Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_14270
Subject:
NM_001282684.1
Aligned Length:
963
Identities:
937
Gaps:
21

Alignment

Query   1  ---------------------ATGAGGATGGAGGCCGGTGAGGCAGCGCCGCCGGCGGGGGCGGGCGGCCGCGC  53
                                |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGCAGACGCCGCGGCCGGCGATGAGGATGGAGGCCGGGGAGGCAGCGCCGCCGGCGGGGGCGGGCGGCCGCGC  74

Query  54  CGCAGGCGGCTGGGGCAAGTGGGTGCGGCTCAACGTGGGGGGCACGGTGTTCCTGACCACCCGGCAGACGCTGT  127
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  CGCAGGCGGCTGGGGCAAGTGGGTGCGGCTCAACGTGGGGGGCACGGTGTTCCTGACCACCCGGCAGACGCTGT  148

Query 128  GCGGCGAGCAGAAGTCCTTCCTCAGCCGCCTGTGCCAGGGGGAAGAGCTGCAGTCGGACCGGGATGAGACCGGG  201
           ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  GCCGCGAGCAGAAGTCCTTCCTCAGCCGCCTGTGCCAGGGGGAAGAGCTGCAGTCGGACCGGGATGAGACCGGG  222

Query 202  GCCTACCTCATTGACCGTGACCCCACCTACTTCGGGCCCATCCTGAACTTCCTCCGGCATGGCAAGCTGGTGCT  275
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  GCCTACCTCATTGACCGTGACCCCACCTACTTCGGGCCCATCCTGAACTTCCTCCGGCATGGCAAGCTGGTGCT  296

Query 276  GGACAAGGACATGGCTGAGGAGGGGGTCCTGGAGGAAGCCGAGTTCTACAACATCGGCCCGCTGATCCGCATCA  349
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  GGACAAGGACATGGCTGAGGAGGGGGTCCTGGAGGAAGCCGAGTTCTACAACATCGGCCCGCTGATCCGCATCA  370

Query 350  TCAAAGACCGGATGGAAGAGAAGGACTACACGGTCACCCAGGTCCCACCCAAGCATGTGTACCGCGTGCTGCAG  423
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 371  TCAAAGACCGGATGGAAGAGAAGGACTACACGGTCACCCAGGTCCCACCCAAGCACGTGTACCGCGTGCTGCAG  444

Query 424  TGCCAGGAGGAGGAGCTCACGCAAATGGTCTCAACCATGTCTGATGGCTGGCGCTTCGAGCAGCTGGTGAACAT  497
           ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  TGCCAGGAGGAGGAGCTCACGCAAATGGTCTCCACCATGTCTGATGGCTGGCGCTTCGAGCAGCTGGTGAACAT  518

Query 498  CGGCTCGTCCTACAACTACGGCAGCGAGGACCAGGCAGAGTTCCTGTGTGTGGTGTCCAAGGAGCTCCACAGCA  571
           ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  CGGCTCCTCCTACAACTACGGCAGCGAGGACCAGGCAGAGTTCCTGTGTGTGGTGTCCAAGGAGCTCCACAGCA  592

Query 572  CCCCAAACGGGCTGAGCTCAGAGTCCAGCCGCAAAACCAAGAGCACGGAGGAGCAGCTGGAGGAGCAGCAGCAG  645
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  CCCCAAACGGGCTGAGCTCAGAGTCCAGCCGCAAAACCAAGAGCACGGAGGAGCAGCTGGAGGAGCAGCAGCAG  666

Query 646  CAGGAGGAGGAGGTGGAGGAGGTGGAGGTGGAACAGGTGCAGGTGGAGGCAGATGCACAGGAGAAAGCCCAGTC  719
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  CAGGAGGAGGAGGTGGAGGAGGTGGAGGTGGAACAGGTGCAGGTGGAGGCAGATGCACAGGAGAAAGCCCAGTC  740

Query 720  ATCTCAGGATCCCGCTAACCTTTTCTCCCTCCCACCACTGCCTCCTCCTCCGCTTCCCGCTGGAGGTTCCCGTC  793
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  ATCTCAGGATCCCGCTAACCTTTTCTCCCTCCCACCACTGCCTCCTCCTCCGCTTCCCGCTGGAGGTTCCCGTC  814

Query 794  CGCACCCTCTCAGACCTGAGGCTGAGCTTGCAGTGAGGGCTTCTCCTCGGCCCCTCGCCCGCCCCCAGAGCTGC  867
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815  CGCACCCTCTCAGACCTGAGGCTGAGCTTGCAGTGAGGGCTTCTCCTCGGCCCCTCGCCCGCCCCCAGAGCTGC  888

Query 868  CATCCCTGCTGTTACAAGCCAGAGGCACCCGGATGTGAGGCCCCAGATCACCTCCAGGGACTTGGGGTTCCCAT  941
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889  CATCCCTGCTGTTACAAGCCAGAGGCACCCGGATGTGAGGCCCCAGATCACCTCCAGGGACTTGGGGTTCCCAT  962

Query 942  C  942
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Sbjct 963  C  963