Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14225
• Subject: XR_001737323.1
• Aligned Length: 2023
• Identities: 1111
• Gaps: 908

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  TTGTCTGCCAAAGCCTGCGAGCGCCAGCCGAGATCGCAGCCCAACCCATGGCCGGGTCTCCTAGCCGCGCCGCG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGCCGGCGACTGCAGCTTCCCCTGCTGTGCCTCTTCCTCCAGGGCGCCACTGCCGTCCTCTTTGCTGTCTTTGT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CCGCTACAACCACAAAACCGACGCTGCCCTCTGGCACCGGAGCAACCACAGTAACGCGGACAATGAATTTTACT  222

Query    1  --------------------------------ATGGTCTTCGTGGGCTTTGGCTTCCTCATGGTCTTCCTGCAG  42
                                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTCGCTACCCAAGCTTCCAGGACGTGCATGCCATGGTCTTCGTGGGCTTTGGCTTCCTCATGGTCTTCCTGCAG  296

Query   43  CGTTACGGCTTCAGCAGCGTGGGCTTCACCTTCCTCCTGGCCGCCTTTGCCCTGCAGTGGTCCACACTGGTCCA  116
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGTTACGGCTTCAGCAGCGTGGGCTTCACCTTCCTCCTGGCCGCCTTTGCCCTGCAGTGGTCCACACTGGTCCA  370

Query  117  GGGCTTTCTCCACTCCTTCCACGGTGGCCACATCCATGTTGGCGTGGAGAGCATGATCAATGCTGACTTTTGTG  190
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGGCTTTCTCCACTCCTTCCACGGTGGCCACATCCATGTTGGCGTGGAGAGCATGATCAATGCTGACTTTTGTG  444

Query  191  CGGGGGCCGTGCTCATCTCCTTTGGTGCCGACCTGGGCAAGACCGGGCCTACCCAGCTGCTGCTCATGGCCCTG  264
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGGGGGCCGTGCTCATCTCCTTTGGTGCCGTCCTGGGCAAGACCGGGCCTACCCAGCTGCTGCTCATGGCCCTG  518

Query  265  CTGGAGGTGGTGCTGTTTGGCATCAATGAGTTTGTGCTCCTTCATCTCCTGGGGGTGAGAGTCTGGGGAGGGAT  338
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     
Sbjct  519  CTGGAGGTGGTGCTGTTTGGCATCAATGAGTTTGTGCTCCTTCATCTCCTGGG---------------------  571

Query  339  GGAGTCGGGGGTGGGGGGTGGTCAAGGTCAGCCTCTGAGCCAGGAGCGTGGGGGTGGGGGCGGGGTGCTGCCTC  412
                                                                                      
Sbjct  572  --------------------------------------------------------------------------  571

Query  413  TCACCCCACCTCCCCAGGTGAGAGATGCCGGAGGCTCCATGACTATCCACACCTTTGGTGCCTACTTCGGGCTC  486
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  572  ----------------GGTGAGAGATGCCGGAGGCTCCATGACTATCCACACCTTTGGTGCCTACTTCGGGCTC  629

Query  487  GTCCTTTCGCGGGTTCTGTACAGGCCCCAGCTGGAGAAGAGCAAGCACCGCCAGGGCTCCGTCTACCATTCAGA  560
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  630  GTCCTTTCGCGGGTTCTGTACAGGCCCCAGCTGGAGAAGAGCAAGCACCGCCAGGGCTCCGTCTACCATTCAGA  703

Query  561  CCTCTTCGCCATGATTGGGACCATCTTCCTGTGGATCTTCTGGCCTAGCTTCAATGCTGCACTCACATCGCTGG  634
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  704  CCTCTTCGCCATGATTGGGACCATCTTCCTGTGGATCTTCTGGCCTAGCTTCAATGCTGCACTCACAGCGCTGG  777

Query  635  GGGCTGGGCAGCATCGGACGGCCCTCAACACATACTACTCCCTGGCTGCCAGCACCCTTGGCACCTTTGCCTTG  708
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  778  GGGCTGGGCAGCATCGGACGGCCCTCAACACATACTACTCCCTGGCTGCCAGCACCCTTGGCACCTTTGCCTTG  851

Query  709  TCAGCCCTTGTAGGGGAAGATGGGAGGCTTGACATGGTCCACATCCAAAATGCAGCGCTGGCTGGAGGGGTTGT  782
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  852  TCAGCCCTTGTAGGGGAAGATGGGAGGCTTGACATGGTCCACATCCAAAATGCAGCGCTGGCTGGAGGGGTTGT  925

Query  783  GGTGGGGACCTCAAGTGAAATGATGCTGACACCCTTTGGGGCTCTGGCAGCTGGCTTCTTGGCTAGGACTGTCT  856
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  926  GGTGGGGACCTCAAGTGAAATGATGCTGACACCCTTTGGGGCTCTGGCAGCTGGCTTCTTGGCTGGGACTGTCT  999

Query  857  CCACGCTGGGGTACAAGTTCTTCACGCCCATCCTTGAATCAAAATTCAAAGTCCAAGACACATGTGGAGTCCAC  930
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1000  CCACGCTGGGGTACAAGTTCTTCACGCCCATCCTTGAATCAAAATTCAAAGTCCAAGACACATGTGGAGTCCAC  1073

Query  931  AACCTCCATGGGATGCCGGGGGTCCTGGGGGCCCTCCTGGGGGTCCTTGTGGCTGGACTTGCCACCCATGAAGC  1004
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1074  AACCTCCATGGGATGCCGGGGGTCCTGGGGGCCCTCCTGGGGGTCCTTGTGGCTGGACTTGCCACCCATGAAGC  1147

Query 1005  TTACGGAGATGGCCTGGAGAGTGTGTTTCCACTCATAGCCGAGGGCCAGCGCAGTGCCACGTCACAGGCCATGC  1078
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1148  TTACGGAGATGGCCTGGAGAGTGTGTTTCCACTCATAGCCGAGGGCCAGCGCAGTGCCACGTCACAGGCCATGC  1221

Query 1079  ACCAGCTCTTCGGGCTGTTTGTCACACTGATGTTTGCCTCTGTGGGCGGGGGCCTTGG----------------  1136
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
Sbjct 1222  ACCAGCTCTTCGGGCTGTTTGTCACACTGATGTTTGCCTCTGTGGGCGGGGGCCTTGGAGGCATCATATTGGTC  1295

Query 1137  --------------------------------------------------------------------------  1136
                                                                                      
Sbjct 1296  TTATGCCTCCTAGACCCCTGTGCCCTGTGGCACTGGGTGGCACCCTCCTCCATGGTGGGGGGCAGAGAAGCCTC  1369

Query 1137  -----------------------AGGGCTCCTGCTGAAGCTACCCTTTCTGGACTCCCCCCCCAGACTCCCAGC  1187
                                   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1370  ACAGATCCTCCCCTACCACCACCAGGGCTCCTGCTGAAGCTACCCTTTCTGGACT-CCCCCCCAGACTCCCAGC  1442

Query 1188  GCTACGAGGACCAAGTTCACTGGCAGGTGCCTGGCGAGCA----------------------------------  1227
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                  
Sbjct 1443  ACTACGAGGACCAAGTTCACTGGCAGGTGCCTGGCGAGCATGAGGATAAAGCCCAGAGACCTCTGAGGGTGGAG  1516

Query 1228  --------------------------------------------------------------------------  1227
                                                                                      
Sbjct 1517  GAGGCAGACACTCAGGCCTAACCCACTGCCAGCCCCTGAGAGGACACGCTCCTTTTCGAAGATGCTGACTGGCT  1590

Query 1228  --------------------------------------------------------------------------  1227
                                                                                      
Sbjct 1591  GCTACTAGGAAGTTCTTTTTGAGCTCCCATTCCTCCAGCTGCAAGAAGGGAGCCATGAGCCAGAAGGAGGCCCC  1664

Query 1228  --------------------------------------------------------------------------  1227
                                                                                      
Sbjct 1665  TTTCCACAGGCAGCGTCTCCACAGGGAGAGGGGCAACAGGAGGCTGGGAAATGGTGGGGAGTGGGGCCGTAACT  1738

Query 1228  --------------------------------------------------------------------------  1227
                                                                                      
Sbjct 1739  GGGTACAATAGGGGGAACCTCACCAGATGCCCAACCCGACTGCCCTACCAGCCTGCACATGGGTAGAAGAGGCC  1812

Query 1228  --------------------------------------------------------------------------  1227
                                                                                      
Sbjct 1813  AAATTGAGGCACCCAAGTGATCCACTGGCCCCACGTCACACAGTTACAGTGAAGCCCAAGCCAGGCCTGGTTGA  1886

Query 1228  -------------------------  1227
                                     
Sbjct 1887  GGGTGATAAACGCCACTGTCTCTAA  1911