Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14225
• Subject: NM_001256395.2
• Aligned Length: 1279
• Identities: 1111
• Gaps: 164

Alignment

Query    1  ATGGTCTTCGTGGGCTTTGGCTTCCTCATGGTCTTCCTGCAGCGTTACGGCTTCAGCAGCGTGGGCTTCACCTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTCTTCGTGGGCTTTGGCTTCCTCATGGTCTTCCTGCAGCGTTACGGCTTCAGCAGCGTGGGCTTCACCTT  74

Query   75  CCTCCTGGCCGCCTTTGCCCTGCAGTGGTCCACACTGGTCCAGGGCTTTCTCCACTCCTTCCACGGTGGCCACA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTCCTGGCCGCCTTTGCCCTGCAGTGGTCCACACTGGTCCAGGGCTTTCTCCACTCCTTCCACGGTGGCCACA  148

Query  149  TCCATGTTGGCGTGGAGAGCATGATCAATGCTGACTTTTGTGCGGGGGCCGTGCTCATCTCCTTTGGTGCCGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  149  TCCATGTTGGCGTGGAGAGCATGATCAATGCTGACTTTTGTGCGGGGGCCGTGCTCATCTCCTTTGGTGCCGTC  222

Query  223  CTGGGCAAGACCGGGCCTACCCAGCTGCTGCTCATGGCCCTGCTGGAGGTGGTGCTGTTTGGCATCAATGAGTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGGGCAAGACCGGGCCTACCCAGCTGCTGCTCATGGCCCTGCTGGAGGTGGTGCTGTTTGGCATCAATGAGTT  296

Query  297  TGTGCTCCTTCATCTCCTGGGGGTGAGAGTCTGGGGAGGGATGGAGTCGGGGGTGGGGGGTGGTCAAGGTCAGC  370
            |||||||||||||||||||||                                                     
Sbjct  297  TGTGCTCCTTCATCTCCTGGG-----------------------------------------------------  317

Query  371  CTCTGAGCCAGGAGCGTGGGGGTGGGGGCGGGGTGCTGCCTCTCACCCCACCTCCCCAGGTGAGAGATGCCGGA  444
                                                                      ||||||||||||||||
Sbjct  318  ----------------------------------------------------------GGTGAGAGATGCCGGA  333

Query  445  GGCTCCATGACTATCCACACCTTTGGTGCCTACTTCGGGCTCGTCCTTTCGCGGGTTCTGTACAGGCCCCAGCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  334  GGCTCCATGACTATCCACACCTTTGGTGCCTACTTCGGGCTCGTCCTTTCGCGGGTTCTGTACAGGCCCCAGCT  407

Query  519  GGAGAAGAGCAAGCACCGCCAGGGCTCCGTCTACCATTCAGACCTCTTCGCCATGATTGGGACCATCTTCCTGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  408  GGAGAAGAGCAAGCACCGCCAGGGCTCCGTCTACCATTCAGACCTCTTCGCCATGATTGGGACCATCTTCCTGT  481

Query  593  GGATCTTCTGGCCTAGCTTCAATGCTGCACTCACATCGCTGGGGGCTGGGCAGCATCGGACGGCCCTCAACACA  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  482  GGATCTTCTGGCCTAGCTTCAATGCTGCACTCACAGCGCTGGGGGCTGGGCAGCATCGGACGGCCCTCAACACA  555

Query  667  TACTACTCCCTGGCTGCCAGCACCCTTGGCACCTTTGCCTTGTCAGCCCTTGTAGGGGAAGATGGGAGGCTTGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  556  TACTACTCCCTGGCTGCCAGCACCCTTGGCACCTTTGCCTTGTCAGCCCTTGTAGGGGAAGATGGGAGGCTTGA  629

Query  741  CATGGTCCACATCCAAAATGCAGCGCTGGCTGGAGGGGTTGTGGTGGGGACCTCAAGTGAAATGATGCTGACAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  630  CATGGTCCACATCCAAAATGCAGCGCTGGCTGGAGGGGTTGTGGTGGGGACCTCAAGTGAAATGATGCTGACAC  703

Query  815  CCTTTGGGGCTCTGGCAGCTGGCTTCTTGGCTAGGACTGTCTCCACGCTGGGGTACAAGTTCTTCACGCCCATC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  704  CCTTTGGGGCTCTGGCAGCTGGCTTCTTGGCTGGGACTGTCTCCACGCTGGGGTACAAGTTCTTCACGCCCATC  777

Query  889  CTTGAATCAAAATTCAAAGTCCAAGACACATGTGGAGTCCACAACCTCCATGGGATGCCGGGGGTCCTGGGGGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  778  CTTGAATCAAAATTCAAAGTCCAAGACACATGTGGAGTCCACAACCTCCATGGGATGCCGGGGGTCCTGGGGGC  851

Query  963  CCTCCTGGGGGTCCTTGTGGCTGGACTTGCCACCCATGAAGCTTACGGAGATGGCCTGGAGAGTGTGTTTCCAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  852  CCTCCTGGGGGTCCTTGTGGCTGGACTTGCCACCCATGAAGCTTACGGAGATGGCCTGGAGAGTGTGTTTCCAC  925

Query 1037  TCATAGCCGAGGGCCAGCGCAGTGCCACGTCACAGGCCATGCACCAGCTCTTCGGGCTGTTTGTCACACTGATG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  926  TCATAGCCGAGGGCCAGCGCAGTGCCACGTCACAGGCCATGCACCAGCTCTTCGGGCTGTTTGTCACACTGATG  999

Query 1111  TTTGCCTCTGTGGGCGGGGGCCTTGGAGGGCTCCTGCTGAAGCTACCCTTTCTGGACTCCCCCCCCAGACTCCC  1184
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1000  TTTGCCTCTGTGGGCGGGGGCCTTGGAGGGCTCCTGCTGAAGCTACCCTTTCTGGACT-CCCCCCCAGACTCCC  1072

Query 1185  AGCGCTACGAGGACCAAGTTCACTGGCAGGTGCCTGGCGAGCA-------------------------------  1227
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                               
Sbjct 1073  AGCACTACGAGGACCAAGTTCACTGGCAGGTGCCTGGCGAGCATGAGGATAAAGCCCAGAGACCTCTGAGGGTG  1146

Query 1228  ---------------------  1227
                                 
Sbjct 1147  GAGGAGGCAGACACTCAGGCC  1167