTATAAAAAACTTGAAATAGGTTTTAATGGAAATCGAATTGTTGATGTTAATCTAACTAGTGAAGGAA 145
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TTGGACCTATAAAAAACTTGAAATAGGTTTTAATGGAAATCGAATTGTTGATGTTAATCTAACTAGTGAAGGAA 592
Query 146 AGGTGAAACTGGTTCCAAATACTAAAATCCAGATGTCATATTCAGTAAAATGGAAAAAGTCAGATGTGAAATTT 219
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGGTGAAACTGGTTCCAAATACTAAAATCCAGATGTCATATTCAGTAAAATGGAAAAAGTCAGATGTGAAATTT 666
Query 220 GAAGATCGATTTGACAAATATCTTGATCCGTCCTTTTTTCAACATCGGATTCATTGGTTTTCAATTTTCAACTC 293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAAGATCGATTTGACAAATATCTTGATCCGTCCTTTTTTCAACATCGGATTCATTGGTTTTCAATTTTCAACTC 740
Query 294 CTTCATGATGGTGATCTTCTTGGTGGGCTTAGTTTCAATGATTTTAATGAGAACATTAAGAAAAGATTATGCTC 367
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTTCATGATGGTGATCTTCTTGGTGGGCTTAGTTTCAATGATTTTAATGAGAACATTAAGAAAAGATTATGCTC 814
Query 368 GGTACAGTAAAGAGGAAGAAATGGATGATATGGATAGAGACCTAGGAGATGAATATGGATGGAAACAGGTGCAT 441
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGTACAGTAAAGAGGAAGAAATGGATGATATGGATAGAGACCTAGGAGATGAATATGGATGGAAACAGGTGCAT 888
Query 442 GGAGATGTATTTAGACCATCAAGTCACCCACTGATATTTTCCTCTCTGATTGGTTCTGGATGTCAGATATTTGC 515
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGAGATGTATTTAGACCATCAAGTCACCCACTGATATTTTCCTCTCTGATTGGTTCTGGATGTCAGATATTTGC 962
Query 516 TGTGTCTCTCATCGTTATTATTGTTGCAATGATAGAAGATTTATATACTGAGAGGGGATCAATGCTCAGTACAG 589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGTGTCTCTCATCGTTATTATTGTTGCAATGATAGAAGATTTATATACTGAGAGGGGATCAATGCTCAGTACAG 1036
Query 590 CCATATTTGTCTATGCTGCTACGTCTCCAGTGAATGGTTATTTTGGAGGAAGTCTGTATGCTAGACAAGGAGGA 663
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCATATTTGTCTATGCTGCTACGTCTCCAGTGAATGGTTATTTTGGAGGAAGTCTGTATGCTAGACAAGGAGGA 1110
Query 664 AGGAGATGGATAAAGCAGATGTTTATTGGGGCATTCCTTATCCCAGCTATGGTGTGTGGCACTGCCTTCTTCAT 737
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AGGAGATGGATAAAGCAGATGTTTATTGGGGCATTCCTTATCCCAGCTATGGTGTGTGGCACTGCCTTCTTCAT 1184
Query 738 CAATTTCATAGCCATTTATTACCATGCTTCAAGAGCCATTCCTTTTGGAACAATGGTGGCCGTTTGTTGCATCT 811
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CAATTTCATAGCCATTTATTACCATGCTTCAAGAGCCATTCCTTTTGGAACAATGGTGGCCGTTTGTTGCATCT 1258
Query 812 GTTTTTTTGTTATTCTTCCTCTAAATCTTGTTGGTACAATACTTGGCCGAAATCTGTCAGGTCAGCCCAACTTT 885
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GTTTTTTTGTTATTCTTCCTCTAAATCTTGTTGGTACAATACTTGGCCGAAATCTGTCAGGTCAGCCCAACTTT 1332
Query 886 CCTTGTCGTGTCAATGCTGTGCCTCGTCCTATACCGGAGAAAAAATGGTTCATGGAGCCTGCGGTTATTGTTTG 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CCTTGTCGTGTCAATGCTGTGCCTCGTCCTATACCGGAGAAAAAATGGTTCATGGAGCCTGCGGTTATTGTTTG 1406
Query 960 CCTGGGTGGAATTTTACCTTTTGGTTCAATCTTTATTGAAATGTATTTCATCTTCACGTCTTTCTGGGCATATA 1033
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CCTGGGTGGAATTTTACCTTTTGGTTCAATCTTTATTGAAATGTATTTCATCTTCACGTCTTTCTGGGCATATA 1480
Query 1034 AGATCTATTATGTCTATGGCTTCATGATGCTGGTGCTGGTTATCCTGTGCATTGTGACTGTCTGTGTGACTATT 1107
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGATCTATTATGTCTATGGCTTCATGATGCTGGTGCTGGTTATCCTGTGCATTGTGACTGTCTGTGTGACTATT 1554
Query 1108 GTGTGCACATATTTTCTACTAAATGCAGAAGATTACAGGTGGCAATGGACAAGTTTTCTCTCTGCTGCATCAAC 1181
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GTGTGCACATATTTTCTACTAAATGCAGAAGATTACCGGTGGCAATGGACAAGTTTTCTCTCTGCTGCATCAAC 1628
Query 1182 TGCAATCTATGTTTACATGTATTCCTTTTACTACTATTTTTTCAAAACAAAGATGTATGGCTTATTTCAAACAT 1255
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TGCAATCTATGTTTACATGTATTCCTTTTACTACTATTTTTTCAAAACAAAGATGTATGGCTTATTTCAAACAT 1702
Query 1256 CATTTTACTTTGGATATATGGCGGTATTTAGCACAGCCTTGGGGATAATGTGTGGAGCGATTGGTTACATGGGA 1329
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CATTTTACTTTGGATATATGGCGGTATTTAGCACAGCCTTGGGGATAATGTGTGGAGCGATTGGTTACATGGGA 1776
Query 1330 ACAAGTGCCTTTGTCCGAAAAATCTATAGTCATGTGAAAATTGAC 1374
||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||
Sbjct 1777 ACAAGTGCCTTTGTCCGAAAAATCTATACTAATGTGAAAATTGAC 1821
