Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14225
• Subject: NM_020407.5
• Aligned Length: 1486
• Identities: 1111
• Gaps: 371

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCCGGGTCTCCTAGCCGCGCCGCGGGCCGGCGACTGCAGCTTCCCCTGCTGTGCCTCTTCCTCCAGGGCGC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CACTGCCGTCCTCTTTGCTGTCTTTGTCCGCTACAACCACAAAACCGACGCTGCCCTCTGGCACCGGAGCAACC  148

Query    1  -----------------------------------------------------------ATGGTCTTCGTGGGC  15
                                                                       |||||||||||||||
Sbjct  149  ACAGTAACGCGGACAATGAATTTTACTTTCGCTACCCAAGCTTCCAGGACGTGCATGCCATGGTCTTCGTGGGC  222

Query   16  TTTGGCTTCCTCATGGTCTTCCTGCAGCGTTACGGCTTCAGCAGCGTGGGCTTCACCTTCCTCCTGGCCGCCTT  89
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTTGGCTTCCTCATGGTCTTCCTGCAGCGTTACGGCTTCAGCAGCGTGGGCTTCACCTTCCTCCTGGCCGCCTT  296

Query   90  TGCCCTGCAGTGGTCCACACTGGTCCAGGGCTTTCTCCACTCCTTCCACGGTGGCCACATCCATGTTGGCGTGG  163
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGCCCTGCAGTGGTCCACACTGGTCCAGGGCTTTCTCCACTCCTTCCACGGTGGCCACATCCATGTTGGCGTGG  370

Query  164  AGAGCATGATCAATGCTGACTTTTGTGCGGGGGCCGTGCTCATCTCCTTTGGTGCCGACCTGGGCAAGACCGGG  237
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  371  AGAGCATGATCAATGCTGACTTTTGTGCGGGGGCCGTGCTCATCTCCTTTGGTGCCGTCCTGGGCAAGACCGGG  444

Query  238  CCTACCCAGCTGCTGCTCATGGCCCTGCTGGAGGTGGTGCTGTTTGGCATCAATGAGTTTGTGCTCCTTCATCT  311
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCTACCCAGCTGCTGCTCATGGCCCTGCTGGAGGTGGTGCTGTTTGGCATCAATGAGTTTGTGCTCCTTCATCT  518

Query  312  CCTGGGGGTGAGAGTCTGGGGAGGGATGGAGTCGGGGGTGGGGGGTGGTCAAGGTCAGCCTCTGAGCCAGGAGC  385
            ||||||                                                                    
Sbjct  519  CCTGGG--------------------------------------------------------------------  524

Query  386  GTGGGGGTGGGGGCGGGGTGCTGCCTCTCACCCCACCTCCCCAGGTGAGAGATGCCGGAGGCTCCATGACTATC  459
                                                       |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  525  -------------------------------------------GGTGAGAGATGCCGGAGGCTCCATGACTATC  555

Query  460  CACACCTTTGGTGCCTACTTCGGGCTCGTCCTTTCGCGGGTTCTGTACAGGCCCCAGCTGGAGAAGAGCAAGCA  533
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  556  CACACCTTTGGTGCCTACTTCGGGCTCGTCCTTTCGCGGGTTCTGTACAGGCCCCAGCTGGAGAAGAGCAAGCA  629

Query  534  CCGCCAGGGCTCCGTCTACCATTCAGACCTCTTCGCCATGATTGGGACCATCTTCCTGTGGATCTTCTGGCCTA  607
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  630  CCGCCAGGGCTCCGTCTACCATTCAGACCTCTTCGCCATGATTGGGACCATCTTCCTGTGGATCTTCTGGCCTA  703

Query  608  GCTTCAATGCTGCACTCACATCGCTGGGGGCTGGGCAGCATCGGACGGCCCTCAACACATACTACTCCCTGGCT  681
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  704  GCTTCAATGCTGCACTCACAGCGCTGGGGGCTGGGCAGCATCGGACGGCCCTCAACACATACTACTCCCTGGCT  777

Query  682  GCCAGCACCCTTGGCACCTTTGCCTTGTCAGCCCTTGTAGGGGAAGATGGGAGGCTTGACATGGTCCACATCCA  755
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  778  GCCAGCACCCTTGGCACCTTTGCCTTGTCAGCCCTTGTAGGGGAAGATGGGAGGCTTGACATGGTCCACATCCA  851

Query  756  AAATGCAGCGCTGGCTGGAGGGGTTGTGGTGGGGACCTCAAGTGAAATGATGCTGACACCCTTTGGGGCTCTGG  829
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  852  AAATGCAGCGCTGGCTGGAGGGGTTGTGGTGGGGACCTCAAGTGAAATGATGCTGACACCCTTTGGGGCTCTGG  925

Query  830  CAGCTGGCTTCTTGGCTAGGACTGTCTCCACGCTGGGGTACAAGTTCTTCACGCCCATCCTTGAATCAAAATTC  903
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  926  CAGCTGGCTTCTTGGCTGGGACTGTCTCCACGCTGGGGTACAAGTTCTTCACGCCCATCCTTGAATCAAAATTC  999

Query  904  AAAGTCCAAGACACATGTGGAGTCCACAACCTCCATGGGATGCCGGGGGTCCTGGGGGCCCTCCTGGGGGTCCT  977
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1000  AAAGTCCAAGACACATGTGGAGTCCACAACCTCCATGGGATGCCGGGGGTCCTGGGGGCCCTCCTGGGGGTCCT  1073

Query  978  TGTGGCTGGACTTGCCACCCATGAAGCTTACGGAGATGGCCTGGAGAGTGTGTTTCCACTCATAGCCGAGGGCC  1051
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1074  TGTGGCTGGACTTGCCACCCATGAAGCTTACGGAGATGGCCTGGAGAGTGTGTTTCCACTCATAGCCGAGGGCC  1147

Query 1052  AGCGCAGTGCCACGTCACAGGCCATGCACCAGCTCTTCGGGCTGTTTGTCACACTGATGTTTGCCTCTGTGGGC  1125
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1148  AGCGCAGTGCCACGTCACAGGCCATGCACCAGCTCTTCGGGCTGTTTGTCACACTGATGTTTGCCTCTGTGGGC  1221

Query 1126  GGGGGCCTTGGAGGGCTCCTGCTGAAGCTACCCTTTCTGGACTCCCCCCCCAGACTCCCAGCGCTACGAGGACC  1199
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1222  GGGGGCCTTGGAGGGCTCCTGCTGAAGCTACCCTTTCTGGACT-CCCCCCCAGACTCCCAGCACTACGAGGACC  1294

Query 1200  AAGTTCACTGGCAGGTGCCTGGCGAGCA----------------------------------------------  1227
            ||||||||||||||||||||||||||||                                              
Sbjct 1295  AAGTTCACTGGCAGGTGCCTGGCGAGCATGAGGATAAAGCCCAGAGACCTCTGAGGGTGGAGGAGGCAGACACT  1368

Query 1228  ------  1227
                  
Sbjct 1369  CAGGCC  1374