Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14299
- Subject:
- XM_017008685.2
- Aligned Length:
- 1852
- Identities:
- 1539
- Gaps:
- 299
Alignment
Query 1 ATGAAAGCTGATCTCCTGAGGGCCAGGAACATGAAGAGGTACATCAACCAACTGACTGTGGCAAAGAAGCAGTG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TGAGAAGAGAATCCGAATCCTGGGAGGCCCTGCCTATGAC-----------CAGCAAGAG-----GATGGGGCC 132
||.|.||.|| |||.||.| | |||||..|| |||
Sbjct 1 ----------------ATGCAGGAAG---CTGTCTTT--CCTTTTGTTCCTCAGCAGAAGCTACAGAT------ 47
Query 133 CTGGATGAGGGGGAAGGGCCTCAA---AGCCAGAAGATTCTTCAGTTTGAAGATATCTTGGCCAATACGTTCTA 203
.||||| .|||| ..||| .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 48 -----------AGAAGG--TTCAATATCTCCA-CAGATTCTTCAGTTTGAAGATATCTTGGCCAATACGTTCTA 107
Query 204 CCGAGAGCACTTTGGAATGTACATGGAAAGGATGGACAAAAGAGCTCTGATTAGTTTTTGGGAATCTGTGGAAC 277
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 108 CCGAGAGCACTTTGGAATGTACATGGAAAGGATGGACAAAAGAGCTCTGATTAGTTTTTGGGAATCTGTGGAAC 181
Query 278 ATTTAAAGAATGCTAACAAGAATGAAATTCCACAATTAGTTGGTGAAATTTATCAGAATTTCTTTGTGGAGAGC 351
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 182 ATTTAAAGAATGCTAACAAGAATGAAATTCCACAATTAGTTGGTGAAATTTATCAGAATTTCTTTGTGGAGAGC 255
Query 352 AAAGAAATATCTGTGGAAAAATCACTTTACAAAGAAATTCAGCAGTGTCTTGTAGGAAATAAAGGTATTGAAGT 425
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 256 AAAGAAATATCTGTGGAAAAATCACTTTACAAAGAAATTCAGCAGTGTCTTGTAGGAAATAAAGGTATTGAAGT 329
Query 426 ATTCTACAAAATCCAGGAAGATGTTTATGAGACCCTAAAGGACAGGTATTACCCTTCATTTATTGTCAGTGACC 499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 330 ATTCTACAAAATCCAGGAAGATGTTTATGAGACCCTAAAGGATAGGTATTACCCTTCATTTATTGTCAGTGACC 403
Query 500 TGTATGAGAAATTGTTGATAAAAGAGGAAGAAAAACATGCCTCACAGATGATTTCCAACAAGGATGAGATGGGC 573
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 404 TGTATGAGAAATTGTTGATAAAAGAGGAAGAAAAACATGCCTCACAGATGATTTCCAACAAGGATGAGATGGGC 477
Query 574 CCAAGAGATGAGGCTGGTGAGGAAGCCGTGGATGATGGTACCAATCAGATCAATGAACAAGCCAGTTTTGCTGT 647
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 478 CCAAGAGATGAGGCTGGTGAGGAAGCCGTGGATGATGGTACCAATCAGATCAATGAACAAGCCAGTTTTGCTGT 551
Query 648 AAACAAACTGCGAGAACTAAATGAGAAACTTGAATATAAAAGGCAAGCTCTAAATTCTATTCAAAATGCACCAA 721
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 552 AAACAAACTGCGAGAACTAAATGAGAAACTTGAATATAAAAGGCAAGCTCTAAATTCTATTCAAAATGCACCAA 625
Query 722 AACCTGACAAGAAGATTGTTTCCAAGTTGAAGGATGAAATAATCCTAATAGAGAAAGAACGCACAGACCTTCAG 795
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 626 AACCTGACAAGAAGATTGTTTCCAAGTTGAAGGATGAAATAATCCTAATAGAGAAAGAACGCACAGACCTTCAG 699
Query 796 CTGCACATAGCAAGAACGGATTGGTGGTGTGAAAACCTTGGCATGTGGAAAGCCTCCATCACCAGTGGAGAGGT 869
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 700 CTGCACATGGCAAGAACGGATTGGTGGTGTGAAAACCTTGGCATGTGGAAAGCCTCCATCACCAGTGGAGAGGT 773
Query 870 TACAGAAGAGAATGGTGAGCAATTGCCATGTTACTTTGTCATGGTAAGCCTACAAGAAGTTGGAGGAGTTGAAA 943
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 774 TACAGAAGAGAATGGTGAGCAATTGCCATGTTACTTTGTCATGGTAAGCCTACAAGAAGTTGGAGGAGTTGAAA 847
Query 944 CTAAGAACTGGACGGTCCCCAGAAGGCTCAGCGAGTTTCAGAATTTACACCGGAAACTCAGTGAGTGCGTCCCT 1017
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 848 CTAAGAACTGGACGGTCCCCAGAAGGCTCAGCGAGTTTCAGAATTTACACCGGAAACTCAGTGAGTGCGTCCCT 921
Query 1018 TCTTTAAAAAAAGTCCAGTTGCCTTCTCTTAGCAAGCTGCCTTTCAAATCTATAGATCAAAAGTTTATGGAAAA 1091
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 922 TCTTTAAAAAAAGTCCAGTTGCCTTCTCTTAGCAAGCTGCCTTTCAAATCTATAGATCAAAAGTTTATGGAAAA 995
Query 1092 GTCGAAGAATCAATTAAATAAGTTTTTAC--------------------------------------------- 1120
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 996 GTCGAAGAATCAATTAAATAAGTTTTTACAGAATCTGCTTTCAGATGAAAGACTGTGTCAGAGTGAAGCACTTT 1069
Query 1121 -------------------------------------------------------------------------- 1120
Sbjct 1070 ATGCCTTCTTGAGCCCTTCTCCTGACTACCTCAAGGTTATCGACGTGCAGGGGAAAAAAAATTCTTTTTCATTA 1143
Query 1121 ----------------------------------------------AGGAGGAGACAGAGGAGGACAGTGACCT 1148
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1144 TCCTCATTTTTGGAAAGACTTCCTCGCGACTTCTTCTCCCACCAGGAGGAGGAGACAGAGGAGGACAGTGACCT 1217
Query 1149 GTCAGATTATGGTGATGATGTGGATGGGAGGAAAGACGCCTTGGCTGAACCATGTTTCATGTTGATTGGGGAGA 1222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1218 GTCAGATTATGGTGATGATGTGGATGGGAGGAAAGACGCCTTGGCTGAACCATGTTTCATGTTGATTGGGGAGA 1291
Query 1223 TTTTTGAACTTCGAGGAATGTTTAAATGGGTGAGAAGAACATTAATTGCCCTCGTTCAGGTCACTTTTGGAAGA 1296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1292 TTTTTGAACTTCGAGGAATGTTTAAATGGGTGAGAAGAACATTAATTGCCCTCGTTCAGGTCACTTTTGGAAGA 1365
Query 1297 ACCATCAACAAACAAATCCGGGACACAGTCAGCTGGATTTTCAGTGAGCAAATGTTGGTTTACTACATCAATAT 1370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1366 ACCATCAACAAACAAATCCGGGACACAGTCAGCTGGATTTTCAGTGAGCAAATGTTGGTTTACTACATCAATAT 1439
Query 1371 TTTCCGGGATGCTTTTTGGCCAAATGGGAAGTTGGCACCACCGACCACAATCAGAAGCAAAGAGCAAAGTCAGG 1444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1440 TTTCCGGGATGCTTTTTGGCCAAATGGGAAGTTGGCACCACCGACCACAATCAGAAGCAAAGAGCAAAGTCAGG 1513
Query 1445 AAACAAAACAGAGAGCACAGCAAAAGCTGCTTGAAAACATTCCAGATATGCTTCAGAGCCTTGTTGGACAGCAA 1518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1514 AAACAAAACAGAGAGCACAGCAAAAGCTGCTTGAAAACATTCCAGATATGCTTCAGAGCCTTGTTGGACAGCAA 1587
Query 1519 AATGCCCGCCACGGTATAATAAAAATATTCAATGCACTGCAAGAAACAAGAGCCAACAAGCATCTGTTATATGC 1592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1588 AATGCCCGCCACGGTATAATAAAAATATTCAATGCACTGCAAGAAACAAGAGCCAACAAGCATCTGTTATATGC 1661
Query 1593 GCTGATGGAACTGCTGCTAATTGAACTGTGTCCTGAGCTGAGAGTTCATTTAGATCAACTTAAAGCTGGCCAAG 1666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1662 GCTGATGGAACTGCTGCTAATTGAACTGTGTCCTGAGCTGAGAGTTCATTTAGATCAACTTAAAGCTGGCCAAG 1735
Query 1667 TT 1668
||
Sbjct 1736 TT 1737