Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14299
• Subject: XM_017312502.1
• Aligned Length: 2070
• Identities: 1425
• Gaps: 414

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCTGCTCAGGCAGTTGGAGTACAGAGAGCAGATGAGTGAGCATCACAAGCGAGCCTACACGTACGCGCCTTC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CTACGAGGACTTTATCAAGCTCATCAACAGCAACTCTGATGTGGACTTCCTGAAGCAGCTCAGGTATCAAATTG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TAGTGGAGATAATCCAAGCAACTACAATCAGCAGCTTTCCCCAGCTGAAGAGACACAAGGGTAAGGAATCAGCT  222

Query    1  ---ATGAAAGCTGATCTCCTGAGGGCCAGGAACATGAAGAGGTACATCAACCAACTGACTGTGGCAAAGAAGCA  71
               ||||||.||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCATGAAAACTGATCTCTTGAGGGCCAGGAACATGAAAAGGTACATTAACCAGCTGACTGTGGCAAAGAAGCA  296

Query   72  GTGTGAGAAGAGAATCCGAATCCTGGGAGGCCCTGCCTATGACCAGCAAGAGGATGGGGCCCTGGATGAGGGGG  145
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||..||||||.||||
Sbjct  297  GTGTGAGAAGAGAATCCGAATCCTGGGAGGTCCTGCCTATGACCAGCAAGAGGATGGAGCCTCGGATGAAGGGG  370

Query  146  AAGGGCCTCAAAGCCAGAAGATTCTTCAGTTTGAAGATATCTTGGCCAATACGTTCTACCGAGAGCACTTTGGA  219
            ||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||..||.|||||.|.|||||||||||||.|||||||
Sbjct  371  AAGGGCCTCAGAGCCAAAAGATTCTTCAGTTTGAAGATATTATGACCAATCCTTTCTACCGAGAGCGCTTTGGA  444

Query  220  ATGTACATGGAAAGGATGGACAAAAGAGCTCTGATTAGTTTTTGGGAATCTGTGGAACATTTAAAGAATGCTAA  293
            |..|||||||||.||||.|||||..|.|||||..||.|.||||||||.||||..|||||..|.|||||||||||
Sbjct  445  ACATACATGGAACGGATAGACAAGCGGGCTCTAGTTGGCTTTTGGGAGTCTGCCGAACACCTGAAGAATGCTAA  518

Query  294  CAAGAATGAAATTCCACAATTAGTTGGTGAAATTTATCAGAATTTCTTTGTGGAGAGCAAAGAAATATCTGTGG  367
            |||||.|||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||||
Sbjct  519  CAAGAGTGAAATTCCACAATTAGTTAGTGAAATGTATCAGAATTTCTTCGTGGAAAGCAAGGAAATCTCCGTGG  592

Query  368  AAAAATCACTTTACAAAGAAATTCAGCAGTGTCTTGTAGGAAATAAAGGTATTGAAGTATTCTACAAAATCCAG  441
            ||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|.|||.||.||.||.|||..|||||||||.
Sbjct  593  AAAAGTCACTTTACAAAGAAATCCAGCAGTGTCTTGTGGGAAACAGAGGCATCGAGGTGTTCAGCAAAATCCAA  666

Query  442  GAAGATGTTTATGAGACCCTAAAGGACAGGTATTACCCTTCATTTATTGTCAGTGACCTGTATGAGAA----AT  511
            |..|||||.|..|||...||.|.|||..||||||||||.||.||..|.|||||.||||||||||||||    ||
Sbjct  667  GCCGATGTGTCCGAGGTGCTGAGGGAGCGGTATTACCCCTCCTTCCTCGTCAGCGACCTGTATGAGAAGCTCAT  740

Query  512  ---TGTTGATAAAAGAGGAAGAAAAACATGCCT----CACAGATGATTTCCAACAAGGATGAGATGGGCCCAAG  578
               ||..|| |.|||||||.||       ||||    |.|||.||...||..|.|||||||||.||||..||.|
Sbjct  741  GCGTGAGGA-AGAAGAGGAGGA-------GCCTGACGCTCAGCTGGCCTCTGAGAAGGATGAGCTGGGTTCAGG  806

Query  579  AGATGAGGCTGGTGAGGAAGCCGTGGATGATGGTACCAATCAGATCAATGAACAAGCCAGTTTTGCTGTAAACA  652
            ||.|||||||||||||||.||.||   .||.||.||||.|..|.|||.|||.|.||||||.||||||||||.||
Sbjct  807  AGGTGAGGCTGGTGAGGAGGCTGT---AGAAGGCACCAGTGGGGTCAGTGATCCAGCCAGCTTTGCTGTAATCA  877

Query  653  AACTGCGAGAACTAAATGAGAAACTTGAATATAAAAGGCAAGCTCTAAATTCTATTCAAAATGCACCAAAACCT  726
            ||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  878  AACTCCGAGAGCTAAATGAGAAACTTGAATACAAAAGGCAAGCTCTAAGTTCTATTCAGAATGCACCAAAACCT  951

Query  727  GACAAGAAGATTGTTTCCAAGTTGAAGGATGAAATAATCCTAATAGAGAAAGAACGCACAGACCTTCAGCTGCA  800
            ||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||||||.||||.|..|||||||||||
Sbjct  952  GATAAGAAGATTATTTCCAAGTTGAAGGATGAAATACTTCTGATAGAGAAAGAATGCACGGCTCTTCAGCTGCA  1025

Query  801  CATAGCAAGAACGGATTGGTGGTGTGAAAACCTTGGCATGTGGAAAGCCTCCATCACCAGTGGAGAGGTTACAG  874
            |||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||.||||||.|||.|||||||||||.|.||||||.||||
Sbjct 1026  CATGGCGAGAACAGATTGGTGGTGTGAGAACCTGGGCCTGTGGAGAGCATCCATCACCAGCGCAGAGGTGACAG  1099

Query  875  AAGAGAATGGTGAGCAATTGCCATGTTACTTTGTCATGGTAAGCCTACAAGAAGTTGGAGGAGTTGAAACTAAG  948
            ||||||||||.||||||.||||.|||||||||||||.|||||..||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1100  AAGAGAATGGCGAGCAAATGCCTTGTTACTTTGTCAGGGTAAATCTACAAGAAGTTGGAGGAGTTGAAACTAAG  1173

Query  949  AACTGGACGGTCCCCAGAAGGCTCAGCGAGTTTCAGAATTTACACCGGAAACTCAGTGAGTGCGTCCCTTCTTT  1022
            ||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1174  AACTGGACCGTCCCAAGAAGGCTCAGTGAGTTTCAGAATTTACATCGGAAACTTAGTGAGTGTGTCCCTTCTTT  1247

Query 1023  AAAAAAAGTCCAGTTGCCTTCTCTTAGCAAGCTGCCTTTCAAATCTATAGATCAAAAGTTTATGGAAAAGTCGA  1096
            ||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||..|||.|||||| |
Sbjct 1248  AAAAAAAGTCCAGTTGCCTTCTCTCAGTAAGCTGCCTTTCAAATCTATAGATCACAAGTTCCTGGGAAAGTC-A  1320

Query 1097  AG-AATCAATTAAAT-----------------------------AAG---------------------------  1113
            || |||||.||||||                             |||                           
Sbjct 1321  AGAAATCAGTTAAATGCATTTCTACAGAACCTGCTTTCAGATGAAAGACTGTTCCAGAGCGAAGCACTTTATGC  1394

Query 1114  -TTTTT--------------AC----------------------------------------------------  1120
             |||||              ||                                                    
Sbjct 1395  CTTTTTGAGCCCTTCTCCTGACTACCTCAAGGTCATTGATGTACAGGGGAAAAAGACCTCCTTCTCATTGTCTT  1468

Query 1121  ------------------------------------------AGGAGGAGACAGAGGAGGACAGTGACCTGTCA  1152
                                                      |||||||||.|||.||||||||.||||||||.
Sbjct 1469  CATTTCTGGAAAAACTTCCTCGTGACTTCTTCTCCCATCAGGAGGAGGAGATAGAAGAGGACAGCGACCTGTCC  1542

Query 1153  GATTATGGTGATGATGTGGATGGGAGGAAAGACGCCTTGGCTGAACCATGTTTCATGTTGATTGGGGAGATTTT  1226
            |||||.||.|||||||||||.||||.|||.||..|||||||||||||.|||||||||.||||.|||||||||||
Sbjct 1543  GATTACGGGGATGATGTGGACGGGAAGAAGGATTCCTTGGCTGAACCGTGTTTCATGCTGATCGGGGAGATTTT  1616

Query 1227  TGAACTTCGAGGAATGTTTAAATGGGTGAGAAGAACATTAATTGCCCTCGTTCAGGTCACTTTTGGAAGAACCA  1300
            .|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1617  CGAACTTCGAGGAATGTTTAAATGGGTGCGAAGAACATTAATCGCTCTTGTTCAGGTCACGTTTGGAAGAACCA  1690

Query 1301  TCAACAAACAAATCCGGGACACAGTCAGCTGGATTTTCAGTGAGCAAATGTTGGTTTACTACATCAATATTTTC  1374
            |||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.|.|||.|||||.|||.||||.||||||||||.|..||||
Sbjct 1691  TCAACAAGCAAATCCGCGACACGGTGAGCTGGATCTCCAGCGAGCAGATGCTGGTCTACTACATCAGTGCTTTC  1764

Query 1375  CGGGATGCTTTTTGGCCAAATGGGAAGTTGGCACCACCGACCACAATCAGAAGCAAAGAGCAAAGTCAGGAAAC  1448
            ||||||||.|||||||||||.|||||..|||||||.||.||.|.||||.|||||...|..||.||||||||.||
Sbjct 1765  CGGGATGCCTTTTGGCCAAACGGGAAACTGGCACCTCCAACAAGAATCCGAAGCGTGGCACAGAGTCAGGAGAC  1838

Query 1449  AAAACAGAGAGCACAGCAAAAGCTGCTTGAAAACATTCCAGATATGCTTCAGAGCCTTGTTGGACAGCAAAATG  1522
            .||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1839  GAAGCAGAGAGCACAGCAGAAGCTGCTCGAGAACATTCCAGATACACTTCAGAGCCTTGTTGGACAGCAAAATG  1912

Query 1523  CCCGCCACGGTATAATAAAAATATTCAATGCACTGCAAGAAACAAGAGCCAACAAGCATCTGTTATATGCGCTG  1596
            |||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||..||||||||.||.|||.|.||||.||||
Sbjct 1913  CCCGCCATGGTATAATAAAAATATTCAAGGCGCTGCAAGAGACAAAGGCCAACAAACACCTGCTCTATGTGCTG  1986

Query 1597  ATGGAACTGCTGCTAATTGAACTGTGTCCTGAGCTGAGAGTTCATTTAGATCAACTTAAAGCTGGCCAAGTT  1668
            |||||.||||||||.|..||.||.||.|||||||||||.|.|||..|.|||||..|.||||||||||||||.
Sbjct 1987  ATGGAGCTGCTGCTGACAGAGCTCTGCCCTGAGCTGAGGGCTCACCTGGATCAGTTCAAAGCTGGCCAAGTC  2058