Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14249
- Subject:
- XM_006713303.3
- Aligned Length:
- 1671
- Identities:
- 1259
- Gaps:
- 408
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCGGGTGCGGGGCTGCGGGCGGCCGCTCGGCGCTGGCTGCTGTGCGGAGGCCACGGCGGGCCGCGAGCCGC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CTCGTCCTCGCCCTCCTGCCCTGGGTGCGGCCCCCCGGGTCCCGGCGCCCACTGCCCCGGCGTCCCGCGCTCCG 148
Query 1 -----------------------------------------------------------------ATGCGGAGA 9
|||||||||
Sbjct 149 CGCCCGCCCAGGCACCCACCAGCGGCGCCGACCTCAGCGCGCACCTATGGGCTCGCTACCAGGACATGCGGAGA 222
Query 10 CTGGTGCACGACCTCCTGCCCCCCGAGGTCTGCAGTCTCCTGAACCCAGCAGCCATCTACGCCAACAACGAGAT 83
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTGGTGCACGACCTCCTGCCCCCCGAGGTCTGCAGTCTCCTGAACCCAGCAGCCATCTACGCCAACAACGAGAT 296
Query 84 CAGCCTGCGTGACGTTGAGGTCTACGGCTTTGACTACGACTACACCCTGGACCAGTATGCAGACGCACTGCACC 157
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CAGCCTGCGTGACGTTGAGGTCTACGGCTTTGACTACGACTACACCCTGGCCCAGTATGCAGACGCACTGCACC 370
Query 158 CCGAGATCTTCAGTACCGCCCGTGACATCCTGATCGAGCACTAC------------------------------ 201
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCGAGATCTTCAGTACCGCCCGTGACATCCTGATCGAGCACTACAAGTACCCAGAAGGGATTCGGAAGTATGAC 444
Query 202 ---------------------------------------------AAGAGCCTTCTGATGAAGATTGACGCCTT 230
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TACAACCCCAGCTTTGCCATCCGTGGCCTCCACTATGACATTCAGAAGAGCCTTCTGATGAAGATTGACGCCTT 518
Query 231 CCACTACGTGCAGCTGGGGACAGCCTACAGGGGCCTCCAGCCTGTGCCAGACGAGGAGGTGATTGAGCTGTATG 304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCACTACGTGCAGCTGGGGACAGCCTACAGGGGCCTCCAGCCTGTGCCAGACGAGGAGGTGATTGAGCTGTATG 592
Query 305 GGGGTACCCAGCACATCCCACTATACCAGATGAGTGGCTTCTATGGCAAGGGTCCCTCCATTAAGCAGTTCATG 378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GGGGTACCCAGCACATCCCACTATACCAGATGAGTGGCTTCTATGGCAAGGGTCCCTCCATTAAGCAGTTCATG 666
Query 379 GACATCTTCTCGCTACCGGAGATGGCTCTGCTGTCCTGTGTGGTGGACTACTTTCTGGGCCACAGCCTGGAGTT 452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GACATCTTCTCGCTACCGGAGATGGCTCTGCTGTCCTGTGTGGTGGACTACTTTCTGGGCCACAGCCTGGAGTT 740
Query 453 TGACCAAGCACATCTCTACAAGGACGTGACGGACGCCATCCGAGACGTGCATGTGAAGGGCCTCATGTACCAGT 526
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGACCAAGCACATCTCTACAAGGACGTGACGGACGCCATCCGAGACGTGCATGTGAAGGGCCTCATGTACCAGT 814
Query 527 GGATCGAGCAGGACATGGAGAAGTACATCCTGAGAGGGGATGAGACGTTTGCTGTCCTGAGCCGCCTGGTGGCC 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGATCGAGCAGGACATGGAGAAGTACATCCTGAGAGGGGATGAGACGTTTGCTGTCCTGAGCCGCCTGGTGGCC 888
Query 601 CATGGGAAGCAGCTGTTCCTCATCACCAACAGTCCTTTCAGCTTCGTAGACAAGGGGATGCGGCACATGGTGGG 674
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CATGGGAAACAGCTGTTCCTCATCACCAACAGTCCTTTCAGCTTCGTAGACAAGGGGATGCGGCACATGGTGGG 962
Query 675 TCCCGATTGGCGCCAGCTCTTCGATGTGGTCATTGTCCAGGCAGACAAGCCCAGCTTCTTCACTGACCGGCGCA 748
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TCCCGATTGGCGCCAGCTCTTCGATGTGGTCATTGTCCAGGCAGACAAGCCCAGCTTCTTCACTGACCGGCGCA 1036
Query 749 AGCCTTTCAGAAAACTCGATGAGAAGGGCTCACTTCAGTGGGACCGGATCACCCGCTTGGAAAAGGGCAAGATC 822
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGCCTTTCAGAAAACTCGATGAGAAGGGCTCACTTCAGTGGGACCGGATCACCCGCTTGGAAAAGGGCAAGATC 1110
Query 823 TATCGGCAGGGAAACCTGTTTGACTTCTTGCGCTTGACGGAATGGCGTGGCCCCCGCGTGCTCTACTTCGGGGA 896
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TATCGGCAGGGAAACCTGTTTGACTTCTTACGCTTGACGGAATGGCGTGGCCCCCGCGTGCTCTACTTCGGGGA 1184
Query 897 CCACCTCTATAGTGATCTGGCGGATCTCATGCTGCGGCACGGCTGGCGCACAGGCGCCATCATCCCCGAGCTGG 970
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCACCTCTATAGTGATCTGGCGGATCTCATGCTGCGGCACGGCTGGCGCACAGGCGCCATCATCCCCGAGCTGG 1258
Query 971 AGCGTGAGATCCGCATCATCAACACGGAGCAGTACATGCACTCGCTGACGTGGCAACAGGCGCTCACGGGGCTG 1044
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGCGTGAGATCCGCATCATCAACACGGAGCAGTACATGCACTCGCTGACGTGGCAGCAGGCGCTCACGGGGCTG 1332
Query 1045 CTGGAGCGCATGCAGACCTATCAGGACGCGGAGTCGAGGCAGGTGCTGGCTGCCTGGATGAAAGAGCGGCAGGA 1118
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CTGGAGCGCATGCAGACCTATCAGGACGCGGAGTCGAGGCAGGTGCTGGCTGCCTGGATGAAAGAGCGGCAGGA 1406
Query 1119 GCTGAGGTGCATCACCAAGGCCCTGTTCAATGCGCAGTTCGGCAGCATCTTCCGCACCTTCCACAACCCCACCT 1192
||||
Sbjct 1407 GCTG---------------------------------------------------------------------- 1410
Query 1193 ACTTCTCAAGGCGCCTCGTGCGCTTCTCTGACCTCTACATGGCCTCCCTCAGCTGCCTGCTCAACTACCGCGTG 1266
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1411 --------------------------------------------------AGCTGCCTGCTCAACTACCGCGTG 1434
Query 1267 GACTTCACCTTCTACCCACGCCGTACGCCGCTGCAGCACGAGGCACCCCTCTGGATGGACCAGCTCTGCACCGG 1340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1435 GACTTCACCTTCTACCCACGCCGTACGCCGCTGCAGCACGAGGCACCCCTCTGGATGGACCAGCTCTGCACCGG 1508
Query 1341 CTGCATGAAGACCCCCTTCCTTGGTGACATGGCCCACATCCGC 1383
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1509 CTGCATGAAGACCCCCTTCCTTGGTGACATGGCCCACATCCGC 1551