Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14337
- Subject:
- XM_011525758.1
- Aligned Length:
- 1979
- Identities:
- 1541
- Gaps:
- 403
Alignment
Query 1 ATGAAACAGCCCAACAGGAAAAGGAAGCTTAATATGGATTCCAAAGAGCGTTTGGATCAGGACGGACGCTTGGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAACAGCCCAACAGGAAAAGGAAGCTTAATATGGATTCCAAAGAGCGTTTGGATCAGGACGGACGCTTGGA 74
Query 75 GCAAGCTGAAGAGGAAAAGAAGCCCAAGGATAGCACAACCCCTTTGAGTCACGTCCCTTCAGCGGCTGCACAGG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GCAAGCTGAAGAGGAAAAGAAGCCCAAGGATAGCACAACCCCTTTGAGTCACGTCCCTTCAGCGGCTGCACAGG 148
Query 149 GAGCATGGTCTTGGGAGTGGTACTTGAAAGAACAGAAGGCTGTCGCAGCACCTGTTGAGCTGTTTTCCAAGGAT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GAGCATGGTCTTGGGAGTGGTACTTGAAAGAACAGAAGGCTGTCGCAGCACCTGTTGAGCTGTTTTCCAAGGAT 222
Query 223 CAGTCCTTTCCAGAGCATGAAAATGGTTTTCAGATTGGAATGAGATTAGAAGGCATTGATCCCCGACATCCATC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CAGTCCTTTCCAGAGCATGAAAATGGTTTTCAGATTGGAATGAGATTAGAAGGCATTGATCCCCGACATCCATC 296
Query 297 GGTATTCTGTGTGCTTTCTGTAGCGGAGGTTTGTGGTTACCGTCTAAGACTTCATTTTGATGGTTATTTAAGTT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGTATTCTGTGTGCTTTCTGTAGCGGAGGTTTGTGGTTACCGTCTAAGACTTCATTTTGATGGTTATTTAAGTT 370
Query 371 GCTATGATTTTTGGACCAATGCTGGTTCCCCTGACATTCATCCAGTAGGATGGTGTGAAAAGACCAAACATGAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GCTATGATTTTTGGACCAATGCTGGTTCCCCTGACATTCATCCAGTAGGATGGTGTGAAAAGACCAAACATGAA 444
Query 445 CTGCACATCCCTAAGGGTTATAGAAAAGATAAATTTGTTTGGATGGATTACTTGAAGGCCTGCAAATTGCAAAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTGCACATCCCTAAGGGTTATAGAAAAGATAAATTTGTTTGGATGGATTACTTGAAGGCCTGCAAATTGCAAAA 518
Query 519 TGCTCCAAAGAAATTATTCAGAAACAGAAGTCCTAATGGGCCAATGTCTAAAGAATTTCAGGTTGGAATGAAGC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGCTCCAAAGAAATTATTCAGAAACAGAAGTCCTAATGGGCCAATGTCTAAAGAATTTCAGGTTGGAATGAAGC 592
Query 593 TGGAGGCCGTGGACAGGAAGAACCCTTCCTTGGTGTGTGTGGCGACCATAGCAGATATTGTTGAAGATCGCTTA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGGAGGCCGTGGACAGGAAGAACCCTTCCTTGGTGTGTGTGGCGACCATAGCAGATATTGTTGAAGATCGCTTA 666
Query 667 CTAGTGCATTTTGACAACTGGGATGATAGTTACGATTACTGGTGCGATGTTAATAGCCCTTATGTCCAGCCAGT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CTAGTGCATTTTGACAACTGGGATGATAGTTACGATTACTGGTGCGATGTTAATAGCCCTTATGTCCAGCCAGT 740
Query 741 TGGTTGGTGTCAGGAGAATGGAAGAACTCTGATAGCACCCCAAGGTTATCCCAATCCAGAAAATTTTTCCTGGA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGGTTGGTGTCAGGAGAATGGAAGAACTCTGATAGCACCCCAAGGTTATCCCAATCCAGAAAATTTTTCCTGGA 814
Query 815 CAGAATACCTGGAAGCTACTCAAACCAATGCAGTTCCTGCCAAAGTTTTTAAAATGAGGTTGCCTCATGGTTTT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CAGAATACCTGGAAGCTACTCAAACCAATGCAGTTCCTGCCAAAGTTTTTAAAATGAGGTTGCCTCATGGTTTT 888
Query 889 CTGCCAAATATGAAACTTGAAGTTGTGGATAAACGGAACCCCAGGTTAATTCGTGTTGCTACGATTGTAGATGT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTGCCAAATATGAAACTTGAAGTTGTGGATAAACGGAACCCCAGGTTAATTCGTGTTGCTACGATTGTAGATGT 962
Query 963 TGATGACCAAAGAGTAAAGGTTCATTTTGATGGTTGGGACCATAAGTATGACTACTGGGTGGAGGCAGACAGCC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGATGACCAAAGAGTAAAGGTTCATTTTGATGGTTGGGACCATAAGTATGACTACTGGGTGGAGGCAGACAGCC 1036
Query 1037 CTGATATCCACCCGATCGGATGGTGTGATGTCACAGGGCATCCACTGGAAGTGCCACAGCGAACGAATGACCTG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTGATATCCACCCGATCGGATGGTGTGATGTCACAGGGCATCCACTGGAAGTGCCACAGCGAACGAATGACCTG 1110
Query 1111 AAGATCCTTCCAGGTCAAGCTGTCTGTCCTACTCCCGGGTGCCGAGGAATAGGCCATATCCGTGGTCCACGTTA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AAGATCCTTCCAGGTCAAGCTGTCTGTCCTACTCCCGGGTGCCGAGGAATAGGCCATATCCGTGGTCCACGTTA 1184
Query 1185 TTCGGGACATCACAGTGCTTTTGGCTGCCCGTATTCAGACATGAACTTGAAAAAGGAGGCAACACTTCACGATC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TTCGGGACATCACAGTGCTTTTGGCTGCCCGTATTCAGACATGAACTTGAAAAAGGAGGCAACACTTCACGATC 1258
Query 1259 GTTTGAGAGAACAAACACAGGCAAATTTGGAATCAGACTCTTCACATTCAAAATCAAAAAGCCTCTGTAGTTTG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GTTTGAGAGAACAAACACAGGCAAATTTGGAATCAGACTCTTCACATTCAAAATCAAAAAGCCTCTGTAGTTTG 1332
Query 1333 AACTTCAATGGAAAACATGAAAAGGTGAACAGTCAGCCCAGACTTGTACAGCAGGCAAAGTGTTTGAAAATCAA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AACTTCAATGGAAAACATGAAAAGGTGAACAGTCAGCCCAGACTTGTACAGCAGGCAAAGTGTTTGAAAATCAA 1406
Query 1407 AGGAAAAGAAGATATTGACTTGGATAATCTCTTCAGAGGCCGAGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCAC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|..|||| ||| |||||||...
Sbjct 1407 AGGAAAAGAAGATATTGACTTGGATAATCTCTTCAGAGTGCTTGTGC---------TGC-----ATCCCAGAGG 1466
Query 1481 TTTGGGA-----GGCCGAGGCAGGCAGA---------TCACGAGATCAGGAGATCAAGACCATCCTG---GCCA 1537
|||||.| ||..|| ||||||..| ||||.|| ||| |.|..||.|.|||...|| |||.
Sbjct 1467 TTTGGAATACTCGGTGGA-GCAGGCGCAGCAGGTGCTTCACCAG-TCA-GTGTCCATGTCCACGGTGTCAGCCC 1537
Query 1538 ACGCAGT--GAAAC---CCCGTCTC------TACCAAAAATACAAAAAATTAG------CCAGGCGTGGTGG-- 1592
||.|..| |..|| ||| ||| .|.|||.|.|.|| || ||||||||||..|
Sbjct 1538 ACCCTTTTCGGGACCTTCCC--CTCGGCAGGGAGCAACACTGCA-------AGTTGCTTCCAGGCGTGGCTGAC 1602
Query 1593 ---CGGGC--GCCTA----------------------------------------------------------- 1602
||||| |||.|
Sbjct 1603 ATCCGGGCCAGCCAAGTGGCACGTTGGACTGTGGATGAGGTGGCTGAGTTTGTACAGTCTCTTCTGGGCTGTGA 1676
Query 1603 -------------------------------------------------------------------------- 1602
Sbjct 1677 AGAGCATGCCAAGTGCTTTAAGAAAGAGGAATCATCTGAGCCAGGCTGTGTCAATCAGAGACGCTGCAGTAGTC 1750
Query 1603 -------------------------------------------------------------------------- 1602
Sbjct 1751 CCTGGAGTTGTGCTGAGGTCACTGGGGCATCCAGAAGCTGGGGAAAGCAGCCTACACGGTGGCCACTGCCATCC 1824
Query 1603 -------------------------------------------------------------------------- 1602
Sbjct 1825 TCAGATCGATGGCAAAGCCTTCCTGCTTCTGACACAGACGGACATTGTCAAAGTGATGAAGATCAAACTGGGCC 1898
Query 1603 ------------------------------------------------------- 1602
Sbjct 1899 CAGCACTGAAGATTTACAACTCTATCCTGATGTTCAGGCATTCCCAGGAACTCCC 1953