Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14337
• Subject: NM_001365766.2
• Aligned Length: 1605
• Identities: 1477
• Gaps: 117

Alignment

Query    1  ATGAAACAGCCCAACAGGAAAAGGAAGCTTAATATGGATTCCAAAGAGCGTTTGGATCAGGACGGACGCTTGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAACAGCCCAACAGGAAAAGGAAGCTTAATATGGATTCCAAAGAGCGTTTGGATCAGGACGGACGCTTGGA  74

Query   75  GCAAGCTGAAGAGGAAAAGAAGCCCAAGGATAGCACAACCCCTTTGAGTCACGTCCCTTCAGCGGCTGCACAGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCAAGCTGAAGAGGAAAAGAAGCCCAAGGATAGCACAACCCCTTTGAGTCACGTCCCTTCAGCGGCTGCACAGG  148

Query  149  GAGCATGGTCTTGGGAGTGGTACTTGAAAGAACAGAAGGCTGTCGCAGCACCTGTTGAGCTGTTTTCCAAGGAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GAGCATGGTCTTGGGAGTGGTACTTGAAAGAACAGAAGGCTGTCGCAGCACCTGTTGAGCTGTTTTCCAAGGAT  222

Query  223  CAGTCCTTTCCAGAGCATGAAAATGGTTTTCAGATTGGAATGAGATTAGAAGGCATTGATCCCCGACATCCATC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGTCCTTTCCAGAGCATGAAAATGGTTTTCAGATTGGAATGAGATTAGAAGGCATTGATCCCCGACATCCATC  296

Query  297  GGTATTCTGTGTGCTTTCTGTAGCGGAGGTTTGTGGTTACCGTCTAAGACTTCATTTTGATGGTTATTTAAGTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGTATTCTGTGTGCTTTCTGTAGCGGAGGTTTGTGGTTACCGTCTAAGACTTCATTTTGATGGTTATTTAAGTT  370

Query  371  GCTATGATTTTTGGACCAATGCTGGTTCCCCTGACATTCATCCAGTAGGATGGTGTGAAAAGACCAAACATGAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCTATGATTTTTGGACCAATGCTGGTTCCCCTGACATTCATCCAGTAGGATGGTGTGAAAAGACCAAACATGAA  444

Query  445  CTGCACATCCCTAAGGGTTATAGAAAAGATAAATTTGTTTGGATGGATTACTTGAAGGCCTGCAAATTGCAAAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGCACATCCCTAAGGGTTATAGAAAAGATAAATTTGTTTGGATGGATTACTTGAAGGCCTGCAAATTGCAAAA  518

Query  519  TGCTCCAAAGAAATTATTCAGAAACAGAAGTCCTAATGGGCCAATGTCTAAAGAATTTCAGGTTGGAATGAAGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGCTCCAAAGAAATTATTCAGAAACAGAAGTCCTAATGGGCCAATGTCTAAAGAATTTCAGGTTGGAATGAAGC  592

Query  593  TGGAGGCCGTGGACAGGAAGAACCCTTCCTTGGTGTGTGTGGCGACCATAGCAGATATTGTTGAAGATCGCTTA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGAGGCCGTGGACAGGAAGAACCCTTCCTTGGTGTGTGTGGCGACCATAGCAGATATTGTTGAAGATCGCTTA  666

Query  667  CTAGTGCATTTTGACAACTGGGATGATAGTTACGATTACTGGTGCGATGTTAATAGCCCTTATGTCCAGCCAGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTAGTGCATTTTGACAACTGGGATGATAGTTACGATTACTGGTGCGATGTTAATAGCCCTTATGTCCAGCCAGT  740

Query  741  TGGTTGGTGTCAGGAGAATGGAAGAACTCTGATAGCACCCCAAGGTTATCCCAATCCAGAAAATTTTTCCTGGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGGTTGGTGTCAGGAGAATGGAAGAACTCTGATAGCACCCCAAGGTTATCCCAATCCAGAAAATTTTTCCTGGA  814

Query  815  CAGAATACCTGGAAGCTACTCAAACCAATGCAGTTCCTGCCAAAGTTTTTAAAATGAGGTTGCCTCATGGTTTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAGAATACCTGGAAGCTACTCAAACCAATGCAGTTCCTGCCAAAGTTTTTAAAATGAGGTTGCCTCATGGTTTT  888

Query  889  CTGCCAAATATGAAACTTGAAGTTGTGGATAAACGGAACCCCAGGTTAATTCGTGTTGCTACGATTGTAGATGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGCCAAATATGAAACTTGAAGTTGTGGATAAACGGAACCCCAGGTTAATTCGTGTTGCTACGATTGTAGATGT  962

Query  963  TGATGACCAAAGAGTAAAGGTTCATTTTGATGGTTGGGACCATAAGTATGACTACTGGGTGGAGGCAGACAGCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGATGACCAAAGAGTAAAGGTTCATTTTGATGGTTGGGACCATAAGTATGACTACTGGGTGGAGGCAGACAGCC  1036

Query 1037  CTGATATCCACCCGATCGGATGGTGTGATGTCACAGGGCATCCACTGGAAGTGCCACAGCGAACGAATGACCTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTGATATCCACCCGATCGGATGGTGTGATGTCACAGGGCATCCACTGGAAGTGCCACAGCGAACGAATGACCTG  1110

Query 1111  AAGATCCTTCCAGGTCAAGCTGTCTGTCCTACTCCCGGGTGCCGAGGAATAGGCCATATCCGTGGTCCACGTTA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAGATCCTTCCAGGTCAAGCTGTCTGTCCTACTCCCGGGTGCCGAGGAATAGGCCATATCCGTGGTCCACGTTA  1184

Query 1185  TTCGGGACATCACAGTGCTTTTGGCTGCCCGTATTCAGACATGAACTTGAAAAAGGAGGCAACACTTCACGATC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTCGGGACATCACAGTGCTTTTGGCTGCCCGTATTCAGACATGAACTTGAAAAAGGAGGCAACACTTCACGATC  1258

Query 1259  GTTTGAGAGAACAAACACAGGCAAATTTGGAATCAGACTCTTCACATTCAAAATCAAAAAGCCTCTGTAGTTTG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GTTTGAGAGAACAAACACAGGCAAATTTGGAATCAGACTCTTCACATTCAAAATCAAAAAGCCTCTGTAGTTTG  1332

Query 1333  AACTTCAATGGAAAACATGAAAAGGTGAACAGTCAGCCCAGACTTGTACAGCAGGCAAAGTGTTTGAAAATCAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AACTTCAATGGAAAACATGAAAAGGTGAACAGTCAGCCCAGACTTGTACAGCAGGCAAAGTGTTTGAAAATCAA  1406

Query 1407  AGGAAAAGAAGATATTGACTTGGATAATCTCTTCAGAGGCCGAGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCAC  1480
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||.||               |||          
Sbjct 1407  AGGAAAAGAAGATATTGACTTGGATAATCTCTTCAGAGG--GAATG---------------GTA----------  1453

Query 1481  TTTGGGAG-GCCGAGGCAGGCAGATCACGAGA--TCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCCAACGCAGTGAAACCC  1551
               |..|| |||            |.||.|||  |||..||    ||||  |..||..|               
Sbjct 1454  ---GAAAGAGCC------------TAACTAGAAGTCAAAAG----AGAC--TTGTGTTC---------------  1491

Query 1552  CGTCTCTACCAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCGGGCGCCTA  1602
                                                               
Sbjct 1492  ---------------------------------------------------  1491