Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_14270
Subject:
XM_005261742.3
Aligned Length:
1059
Identities:
914
Gaps:
120

Alignment

Query    1  ---------------------ATGAGGATGGAGGCCGGTGAGGCAGCGCCGCCGGCGGGGGCGGGCGGCCGCGC  53
                                 |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCAGACGCCGCGGCCGGCGATGAGGATGGAGGCCGGGGAGGCAGCGCCGCCGGCGGGGGCGGGCGGCCGCGC  74

Query   54  CGCAGGCGGCTGGGGCAAGTGGGTGCGGCTCAACGTGGGGGGCACGGTGTTCCTGACCACCCGGCAGACGCTGT  127
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGCAGGCGGCTGGGGCAAGTGGGTGCGGCTCAACGTGGGGGGCACGGTGTTCCTGACCACCCGGCAGACGCTGT  148

Query  128  GCGGCGAGCAGAAGTCCTTCCTCAGCCGCCTGTGCCAGGGGGAAGAGCTGCAGTCGGACCGGGATGAGACCGGG  201
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCCGCGAGCAGAAGTCCTTCCTCAGCCGCCTGTGCCAGGGGGAAGAGCTGCAGTCGGACCGGGATGAGACCGGG  222

Query  202  GCCTACCTCATTGACCGTGACCCCACCTACTTCGGGCCCATCCTGAACTTCCTCCGGCATGGCAAGCTGGTGCT  275
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCTACCTCATTGACCGTGACCCCACCTACTTCGGGCCCATCCTGAACTTCCTCCGGCATGGCAAGCTGGTGCT  296

Query  276  GGACAAGGACATGGCTGAGGAGGGGGTCCTGGAGGAAGCCGAGTTCTACAACATCGGCCCGCTGATCCGCATCA  349
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGACAAGGACATGGCTGAGGAGGGGGTCCTGGAGGAAGCCGAGTTCTACAACATCGGCCCGCTGATCCGCATCA  370

Query  350  TCAAAGACCGGATGGAAGAGAAGGACTACACGGTCACCCAGGTCCCACCCAAGCATGTGTACCGCGTGCTGCAG  423
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCAAAGACCGGATGGAAGAGAAGGACTACACGGTCACCCAGGTCCCACCCAAGCACGTGTACCGCGTGCTGCAG  444

Query  424  TGCCAGGAGGAGGAGCTCACGCAAATGGTCTCAACCATGTCTGATGGCTGGCGCTTCGAGCAGCTGGTGAACAT  497
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGCCAGGAGGAGGAGCTCACGCAAATGGTCTCCACCATGTCTGATGGCTGGCGCTTCGAGCAGCTGGTGAACAT  518

Query  498  CGGCTCGTCCTACAACTACGGCAGCGAGGACCAGGCAGAGTTCCTGTGTGTGGTGTCCAAGGAGCTCCACAGCA  571
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGGCTCCTCCTACAACTACGGCAGCGAGGACCAGGCAGAGTTCCTGTGTGTGGTGTCCAAGGAGCTCCACAGCA  592

Query  572  CCCCAAACGGGCTGAGCTCAGAGTCCAGCCGCAAAACCAAGAGCACGGAGGAGCAGCTGGAGGAGCAGCAGCAG  645
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCCCAAACGGGCTGAGCTCAGAGTCCAGCCGCAAAACCAAGAGCACGGAGGAGCAGCTGGAGGAGCAGCAGCAG  666

Query  646  CAGGAGGAGGAGGTGGAGGAGGTGGAGGTGGAACAGGTGCAGGTGGAGGCAGATGCACAGGAGAAAGCCCAGTC  719
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGGAGGAGGAGGTGGAGGAGGTGGAGGTGGAACAGGTGCAGGTGGAGGCAGATGCACAGGAGAAAGCCCAGTC  740

Query  720  ATCTCAGGATCCCGCTAACCTTTTCTCCCTCCCACCACTGCCTCCTCCTCCGCTTCCCGCTGGAGGTTCCCGTC  793
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATCTCAGGATCCCGCTAACCTTTTCTCCCTCCCACCACTGCCTCCTCCTCCGCTTCCCGCTGGAGGTTCCCGTC  814

Query  794  CGCACCCTCTCAGACCTGAGGCTGAGCTTGCAGTGAGGGCTTCTCCTCGGCCCCTCGCCCGCCCCCAGAGCTGC  867
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CGCACCCTCTCAGACCTGAGGCTGAGCTTGCAGTGAGGGCTTCTCCTCGGCCCCTCGCCCGCCCCCAGAGCTGC  888

Query  868  CATCCCTGCTGTTACA---------------------------AGCCA-GAGG-----CA----------CCCG  898
            ||||||||.| ||..|                           |||.| ||||     ||          |..|
Sbjct  889  CATCCCTGGT-TTGTAGCTTGGCGGTGCTGGAGGGAGGGGTGGAGCGAGGAGGGTGCTCATCTCTTGATCCTTG  961

Query  899  GATGTGAGGCCC----------CAGATCACCTCCAGGGACTTGGGGTTCCCATC--------------------  942
            ||..||||  ||          |.|||.|.|||||...||....|.|||.||||                    
Sbjct  962  GACTTGAG--CCGAGCTTTCGGCTGATTATCTCCACCCACCAAAGTTTCTCATCCGACCTTGGCCTTGGGGGTG  1033

Query  943  -----------------------  942
                                   
Sbjct 1034  AGGCTCTGAGAGGAGAAGAAAGT  1056