Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14249
• Subject: NM_001134231.2
• Aligned Length: 1671
• Identities: 1379
• Gaps: 288

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCGGGTGCGGGGCTGCGGGCGGCCGCTCGGCGCTGGCTGCTGTGCGGAGGCCACGGCGGGCCGCGAGCCGC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CTCGTCCTCGCCCTCCTGCCCTGGGTGCGGCCCCCCGGGTCCCGGCGCCCACTGCCCCGGCGTCCCGCGCTCCG  148

Query    1  -----------------------------------------------------------------ATGCGGAGA  9
                                                                             |||||||||
Sbjct  149  CGCCCGCCCAGGCACCCACCAGCGGCGCCGACCTCAGCGCGCACCTATGGGCTCGCTACCAGGACATGCGGAGA  222

Query   10  CTGGTGCACGACCTCCTGCCCCCCGAGGTCTGCAGTCTCCTGAACCCAGCAGCCATCTACGCCAACAACGAGAT  83
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGGTGCACGACCTCCTGCCCCCCGAGGTCTGCAGTCTCCTGAACCCAGCAGCCATCTACGCCAACAACGAGAT  296

Query   84  CAGCCTGCGTGACGTTGAGGTCTACGGCTTTGACTACGACTACACCCTGGACCAGTATGCAGACGCACTGCACC  157
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAGCCTGCGTGACGTTGAGGTCTACGGCTTTGACTACGACTACACCCTGGCCCAGTATGCAGACGCACTGCACC  370

Query  158  CCGAGATCTTCAGTACCGCCCGTGACATCCTGATCGAGCACTAC------------------------------  201
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                              
Sbjct  371  CCGAGATCTTCAGTACCGCCCGTGACATCCTGATCGAGCACTACAAGTACCCAGAAGGGATTCGGAAGTATGAC  444

Query  202  ---------------------------------------------AAGAGCCTTCTGATGAAGATTGACGCCTT  230
                                                         |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TACAACCCCAGCTTTGCCATCCGTGGCCTCCACTATGACATTCAGAAGAGCCTTCTGATGAAGATTGACGCCTT  518

Query  231  CCACTACGTGCAGCTGGGGACAGCCTACAGGGGCCTCCAGCCTGTGCCAGACGAGGAGGTGATTGAGCTGTATG  304
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCACTACGTGCAGCTGGGGACAGCCTACAGGGGCCTCCAGCCTGTGCCAGACGAGGAGGTGATTGAGCTGTATG  592

Query  305  GGGGTACCCAGCACATCCCACTATACCAGATGAGTGGCTTCTATGGCAAGGGTCCCTCCATTAAGCAGTTCATG  378
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGGGTACCCAGCACATCCCACTATACCAGATGAGTGGCTTCTATGGCAAGGGTCCCTCCATTAAGCAGTTCATG  666

Query  379  GACATCTTCTCGCTACCGGAGATGGCTCTGCTGTCCTGTGTGGTGGACTACTTTCTGGGCCACAGCCTGGAGTT  452
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GACATCTTCTCGCTACCGGAGATGGCTCTGCTGTCCTGTGTGGTGGACTACTTTCTGGGCCACAGCCTGGAGTT  740

Query  453  TGACCAAGCACATCTCTACAAGGACGTGACGGACGCCATCCGAGACGTGCATGTGAAGGGCCTCATGTACCAGT  526
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGACCAAGCACATCTCTACAAGGACGTGACGGACGCCATCCGAGACGTGCATGTGAAGGGCCTCATGTACCAGT  814

Query  527  GGATCGAGCAGGACATGGAGAAGTACATCCTGAGAGGGGATGAGACGTTTGCTGTCCTGAGCCGCCTGGTGGCC  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGATCGAGCAGGACATGGAGAAGTACATCCTGAGAGGGGATGAGACGTTTGCTGTCCTGAGCCGCCTGGTGGCC  888

Query  601  CATGGGAAGCAGCTGTTCCTCATCACCAACAGTCCTTTCAGCTTCGTAGACAAGGGGATGCGGCACATGGTGGG  674
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CATGGGAAACAGCTGTTCCTCATCACCAACAGTCCTTTCAGCTTCGTAGACAAGGGGATGCGGCACATGGTGGG  962

Query  675  TCCCGATTGGCGCCAGCTCTTCGATGTGGTCATTGTCCAGGCAGACAAGCCCAGCTTCTTCACTGACCGGCGCA  748
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCCCGATTGGCGCCAGCTCTTCGATGTGGTCATTGTCCAGGCAGACAAGCCCAGCTTCTTCACTGACCGGCGCA  1036

Query  749  AGCCTTTCAGAAAACTCGATGAGAAGGGCTCACTTCAGTGGGACCGGATCACCCGCTTGGAAAAGGGCAAGATC  822
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGCCTTTCAGAAAACTCGATGAGAAGGGCTCACTTCAGTGGGACCGGATCACCCGCTTGGAAAAGGGCAAGATC  1110

Query  823  TATCGGCAGGGAAACCTGTTTGACTTCTTGCGCTTGACGGAATGGCGTGGCCCCCGCGTGCTCTACTTCGGGGA  896
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TATCGGCAGGGAAACCTGTTTGACTTCTTACGCTTGACGGAATGGCGTGGCCCCCGCGTGCTCTACTTCGGGGA  1184

Query  897  CCACCTCTATAGTGATCTGGCGGATCTCATGCTGCGGCACGGCTGGCGCACAGGCGCCATCATCCCCGAGCTGG  970
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCACCTCTATAGTGATCTGGCGGATCTCATGCTGCGGCACGGCTGGCGCACAGGCGCCATCATCCCCGAGCTGG  1258

Query  971  AGCGTGAGATCCGCATCATCAACACGGAGCAGTACATGCACTCGCTGACGTGGCAACAGGCGCTCACGGGGCTG  1044
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGCGTGAGATCCGCATCATCAACACGGAGCAGTACATGCACTCGCTGACGTGGCAGCAGGCGCTCACGGGGCTG  1332

Query 1045  CTGGAGCGCATGCAGACCTATCAGGACGCGGAGTCGAGGCAGGTGCTGGCTGCCTGGATGAAAGAGCGGCAGGA  1118
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTGGAGCGCATGCAGACCTATCAGGACGCGGAGTCGAGGCAGGTGCTGGCTGCCTGGATGAAAGAGCGGCAGGA  1406

Query 1119  GCTGAGGTGCATCACCAAGGCCCTGTTCAATGCGCAGTTCGGCAGCATCTTCCGCACCTTCCACAACCCCACCT  1192
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCTGAGGTGCATCACCAAGGCCCTGTTCAATGCGCAGTTCGGCAGCATCTTCCGCACCTTCCACAACCCCACCT  1480

Query 1193  ACTTCTCAAGGCGCCTCGTGCGCTTCTCTGACCTCTACATGGCCTCCCTCAGCTGCCTGCTCAACTACCGCGTG  1266
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACTTCTCAAGGCGCCTCGTGCGCTTCTCTGACCTCTACATGGCCTCCCTCAGCTGCCTGCTCAACTACCGCGTG  1554

Query 1267  GACTTCACCTTCTACCCACGCCGTACGCCGCTGCAGCACGAGGCACCCCTCTGGATGGACCAGCTCTGCACCGG  1340
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GACTTCACCTTCTACCCACGCCGTACGCCGCTGCAGCACGAGGCACCCCTCTGGATGGACCAGCTCTGCACCGG  1628

Query 1341  CTGCATGAAGACCCCCTTCCTTGGTGACATGGCCCACATCCGC  1383
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CTGCATGAAGACCCCCTTCCTTGGTGACATGGCCCACATCCGC  1671