Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14249
- Subject:
- NM_022908.3
- Aligned Length:
- 1561
- Identities:
- 1375
- Gaps:
- 179
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCGAGTGGAGAGCGGTTCTGCGCAGGAAAGAGGAATTTTGTTGGAAAGCCTGTCGACGTTGCTAGAAAAGAC 74
Query 1 --------------------ATGC----GGAGACTGG----TGCAC-GACCTCCTGCCCCCCGAGGTCTGCAGT 45
.||| |||.||.|| || || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CACAGCATCTCACGAGGGGCGTGCGCCGGGAAACCGGGAGTTG-ACGGACCTCCTGCCCCCCGAGGTCTGCAGT 147
Query 46 CTCCTGAACCCAGCAGCCATCTACGCCAACAACGAGATCAGCCTGCGTGACGTTGAGGTCTACGGCTTTGACTA 119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 148 CTCCTGAACCCAGCAGCCATCTACGCCAACAACGAGATCAGCCTGCGTGACGTTGAGGTCTACGGCTTTGACTA 221
Query 120 CGACTACACCCTGGACCAGTATGCAGACGCACTGCACCCCGAGATCTTCAGTACCGCCCGTGACATCCTGATCG 193
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 222 CGACTACACCCTGGCCCAGTATGCAGACGCACTGCACCCCGAGATCTTCAGTACCGCCCGTGACATCCTGATCG 295
Query 194 AGCACTAC------------------------------------------------------------------ 201
||||||||
Sbjct 296 AGCACTACAAGTACCCAGAAGGGATTCGGAAGTATGACTACAACCCCAGCTTTGCCATCCGTGGCCTCCACTAT 369
Query 202 ---------AAGAGCCTTCTGATGAAGATTGACGCCTTCCACTACGTGCAGCTGGGGACAGCCTACAGGGGCCT 266
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370 GACATTCAGAAGAGCCTTCTGATGAAGATTGACGCCTTCCACTACGTGCAGCTGGGGACAGCCTACAGGGGCCT 443
Query 267 CCAGCCTGTGCCAGACGAGGAGGTGATTGAGCTGTATGGGGGTACCCAGCACATCCCACTATACCAGATGAGTG 340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 444 CCAGCCTGTGCCAGACGAGGAGGTGATTGAGCTGTATGGGGGTACCCAGCACATCCCACTATACCAGATGAGTG 517
Query 341 GCTTCTATGGCAAGGGTCCCTCCATTAAGCAGTTCATGGACATCTTCTCGCTACCGGAGATGGCTCTGCTGTCC 414
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 518 GCTTCTATGGCAAGGGTCCCTCCATTAAGCAGTTCATGGACATCTTCTCGCTACCGGAGATGGCTCTGCTGTCC 591
Query 415 TGTGTGGTGGACTACTTTCTGGGCCACAGCCTGGAGTTTGACCAAGCACATCTCTACAAGGACGTGACGGACGC 488
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592 TGTGTGGTGGACTACTTTCTGGGCCACAGCCTGGAGTTTGACCAAGCACATCTCTACAAGGACGTGACGGACGC 665
Query 489 CATCCGAGACGTGCATGTGAAGGGCCTCATGTACCAGTGGATCGAGCAGGACATGGAGAAGTACATCCTGAGAG 562
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 666 CATCCGAGACGTGCATGTGAAGGGCCTCATGTACCAGTGGATCGAGCAGGACATGGAGAAGTACATCCTGAGAG 739
Query 563 GGGATGAGACGTTTGCTGTCCTGAGCCGCCTGGTGGCCCATGGGAAGCAGCTGTTCCTCATCACCAACAGTCCT 636
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 740 GGGATGAGACGTTTGCTGTCCTGAGCCGCCTGGTGGCCCATGGGAAACAGCTGTTCCTCATCACCAACAGTCCT 813
Query 637 TTCAGCTTCGTAGACAAGGGGATGCGGCACATGGTGGGTCCCGATTGGCGCCAGCTCTTCGATGTGGTCATTGT 710
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 TTCAGCTTCGTAGACAAGGGGATGCGGCACATGGTGGGTCCCGATTGGCGCCAGCTCTTCGATGTGGTCATTGT 887
Query 711 CCAGGCAGACAAGCCCAGCTTCTTCACTGACCGGCGCAAGCCTTTCAGAAAACTCGATGAGAAGGGCTCACTTC 784
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 CCAGGCAGACAAGCCCAGCTTCTTCACTGACCGGCGCAAGCCTTTCAGAAAACTCGATGAGAAGGGCTCACTTC 961
Query 785 AGTGGGACCGGATCACCCGCTTGGAAAAGGGCAAGATCTATCGGCAGGGAAACCTGTTTGACTTCTTGCGCTTG 858
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 962 AGTGGGACCGGATCACCCGCTTGGAAAAGGGCAAGATCTATCGGCAGGGAAACCTGTTTGACTTCTTACGCTTG 1035
Query 859 ACGGAATGGCGTGGCCCCCGCGTGCTCTACTTCGGGGACCACCTCTATAGTGATCTGGCGGATCTCATGCTGCG 932
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 ACGGAATGGCGTGGCCCCCGCGTGCTCTACTTCGGGGACCACCTCTATAGTGATCTGGCGGATCTCATGCTGCG 1109
Query 933 GCACGGCTGGCGCACAGGCGCCATCATCCCCGAGCTGGAGCGTGAGATCCGCATCATCAACACGGAGCAGTACA 1006
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 GCACGGCTGGCGCACAGGCGCCATCATCCCCGAGCTGGAGCGTGAGATCCGCATCATCAACACGGAGCAGTACA 1183
Query 1007 TGCACTCGCTGACGTGGCAACAGGCGCTCACGGGGCTGCTGGAGCGCATGCAGACCTATCAGGACGCGGAGTCG 1080
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184 TGCACTCGCTGACGTGGCAGCAGGCGCTCACGGGGCTGCTGGAGCGCATGCAGACCTATCAGGACGCGGAGTCG 1257
Query 1081 AGGCAGGTGCTGGCTGCCTGGATGAAAGAGCGGCAGGAGCTGAGGTGCATCACCAAGGCCCTGTTCAATGCGCA 1154
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 AGGCAGGTGCTGGCTGCCTGGATGAAAGAGCGGCAGGAGCTGAGGTGCATCACCAAGGCCCTGTTCAATGCGCA 1331
Query 1155 GTTCGGCAGCATCTTCCGCACCTTCCACAACCCCACCTACTTCTCAAGGCGCCTCGTGCGCTTCTCTGACCTCT 1228
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332 GTTCGGCAGCATCTTCCGCACCTTCCACAACCCCACCTACTTCTCAAGGCGCCTCGTGCGCTTCTCTGACCTCT 1405
Query 1229 ACATGGCCTCCCTCAGCTGCCTGCTCAACTACCGCGTGGACTTCACCTTCTACCCACGCCGTACGCCGCTGCAG 1302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406 ACATGGCCTCCCTCAGCTGCCTGCTCAACTACCGCGTGGACTTCACCTTCTACCCACGCCGTACGCCGCTGCAG 1479
Query 1303 CACGAGGCACCCCTCTGGATGGACCAGCTCTGCACCGGCTGCATGAAGACCCCCTTCCTTGGTGACATGGCCCA 1376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480 CACGAGGCACCCCTCTGGATGGACCAGCTCTGCACCGGCTGCATGAAGACCCCCTTCCTTGGTGACATGGCCCA 1553
Query 1377 CATCCGC 1383
|||||||
Sbjct 1554 CATCCGC 1560