Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14249
• Subject: XM_024453719.1
• Aligned Length: 1464
• Identities: 1167
• Gaps: 294

Alignment

Query    1  ATGCGGAGACTGGTGCACGACCTCCTGCCCCCCGAGGTCTGCAGTCTCCTGAACCCAGCAGCCATCTACGCCAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CAACGAGATCAGCCTGCGTGACGTTGAGGTCTACGGCTTTGACTACGACTACACCCTGGACCAGTATGCAGACG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CACTGCACCCCGAGATCTTCAGTACCGCCCGTGACATCCTGATCGAGCACTACAAGAGCCTTCTGATGAAGATT  222
                                                                             |||||||||
Sbjct    1  -----------------------------------------------------------------ATGAAGATT  9

Query  223  GACGCCTTCCACTACGTGCAGCTGGGGACAGCCTACAGGGGCCTCCAGCCTGTGCCAGACGAGGAGGTGATTGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   10  GACGCCTTCCACTACGTGCAGCTGGGGACAGCCTACAGGGGCCTCCAGCCTGTGCCAGACGAGGAGGTGATTGA  83

Query  297  GCTGTATGGGGGTACCCAGCACATCCCACTATACCAGATGAGTGGCTTCTATGGCAAGGGTCCCTCCATTAAGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   84  GCTGTATGGGGGTACCCAGCACATCCCACTATACCAGATGAGTGGCTTCTATGGCAAGGGTCCCTCCATTAAGC  157

Query  371  AGTTCATGGACATCTTCTCGCTACCGGAGATGGCTCTGCTGTCCTGTGTGGTGGACTACTTTCTGGGCCACAGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  158  AGTTCATGGACATCTTCTCGCTACCGGAGATGGCTCTGCTGTCCTGTGTGGTGGACTACTTTCTGGGCCACAGC  231

Query  445  CTGGAGTTTGACCAAGCACATCTCTACAAGGACGTGACGGACGCCATCCGAGACGTGCATGTGAAGGGCCTCAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  232  CTGGAGTTTGACCAAGCACATCTCTACAAGGACGTGACGGACGCCATCCGAGACGTGCATGTGAAGGGCCTCAT  305

Query  519  GTACCAGTGGATCGAGCAGGACATG-------------------------------------------------  543
            |||||||||||||||||||||||||                                                 
Sbjct  306  GTACCAGTGGATCGAGCAGGACATGGGTAAGTGTGGACAGAAGCCCTGCCGTGGCCGGCCTGAGCAGGTGGCAG  379

Query  544  --------------------------------GAGAAGTACATCCTGAGAGGGGATGAGACGTTTGCTGTCCTG  585
                                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  380  GACTGACCCTCACAGACTCATCTGCCCCATTAGAGAAGTACATCCTGAGAGGGGATGAGACGTTTGCTGTCCTG  453

Query  586  AGCCGCCTGGTGGCCCATGGGAAGCAGCTGTTCCTCATCACCAACAGTCCTTTCAGCTTCGTAGACAAGGGGAT  659
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  454  AGCCGCCTGGTGGCCCATGGGAAACAGCTGTTCCTCATCACCAACAGTCCTTTCAGCTTCGTAGACAAGGGGAT  527

Query  660  GCGGCACATGGTGGGTCCCGATTGGCGCCAGCTCTTCGATGTGGTCATTGTCCAGGCAGACAAGCCCAGCTTCT  733
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  528  GCGGCACATGGTGGGTCCCGATTGGCGCCAGCTCTTCGATGTGGTCATTGTCCAGGCAGACAAGCCCAGCTTCT  601

Query  734  TCACTGACCGGCGCAAGCCTTTCAGAAAACTCGATGAGAAGGGCTCACTTCAGTGGGACCGGATCACCCGCTTG  807
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  602  TCACTGACCGGCGCAAGCCTTTCAGAAAACTCGATGAGAAGGGCTCACTTCAGTGGGACCGGATCACCCGCTTG  675

Query  808  GAAAAGGGCAAGATCTATCGGCAGGGAAACCTGTTTGACTTCTTGCGCTTGACGGAATGGCGTGGCCCCCGCGT  881
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  676  GAAAAGGGCAAGATCTATCGGCAGGGAAACCTGTTTGACTTCTTACGCTTGACGGAATGGCGTGGCCCCCGCGT  749

Query  882  GCTCTACTTCGGGGACCACCTCTATAGTGATCTGGCGGATCTCATGCTGCGGCACGGCTGGCGCACAGGCGCCA  955
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  750  GCTCTACTTCGGGGACCACCTCTATAGTGATCTGGCGGATCTCATGCTGCGGCACGGCTGGCGCACAGGCGCCA  823

Query  956  TCATCCCCGAGCTGGAGCGTGAGATCCGCATCATCAACACGGAGCAGTACATGCACTCGCTGACGTGGCAACAG  1029
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  824  TCATCCCCGAGCTGGAGCGTGAGATCCGCATCATCAACACGGAGCAGTACATGCACTCGCTGACGTGGCAGCAG  897

Query 1030  GCGCTCACGGGGCTGCTGGAGCGCATGCAGACCTATCAGGACGCGGAGTCGAGGCAGGTGCTGGCTGCCTGGAT  1103
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  898  GCGCTCACGGGGCTGCTGGAGCGCATGCAGACCTATCAGGACGCGGAGTCGAGGCAGGTGCTGGCTGCCTGGAT  971

Query 1104  GAAAGAGCGGCAGGAGCTGAGGTGCATCACCAAGGCCCTGTTCAATGCGCAGTTCGGCAGCATCTTCCGCACCT  1177
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  972  GAAAGAGCGGCAGGAGCTGAGGTGCATCACCAAGGCCCTGTTCAATGCGCAGTTCGGCAGCATCTTCCGCACCT  1045

Query 1178  TCCACAACCCCACCTACTTCTCAAGGCGCCTCGTGCGCTTCTCTGACCTCTACATGGCCTCCCTCAGCTGCCTG  1251
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1046  TCCACAACCCCACCTACTTCTCAAGGCGCCTCGTGCGCTTCTCTGACCTCTACATGGCCTCCCTCAGCTGCCTG  1119

Query 1252  CTCAACTACCGCGTGGACTTCACCTTCTACCCACGCCGTACGCCGCTGCAGCACGAGGCACCCCTCTGGATGGA  1325
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1120  CTCAACTACCGCGTGGACTTCACCTTCTACCCACGCCGTACGCCGCTGCAGCACGAGGCACCCCTCTGGATGGA  1193

Query 1326  CCAGCTCTGCACCGGCTGCATGAAGACCCCCTTCCTTGGTGACATGGCCCACATCCGC  1383
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1194  CCAGCTCTGCACCGGCTGCATGAAGACCCCCTTCCTTGGTGACATGGCCCACATCCGC  1251